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Histone deacetylase 8 isoform 7
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- EOY33305 2118 447aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A061GTZ2 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - EOY33306 1451 407aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A061GUZ1 - - - EOY33311 1214 350aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A061GUZ5 - - - EOY33307 1174 343aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A061GVW0 - - - EOY33310 1155 351aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A061GTZ7 - - - EOY33308 1146 340aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A061GV75 - - - EOY33309 1127 334aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A061GZM8 - -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants 5 prime UTR Missense Synonymous Other Markup Variants are filtered by consequence type ▼ ▲
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants 5 prime UTR Missense Synonymous Other Markup Variants are filtered by consequence type
Y M R Y
1 G AGGACTTCGAAAG CCGAAATGAAGAAAAACCAAGCATATGAACG ATC C GGAAACC 60
............................................................
............................................................
R R R
61 GTGAACTGA CTCCAGTCCTATCAACT CTCAGTTACAA ATG TCT GTT CCC GGC CAA CC 120
........................................ATGTCTGTTCCCGGCCAACC 20
........................................-M--S--V--P--G--Q--P 7
121 T TTT CCA ACG TCC TCA ACA GGT TGC ATC CAT GTG TTT TGG CAC GAG GGA ATG CTA AGA CA 180
21 TTTTCCAACGTCCTCAACAGGTTGCATCCATGTGTTTTGGCACGAGGGAATGCTAAGACA 80
7 --F--P--T--S--S--T--G--C--I--H--V--F--W--H--E--G--M--L--R--H 27
S S
181 T GA ACA GGC GT GGC GTA TTT GAC ACG GGG ATC GAC CCA GGT TTC TTG GAG GTG TTA GA 240
81 TGACACAGGCCGTGGCGTATTTGACACGGGGATCGACCCAGGTTTCTTGGAGGTGTTAGA 140
27 - -D- -T--G- -R- -G--V--F--D--T--G--I--D--P--G--F--L--E--V--L--E 47
241 A AAG CAC CCA GAG AAT TCA GAC AGG GTC AGA AAC ATC GTC TCT ATC CTC AAA AGA GGA CC 300
141 AAAGCACCCAGAGAATTCAGACAGGGTCAGAAACATCGTCTCTATCCTCAAAAGAGGACC 200
47 --K--H--P--E--N--S--D--R--V--R--N--I--V--S--I--L--K--R--G--P 67
301 C ATC TCT CCT CAC GTC TCT TGG CAC ACT GGC AGA CCT GCT AAT ATT CCT GAG CTT CTC TC 360
201 CATCTCTCCTCACGTCTCTTGGCACACTGGCAGACCTGCTAATATTCCTGAGCTTCTCTC 260
67 --I--S--P--H--V--S--W--H--T--G--R--P--A--N--I--P--E--L--L--S 87
W R
361 T TTC CAT TCC CAA G GA TAT ATT AAT CG CTA GTT GAA GCC GAC AAG AAT GG GGT AAG GA 420
261 TTTCCATTCCCAAGGATATATTAATACGCTAGTTGAAGCCGACAAGAATGGGGGTAAGGA 320
87 --F--H--S--Q--G--Y--I--N- -T- -L--V--E--A--D--K--N- -G- -G--K--E 107
421 A ATC TGT GGT GGT ACC TTC TTG AAC CCT GGT TCA TTC GAT GCC GCT CTG CTA GCT GCC GG 480
321 AATCTGTGGTGGTACCTTCTTGAACCCTGGTTCATTCGATGCCGCTCTGCTAGCTGCCGG 380
107 --I--C--G--G--T--F--L--N--P--G--S--F--D--A--A--L--L--A--A--G 127
Y R W
481 ACT ACG CTA TCA GCT TG AAA CAT ATA CTT GAT GGC CAC GGG AAA CT GCT TAT GCA TT 540
381 TACTACGCTATCAGCTATGAAACATATACTTGATGGCCACGGGAAACTTGCTTATGCATT 440
127 --T--T--L--S--A- -M- -K--H--I--L--D--G--H--G--K--L--A--Y--A--L 147
R
541 G GTT AGG CCT CCA GGT CAC CAT GCT CAA CCT ACT CA GCA GAT GGG TAT TGC TTT TTT AA 600
441 GGTTAGGCCTCCAGGTCACCATGCTCAACCTACTCAAGCAGATGGGTATTGCTTTTTTAA 500
147 --V--R--P--P--G--H--H--A--Q--P--T--Q--A--D--G--Y--C--F--F--N 167
R M
601 C AAC GC GGG CTT GCT GTG CAA TTG GCT TT GAT TCA GGG TGT AGA AAG GTC ACG GTC AT 660
501 CAACGCAGGGCTTGCTGTGCAATTGGCTTTAGATTCAGGGTGTAGAAAGGTCACGGTCAT 560
167 --N--A--G--L--A--V--Q--L--A- -L- -D--S--G--C--R--K--V--T--V--I 187
M
661 GAT ATC GAT GTT CAT TAT GGC AAT GGG ACA GCA GAG GGG TTC TAT CGG TCT GAT AAA GT 720
561 AGATATCGATGTTCATTATGGCAATGGGACAGCAGAGGGGTTCTATCGGTCTGATAAAGT 620
187 --D--I--D--V--H--Y--G--N--G--T--A--E--G--F--Y--R--S--D--K--V 207
S K
721 T CTT ACA TG TCC CTC CAT ATG AAT CAT GGT TCT TGG GGT CCT TCT CA CCG CAA ACT GG 780
621 TCTTACAGTGTCCCTCCATATGAATCATGGTTCTTGGGGTCCTTCTCATCCGCAAACTGG 680
207 --L--T- -V- -S--L--H--M--N--H--G--S--W--G--P--S- -H- -P--Q--T--G 227
R M
781 A ACA GTA GAT GAG CTT GGT GAA GGG GAA GGA TTT GGG TAT AAT TTG AAT AT CT TTG CC 840
681 AACAGTAGATGAGCTTGGTGAAGGGGAAGGATTTGGGTATAATTTGAATATACCTTTGCC 740
227 --T--V--D--E--L--G--E--G--E--G--F--G--Y--N--L--N- -I- -P- -L--P 247
R
841 A AAT GGA ACC GGT GAC AAG GGA TAT GAA TAT GCG ATG AG GAG TTG GTT GCC CCA GCT GT 900
741 AAATGGAACCGGTGACAAGGGATATGAATATGCGATGAGGGAGTTGGTTGCCCCAGCTGT 800
247 --N--G--T--G--D--K--G--Y--E--Y--A--M--R--E--L--V--A--P--A--V 267
S S W W
901 T CAG AAG TTT GAG CCA GAT GTG AT TG CTG GTG ATT GG CAG GAC TCA AGT GCT A G TA 960
801 TCAGAAGTTTGAGCCAGATGTGATCGTGCTGGTGATTGGTCAGGACTCAAGTGCTATGTA 860
267 --Q--K--F--E--P--D--V- -I- -V- -L--V--I--G--Q--D--S--S--A- -M- -Y 287
M Y
961 T GAG AGT GGA A A AAA AGT GGC CTT CTA AGG GAT AAA AA GGC ATG TTA AAT TTC ACA AA 1020
861 TGAGAGTGGAACAAAAAGTGGCCTTCTAAGGGATAAAAATGGCATGTTAAATTTCACAAA 920
287 --E--S--G- -T- -K--S--G--L--L--R--D--K--N--G--M--L--N--F--T--N 307
1021 C ACC GGA GGC ATT ACA AGA GAT TAT TTG TGT TTC TCC TCC ACC CCT TTC CTG CCC CCT TC 1080
921 CACCGGAGGCATTACAAGAGATTATTTGTGTTTCTCCTCCACCCCTTTCCTGCCCCCTTC 980
307 --T--G--G--I--T--R--D--Y--L--C--F--S--S--T--P--F--L--P--P--S 327
Y
1081 A CCC TCT GA TAC ACA CAC AAC CTT TCC TTG CCA ATC T TT TGA TCCAAATGGAAGACAAT 1140
981 ACCCTCTGACTACACACACAACCTTTCCTTGCCAATCTTTTGA................. 1023
327 --P--S--D--Y--T--H--N--L--S--L--P--I--F--*-................. 340
1141 GCTTGA 1146
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