Transcript: PGSC0003DMT400084504
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Description
OTU domain-containing protein [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG402034099]
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- PGSC0003DMT400084504 1039 278aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1D7U3 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 G AGAAGTGTGCAATTTTCCGTGGAGGATAAAAGAGAGACCGTAACATAACACCAGTCGCC 60
............................................................
............................................................
61 GGTCGGCGTTTGACAGACCAACTGAGAAATAACCAATCGACGAG ATG GCC AAA ATG AAG C 120
............................................ATGGCCAAAATGAAGC 16
............................................-M--A--K--M--K-- 5
121 AT CAA AAA TCC AAA CCT AAC AAA CAA TCT CAT GCT AAA AAG CAC GGA AAG CAG ACT GAT A 180
17 ATCAAAAATCCAAACCTAACAAACAATCTCATGCTAAAAAGCACGGAAAGCAGACTGATA 76
6 H--Q--K--S--K--P--N--K--Q--S--H--A--K--K--H--G--K--Q--T--D-- 25
181 TT TCT GAA TTT CGA GCT CAG CTT GAT GCA TTG GGC TTA AAG ATT ATA CAA GTG ACG GCA G 240
77 TTTCTGAATTTCGAGCTCAGCTTGATGCATTGGGCTTAAAGATTATACAAGTGACGGCAG 136
26 I--S--E--F--R--A--Q--L--D--A--L--G--L--K--I--I--Q--V--T--A-- 45
241 AT GGA AAT TGT TTC TTC AG G GCA TTA GGT GAT CAG TTG GAA GGC AAT GAG GAG GAG CAT G 300
137 ATGGAAATTGTTTCTTCAGGGCATTAGGTGATCAGTTGGAAGGCAATGAGGAGGAGCATG 196
46 D--G--N--C--F--F--R--A--L--G--D--Q--L--E--G--N--E--E--E--H-- 65
301 AG AAA TAT CGA GCT ATG ACT GTA AAA TTT ATC AGG AAT AAC CGT GAT ACG TTT GAG CCT T 360
197 AGAAATATCGAGCTATGACTGTAAAATTTATCAGGAATAACCGTGATACGTTTGAGCCTT 256
66 E--K--Y--R--A--M--T--V--K--F--I--R--N--N--R--D--T--F--E--P-- 85
361 TT ATT GAA GAT GAT GTA CCA TTT GAT GAA TAT TGT GAG TCC ATG GAG AAG GAT GGC ACT T 420
257 TTATTGAAGATGATGTACCATTTGATGAATATTGTGAGTCCATGGAGAAGGATGGCACTT 316
86 F--I--E--D--D--V--P--F--D--E--Y--C--E--S--M--E--K--D--G--T-- 105
421 GG GCT GGA CAT ATG GAA TTA CAA GCA GCT TCT CTT GTT ACT CAT ACC AAT ATA TGC ATT C 480
317 GGGCTGGACATATGGAATTACAAGCAGCTTCTCTTGTTACTCATACCAATATATGCATTC 376
106 W--A--G--H--M--E--L--Q--A--A--S--L--V--T--H--T--N--I--C--I-- 125
481 AC CGA C AT ATG TCA CCT CGC TGG TAC ATA CAG AAT TTT GAC AAC CGT GAA TCT CGG ATG C 540
377 ACCGACATATGTCACCTCGCTGGTACATACAGAATTTTGACAACCGTGAATCTCGGATGC 436
126 H--R--H--M--S--P--R--W--Y--I--Q--N--F--D--N--R--E--S--R--M-- 145
541 TT CAT CT T TCT TAT CAT GAC GGA GAG CAT TAC AAT AGC ATC CGG CTA AGG GAA GAT TCT T 600
437 TTCATCTTTCTTATCATGACGGAGAGCATTACAATAGCATCCGGCTAAGGGAAGATTCTT 496
146 L--H--L--S--Y--H--D--G--E--H--Y--N--S--I--R--L--R--E--D--S-- 165
601 GC ACT GGA CCA GCT AGC CCG ATT ATT ATC AAG GCT GAT GCT GAT CTT TCA GCA AAA TCT C 660
497 GCACTGGACCAGCTAGCCCGATTATTATCAAGGCTGATGCTGATCTTTCAGCAAAATCTC 556
166 C--T--G--P--A--S--P--I--I--I--K--A--D--A--D--L--S--A--K--S-- 185
661 GT GAA TCT ATA GCT GCT GCC AAG TCT AAG GGA GAC ACT AGT CGG AAT ATG GTT CCA GTA G 720
557 GTGAATCTATAGCTGCTGCCAAGTCTAAGGGAGACACTAGTCGGAATATGGTTCCAGTAG 616
186 R--E--S--I--A--A--A--K--S--K--G--D--T--S--R--N--M--V--P--V-- 205
721 GA TCA GTC AAA ATG GTT ATG GCT GGA AGT GGG TGT GAT AAC AAA CAA AAA GTG GAG CAG G 780
617 GATCAGTCAAAATGGTTATGGCTGGAAGTGGGTGTGATAACAAACAAAAAGTGGAGCAGG 676
206 G--S--V--K--M--V--M--A--G--S--G--C--D--N--K--Q--K--V--E--Q-- 225
781 TT TTA CGA CAA GTT GGT GGT GAT GTT GAT GCT GCA ATA GAA TTT CTA ATC GCA GAA CAA G 840
677 TTTTACGACAAGTTGGTGGTGATGTTGATGCTGCAATAGAATTTCTAATCGCAGAACAAG 736
226 V--L--R--Q--V--G--G--D--V--D--A--A--I--E--F--L--I--A--E--Q-- 245
841 GA TCT GAG GAC CAG TTA AAT GCA AAT GAT AAC ATT TCT TCT CTG GCA AGC ACT TCA CAA G 900
737 GATCTGAGGACCAGTTAAATGCAAATGATAACATTTCTTCTCTGGCAAGCACTTCACAAG 796
246 G--S--E--D--Q--L--N--A--N--D--N--I--S--S--L--A--S--T--S--Q-- 265
901 GT AAT GGC AAG TCA GTT CTT TTC CAC TTG CTT TTA AAA TAA TTATGCATATTGCGTCTCG 960
797 GTAATGGCAAGTCAGTTCTTTTCCACTTGCTTTTAAAATAA................... 837
266 G--N--G--K--S--V--L--F--H--L--L--L--K--*-................... 278
961 CTGAGATTGCAGTCAATGTAAAGTCTGGTTTTCATAATCATCAGGGTGTCCCAAGCACAT 1020
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1021 GAAAAATAGAAACAGGAAG 1039
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