Solanum tuberosum (SolTub_3.0)
Description

OTU domain-containing protein [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG402034099]

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This transcript has 8 exons and is annotated with 9 domains and features.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-PGSC0003DMT4000845041039278aa
 
Protein coding
M1D7U3 Ensembl Canonical
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     1 GAGAAGTGTGCAATTTTCCGTGGAGGATAAAAGAGAGACCGTAACATAACACCAGTCGCC     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 GGTCGGCGTTTGACAGACCAACTGAGAAATAACCAATCGACGAGATGGCCAAAATGAAGC    120
       ............................................ATGGCCAAAATGAAGC     16
       ............................................-M--A--K--M--K--      5

                                                                          
   121 ATCAAAAATCCAAACCTAACAAACAATCTCATGCTAAAAAGCACGGAAAGCAGACTGATA    180
    17 ATCAAAAATCCAAACCTAACAAACAATCTCATGCTAAAAAGCACGGAAAGCAGACTGATA     76
     6 H--Q--K--S--K--P--N--K--Q--S--H--A--K--K--H--G--K--Q--T--D--     25

                                                                          
   181 TTTCTGAATTTCGAGCTCAGCTTGATGCATTGGGCTTAAAGATTATACAAGTGACGGCAG    240
    77 TTTCTGAATTTCGAGCTCAGCTTGATGCATTGGGCTTAAAGATTATACAAGTGACGGCAG    136
    26 I--S--E--F--R--A--Q--L--D--A--L--G--L--K--I--I--Q--V--T--A--     45

                                                                          
   241 ATGGAAATTGTTTCTTCAGGGCATTAGGTGATCAGTTGGAAGGCAATGAGGAGGAGCATG    300
   137 ATGGAAATTGTTTCTTCAGGGCATTAGGTGATCAGTTGGAAGGCAATGAGGAGGAGCATG    196
    46 D--G--N--C--F--F--R--A--L--G--D--Q--L--E--G--N--E--E--E--H--     65

                                                                          
   301 AGAAATATCGAGCTATGACTGTAAAATTTATCAGGAATAACCGTGATACGTTTGAGCCTT    360
   197 AGAAATATCGAGCTATGACTGTAAAATTTATCAGGAATAACCGTGATACGTTTGAGCCTT    256
    66 E--K--Y--R--A--M--T--V--K--F--I--R--N--N--R--D--T--F--E--P--     85

                                                                          
   361 TTATTGAAGATGATGTACCATTTGATGAATATTGTGAGTCCATGGAGAAGGATGGCACTT    420
   257 TTATTGAAGATGATGTACCATTTGATGAATATTGTGAGTCCATGGAGAAGGATGGCACTT    316
    86 F--I--E--D--D--V--P--F--D--E--Y--C--E--S--M--E--K--D--G--T--    105

                                                                          
   421 GGGCTGGACATATGGAATTACAAGCAGCTTCTCTTGTTACTCATACCAATATATGCATTC    480
   317 GGGCTGGACATATGGAATTACAAGCAGCTTCTCTTGTTACTCATACCAATATATGCATTC    376
   106 W--A--G--H--M--E--L--Q--A--A--S--L--V--T--H--T--N--I--C--I--    125

                                                                          
   481 ACCGACATATGTCACCTCGCTGGTACATACAGAATTTTGACAACCGTGAATCTCGGATGC    540
   377 ACCGACATATGTCACCTCGCTGGTACATACAGAATTTTGACAACCGTGAATCTCGGATGC    436
   126 H--R--H--M--S--P--R--W--Y--I--Q--N--F--D--N--R--E--S--R--M--    145

                                                                          
   541 TTCATCTTTCTTATCATGACGGAGAGCATTACAATAGCATCCGGCTAAGGGAAGATTCTT    600
   437 TTCATCTTTCTTATCATGACGGAGAGCATTACAATAGCATCCGGCTAAGGGAAGATTCTT    496
   146 L--H--L--S--Y--H--D--G--E--H--Y--N--S--I--R--L--R--E--D--S--    165

                                                                          
   601 GCACTGGACCAGCTAGCCCGATTATTATCAAGGCTGATGCTGATCTTTCAGCAAAATCTC    660
   497 GCACTGGACCAGCTAGCCCGATTATTATCAAGGCTGATGCTGATCTTTCAGCAAAATCTC    556
   166 C--T--G--P--A--S--P--I--I--I--K--A--D--A--D--L--S--A--K--S--    185

                                                                          
   661 GTGAATCTATAGCTGCTGCCAAGTCTAAGGGAGACACTAGTCGGAATATGGTTCCAGTAG    720
   557 GTGAATCTATAGCTGCTGCCAAGTCTAAGGGAGACACTAGTCGGAATATGGTTCCAGTAG    616
   186 R--E--S--I--A--A--A--K--S--K--G--D--T--S--R--N--M--V--P--V--    205

                                                                          
   721 GATCAGTCAAAATGGTTATGGCTGGAAGTGGGTGTGATAACAAACAAAAAGTGGAGCAGG    780
   617 GATCAGTCAAAATGGTTATGGCTGGAAGTGGGTGTGATAACAAACAAAAAGTGGAGCAGG    676
   206 G--S--V--K--M--V--M--A--G--S--G--C--D--N--K--Q--K--V--E--Q--    225

                                                                          
   781 TTTTACGACAAGTTGGTGGTGATGTTGATGCTGCAATAGAATTTCTAATCGCAGAACAAG    840
   677 TTTTACGACAAGTTGGTGGTGATGTTGATGCTGCAATAGAATTTCTAATCGCAGAACAAG    736
   226 V--L--R--Q--V--G--G--D--V--D--A--A--I--E--F--L--I--A--E--Q--    245

                                                                          
   841 GATCTGAGGACCAGTTAAATGCAAATGATAACATTTCTTCTCTGGCAAGCACTTCACAAG    900
   737 GATCTGAGGACCAGTTAAATGCAAATGATAACATTTCTTCTCTGGCAAGCACTTCACAAG    796
   246 G--S--E--D--Q--L--N--A--N--D--N--I--S--S--L--A--S--T--S--Q--    265

                                                                          
   901 GTAATGGCAAGTCAGTTCTTTTCCACTTGCTTTTAAAATAATTATGCATATTGCGTCTCG    960
   797 GTAATGGCAAGTCAGTTCTTTTCCACTTGCTTTTAAAATAA...................    837
   266 G--N--G--K--S--V--L--F--H--L--L--L--K--*-...................    278

                                                                          
   961 CTGAGATTGCAGTCAATGTAAAGTCTGGTTTTCATAATCATCAGGGTGTCCCAAGCACAT   1020
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1021 GAAAAATAGAAACAGGAAG                                            1039
       ...................                                                
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