Theobroma cacao Matina 1-6 (Theobroma_cacao_20110822) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein
Chromosome 1: 7,374,325-7,380,467 forward strand.
This transcript has 16 exons and is annotated with 27 domains and features.
This transcript is a product of gene TCM_001477 Show transcript tableHide transcript table
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1 ATAATTACATTACCTGTAATTATTAAAAAGTAACTAACCTCACTTAAGTACCGGCTATTT 60 ............................................................ ............................................................ 61 TGATAAAAATGAAAAACGTAGCGGTTCGGACCACCATTTAGGGTTTTAGGCTATATAACA 120 ............................................................ ............................................................ 121 AAACCTTTCGGCTCCCCGCATTCTGTTTTCGTTAATTTTTTTTCTTCTTTCAGTAATCAG 180 ............................................................ ............................................................ 181 TTTCACCTTGTATGTATCATATCTTCTGTTACCTATTTTTTTCAACTCAGCTTTTTACGT 240 ............................................................ ............................................................ 241 TCTAATGCTTTTCTTTTTCTCTTTCTGTTAAACAAAATTTAGATAAGAAGGCAACCTTCA 300 ............................................................ ............................................................ 301 AGAATGATATCAGCAATTGCATGGGTGCCAAAAGGGGCGTCAAAGCCTGAACCAGAAGTG 360 ...ATGATATCAGCAATTGCATGGGTGCCAAAAGGGGCGTCAAAGCCTGAACCAGAAGTG 57 ...-M--I--S--A--I--A--W--V--P--K--G--A--S--K--P--E--P--E--V- 19 361 GCTGAGTTACCTTCCAAAGAAGAAATTGAAGAACTGATTAAGACCGGTGCTTTGGAGAGA 420 58 GCTGAGTTACCTTCCAAAGAAGAAATTGAAGAACTGATTAAGACCGGTGCTTTGGAGAGA 117 20 -A--E--L--P--S--K--E--E--I--E--E--L--I--K--T--G--A--L--E--R- 39 421 AGTGAAGATAATGGTAGTGAGGATGAAGATCAAGATATGGATGCTGATGCTGAGAAGCAA 480 118 AGTGAAGATAATGGTAGTGAGGATGAAGATCAAGATATGGATGCTGATGCTGAGAAGCAA 177 40 -S--E--D--N--G--S--E--D--E--D--Q--D--M--D--A--D--A--E--K--Q- 59 481 ACCGGTGAAGTTGCCCAAGCACTTGCTGTGGCAGACGCCCTTGGAAAAACTTCCAATAAC 540 178 ACCGGTGAAGTTGCCCAAGCACTTGCTGTGGCAGACGCCCTTGGAAAAACTTCCAATAAC 237 60 -T--G--E--V--A--Q--A--L--A--V--A--D--A--L--G--K--T--S--N--N- 79 541 AAGTCAGGGGCACAATTAGAAGATCTTACAGATGGGTTGAAAGAGCTTGACATGGAAAAT 600 238 AAGTCAGGGGCACAATTAGAAGATCTTACAGATGGGTTGAAAGAGCTTGACATGGAAAAT 297 80 -K--S--G--A--Q--L--E--D--L--T--D--G--L--K--E--L--D--M--E--N- 99 601 TATGACGAAGAGGATGATGGTATTGAGCTATTTAGCAAGGGCCTTGGTGACCTTTATTAT 660 298 TATGACGAAGAGGATGATGGTATTGAGCTATTTAGCAAGGGCCTTGGTGACCTTTATTAT 357 100 -Y--D--E--E--D--D--G--I--E--L--F--S--K--G--L--G--D--L--Y--Y- 119 661 CCAAGCAATGACATAGATCCATATTTAAAGGATCAGGATGATAATGATTCAGAAGAGATT 720 358 CCAAGCAATGACATAGATCCATATTTAAAGGATCAGGATGATAATGATTCAGAAGAGATT 417 120 -P--S--N--D--I--D--P--Y--L--K--D--Q--D--D--N--D--S--E--E--I- 139 721 GAGGACATGACCATTAGACCCATGGATGCTGTCGTGGTTTGTGCACGCAATGAAGATGAT 780 418 GAGGACATGACCATTAGACCCATGGATGCTGTCGTGGTTTGTGCACGCAATGAAGATGAT 477 140 -E--D--M--T--I--R--P--M--D--A--V--V--V--C--A--R--N--E--D--D- 159 781 GTCAGCCATCTTGAGGTTTGGATATATGAGGATTCAGACGATGGTGATTCAAACATGTAT 840 478 GTCAGCCATCTTGAGGTTTGGATATATGAGGATTCAGACGATGGTGATTCAAACATGTAT 537 160 -V--S--H--L--E--V--W--I--Y--E--D--S--D--D--G--D--S--N--M--Y- 179 841 GTTCACCATGATATCATCATTTCAGCATTTCCCCTTTGCACTGCATGGCTTGACTTCCCA 900 538 GTTCACCATGATATCATCATTTCAGCATTTCCCCTTTGCACTGCATGGCTTGACTTCCCA 597 180 -V--H--H--D--I--I--I--S--A--F--P--L--C--T--A--W--L--D--F--P- 199 901 CTTAAAGGGGGAGAAAAAGGGAATTTTGTGGCTGTTGGTTCAATGGAGCCGTCGATCGAA 960 598 CTTAAAGGGGGAGAAAAAGGGAATTTTGTGGCTGTTGGTTCAATGGAGCCGTCGATCGAA 657 200 -L--K--G--G--E--K--G--N--F--V--A--V--G--S--M--E--P--S--I--E- 219 961 ATATGGGACCTTGACATTATCGATGAAGTGCAACCATGTGTGGTATTAGGTGGTGCAGTG 1020 658 ATATGGGACCTTGACATTATCGATGAAGTGCAACCATGTGTGGTATTAGGTGGTGCAGTG 717 220 -I--W--D--L--D--I--I--D--E--V--Q--P--C--V--V--L--G--G--A--V- 239 1021 GAGAAAAAGACAAAAAAAGGAAAAAAGAAATCACAATACAAGGAGGGCAGTCATACTGGT 1080 718 GAGAAAAAGACAAAAAAAGGAAAAAAGAAATCACAATACAAGGAGGGCAGTCATACTGGT 777 240 -E--K--K--T--K--K--G--K--K--K--S--Q--Y--K--E--G--S--H--T--G- 259 1081 CCCGTTCTTGGTCTTGCTTGGAACAAGGAGTACAGCAATATCCTTGCCAGTGCAAGTGCG 1140 778 CCCGTTCTTGGTCTTGCTTGGAACAAGGAGTACAGCAATATCCTTGCCAGTGCAAGTGCG 837 260 -P--V--L--G--L--A--W--N--K--E--Y--S--N--I--L--A--S--A--S--A- 279 1141 GACAAACAAGTTAAGATTTGGGATATGGCTGCTGGAAAATGCAGCATAACCATGGAGCAT 1200 838 GACAAACAAGTTAAGATTTGGGATATGGCTGCTGGAAAATGCAGCATAACCATGGAGCAT 897 280 -D--K--Q--V--K--I--W--D--M--A--A--G--K--C--S--I--T--M--E--H- 299 1201 CATGAGGACAAGGTTCAAGCAGTTGCTTGGAATCACCACTCGCCACAAGTTCTTCTTAGT 1260 898 CATGAGGACAAGGTTCAAGCAGTTGCTTGGAATCACCACTCGCCACAAGTTCTTCTTAGT 957 300 -H--E--D--K--V--Q--A--V--A--W--N--H--H--S--P--Q--V--L--L--S- 319 1261 GGGTCTTTTGATCGTTCGGTTGTCATGAAGGATGGGAGAGTACCATCTCATTCTGGTTTA 1320 958 GGGTCTTTTGATCGTTCGGTTGTCATGAAGGATGGGAGAGTACCATCTCATTCTGGTTTA 1017 320 -G--S--F--D--R--S--V--V--M--K--D--G--R--V--P--S--H--S--G--L- 339 1321 AAGTGGTCAGTCACTTCTGAGGTTGAATGCTTGGCATGGGATCCACACACTGAGTACTCA 1380 1018 AAGTGGTCAGTCACTTCTGAGGTTGAATGCTTGGCATGGGATCCACACACTGAGTACTCA 1077 340 -K--W--S--V--T--S--E--V--E--C--L--A--W--D--P--H--T--E--Y--S- 359 1381 TTTGTGGTGAGTCTTGAAGATGGTACAGTCAGAGGTTATGATATTCGAGCTGCCAAATCC 1440 1078 TTTGTGGTGAGTCTTGAAGATGGTACAGTCAGAGGTTATGATATTCGAGCTGCCAAATCC 1137 360 -F--V--V--S--L--E--D--G--T--V--R--G--Y--D--I--R--A--A--K--S- 379 1441 AATCCATCTTCTGAGTTGAAACCAAGTTTTACTCTCCATGCACATGACAAGGCTGCTTGC 1500 1138 AATCCATCTTCTGAGTTGAAACCAAGTTTTACTCTCCATGCACATGACAAGGCTGCTTGC 1197 380 -N--P--S--S--E--L--K--P--S--F--T--L--H--A--H--D--K--A--A--C- 399 1501 ACCCTTTCATATAATCCTAAAGCACCAAATCTGCTTGCAACTGGATCCATGGATAAAATG 1560 1198 ACCCTTTCATATAATCCTAAAGCACCAAATCTGCTTGCAACTGGATCCATGGATAAAATG 1257 400 -T--L--S--Y--N--P--K--A--P--N--L--L--A--T--G--S--M--D--K--M- 419 1561 GTAAAACTTTGGGATTTATCAAACAATCAACCTTCATGTGTTGCATCCAGAAATCCTAAA 1620 1258 GTAAAACTTTGGGATTTATCAAACAATCAACCTTCATGTGTTGCATCCAGAAATCCTAAA 1317 420 -V--K--L--W--D--L--S--N--N--Q--P--S--C--V--A--S--R--N--P--K- 439 1621 GCAGGAGCTGTCTTTTCAATTTCCTTCTCAGAAGATAGTCCTTTTTTGCTGGCTATTGGA 1680 1318 GCAGGAGCTGTCTTTTCAATTTCCTTCTCAGAAGATAGTCCTTTTTTGCTGGCTATTGGA 1377 440 -A--G--A--V--F--S--I--S--F--S--E--D--S--P--F--L--L--A--I--G- 459 1681 GGCTCAAAGGGAAAACTGGGAGTTTGGGATACATTATCTGATGCAGGCGTCTCAGGAAAA 1740 1378 GGCTCAAAGGGAAAACTGGGAGTTTGGGATACATTATCTGATGCAGGCGTCTCAGGAAAA 1437 460 -G--S--K--G--K--L--G--V--W--D--T--L--S--D--A--G--V--S--G--K- 479 1741 TTTGGGCACTACAGCCAGCCGAACAGACCCAAAACATAACTGGGAAGGTGAAAGTTTTTG 1800 1438 TTTGGGCACTACAGCCAGCCGAACAGACCCAAAACATAA..................... 1476 480 -F--G--H--Y--S--Q--P--N--R--P--K--T--*-..................... 491 1801 TTGTTTCTCTGAGAGTTTGTATTTATGTGAGGAACAGTTTCCATGGGTTGCAAGATAAGT 1860 ............................................................ ............................................................ 1861 TTTCATGGTTCTGAAATTATTTTTATGTTGTTTTTGCCCCTATTTTAGGGAGTATAATAT 1920 ............................................................ ............................................................ 1921 ATAATTCAATCCATAGAAATTCTGTAGCTGTATTATGCATGGTTAAAAAGGTCCAGATAT 1980 ............................................................ ............................................................ 1981 AGAGGAAATGAATGCTTTGCTTTGAAGTTGAAGGGAAGTCTCTAAGATGATTCGAGCTTC 2040 ............................................................ ............................................................ 2041 ATTTCATAGTGTTGTTGAACAAATGACAAAACATTTTCCTTATAGCGTGAATAAAGAGGC 2100 ............................................................ ............................................................ 2101 CTGCGTGAAAGCTCTGCATATCAACGAGCTTAACCTTTGGGCTTAAGCTAGTACCAGTTG 2160 ............................................................ ............................................................ 2161 TGAAGACTTCGGTTGACTTGAAAGGTGAACAGAGTGAATCATAACCAAGGCAAAAGGTTA 2220 ............................................................ ............................................................ 2221 AAGTCTACTTAAAAATATAAACGGAGTCCATCT 2253 ................................. .................................
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