Transcript: PGSC0003DMT400015272
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Description
WD-repeat protein [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG402005959]
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- PGSC0003DMT400015272 1329 442aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1A5R7 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG ATA GCA GCT ATT TCA TGG GTT CCC AAA GGG GTT GCA AAG TCT GTA CCA GCT GAG GCT 60
1 ATGATAGCAGCTATTTCATGGGTTCCCAAAGGGGTTGCAAAGTCTGTACCAGCTGAGGCT 60
1 -M--I--A--A--I--S--W--V--P--K--G--V--A--K--S--V--P--A--E--A- 20
61 GAT CCA CCT ACA AAG GAG GAA ATT GAA CAG ATT TTG AAG AGT GGT CTT TTT GAT AAA CG T 120
61 GATCCACCTACAAAGGAGGAAATTGAACAGATTTTGAAGAGTGGTCTTTTTGATAAACGT 120
21 -D--P--P--T--K--E--E--I--E--Q--I--L--K--S--G--L--F--D--K--R- 40
121 GAA GAT AGT GAT GAC GAG GAG GCT GAA GAA GAT ATG AAT GTT GAT GAA TCC GAG GAA AAT 180
121 GAAGATAGTGATGACGAGGAGGCTGAAGAAGATATGAATGTTGATGAATCCGAGGAAAAT 180
41 -E--D--S--D--D--E--E--A--E--E--D--M--N--V--D--E--S--E--E--N- 60
181 GAG GAT GAT GAA GTT GCT ATT GCA TTA GCT GCT GCT GAT GCA CTT GGA AAG GCT ACG CAA 240
181 GAGGATGATGAAGTTGCTATTGCATTAGCTGCTGCTGATGCACTTGGAAAGGCTACGCAA 240
61 -E--D--D--E--V--A--I--A--L--A--A--A--D--A--L--G--K--A--T--Q- 80
241 GTT TCT TCT GCA GGA ACC GAT GAC ATA ATA GAT GGT TTA AAG GAA CTG GAC ATG GAC AAC 300
241 GTTTCTTCTGCAGGAACCGATGACATAATAGATGGTTTAAAGGAACTGGACATGGACAAC 300
81 -V--S--S--A--G--T--D--D--I--I--D--G--L--K--E--L--D--M--D--N- 100
301 TAT GAT GAA GAG GAG GAG G G A ATT GAG CTT TTT GGT TCA GGA CTC AAA GAC TTG TAC TAT 360
301 TATGATGAAGAGGAGGAGGGAATTGAGCTTTTTGGTTCAGGACTCAAAGACTTGTACTAT 360
101 -Y--D--E--E--E--E--G--I--E--L--F--G--S--G--L--K--D--L--Y--Y- 120
361 GCA AGT AAT GAC ATG GAC CCA TAT CTC AAG GAT AAG GAC AAT GAC TCT GAA GAA GAT GAT 420
361 GCAAGTAATGACATGGACCCATATCTCAAGGATAAGGACAATGACTCTGAAGAAGATGAT 420
121 -A--S--N--D--M--D--P--Y--L--K--D--K--D--N--D--S--E--E--D--D- 140
421 GAC ATG ATA ATA AGA CCT GAT GAT TTT GTT ATA GTT TGT GCA AGC AAT GAG GAT GAT C TG 480
421 GACATGATAATAAGACCTGATGATTTTGTTATAGTTTGTGCAAGCAATGAGGATGATCTG 480
141 -D--M--I--I--R--P--D--D--F--V--I--V--C--A--S--N--E--D--D--L- 160
481 TGG GGT TCA ATG GAA CCA GCA ATT GAA ATT TGG GAC ATT GAC ATA ATA GAT GAG GTG CAA 540
481 TGGGGTTCAATGGAACCAGCAATTGAAATTTGGGACATTGACATAATAGATGAGGTGCAA 540
161 -W--G--S--M--E--P--A--I--E--I--W--D--I--D--I--I--D--E--V--Q- 180
541 CCA TCT GTT ATT TTA GGT GGC ATC GCT GAT ATA AAG AGA AAG GGA AAA AAG AAA TCT ATC 600
541 CCATCTGTTATTTTAGGTGGCATCGCTGATATAAAGAGAAAGGGAAAAAAGAAATCTATC 600
181 -P--S--V--I--L--G--G--I--A--D--I--K--R--K--G--K--K--K--S--I- 200
601 AAA TAC AAA AAG GAT AGC CAC AAG GAT GCA GTA CTT GGT CTT TCT TGG AAC AAG GAA TAT 660
601 AAATACAAAAAGGATAGCCACAAGGATGCAGTACTTGGTCTTTCTTGGAACAAGGAATAT 660
201 -K--Y--K--K--D--S--H--K--D--A--V--L--G--L--S--W--N--K--E--Y- 220
661 AG G AAT ATA CTT GCT AGT GCT AGT GCT GAT CAT ACC GTC AAG GTT TGG GAT GTG ACT ACC 720
661 AGGAATATACTTGCTAGTGCTAGTGCTGATCATACCGTCAAGGTTTGGGATGTGACTACC 720
221 -R--N--I--L--A--S--A--S--A--D--H--T--V--K--V--W--D--V--T--T- 240
721 GAA GCC TGT AAT CTC ACT ATG AAT GAC CAT ACC GAC AAG G TT CAA GCA GTT GCA TGG AAT 780
721 GAAGCCTGTAATCTCACTATGAATGACCATACCGACAAGGTTCAAGCAGTTGCATGGAAT 780
241 -E--A--C--N--L--T--M--N--D--H--T--D--K--V--Q--A--V--A--W--N- 260
781 CCA TTT GCT CCA CAG ATT CTT CTG AGC GGG TCA TTC GAT CAT ACA GTT TGC TTG A AG GAT 840
781 CCATTTGCTCCACAGATTCTTCTGAGCGGGTCATTCGATCATACAGTTTGCTTGAAGGAT 840
261 -P--F--A--P--Q--I--L--L--S--G--S--F--D--H--T--V--C--L--K--D- 280
841 GGG AGG AAA CCC TCT CAC AGT GGA TTT AAG TTT TCA GTT GGT GCT GAT GTT GAA AGC TTG 900
841 GGGAGGAAACCCTCTCACAGTGGATTTAAGTTTTCAGTTGGTGCTGATGTTGAAAGCTTG 900
281 -G--R--K--P--S--H--S--G--F--K--F--S--V--G--A--D--V--E--S--L- 300
901 GCT TGG GAT CCG CAT TCG GAG CAT TCA TTT GTG GTC AGT GCT CGC ATC ATG TTT GTT ATT 960
901 GCTTGGGATCCGCATTCGGAGCATTCATTTGTGGTCAGTGCTCGCATCATGTTTGTTATT 960
301 -A--W--D--P--H--S--E--H--S--F--V--V--S--A--R--I--M--F--V--I- 320
961 AAT TCA ATC TGT GTT GAG GCT TTA TTT GCT TTG G TC AGC TTG GAG AAC GGT ACC GTT ACT 1020
961 AATTCAATCTGTGTTGAGGCTTTATTTGCTTTGGTCAGCTTGGAGAACGGTACCGTTACT 1020
321 -N--S--I--C--V--E--A--L--F--A--L--V--S--L--E--N--G--T--V--T- 340
1021 AGT TTT GAT ATC CGT GCT GCT AGT TCT GCT TCG ACT TCT GAG ACA AAG CCA AGT TTC ACC 1080
1021 AGTTTTGATATCCGTGCTGCTAGTTCTGCTTCGACTTCTGAGACAAAGCCAAGTTTCACC 1080
341 -S--F--D--I--R--A--A--S--S--A--S--T--S--E--T--K--P--S--F--T- 360
1081 ATC CAT GCT CAT GAT AAA GCA GCG TCC TCG TTG TGC TTC AAT CCT CTA GTC CCA AAT CTT 1140
1081 ATCCATGCTCATGATAAAGCAGCGTCCTCGTTGTGCTTCAATCCTCTAGTCCCAAATCTT 1140
361 -I--H--A--H--D--K--A--A--S--S--L--C--F--N--P--L--V--P--N--L- 380
1141 CTT GCA ACT GGC TCC ACG GAC AAG ATG GGA GCC GTC TTC ACT GTA TCC TTC TCA GAT GAT 1200
1141 CTTGCAACTGGCTCCACGGACAAGATGGGAGCCGTCTTCACTGTATCCTTCTCAGATGAT 1200
381 -L--A--T--G--S--T--D--K--M--G--A--V--F--T--V--S--F--S--D--D- 400
1201 TGC CCC TTT TTT CTT GCT ATT GGT GGC TCT AAA GGA AAG TTG CAG C TA TGG GAT ATT TCG 1260
1201 TGCCCCTTTTTTCTTGCTATTGGTGGCTCTAAAGGAAAGTTGCAGCTATGGGATATTTCG 1260
401 -C--P--F--F--L--A--I--G--G--S--K--G--K--L--Q--L--W--D--I--S- 420
1261 TCT GAA GAT GCC GTG TTG AAG AAA TAT GGG AAA TAC GTT GCA CAG AAA AAG CAG TCG CCC 1320
1261 TCTGAAGATGCCGTGTTGAAGAAATATGGGAAATACGTTGCACAGAAAAAGCAGTCGCCC 1320
421 -S--E--D--A--V--L--K--K--Y--G--K--Y--V--A--Q--K--K--Q--S--P- 440
1321 AAA TCA TAA 1329
1321 AAATCATAA 1329
441 -K--S--*- 442
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