Theobroma cacao Matina 1-6 (Theobroma_cacao_20110822) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Transducin family protein / WD-40 repeat family protein
Chromosome 6: 18,943,980-18,947,984 reverse strand.
This transcript has 2 exons and is annotated with 22 domains and features.
This transcript is a product of gene TCM_028864 Show transcript tableHide transcript table
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1 AAGCCTTTCTCAATTCCTTTGCCAACTGATTGGAGCTAGTCCGCGTCCGGTCGTCCTCCA 60 ............................................................ ............................................................ 61 ACGACGTCGTTTCTGTAAGTTTTCGATCTTCCTTCCCTGATACATACATGGATGTCGTGA 120 ............................................................ ............................................................ 121 AAACGTTTCTGTATATCTAACGAACGTTGAAAATGGCTATGTCTTCCTTCCGTTTTTCGT 180 ............................................................ ............................................................ 181 GATTTGATTTTTTGTATTAATAAAGAGTTTAATTTCTGATCTTGAATTGAATTTTCATTT 240 ............................................................ ............................................................ 241 TCTGATGCTTTAGTAATCAATCGATTTTGCTCAGATTGATGCTAAATTAAAAATGAATCG 300 ............................................................ ............................................................ 301 GAGATCTCAAATTAGGGTTCGATTTGAGCTATAGATTCTAGAGATTCTTTTTAAATCTGA 360 ............................................................ ............................................................ 361 TTTGTTTTGTATATTAGCTAAGCTGAGAACAATAGCGCAGAATTTGAAAAGTATGAAAAA 420 ............................................................ ............................................................ 421 TGATTAAGGATGAATTTGCTTGTGCGAGACCATAAGATCTGTTTTTCACTAAATTTTGCT 480 ............................................................ ............................................................ 481 CTTATTTTTTATATTGACATTTTTTTAAACATTTATTGTATTAATTTTTTTTATTCTTTC 540 ............................................................ ............................................................ 541 CGTTTGGATTAAGAAATTAAAACTGAAAATTTATGCCAGAAGAATAAAGATCGCTCTTTC 600 ............................................................ ............................................................ 601 TTTTTTGAAATATTTGGACTTTTATTGGAAAACCCAACTCTGGTTTTTGATATTGAAACT 660 ............................................................ ............................................................ 661 GGATATTTCACAGATAAAAAAGAATGCCTCCACAAAAGATCGAAACTGGCCACCAGGACA 720 .......................ATGCCTCCACAAAAGATCGAAACTGGCCACCAGGACA 37 .......................-M--P--P--Q--K--I--E--T--G--H--Q--D-- 12 721 CGGTCCATGATGTGGCCATGGATTACTATGGTAAGCGAATCGCCAGTGCCTCATCAGACA 780 38 CGGTCCATGATGTGGCCATGGATTACTATGGTAAGCGAATCGCCAGTGCCTCATCAGACA 97 13 T--V--H--D--V--A--M--D--Y--Y--G--K--R--I--A--S--A--S--S--D-- 32 781 CCACAATTAAGATAGCTGGGGTCAGCAACAATACCCATCAGCACTTAGCGACTTTGTCGG 840 98 CCACAATTAAGATAGCTGGGGTCAGCAACAATACCCATCAGCACTTAGCGACTTTGTCGG 157 33 T--T--I--K--I--A--G--V--S--N--N--T--H--Q--H--L--A--T--L--S-- 52 841 CTCACCAAGGACCAGTATGGCAGGTGGCTTGGGCTCACCCAAAGTTTGGCTCCTTACTTG 900 158 CTCACCAAGGACCAGTATGGCAGGTGGCTTGGGCTCACCCAAAGTTTGGCTCCTTACTTG 217 53 A--H--Q--G--P--V--W--Q--V--A--W--A--H--P--K--F--G--S--L--L-- 72 901 CTTCATGTTCTTATGATGGGCGTGTGATTATATGGAAGGAAGGCAATCAGAATGAATGGA 960 218 CTTCATGTTCTTATGATGGGCGTGTGATTATATGGAAGGAAGGCAATCAGAATGAATGGA 277 73 A--S--C--S--Y--D--G--R--V--I--I--W--K--E--G--N--Q--N--E--W-- 92 961 GCCAGGCTCATGTTTTTGAGGACCATAAGTCATCTGTTAATTCAATTGCTTGGGCTCCTC 1020 278 GCCAGGCTCATGTTTTTGAGGACCATAAGTCATCTGTTAATTCAATTGCTTGGGCTCCTC 337 93 S--Q--A--H--V--F--E--D--H--K--S--S--V--N--S--I--A--W--A--P-- 112 1021 ATGAACTGGGACTTTGTTTGGCATGTGGTTCTTCTGATGGAAATATATCAGTTTTCACTG 1080 338 ATGAACTGGGACTTTGTTTGGCATGTGGTTCTTCTGATGGAAATATATCAGTTTTCACTG 397 113 H--E--L--G--L--C--L--A--C--G--S--S--D--G--N--I--S--V--F--T-- 132 1081 CAAGGGCAGACGGAGGCTGGGACACTTCAAGGATTGACCAGGCTCACCCGGTTGGTGTAA 1140 398 CAAGGGCAGACGGAGGCTGGGACACTTCAAGGATTGACCAGGCTCACCCGGTTGGTGTAA 457 133 A--R--A--D--G--G--W--D--T--S--R--I--D--Q--A--H--P--V--G--V-- 152 1141 CTTCTGTTTCGTGGGCTCCATCAACGGCACCTGGGGCTCTTGTTGGTTCTGGTTTGCTTG 1200 458 CTTCTGTTTCGTGGGCTCCATCAACGGCACCTGGGGCTCTTGTTGGTTCTGGTTTGCTTG 517 153 T--S--V--S--W--A--P--S--T--A--P--G--A--L--V--G--S--G--L--L-- 172 1201 ACCCTGTTCAGAAACTTTGCTCAGGTGGCTGTGATAACACTGTAAAGGTGTGGAAGCTCT 1260 518 ACCCTGTTCAGAAACTTTGCTCAGGTGGCTGTGATAACACTGTAAAGGTGTGGAAGCTCT 577 173 D--P--V--Q--K--L--C--S--G--G--C--D--N--T--V--K--V--W--K--L-- 192 1261 ACAATGGAATCTGGAAGATGGACTGCTTTCCAGCTCTTCAAATGCATACTGATTGGGTAC 1320 578 ACAATGGAATCTGGAAGATGGACTGCTTTCCAGCTCTTCAAATGCATACTGATTGGGTAC 637 193 Y--N--G--I--W--K--M--D--C--F--P--A--L--Q--M--H--T--D--W--V-- 212 1321 GGGATGTTGCTTGGGCACCCAATTTGGGGTTGCCAAAATCTACTATTGCAAGTGCATCAC 1380 638 GGGATGTTGCTTGGGCACCCAATTTGGGGTTGCCAAAATCTACTATTGCAAGTGCATCAC 697 213 R--D--V--A--W--A--P--N--L--G--L--P--K--S--T--I--A--S--A--S-- 232 1381 AGGATGGGAAAGTAATTATATGGACTGTGGCCAAAGAAGGGGATCAGTGGGAAGGTAAAG 1440 698 AGGATGGGAAAGTAATTATATGGACTGTGGCCAAAGAAGGGGATCAGTGGGAAGGTAAAG 757 233 Q--D--G--K--V--I--I--W--T--V--A--K--E--G--D--Q--W--E--G--K-- 252 1441 TACTGCATGATTTTAATACCCCTGTCTGGAGGGTATCATGGTCACTGACAGGTAACATAT 1500 758 TACTGCATGATTTTAATACCCCTGTCTGGAGGGTATCATGGTCACTGACAGGTAACATAT 817 253 V--L--H--D--F--N--T--P--V--W--R--V--S--W--S--L--T--G--N--I-- 272 1501 TAGCTGTAGCTGATGGGAACAACAATGTGACCTTGTGGAAAGAAGCTGTAGACGGAGAGT 1560 818 TAGCTGTAGCTGATGGGAACAACAATGTGACCTTGTGGAAAGAAGCTGTAGACGGAGAGT 877 273 L--A--V--A--D--G--N--N--N--V--T--L--W--K--E--A--V--D--G--E-- 292 1561 GGCAACAGCTTGTTTGCTTCCCTTCAACAATGTGCCTTGTTGGCTTGCTGCATTTCCTCT 1620 878 GGCAACAGCTTGTTTGCTTCCCTTCAACAATGTGCCTTGTTGGCTTGCTGCATTTCCTCT 937 293 W--Q--Q--L--V--C--F--P--S--T--M--C--L--V--G--L--L--H--F--L-- 312 1621 AGCAAGCAACTGCAAGGACCCAAAGAATGGATGTTAGGACAAGGAATTCGGCGTGGGTTC 1680 938 AG.......................................................... 939 *-.......................................................... 312 1681 GTACGCAAGATAGTTGCGTCCATTTCGATGTCTGAACGCTGAAGAGTGAAGACCCTTGGC 1740 ............................................................ ............................................................ 1741 CCTTCTCCTTAACTTCCAAAGGCCCATTCTGTAAGACCCCAAAATTCTTCCTAGATATTC 1800 ............................................................ ............................................................ 1801 AACGCATATTCTCATTCCAAAAGCTATTTATGAGTTGGGTCGGCTCAAATTTCGGTTGGC 1860 ............................................................ ............................................................ 1861 ACTTCTAAAATTAAAATTCAGGTTCGGTTCAATATATTCGTTTAAATTATATTTATCATT 1920 ............................................................ ............................................................ 1921 TAAAATATTAATAAATTATA 1940 .................... ....................
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