Theobroma cacao Matina 1-6 (Theobroma_cacao_20110822) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein isoform 2
Chromosome 1: 6,457,275-6,461,264 reverse strand.
This transcript has 8 exons and is annotated with 31 domains and features.
This transcript is a product of gene TCM_001311 Show transcript tableHide transcript table
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1 CAAAATAAAAGTGCTGAAAAACAAAATTGTCAACGTAATTCAAGTTGGGCCTGATGTTGG 60 .....................................................ATGTTGG 7 .....................................................-M--L-- 2 61 GCTCAACTTCCAAACGGCCCAAATCTAAAAATGGACTCTACATAGCCCATTTGAACAAAA 120 8 GCTCAACTTCCAAACGGCCCAAATCTAAAAATGGACTCTACATAGCCCATTTGAACAAAA 67 3 G--S--T--S--K--R--P--K--S--K--N--G--L--Y--I--A--H--L--N--K-- 22 121 CCGAATTCCCTCATCAGTGTCTCCGGCTGCTGCCGGGTTGCCAAGGAAAAGACCGAAATA 180 68 CCGAATTCCCTCATCAGTGTCTCCGGCTGCTGCCGGGTTGCCAAGGAAAAGACCGAAATA 127 23 T--E--F--P--H--Q--C--L--R--L--L--P--G--C--Q--G--K--D--R--N-- 42 181 TGAGTGTGTCGGACCTGCCAAGGAAAGAAGCGAACGTGCTAAAAGGCCACGAAGGTGCAG 240 128 TGAGTGTGTCGGACCTGCCAAGGAAAGAAGCGAACGTGCTAAAAGGCCACGAAGGTGCAG 187 43 M--S--V--S--D--L--P--R--K--E--A--N--V--L--K--G--H--E--G--A-- 62 241 TATTAGCGGCGAGGTTCAACAGCGACGGCAATTATTGCCTGAGCTGCGGCAAAGACCGCA 300 188 TATTAGCGGCGAGGTTCAACAGCGACGGCAATTATTGCCTGAGCTGCGGCAAAGACCGCA 247 63 V--L--A--A--R--F--N--S--D--G--N--Y--C--L--S--C--G--K--D--R-- 82 301 CCATCCGTCTTTGGAACCCACACCGCGGCATCCACATTAAAACCTACAAATCTCACGGCC 360 248 CCATCCGTCTTTGGAACCCACACCGCGGCATCCACATTAAAACCTACAAATCTCACGGCC 307 83 T--I--R--L--W--N--P--H--R--G--I--H--I--K--T--Y--K--S--H--G-- 102 361 GCGAAGTCCGCGACGTCCACGTCACCCCAGATAACTCCAAGTTGTGTTCTTGCGGTGGGG 420 308 GCGAAGTCCGCGACGTCCACGTCACCCCAGATAACTCCAAGTTGTGTTCTTGCGGTGGGG 367 103 R--E--V--R--D--V--H--V--T--P--D--N--S--K--L--C--S--C--G--G-- 122 421 ACAGACAGATTTTCTACTGGGATGTCTCAACTGGTCGTGTTATTCGCAAGTTTCGAGGCC 480 368 ACAGACAGATTTTCTACTGGGATGTCTCAACTGGTCGTGTTATTCGCAAGTTTCGAGGCC 427 123 D--R--Q--I--F--Y--W--D--V--S--T--G--R--V--I--R--K--F--R--G-- 142 481 ACGATGGCGAGGTGAATGCAGTAAAGTTTAATGAGTATGCATCAGTGGTAGTATCTGCAG 540 428 ACGATGGCGAGGTGAATGCAGTAAAGTTTAATGAGTATGCATCAGTGGTAGTATCTGCAG 487 143 H--D--G--E--V--N--A--V--K--F--N--E--Y--A--S--V--V--V--S--A-- 162 541 GCTATGATCGGTCCTTGCGTGCTTGGGACTGCAGGTCTCACAACACTGAGCCTATACAGA 600 488 GCTATGATCGGTCCTTGCGTGCTTGGGACTGCAGGTCTCACAACACTGAGCCTATACAGA 547 163 G--Y--D--R--S--L--R--A--W--D--C--R--S--H--N--T--E--P--I--Q-- 182 601 TAATTGACTCATTTTTGGACACTGTCATGTCTGTGTGTTTAACAAATACTGAAATTATTG 660 548 TAATTGACTCATTTTTGGACACTGTCATGTCTGTGTGTTTAACAAATACTGAAATTATTG 607 183 I--I--D--S--F--L--D--T--V--M--S--V--C--L--T--N--T--E--I--I-- 202 661 GTGGGAGTGTTGATGGAACTGTTCGAACATTTGATATTCGTATTGGTAGAGAAATATCAG 720 608 GTGGGAGTGTTGATGGAACTGTTCGAACATTTGATATTCGTATTGGTAGAGAAATATCAG 667 203 G--G--S--V--D--G--T--V--R--T--F--D--I--R--I--G--R--E--I--S-- 222 721 ATGACTTGGGGCAACCTGTCAACTGTATCTCAATGTCAAATGATGGTAACTGCATATTAG 780 668 ATGACTTGGGGCAACCTGTCAACTGTATCTCAATGTCAAATGATGGTAACTGCATATTAG 727 223 D--D--L--G--Q--P--V--N--C--I--S--M--S--N--D--G--N--C--I--L-- 242 781 CCAGTTGCTTGGATTCTACTTTACGCCTTTTGGACCGATCCACAGGTGAATTATTGCAAG 840 728 CCAGTTGCTTGGATTCTACTTTACGCCTTTTGGACCGATCCACAGGTGAATTATTGCAAG 787 243 A--S--C--L--D--S--T--L--R--L--L--D--R--S--T--G--E--L--L--Q-- 262 841 AATATAAAGGACATGCTTGCAAGTCCTATAAAATGGATTGCTGCCTAACCAACACTGACG 900 788 AATATAAAGGACATGCTTGCAAGTCCTATAAAATGGATTGCTGCCTAACCAACACTGACG 847 263 E--Y--K--G--H--A--C--K--S--Y--K--M--D--C--C--L--T--N--T--D-- 282 901 CGCATGTAACTAGTGGATCTGAGGATGGCTCAATTTTCTTCTGGGATCTGGTAGATGCAT 960 848 CGCATGTAACTAGTGGATCTGAGGATGGCTCAATTTTCTTCTGGGATCTGGTAGATGCAT 907 283 A--H--V--T--S--G--S--E--D--G--S--I--F--F--W--D--L--V--D--A-- 302 961 CTGTGGTTTCAAAATTCCAAGCTCATGCATCTGTGGTAACAAGCGTGAGTTACCATCCAA 1020 908 CTGTGGTTTCAAAATTCCAAGCTCATGCATCTGTGGTAACAAGCGTGAGTTACCATCCAA 967 303 S--V--V--S--K--F--Q--A--H--A--S--V--V--T--S--V--S--Y--H--P-- 322 1021 AAGACAATTGTTTAATAACCTCCTCTGTGGATGGCACTGTTCGAGTTTGGAAAACATGAG 1080 968 AAGACAATTGTTTAATAACCTCCTCTGTGGATGGCACTGTTCGAGTTTGGAAAACATGA. 1026 323 K--D--N--C--L--I--T--S--S--V--D--G--T--V--R--V--W--K--T--*-. 341 1081 ATTATGGAACAATTAAGCTCTGCGAGACTGCATTTGTTAGGATAGAATTAATACTGTTGA 1140 ............................................................ ............................................................ 1141 AAGAATTTTGGAGGTGCAGTACCTGACATTTTGCTTACTTCGTAAATTGTTGTTTTATGG 1200 ............................................................ ............................................................ 1201 CTGAACCTGATATTTCTCTCTAGCATTTATACATGAATGAACTTCTTTGGTTTGTGAGAA 1260 ............................................................ ............................................................ 1261 TTCTCGCATGGTCCTCATATCTTGTTTAGAACTCTTTTAGTATAAGAAGATTCCTATAGA 1320 ............................................................ ............................................................ 1321 AATTGGACCCTGGAACAGAAGAAAAAATTCTTCTGTTATTTGGTATCATCTCCTTGATGC 1380 ............................................................ ............................................................ 1381 ATTTATGATTTTAAGAGCAGCTACATTAGCAACTGTAATGCGGTATATTTGCCACTTGTG 1440 ............................................................ ............................................................ 1441 TGCCATCTCTCTACGCAATACTTTCTGACTACATATGAAAGTTGGACTCAGACACAGTCT 1500 ............................................................ ............................................................ 1501 GCCTTATATTTTCCCAAAACGTCACAGGTGATGAGAAAATTAACAAAATACTGACACTGT 1560 ............................................................ ............................................................ 1561 CAATCTCTTTCTCCAGTTATTGCTGGATATTCTGAACATGAAGATATCTTTTGAACCACT 1620 ............................................................ ............................................................ 1621 TATAAAGTTCAAGAAATTGT 1640 .................... ....................
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