Theobroma cacao Matina 1-6 (Theobroma_cacao_20110822) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Flavin-binding, kelch repeat, f box 1 isoform 1
Chromosome 2: 37,721,721-37,725,804 forward strand.
This transcript has 2 exons and is annotated with 16 domains and features.
This transcript is a product of gene TCM_011059 Show transcript tableHide transcript table
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1 TAGCACTCTAGTTTTTGAACATAGTGAAAGTCGGTTCTTACAGTATAGAGACCCACGTGC 60 .AGCACTCTAGTTTTTGAACATAGTGAAAGTCGGTTCTTACAGTATAGAGACCCACGTGC 59 .-S--T--L--V--F--E--H--S--E--S--R--F--L--Q--Y--R--D--P--R--A 20 61 TCAAAGACGGCACCCTTTGGTAGATCCTTTTGTTGTGTCTGAGATCCGAAGATGTCTTGA 120 60 TCAAAGACGGCACCCTTTGGTAGATCCTTTTGTTGTGTCTGAGATCCGAAGATGTCTTGA 119 20 --Q--R--R--H--P--L--V--D--P--F--V--V--S--E--I--R--R--C--L--E 40 121 GGAAGGTATTGTATTCCAAGGTGAGCTTCTGAATTTCAGGAAGGATGGTACTCCGTTAGT 180 120 GGAAGGTATTGTATTCCAAGGTGAGCTTCTGAATTTCAGGAAGGATGGTACTCCGTTAGT 179 40 --E--G--I--V--F--Q--G--E--L--L--N--F--R--K--D--G--T--P--L--V 60 181 GAACAGACTGAAACTTGCACCTATTCATGATGATGATCGAACAGTCACACACATTATTGG 240 180 GAACAGACTGAAACTTGCACCTATTCATGATGATGATCGAACAGTCACACACATTATTGG 239 60 --N--R--L--K--L--A--P--I--H--D--D--D--R--T--V--T--H--I--I--G 80 241 TATTCAAGTGTTTTCTGAAGCAAAAATAGATCTGAACCATGTATCATATCCGGTTTTCAA 300 240 TATTCAAGTGTTTTCTGAAGCAAAAATAGATCTGAACCATGTATCATATCCGGTTTTCAA 299 80 --I--Q--V--F--S--E--A--K--I--D--L--N--H--V--S--Y--P--V--F--K 100 301 AGAGGCTTGTAATCAGCAGTTGGATCAGTCAGCTAAATACTCTCATTTGAGCGAAAATCC 360 300 AGAGGCTTGTAATCAGCAGTTGGATCAGTCAGCTAAATACTCTCATTTGAGCGAAAATCC 359 100 --E--A--C--N--Q--Q--L--D--Q--S--A--K--Y--S--H--L--S--E--N--P 120 361 ACCATTCAGCCAGCATCAAGAAATATGTGGGATACTCCAACTCTCTGATGAAGTCTTGGC 420 360 ACCATTCAGCCAGCATCAAGAAATATGTGGGATACTCCAACTCTCTGATGAAGTCTTGGC 419 120 --P--F--S--Q--H--Q--E--I--C--G--I--L--Q--L--S--D--E--V--L--A 140 421 TCATAACATTTTATCACGTTTGACGCCAAGGGATGTTGCATCTATCGGGTCTGTCTGCAG 480 420 TCATAACATTTTATCACGTTTGACGCCAAGGGATGTTGCATCTATCGGGTCTGTCTGCAG 479 140 --H--N--I--L--S--R--L--T--P--R--D--V--A--S--I--G--S--V--C--R 160 481 AAGGGTACGCCAACTAACAAAGAATGAGCATGTGAGGAAGATGGTATGCCAAAATGCCTG 540 480 AAGGGTACGCCAACTAACAAAGAATGAGCATGTGAGGAAGATGGTATGCCAAAATGCCTG 539 160 --R--V--R--Q--L--T--K--N--E--H--V--R--K--M--V--C--Q--N--A--W 180 541 GGGAAGAGAAGTCACTGGTACATTAGAAATGATGACTAAGAAGTTGGGGTGGGGACGTCT 600 540 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CACTCTCTCGTGCCTGAATGGTTCATGGTTGGTGGTATTTGGGGGATGCGGAAGGCAAGG 900 840 CACTCTCTCGTGCCTGAATGGTTCATGGTTGGTGGTATTTGGGGGATGCGGAAGGCAAGG 899 280 --T--L--S--C--L--N--G--S--W--L--V--V--F--G--G--C--G--R--Q--G 300 901 ATTGCTCAATGATGTTTTTGTTCTTGACTTGGATGCCAAACAGCCTACATGGAAAGAAGT 960 900 ATTGCTCAATGATGTTTTTGTTCTTGACTTGGATGCCAAACAGCCTACATGGAAAGAAGT 959 300 --L--L--N--D--V--F--V--L--D--L--D--A--K--Q--P--T--W--K--E--V 320 961 TTCTGGTGGAACTCCTCCGCTCCCTAGATCATGGCATAGCTCTTGCACAATAGATGGCTC 1020 960 TTCTGGTGGAACTCCTCCGCTCCCTAGATCATGGCATAGCTCTTGCACAATAGATGGCTC 1019 320 --S--G--G--T--P--P--L--P--R--S--W--H--S--S--C--T--I--D--G--S 340 1021 TAAGTTGGTTGTGTCTGGTGGGTGCACAGACGCTGGGGTGCTTCTCAGTGATACATTTCT 1080 1020 TAAGTTGGTTGTGTCTGGTGGGTGCACAGACGCTGGGGTGCTTCTCAGTGATACATTTCT 1079 340 --K--L--V--V--S--G--G--C--T--D--A--G--V--L--L--S--D--T--F--L 360 1081 TTTGGATCTCACGACTGACAAGCCAAAGTGGAAAGAGATCCCAACATCATGGGCACCTCC 1140 1080 TTTGGATCTCACGACTGACAAGCCAAAGTGGAAAGAGATCCCAACATCATGGGCACCTCC 1139 360 --L--D--L--T--T--D--K--P--K--W--K--E--I--P--T--S--W--A--P--P 380 1141 ATCTAGGTTGGGCCAATCACTTTCGGTTTATGGTCGTACTAAAATTCTTATGTTTGGGGG 1200 1140 ATCTAGGTTGGGCCAATCACTTTCGGTTTATGGTCGTACTAAAATTCTTATGTTTGGGGG 1199 380 --S--R--L--G--Q--S--L--S--V--Y--G--R--T--K--I--L--M--F--G--G 400 1201 GCTTGCAAAGAGTGGGAACTTGCGATTGCGATCAGGTGAAGCCTACACCATTGATTTGGA 1260 1200 GCTTGCAAAGAGTGGGAACTTGCGATTGCGATCAGGTGAAGCCTACACCATTGATTTGGA 1259 400 --L--A--K--S--G--N--L--R--L--R--S--G--E--A--Y--T--I--D--L--E 420 1261 GGATGAAGAACCACATTGGAGGCAACTGGACTTTAGTGCCTTCACCAGCCTTGGCAGCCA 1320 1260 GGATGAAGAACCACATTGGAGGCAACTGGACTTTAGTGCCTTCACCAGCCTTGGCAGCCA 1319 420 --D--E--E--P--H--W--R--Q--L--D--F--S--A--F--T--S--L--G--S--Q 440 1321 AAGTGCTGTGGTACCTCCTCCTAGACTTGATCATGTTGCTGTAAGCATGCCTTGTGGGAG 1380 1320 AAGTGCTGTGGTACCTCCTCCTAGACTTGATCATGTTGCTGTAAGCATGCCTTGTGGGAG 1379 440 --S--A--V--V--P--P--P--R--L--D--H--V--A--V--S--M--P--C--G--R 460 1381 GATAATTATATTTGGTGGTTCCATTGCTGGGTTGCACTCTCCTTCTCAGCTTTTCCTTCT 1440 1380 GATAATTATATTTGGTGGTTCCATTGCTGGGTTGCACTCTCCTTCTCAGCTTTTCCTTCT 1439 460 --I--I--I--F--G--G--S--I--A--G--L--H--S--P--S--Q--L--F--L--L 480 1441 GGATCCTTCAGAGGAGAAACCATCATGGAGGACTCTCAATGTTCCTGGGCAACCACCAAA 1500 1440 GGATCCTTCAGAGGAGAAACCATCATGGAGGACTCTCAATGTTCCTGGGCAACCACCAAA 1499 480 --D--P--S--E--E--K--P--S--W--R--T--L--N--V--P--G--Q--P--P--K 500 1501 ATTTGCCTGGGGTCATAGTACCTGTGTGGTTGGAGGGACTAGGGTCCTGGTATTGGGTGG 1560 1500 ATTTGCCTGGGGTCATAGTACCTGTGTGGTTGGAGGGACTAGGGTCCTGGTATTGGGTGG 1559 500 --F--A--W--G--H--S--T--C--V--V--G--G--T--R--V--L--V--L--G--G 520 1561 ACACACTGGTGAGGAGTGGATACTCAACGAGTTGCATGAGTTGTGCTTAGCAAGCAGGCA 1620 1560 ACACACTGGTGAGGAGTGGATACTCAACGAGTTGCATGAGTTGTGCTTAGCAAGCAGGCA 1619 520 --H--T--G--E--E--W--I--L--N--E--L--H--E--L--C--L--A--S--R--Q 540 1621 GGACTCAGACTCATGATTCAAAACGGACTCATCAGCATTACGAAGACAACCGTGGAAGAA 1680 1620 GGACTCAGACTCATGA............................................ 1635 540 --D--S--D--S--*-............................................ 544 1681 ATTTTTTCTTTACAAGCACTCACTGAGGTCATTTCTTCCGCATTGTTTACTCAGACTCCT 1740 ............................................................ ............................................................ 1741 ATTTTTGACATGTTTGGCCTGGTGCATTGTGTTTTTGTTCAGATTGTGTCACTGTATAAA 1800 ............................................................ ............................................................ 1801 TGTCCCTTCTTAGTGTCTGTTCTGGTTGTACAATGTAAACATAATAGTGAGTGTATATTC 1860 ............................................................ ............................................................ 1861 AGTGTTTGTGATCCGACTAAATAAGTGTTGTGACTCTTTTTGTAGGTTAGATATCTTATA 1920 ............................................................ ............................................................ 1921 TATCAAAATGCCAATAGCTTGGGTATGAGAGTGGTGCATGTATTTCCTCTAATTTACTTT 1980 ............................................................ ............................................................ 1981 CATTTTTGGCCTATTTTCAAGGAATTAATTTTTGACCTGGTTTTGGCTGACAAATAAAAT 2040 ............................................................ ............................................................ 2041 GGTTCTTGAACTAGGAATGAATGAATATGGTGTATTTATAATTCAGAACACCTTGGTGGA 2100 ............................................................ ............................................................ 2101 TCACTTGGTTTCTTACGATCTCAAAAGCTGTGAGGGGACAAAGCTCTGGTGGAATCTTTC 2160 ............................................................ ............................................................ 2161 CAGGAAGTGAATTGAAGCAAAGGCTAAGAATTTTTCCATGGCGGAGATCATTTCCCCTAA 2220 ............................................................ ............................................................ 2221 TCAAGCAGGTATAGGAATTTCCAGCACAGGCATTGTCATACAGATCAAGAGTTGGTCTGC 2280 ............................................................ ............................................................ 2281 CAAGTTGCCACCTTTCAAGTTGAACATTCTCCAGTATCAATTCTGGTGCCGACAGTAATA 2340 ............................................................ ............................................................ 2341 TTATGAAGCCCTTCCAGCAAAGGCACCTTACTTTTAGTATGCCTACATGAGCTGTTATGT 2400 ............................................................ ............................................................ 2401 CAGAAATCTCCCCAGCTTTAGATTTCCAAGTTCCCCCTACCTTTCATTATTCTGGTCGGA 2460 ............................................................ ............................................................ 2461 AGATAACGAGGGACAAATGGTTGAGCCAGTTAGGGGGTGCAGTACTGCAAAGACTTTGCA 2520 ............................................................ ............................................................ 2521 GATGTGGCTTTGTTTTGTAATCGAGGAATAGATACCCCATTTGGAAGGAACTCACCTTTA 2580 ............................................................ ............................................................ 2581 GCTAAACTATGAATATGTTGCACATATAACTCGAAAACGATAGGTCCCCAAATTCTTGAT 2640 ............................................................ ............................................................ 2641 GGAGACAAGATTTGATCTGTTATAGGTCCTTGTCTTTATGAGACATTTCCCCACCTAGGT 2700 ............................................................ ............................................................ 2701 AGCTGCTTGTTCATGTCACCCGACCCCAGCTAATCTCCCTGCGACGTCTTTTCTAGTCAC 2760 ............................................................ ............................................................ 2761 TGCCGAGCTCTACATAAACAGCGTCAGGCTTTCGTCCGGGTCCAGCGCAGGGAAAGCTCT 2820 ............................................................ ............................................................ 2821 ACTACAACAACACCATATGCACAAGAGAGGCCGCTCCACGTTTCCCACCGAACTGGCCAT 2880 ............................................................ ............................................................ 2881 CGACCCGGTCCAGTCCTTATACTAGACCGGTAAGTAAATGATCCAGTCAAACTTGATTAA 2940 ............................................................ ............................................................ 2941 ACCCCTGGTTAAATTGGTTTGACATAATTTGGTTAACATTTAAAGATTTATATTAAATTA 3000 ............................................................ ............................................................ 3001 AAGTCACTTAATAGTCA 3017 ................. .................
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