Transcript: PGSC0003DMT400075778
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Description
Avr9/Cf-9 rapidly elicited protein 74 [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG400029464]
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- PGSC0003DMT400075778 1527 442aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1CVP2 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 C TTGCAAACAATAAAATCATAAAACCAAACTCATTTCCAAAGATTTAATTTCAAGTTCAA 60
............................................................
............................................................
61 GTTAAGTTTTGTTTCTTTTTGTTGTTGTAATATAAAAACA ATG ATT TCA ACA TGG AGG AA 120
........................................ATGATTTCAACATGGAGGAA 20
........................................-M--I--S--T--W--R--K 7
121 G AAA AGA GCA TCA AGG AGG AGT AAC TCA AAG AAA CAA ATT GAA GAA AAA ACC ATG GAG TT 180
21 GAAAAGAGCATCAAGGAGGAGTAACTCAAAGAAACAAATTGAAGAAAAAACCATGGAGTT 80
7 --K--R--A--S--R--R--S--N--S--K--K--Q--I--E--E--K--T--M--E--L 27
181 G TTG ATG GTT CCT AGC CAT TTC AAG TGT CCA ATT TCA TTA GAT TTG ATG AAG GAT CCG GT 240
81 GTTGATGGTTCCTAGCCATTTCAAGTGTCCAATTTCATTAGATTTGATGAAGGATCCGGT 140
27 --L--M--V--P--S--H--F--K--C--P--I--S--L--D--L--M--K--D--P--V 47
241 G ACG TTG TCG ACG GGG ATC ACG TAT GAT CGA GTG AGT ATC GAG ACA TGG ATT GAA AAT GG 300
141 GACGTTGTCGACGGGGATCACGTATGATCGAGTGAGTATCGAGACATGGATTGAAAATGG 200
47 --T--L--S--T--G--I--T--Y--D--R--V--S--I--E--T--W--I--E--N--G 67
301 A AAT CAA ACA TGT CCT ATC ACT AAA AAA GTG GTG AAG ACA CTT GAG CCA ATT CCT AAT CA 360
201 AAATCAAACATGTCCTATCACTAAAAAAGTGGTGAAGACACTTGAGCCAATTCCTAATCA 260
67 --N--Q--T--C--P--I--T--K--K--V--V--K--T--L--E--P--I--P--N--H 87
361 C ACA ATG AGG AAA ATG ATC CAA GAA TGG TGT GTT GTG AAT AAA GAT TAT GGG ATC GAG AG 420
261 CACAATGAGGAAAATGATCCAAGAATGGTGTGTTGTGAATAAAGATTATGGGATCGAGAG 320
87 --T--M--R--K--M--I--Q--E--W--C--V--V--N--K--D--Y--G--I--E--R 107
421 G ATC CCA ACT CCA AGA ATC CCC GTT ACC TCT GAT GAG GTA ACG GTG ATT CTT AGG AAG AT 480
321 GATCCCAACTCCAAGAATCCCCGTTACCTCTGATGAGGTAACGGTGATTCTTAGGAAGAT 380
107 --I--P--T--P--R--I--P--V--T--S--D--E--V--T--V--I--L--R--K--I 127
481 T GAG TCT TGC TGC AAA TTG CAG CAA GGC TCA GAG TCT AGT CGC GAA CTA GTA ATG AAA AT 540
381 TGAGTCTTGCTGCAAATTGCAGCAAGGCTCAGAGTCTAGTCGCGAACTAGTAATGAAAAT 440
127 --E--S--C--C--K--L--Q--Q--G--S--E--S--S--R--E--L--V--M--K--M 147
541 G AGG AAG ATG ATA AAA GAA AGT ATG AGG AAT AAA CGT TGT TTT GTT GCA AAT GGT GCA GG 600
441 GAGGAAGATGATAAAAGAAAGTATGAGGAATAAACGTTGTTTTGTTGCAAATGGTGCAGG 500
147 --R--K--M--I--K--E--S--M--R--N--K--R--C--F--V--A--N--G--A--G 167
601 G AAG ATC TTA TCA TCT ATA CTT GTT GGT TTT ACG GAG AAA TCA TCC GTT TAT GAA GTT GA 660
501 GAAGATCTTATCATCTATACTTGTTGGTTTTACGGAGAAATCATCCGTTTATGAAGTTGA 560
167 --K--I--L--S--S--I--L--V--G--F--T--E--K--S--S--V--Y--E--V--E 187
661 A ACA ATG GAA GAA ATA TTA TCA ACT TTG ACA ATA TTA TTG CCT CTA GAT GGT GAG TCC AA 720
561 AACAATGGAAGAAATATTATCAACTTTGACAATATTATTGCCTCTAGATGGTGAGTCCAA 620
187 --T--M--E--E--I--L--S--T--L--T--I--L--L--P--L--D--G--E--S--K 207
721 G TCA TTT CTT GGA TCA AAA TCA TCA TTA AAT TGC ATG ATT TGG TTC TTG AAA TGT GGA AG 780
621 GTCATTTCTTGGATCAAAATCATCATTAAATTGCATGATTTGGTTCTTGAAATGTGGAAG 680
207 --S--F--L--G--S--K--S--S--L--N--C--M--I--W--F--L--K--C--G--S 227
781 T TTA TCA AGT AGG AGA AAT TCA GTG TTT TTG CTT AAA GAA ATA ATG AGA ATG GAA GAA AC 840
681 TTTATCAAGTAGGAGAAATTCAGTGTTTTTGCTTAAAGAAATAATGAGAATGGAAGAAAC 740
227 --L--S--S--R--R--N--S--V--F--L--L--K--E--I--M--R--M--E--E--T 247
841 A TGG AGA GTA GAA GAG TTA TTA AAG ATT GAT GGA AGT TTG GAA TCA TTA GTG AAG TTA GT 900
741 ATGGAGAGTAGAAGAGTTATTAAAGATTGATGGAAGTTTGGAATCATTAGTGAAGTTAGT 800
247 --W--R--V--E--E--L--L--K--I--D--G--S--L--E--S--L--V--K--L--V 267
901 A AAA GAG CCA ATA TGT CCT ACA ACT ACA AAA GCT TCT TTA TTA ACA ATT TAC CAT ATG GT 960
801 AAAAGAGCCAATATGTCCTACAACTACAAAAGCTTCTTTATTAACAATTTACCATATGGT 860
267 --K--E--P--I--C--P--T--T--T--K--A--S--L--L--T--I--Y--H--M--V 287
961 T AAT TCA TCA CAA TTA TCA AAT GAG AAA GCA AGA TCC AAA TTT GTT GAT TTG GGA TTA GT 1020
861 TAATTCATCACAATTATCAAATGAGAAAGCAAGATCCAAATTTGTTGATTTGGGATTAGT 920
287 --N--S--S--Q--L--S--N--E--K--A--R--S--K--F--V--D--L--G--L--V 307
1021 G GAA TTG CTT ATA GAG ACA CTT GTG GAT TGT GAA AAG AGC ATA TGT GAA AAA GTA TTG GG 1080
921 GGAATTGCTTATAGAGACACTTGTGGATTGTGAAAAGAGCATATGTGAAAAAGTATTGGG 980
307 --E--L--L--I--E--T--L--V--D--C--E--K--S--I--C--E--K--V--L--G 327
1081 A ATT TTG GCT AGA ATT TGC AAC TCA CAA GAA GGG AAA AAA AGG GCT AAT AAT TAT GCC TT 1140
981 AATTTTGGCTAGAATTTGCAACTCACAAGAAGGGAAAAAAAGGGCTAATAATTATGCCTT 1040
327 --I--L--A--R--I--C--N--S--Q--E--G--K--K--R--A--N--N--Y--A--L 347
1141 A ACT ATT CCT GTT TTG ATC AAG AAA TTA TTG AGA GTT TCA GTT TTA GCA ACT GAA TTT TC 1200
1041 AACTATTCCTGTTTTGATCAAGAAATTATTGAGAGTTTCAGTTTTAGCAACTGAATTTTC 1100
347 --T--I--P--V--L--I--K--K--L--L--R--V--S--V--L--A--T--E--F--S 367
1201 A GTT TCA ATA TTA TGG AAG TTA TTA ATT GAG AAA AGG GAT AAT GTT GTG CTT ATT AAT GA 1260
1101 AGTTTCAATATTATGGAAGTTATTAATTGAGAAAAGGGATAATGTTGTGCTTATTAATGA 1160
367 --V--S--I--L--W--K--L--L--I--E--K--R--D--N--V--V--L--I--N--E 387
1261 A GCA CTT CAA GTT GGT GCA TTT CAA AAG CTA TTG TTA CTA ATA CAA GTT GGT TGT AGT GA 1320
1161 AGCACTTCAAGTTGGTGCATTTCAAAAGCTATTGTTACTAATACAAGTTGGTTGTAGTGA 1220
387 --A--L--Q--V--G--A--F--Q--K--L--L--L--L--I--Q--V--G--C--S--E 407
1321 A AAT ACT AAG GAG AAG GCA AGT GAG TTG TTG AAA TTG TTG AAT TTG CAT AGA GGT GAG GT 1380
1221 AAATACTAAGGAGAAGGCAAGTGAGTTGTTGAAATTGTTGAATTTGCATAGAGGTGAGGT 1280
407 --N--T--K--E--K--A--S--E--L--L--K--L--L--N--L--H--R--G--E--V 427
1381 A GAA TGT ATT GAT TCT TTG GAC TTG AAG AAC CTA AAG AGG CCA TTT TGA ACATTTAGTTT 1440
1281 AGAATGTATTGATTCTTTGGACTTGAAGAACCTAAAGAGGCCATTTTGA........... 1329
427 --E--C--I--D--S--L--D--L--K--N--L--K--R--P--F--*-........... 442
1441 AGTTGATATTATGTGTATACATATATTCATTTTTCATATGTCAATGTACAAAATTGAACA 1500
............................................................
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1501 AGGAATAATAAGTTATGAATATTCTTT 1527
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