Solanum tuberosum (SolTub_3.0)
Description

WD-repeat protein [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG402005959]

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About this transcript

This transcript has 14 exons and is annotated with 20 domains and features.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-PGSC0003DMT4000152721329442aa
 
Protein coding
M1A5R7 Ensembl Canonical
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     1 ATGATAGCAGCTATTTCATGGGTTCCCAAAGGGGTTGCAAAGTCTGTACCAGCTGAGGCT     60
     1 ATGATAGCAGCTATTTCATGGGTTCCCAAAGGGGTTGCAAAGTCTGTACCAGCTGAGGCT     60
     1 -M--I--A--A--I--S--W--V--P--K--G--V--A--K--S--V--P--A--E--A-     20

                                                                          
    61 GATCCACCTACAAAGGAGGAAATTGAACAGATTTTGAAGAGTGGTCTTTTTGATAAACGT    120
    61 GATCCACCTACAAAGGAGGAAATTGAACAGATTTTGAAGAGTGGTCTTTTTGATAAACGT    120
    21 -D--P--P--T--K--E--E--I--E--Q--I--L--K--S--G--L--F--D--K--R-     40

                                                                          
   121 GAAGATAGTGATGACGAGGAGGCTGAAGAAGATATGAATGTTGATGAATCCGAGGAAAAT    180
   121 GAAGATAGTGATGACGAGGAGGCTGAAGAAGATATGAATGTTGATGAATCCGAGGAAAAT    180
    41 -E--D--S--D--D--E--E--A--E--E--D--M--N--V--D--E--S--E--E--N-     60

                                                                          
   181 GAGGATGATGAAGTTGCTATTGCATTAGCTGCTGCTGATGCACTTGGAAAGGCTACGCAA    240
   181 GAGGATGATGAAGTTGCTATTGCATTAGCTGCTGCTGATGCACTTGGAAAGGCTACGCAA    240
    61 -E--D--D--E--V--A--I--A--L--A--A--A--D--A--L--G--K--A--T--Q-     80

                                                                          
   241 GTTTCTTCTGCAGGAACCGATGACATAATAGATGGTTTAAAGGAACTGGACATGGACAAC    300
   241 GTTTCTTCTGCAGGAACCGATGACATAATAGATGGTTTAAAGGAACTGGACATGGACAAC    300
    81 -V--S--S--A--G--T--D--D--I--I--D--G--L--K--E--L--D--M--D--N-    100

                                                                          
   301 TATGATGAAGAGGAGGAGGGAATTGAGCTTTTTGGTTCAGGACTCAAAGACTTGTACTAT    360
   301 TATGATGAAGAGGAGGAGGGAATTGAGCTTTTTGGTTCAGGACTCAAAGACTTGTACTAT    360
   101 -Y--D--E--E--E--E--G--I--E--L--F--G--S--G--L--K--D--L--Y--Y-    120

                                                                          
   361 GCAAGTAATGACATGGACCCATATCTCAAGGATAAGGACAATGACTCTGAAGAAGATGAT    420
   361 GCAAGTAATGACATGGACCCATATCTCAAGGATAAGGACAATGACTCTGAAGAAGATGAT    420
   121 -A--S--N--D--M--D--P--Y--L--K--D--K--D--N--D--S--E--E--D--D-    140

                                                                          
   421 GACATGATAATAAGACCTGATGATTTTGTTATAGTTTGTGCAAGCAATGAGGATGATCTG    480
   421 GACATGATAATAAGACCTGATGATTTTGTTATAGTTTGTGCAAGCAATGAGGATGATCTG    480
   141 -D--M--I--I--R--P--D--D--F--V--I--V--C--A--S--N--E--D--D--L-    160

                                                                          
   481 TGGGGTTCAATGGAACCAGCAATTGAAATTTGGGACATTGACATAATAGATGAGGTGCAA    540
   481 TGGGGTTCAATGGAACCAGCAATTGAAATTTGGGACATTGACATAATAGATGAGGTGCAA    540
   161 -W--G--S--M--E--P--A--I--E--I--W--D--I--D--I--I--D--E--V--Q-    180

                                                                          
   541 CCATCTGTTATTTTAGGTGGCATCGCTGATATAAAGAGAAAGGGAAAAAAGAAATCTATC    600
   541 CCATCTGTTATTTTAGGTGGCATCGCTGATATAAAGAGAAAGGGAAAAAAGAAATCTATC    600
   181 -P--S--V--I--L--G--G--I--A--D--I--K--R--K--G--K--K--K--S--I-    200

                                                                          
   601 AAATACAAAAAGGATAGCCACAAGGATGCAGTACTTGGTCTTTCTTGGAACAAGGAATAT    660
   601 AAATACAAAAAGGATAGCCACAAGGATGCAGTACTTGGTCTTTCTTGGAACAAGGAATAT    660
   201 -K--Y--K--K--D--S--H--K--D--A--V--L--G--L--S--W--N--K--E--Y-    220

                                                                          
   661 AGGAATATACTTGCTAGTGCTAGTGCTGATCATACCGTCAAGGTTTGGGATGTGACTACC    720
   661 AGGAATATACTTGCTAGTGCTAGTGCTGATCATACCGTCAAGGTTTGGGATGTGACTACC    720
   221 -R--N--I--L--A--S--A--S--A--D--H--T--V--K--V--W--D--V--T--T-    240

                                                                          
   721 GAAGCCTGTAATCTCACTATGAATGACCATACCGACAAGGTTCAAGCAGTTGCATGGAAT    780
   721 GAAGCCTGTAATCTCACTATGAATGACCATACCGACAAGGTTCAAGCAGTTGCATGGAAT    780
   241 -E--A--C--N--L--T--M--N--D--H--T--D--K--V--Q--A--V--A--W--N-    260

                                                                          
   781 CCATTTGCTCCACAGATTCTTCTGAGCGGGTCATTCGATCATACAGTTTGCTTGAAGGAT    840
   781 CCATTTGCTCCACAGATTCTTCTGAGCGGGTCATTCGATCATACAGTTTGCTTGAAGGAT    840
   261 -P--F--A--P--Q--I--L--L--S--G--S--F--D--H--T--V--C--L--K--D-    280

                                                                          
   841 GGGAGGAAACCCTCTCACAGTGGATTTAAGTTTTCAGTTGGTGCTGATGTTGAAAGCTTG    900
   841 GGGAGGAAACCCTCTCACAGTGGATTTAAGTTTTCAGTTGGTGCTGATGTTGAAAGCTTG    900
   281 -G--R--K--P--S--H--S--G--F--K--F--S--V--G--A--D--V--E--S--L-    300

                                                                          
   901 GCTTGGGATCCGCATTCGGAGCATTCATTTGTGGTCAGTGCTCGCATCATGTTTGTTATT    960
   901 GCTTGGGATCCGCATTCGGAGCATTCATTTGTGGTCAGTGCTCGCATCATGTTTGTTATT    960
   301 -A--W--D--P--H--S--E--H--S--F--V--V--S--A--R--I--M--F--V--I-    320

                                                                          
   961 AATTCAATCTGTGTTGAGGCTTTATTTGCTTTGGTCAGCTTGGAGAACGGTACCGTTACT   1020
   961 AATTCAATCTGTGTTGAGGCTTTATTTGCTTTGGTCAGCTTGGAGAACGGTACCGTTACT   1020
   321 -N--S--I--C--V--E--A--L--F--A--L--V--S--L--E--N--G--T--V--T-    340

                                                                          
  1021 AGTTTTGATATCCGTGCTGCTAGTTCTGCTTCGACTTCTGAGACAAAGCCAAGTTTCACC   1080
  1021 AGTTTTGATATCCGTGCTGCTAGTTCTGCTTCGACTTCTGAGACAAAGCCAAGTTTCACC   1080
   341 -S--F--D--I--R--A--A--S--S--A--S--T--S--E--T--K--P--S--F--T-    360

                                                                          
  1081 ATCCATGCTCATGATAAAGCAGCGTCCTCGTTGTGCTTCAATCCTCTAGTCCCAAATCTT   1140
  1081 ATCCATGCTCATGATAAAGCAGCGTCCTCGTTGTGCTTCAATCCTCTAGTCCCAAATCTT   1140
   361 -I--H--A--H--D--K--A--A--S--S--L--C--F--N--P--L--V--P--N--L-    380

                                                                          
  1141 CTTGCAACTGGCTCCACGGACAAGATGGGAGCCGTCTTCACTGTATCCTTCTCAGATGAT   1200
  1141 CTTGCAACTGGCTCCACGGACAAGATGGGAGCCGTCTTCACTGTATCCTTCTCAGATGAT   1200
   381 -L--A--T--G--S--T--D--K--M--G--A--V--F--T--V--S--F--S--D--D-    400

                                                                          
  1201 TGCCCCTTTTTTCTTGCTATTGGTGGCTCTAAAGGAAAGTTGCAGCTATGGGATATTTCG   1260
  1201 TGCCCCTTTTTTCTTGCTATTGGTGGCTCTAAAGGAAAGTTGCAGCTATGGGATATTTCG   1260
   401 -C--P--F--F--L--A--I--G--G--S--K--G--K--L--Q--L--W--D--I--S-    420

                                                                          
  1261 TCTGAAGATGCCGTGTTGAAGAAATATGGGAAATACGTTGCACAGAAAAAGCAGTCGCCC   1320
  1261 TCTGAAGATGCCGTGTTGAAGAAATATGGGAAATACGTTGCACAGAAAAAGCAGTCGCCC   1320
   421 -S--E--D--A--V--L--K--K--Y--G--K--Y--V--A--Q--K--K--Q--S--P-    440

                                                                          
  1321 AAATCATAA                                                      1329
  1321 AAATCATAA                                                      1329
   441 -K--S--*-                                                       442