Solanum tuberosum (SolTub_3.0)
Description

Avr9/Cf-9 rapidly elicited protein 74 [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG400029464]

Location
About this transcript

This transcript has 1 exon and is annotated with 11 domains and features.

Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-PGSC0003DMT4000757781527442aa
 
Protein coding
M1CVP2 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 CTTGCAAACAATAAAATCATAAAACCAAACTCATTTCCAAAGATTTAATTTCAAGTTCAA     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 GTTAAGTTTTGTTTCTTTTTGTTGTTGTAATATAAAAACAATGATTTCAACATGGAGGAA    120
       ........................................ATGATTTCAACATGGAGGAA     20
       ........................................-M--I--S--T--W--R--K      7

                                                                          
   121 GAAAAGAGCATCAAGGAGGAGTAACTCAAAGAAACAAATTGAAGAAAAAACCATGGAGTT    180
    21 GAAAAGAGCATCAAGGAGGAGTAACTCAAAGAAACAAATTGAAGAAAAAACCATGGAGTT     80
     7 --K--R--A--S--R--R--S--N--S--K--K--Q--I--E--E--K--T--M--E--L     27

                                                                          
   181 GTTGATGGTTCCTAGCCATTTCAAGTGTCCAATTTCATTAGATTTGATGAAGGATCCGGT    240
    81 GTTGATGGTTCCTAGCCATTTCAAGTGTCCAATTTCATTAGATTTGATGAAGGATCCGGT    140
    27 --L--M--V--P--S--H--F--K--C--P--I--S--L--D--L--M--K--D--P--V     47

                                                                          
   241 GACGTTGTCGACGGGGATCACGTATGATCGAGTGAGTATCGAGACATGGATTGAAAATGG    300
   141 GACGTTGTCGACGGGGATCACGTATGATCGAGTGAGTATCGAGACATGGATTGAAAATGG    200
    47 --T--L--S--T--G--I--T--Y--D--R--V--S--I--E--T--W--I--E--N--G     67

                                                                          
   301 AAATCAAACATGTCCTATCACTAAAAAAGTGGTGAAGACACTTGAGCCAATTCCTAATCA    360
   201 AAATCAAACATGTCCTATCACTAAAAAAGTGGTGAAGACACTTGAGCCAATTCCTAATCA    260
    67 --N--Q--T--C--P--I--T--K--K--V--V--K--T--L--E--P--I--P--N--H     87

                                                                          
   361 CACAATGAGGAAAATGATCCAAGAATGGTGTGTTGTGAATAAAGATTATGGGATCGAGAG    420
   261 CACAATGAGGAAAATGATCCAAGAATGGTGTGTTGTGAATAAAGATTATGGGATCGAGAG    320
    87 --T--M--R--K--M--I--Q--E--W--C--V--V--N--K--D--Y--G--I--E--R    107

                                                                          
   421 GATCCCAACTCCAAGAATCCCCGTTACCTCTGATGAGGTAACGGTGATTCTTAGGAAGAT    480
   321 GATCCCAACTCCAAGAATCCCCGTTACCTCTGATGAGGTAACGGTGATTCTTAGGAAGAT    380
   107 --I--P--T--P--R--I--P--V--T--S--D--E--V--T--V--I--L--R--K--I    127

                                                                          
   481 TGAGTCTTGCTGCAAATTGCAGCAAGGCTCAGAGTCTAGTCGCGAACTAGTAATGAAAAT    540
   381 TGAGTCTTGCTGCAAATTGCAGCAAGGCTCAGAGTCTAGTCGCGAACTAGTAATGAAAAT    440
   127 --E--S--C--C--K--L--Q--Q--G--S--E--S--S--R--E--L--V--M--K--M    147

                                                                          
   541 GAGGAAGATGATAAAAGAAAGTATGAGGAATAAACGTTGTTTTGTTGCAAATGGTGCAGG    600
   441 GAGGAAGATGATAAAAGAAAGTATGAGGAATAAACGTTGTTTTGTTGCAAATGGTGCAGG    500
   147 --R--K--M--I--K--E--S--M--R--N--K--R--C--F--V--A--N--G--A--G    167

                                                                          
   601 GAAGATCTTATCATCTATACTTGTTGGTTTTACGGAGAAATCATCCGTTTATGAAGTTGA    660
   501 GAAGATCTTATCATCTATACTTGTTGGTTTTACGGAGAAATCATCCGTTTATGAAGTTGA    560
   167 --K--I--L--S--S--I--L--V--G--F--T--E--K--S--S--V--Y--E--V--E    187

                                                                          
   661 AACAATGGAAGAAATATTATCAACTTTGACAATATTATTGCCTCTAGATGGTGAGTCCAA    720
   561 AACAATGGAAGAAATATTATCAACTTTGACAATATTATTGCCTCTAGATGGTGAGTCCAA    620
   187 --T--M--E--E--I--L--S--T--L--T--I--L--L--P--L--D--G--E--S--K    207

                                                                          
   721 GTCATTTCTTGGATCAAAATCATCATTAAATTGCATGATTTGGTTCTTGAAATGTGGAAG    780
   621 GTCATTTCTTGGATCAAAATCATCATTAAATTGCATGATTTGGTTCTTGAAATGTGGAAG    680
   207 --S--F--L--G--S--K--S--S--L--N--C--M--I--W--F--L--K--C--G--S    227

                                                                          
   781 TTTATCAAGTAGGAGAAATTCAGTGTTTTTGCTTAAAGAAATAATGAGAATGGAAGAAAC    840
   681 TTTATCAAGTAGGAGAAATTCAGTGTTTTTGCTTAAAGAAATAATGAGAATGGAAGAAAC    740
   227 --L--S--S--R--R--N--S--V--F--L--L--K--E--I--M--R--M--E--E--T    247

                                                                          
   841 ATGGAGAGTAGAAGAGTTATTAAAGATTGATGGAAGTTTGGAATCATTAGTGAAGTTAGT    900
   741 ATGGAGAGTAGAAGAGTTATTAAAGATTGATGGAAGTTTGGAATCATTAGTGAAGTTAGT    800
   247 --W--R--V--E--E--L--L--K--I--D--G--S--L--E--S--L--V--K--L--V    267

                                                                          
   901 AAAAGAGCCAATATGTCCTACAACTACAAAAGCTTCTTTATTAACAATTTACCATATGGT    960
   801 AAAAGAGCCAATATGTCCTACAACTACAAAAGCTTCTTTATTAACAATTTACCATATGGT    860
   267 --K--E--P--I--C--P--T--T--T--K--A--S--L--L--T--I--Y--H--M--V    287

                                                                          
   961 TAATTCATCACAATTATCAAATGAGAAAGCAAGATCCAAATTTGTTGATTTGGGATTAGT   1020
   861 TAATTCATCACAATTATCAAATGAGAAAGCAAGATCCAAATTTGTTGATTTGGGATTAGT    920
   287 --N--S--S--Q--L--S--N--E--K--A--R--S--K--F--V--D--L--G--L--V    307

                                                                          
  1021 GGAATTGCTTATAGAGACACTTGTGGATTGTGAAAAGAGCATATGTGAAAAAGTATTGGG   1080
   921 GGAATTGCTTATAGAGACACTTGTGGATTGTGAAAAGAGCATATGTGAAAAAGTATTGGG    980
   307 --E--L--L--I--E--T--L--V--D--C--E--K--S--I--C--E--K--V--L--G    327

                                                                          
  1081 AATTTTGGCTAGAATTTGCAACTCACAAGAAGGGAAAAAAAGGGCTAATAATTATGCCTT   1140
   981 AATTTTGGCTAGAATTTGCAACTCACAAGAAGGGAAAAAAAGGGCTAATAATTATGCCTT   1040
   327 --I--L--A--R--I--C--N--S--Q--E--G--K--K--R--A--N--N--Y--A--L    347

                                                                          
  1141 AACTATTCCTGTTTTGATCAAGAAATTATTGAGAGTTTCAGTTTTAGCAACTGAATTTTC   1200
  1041 AACTATTCCTGTTTTGATCAAGAAATTATTGAGAGTTTCAGTTTTAGCAACTGAATTTTC   1100
   347 --T--I--P--V--L--I--K--K--L--L--R--V--S--V--L--A--T--E--F--S    367

                                                                          
  1201 AGTTTCAATATTATGGAAGTTATTAATTGAGAAAAGGGATAATGTTGTGCTTATTAATGA   1260
  1101 AGTTTCAATATTATGGAAGTTATTAATTGAGAAAAGGGATAATGTTGTGCTTATTAATGA   1160
   367 --V--S--I--L--W--K--L--L--I--E--K--R--D--N--V--V--L--I--N--E    387

                                                                          
  1261 AGCACTTCAAGTTGGTGCATTTCAAAAGCTATTGTTACTAATACAAGTTGGTTGTAGTGA   1320
  1161 AGCACTTCAAGTTGGTGCATTTCAAAAGCTATTGTTACTAATACAAGTTGGTTGTAGTGA   1220
   387 --A--L--Q--V--G--A--F--Q--K--L--L--L--L--I--Q--V--G--C--S--E    407

                                                                          
  1321 AAATACTAAGGAGAAGGCAAGTGAGTTGTTGAAATTGTTGAATTTGCATAGAGGTGAGGT   1380
  1221 AAATACTAAGGAGAAGGCAAGTGAGTTGTTGAAATTGTTGAATTTGCATAGAGGTGAGGT   1280
   407 --N--T--K--E--K--A--S--E--L--L--K--L--L--N--L--H--R--G--E--V    427

                                                                          
  1381 AGAATGTATTGATTCTTTGGACTTGAAGAACCTAAAGAGGCCATTTTGAACATTTAGTTT   1440
  1281 AGAATGTATTGATTCTTTGGACTTGAAGAACCTAAAGAGGCCATTTTGA...........   1329
   427 --E--C--I--D--S--L--D--L--K--N--L--K--R--P--F--*-...........    442

                                                                          
  1441 AGTTGATATTATGTGTATACATATATTCATTTTTCATATGTCAATGTACAAAATTGAACA   1500
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1501 AGGAATAATAAGTTATGAATATTCTTT                                    1527
       ...........................                                        
       ...........................