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Theobroma cacao Matina 1-6 (Theobroma_cacao_20110822)
Description

Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B prime gamma, putative isoform 1

Location
About this transcript

This transcript has 4 exons and is annotated with 25 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene TCM_002153 Show transcript tableHide transcript table

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  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-EOX9330910063425aa
 
Protein coding
A0A061DKK3 Ensembl Canonical
-EOX93310927308aa
 
Protein coding
A0A061DKU6 -
Markup
  • loaded
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  • No.
  • Exon / Intron
  • Start
  • End
  • Start Phase
  • End Phase
  • Length
  • Sequence
No.Exon / IntronStartEndStart PhaseEnd PhaseLengthSequence
5' upstream sequence
..........cgtggatataacatcccaaaaacgcagccgttttgataactccgagttat
1EOX93309-112,018,42412,017,75102674
AAGAATAAAGACGCAAAAGAGAAGCAATTCTAATCCGATCAAGAAAGCAAAGCACTGCAG
CAGACAACTGTACAACTTATAAAACAAGAGTTGCAAGCCCACCCCATTTACTTTATCACA
GTTTCGAAGATACTCGAGAAAAAAAAAAAAAACGAAAAAACGAATTCGACAATGGAGCGC
GAAACGCAGCAGCAAGGAATTCCCAACAACCCAACCGCCAATCAAAACGCAGCTTTAATC
AACTCCTTTATCGAAATCACCTCTTCTTCCAAGGAAGAAGCCCTCTTCTTCTTAGAATCC
CACCAGTGGGACCTCGACGCCGCCGTTTCGACTTTCCTCGACAACAACTCCACCGCAACC
ACCGCTGCACACCAACCGCACCCGATCGCACCTCCACCTTCCCGCGACCTCAATAATTCC
CCTACTCCCTCGCCGTCCGATTCCCCTGATTACTCTCCCTCACAATCGCCTTCCCGCTCT
CGCTCCCCTTCCCCTGTCCGCCCCTCTCGTGCCCCTTACCAGCTGCGGTCCCGCCGCAAC
GCTGATAAGAAACCGTCTGGAAGCAATAACGCTCGTGGCGTTCGGACCCTCGCGGATCTG
AACCGGACTCCCCCTGGTGGGTCCGACAGCGATTCGGATGAAGCCCAAGACTATTATACT
GGTGGTGAAAAAAG                                              
 Intron 1-212,017,75012,017,649102
gtttaatttttaactccttttaaaa..........cttaattggttatttgggtgagcag
2EOX93309-212,017,64812,017,35720292
TGGGATGGTGATTCGAGATCCTTCCAAGCATAATGATGTGGATTCGATATTTAATCAAGC
GAGACAAGCGGGAGCTGTGGAAGGATCTGATGATTATTTCCGACCATCGTCGTCGAGCAC
GAGAAGCTTCACTGGAACGGCGAGATTACTCTCTGGAGAAACCGTGGCACCTGCTCCCCC
CCCACCACCTGAAGTTGTCACTCACAATGTTACTTTTTGGAGGAATGGGTTTACCGTTGA
TGATGGGCCGTTGCGTCGCTTGGACGATCCTGCCAATGCTTCCTTCTTGGAG        
 Intron 2-312,017,35612,016,922435
gtaataacaatgcacaatttgctct..........tattctcaattgcctttgaatgcag
3EOX93309-312,016,92112,016,8260096
AGTGTGATGAACTCTGAATGCCCGAAAGAGCTTGAACCAACTGATAGGAGTACAAAATTG
GATCTTCACCTCTTTAGGCGGGATGAAAACTACTCT                        
 Intron 3-412,016,82512,016,73096
gtgtgtcttttatatctcctcttat..........tcttgtgttcttttttttgaagcag
4EOX93309-412,016,72912,007,729019,001
GAACCAAAGAAGCACCAAAGTGTATTTCAGGGTGTTGGGAGAACTCTAGGCAGTAGCAGC
AGCCCCAGCCTTACTGCATCTGAGCCAACTGCTTCTGCCAGTAGTATCATCACTGCACCA
GTGCCATCTATGGGCCTGGTTGTGGATTCATCATTGCCAACAACCTCTATTCAGCTGAGG
TTAGCAGATGGTACACGCATGGTCTCGCGCTTCAACTACCATCATACCATCAGAGACATC
CGTGGCTTCATTGATGCATCAAGACCTGGTGGAGCAAGGAACTACCAGTTGCTGACAATG
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CGTTTGATTGGTAAAAAAGAAATGTTTCTTTTTCAAATTCTCCATCCCACCGGACCCTCT
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AATAGCAGGGACACAGAAAGAAAACAGTACAGCCACAGAGCAAGATATGCCATCTCTTGA
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AAACAAATAAATAAAAATTCCTTGGGAATAAAGGGAGAATGGCTTAGCCATTCCCCCAAC
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TAAATTTTATTAAGTTTTGGAAAGAAAGATTTTTTGTAAAAAAGCATTTGTAATGTCCTA
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GAACAGTTACACTACTTCTTGAGTATAGTAGCATTTCCTCGGTAGCTAAACATATTTGGA
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TGGGTTTGGGTGTGAAAAGATACTTTTGTTCATCAAGTGAAAATTATATTTGTTCAGGGG
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AAGTTGGATTTTATGTTAATCCATAATAGCCATGAAACAGTTTCCAAAATTGAGTCAATT
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TTGACGTAAAATAATTTTCTAAGAAACGTTTTCAAGACTTATACTTATTTGGAAGACGAA
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TAAAATGTTTTGCGTTTTCAAGAGGTGTAAGATATTTTTTAGAAAATAGAAAAAAATGCT
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TTTTATTTAAAAATTGAACAAATCTTTCTAATAATTGTAATAAAAAATATTTTAACTATC
GTCATTTGATAAATACATATTTATAAATATATGTTTTTTTATGTTTTATACAATTGATTA
ACATTGATATTTTTATAGTGTTATAGTAAAAAATTGATGAGATGGAAATTATTTTAGATT
TTATAAATTAAATTAATTTAATTGTGAAAGTTATATTTATTATTCAGTGAACATTTTTAC
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T                                                           
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