Transcript: PGSC0003DMT400057187
.
Description
Bromodomain-containing protein [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG400022213]
Show/hide columns (1 hidden)
- PGSC0003DMT400057187 3571 929aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1C0L0 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - PGSC0003DMT400057185 6049 677aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1C0K8 - - PGSC0003DMT400057186 3647 619aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1C0K9 - - PGSC0003DMT400057184 1000 179aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1C0K7 -
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
AACCTCAGGTTTGGACTCAGGTTCGGACCACAAAATTGACTCAAAAAAAGCCAAAGCACT ............................................................ ............................................................ GCCTCAGAGAAAAATAATGTAATGGAGTAAAAGAAGAGAGAGAAAGTGATAGAGAGAGGA ............................................................ ............................................................ AATTGTAGAGAGAGAAAGAGGAAGGAG ATG GGG CAG ATC GTG AAG ACG AAG AAG AAA GGA ...........................ATGGGGCAGATCGTGAAGACGAAGAAGAAAGGA ...........................-M--G--Q--I--V--K--T--K--K--K--G- CGT CCA TCT AAG GCA GAT CTA GCT CGC CGG AAC GCC GCC GTT GAG CAG TCG GAA TCG GCG CGTCCATCTAAGGCAGATCTAGCTCGCCGGAACGCCGCCGTTGAGCAGTCGGAATCGGCG -R--P--S--K--A--D--L--A--R--R--N--A--A--V--E--Q--S--E--S--A- TCG GCG AAG CAG GAG AGG GAG CTT CGT CGG AGT GGA CGG CGT CGG AAT GTT AGG TAC GCT TCGGCGAAGCAGGAGAGGGAGCTTCGTCGGAGTGGACGGCGTCGGAATGTTAGGTACGCT -S--A--K--Q--E--R--E--L--R--R--S--G--R--R--R--N--V--R--Y--A- TTC GAC ATC GAT GAT TAC CTT GAC GAC GAT GAG TAC TTT GTC GAA GAC GAT GAG GAT GAG TTCGACATCGATGATTACCTTGACGACGATGAGTACTTTGTCGAAGACGATGAGGATGAG -F--D--I--D--D--Y--L--D--D--D--E--Y--F--V--E--D--D--E--D--E- AGA GGC AGA GAG AAG AAG CTG AAA CAC TTG CTT AAG CTG CAG AGC GAT GAA ATC GGT GCT AGAGGCAGAGAGAAGAAGCTGAAACACTTGCTTAAGCTGCAGAGCGATGAAATCGGTGCT -R--G--R--E--K--K--L--K--H--L--L--K--L--Q--S--D--E--I--G--A- GAG TCA ACT CCG AGT CGG ACT CGA CGA GTG TCA GTA GGG CCT GCC ACG TCG GCA TCG TCT GAGTCAACTCCGAGTCGGACTCGACGAGTGTCAGTAGGGCCTGCCACGTCGGCATCGTCT -E--S--T--P--S--R--T--R--R--V--S--V--G--P--A--T--S--A--S--S- TCC GAC GAC GGC GAT GGG AGA AAG CCC TCT AAA AAG AGA AGA ATT AAC GGC GAC GAT GAT TCCGACGACGGCGATGGGAGAAAGCCCTCTAAAAAGAGAAGAATTAACGGCGACGATGAT -S--D--D--G--D--G--R--K--P--S--K--K--R--R--I--N--G--D--D--D- AGA GAT GAA GAC GAA GAA GAT AAT GAC GAT GAA ATT GAA ATT GAA AAT GAA AAT GAT GAT AGAGATGAAGACGAAGAAGATAATGACGATGAAATTGAAATTGAAAATGAAAATGATGAT -R--D--E--D--E--E--D--N--D--D--E--I--E--I--E--N--E--N--D--D- GAG GCT AGA GGA AGG AAT GAA GAA GCA AAA GAT GTG GAC TCT GCT CCA G GG ACA CCA TCG GAGGCTAGAGGAAGGAATGAAGAAGCAAAAGATGTGGACTCTGCTCCAGGGACACCATCG -E--A--R--G--R--N--E--E--A--K--D--V--D--S--A--P--G--T--P--S- GAG CCA AAT TCT GGA ATG CCA TTG CCA GAC AAG AAG ACA ATG GAA TTG ATT CTC GAC AAG GAGCCAAATTCTGGAATGCCATTGCCAGACAAGAAGACAATGGAATTGATTCTCGACAAG -E--P--N--S--G--M--P--L--P--D--K--K--T--M--E--L--I--L--D--K- TTA CAG AA G AAA GAC ATA TAT GGT GTT TAT GCG GAA CCT GTT GAT CCT GAA GAG C TA CCT TTACAGAAGAAAGACATATATGGTGTTTATGCGGAACCTGTTGATCCTGAAGAGCTACCT -L--Q--K--K--D--I--Y--G--V--Y--A--E--P--V--D--P--E--E--L--P- GAT TAC CAT GAG GTG ATT GAT AAT CCC ATG GAC TTT ACC ACC GTC AGG AAC AAA TTG CGA GATTACCATGAGGTGATTGATAATCCCATGGACTTTACCACCGTCAGGAACAAATTGCGA -D--Y--H--E--V--I--D--N--P--M--D--F--T--T--V--R--N--K--L--R- ACT GGA TCA TAT GTC ACT TTG GAG CAA TTA GAG A GC GAT ATC TTC CTC ATT TGT TCA AAC ACTGGATCATATGTCACTTTGGAGCAATTAGAGAGCGATATCTTCCTCATTTGTTCAAAC -T--G--S--Y--V--T--L--E--Q--L--E--S--D--I--F--L--I--C--S--N- GCA ATG CAG TAT AAT TCA TCA GAT ACT GTC TAC CAT AAA CAG G CA CGT ACC ATC CAA GAG GCAATGCAGTATAATTCATCAGATACTGTCTACCATAAACAGGCACGTACCATCCAAGAG -A--M--Q--Y--N--S--S--D--T--V--Y--H--K--Q--A--R--T--I--Q--E- TTG GCT ACA AAG AAA TTT GAG AAG CTA AGA ATC AAG CAT GTC CGA TCT GAA AAG GAC GTC TTGGCTACAAAGAAATTTGAGAAGCTAAGAATCAAGCATGTCCGATCTGAAAAGGACGTC -L--A--T--K--K--F--E--K--L--R--I--K--H--V--R--S--E--K--D--V- AAG TTA GAA CAG AAG ACA AAA TAT GGT TCT GTT GTC AGG AAG CAA ATA AAG AAG CCG ATG AAGTTAGAACAGAAGACAAAATATGGTTCTGTTGTCAGGAAGCAAATAAAGAAGCCGATG -K--L--E--Q--K--T--K--Y--G--S--V--V--R--K--Q--I--K--K--P--M- GTC CAG ATG TTC CAG GAA ACT GTT GGC TCT GAT TTC TCG TCA GGT GCC ACT CTT GCT GCA GTCCAGATGTTCCAGGAAACTGTTGGCTCTGATTTCTCGTCAGGTGCCACTCTTGCTGCA -V--Q--M--F--Q--E--T--V--G--S--D--F--S--S--G--A--T--L--A--A- GCT GGA GAT AAC CAC TAT CTT AAC AAC ACT TCT CTT GCT GGA GTG TCA GTG AAA CCT TAT GCTGGAGATAACCACTATCTTAACAACACTTCTCTTGCTGGAGTGTCAGTGAAACCTTAT -A--G--D--N--H--Y--L--N--N--T--S--L--A--G--V--S--V--K--P--Y- GGT GTT GAT GGG CTT GCT GAA GGA AAT TCT TCA CTG ATA GAT CAA AAT GTA GAC AAG GCA GGTGTTGATGGGCTTGCTGAAGGAAATTCTTCACTGATAGATCAAAATGTAGACAAGGCA -G--V--D--G--L--A--E--G--N--S--S--L--I--D--Q--N--V--D--K--A- GAA GAA TCA CTA TCA G G G AAG GGA CCT CTA TCC AGA TTT GGA AGG AAA TCA ACT GTG CCT GAAGAATCACTATCAGGGAAGGGACCTCTATCCAGATTTGGAAGGAAATCAACTGTGCCT -E--E--S--L--S--G--K--G--P--L--S--R--F--G--R--K--S--T--V--P- GAT GAG AAC CGT CGT GGA AGT TAC AAC ATA TCC ACA CAA CCA GTT GGC AAC ATG GAC TCC GATGAGAACCGTCGTGGAAGTTACAACATATCCACACAACCAGTTGGCAACATGGACTCC -D--E--N--R--R--G--S--Y--N--I--S--T--Q--P--V--G--N--M--D--S- ATA TTT TCA ACG TTT GAA GAT GAA AGC AAG CAC CTG GTC ACT GTC GGG CTT TAT TCT GAT ATATTTTCAACGTTTGAAGATGAAAGCAAGCACCTGGTCACTGTCGGGCTTTATTCTGAT -I--F--S--T--F--E--D--E--S--K--H--L--V--T--V--G--L--Y--S--D- CAT GCA TAT GCT AGG AGC CTT ACC CGG TTT GCT GCA ACT CTC GGT CCT GTT GCA TGG CGA CATGCATATGCTAGGAGCCTTACCCGGTTTGCTGCAACTCTCGGTCCTGTTGCATGGCGA -H--A--Y--A--R--S--L--T--R--F--A--A--T--L--G--P--V--A--W--R- GTT GCA TCC CAG AAA ATT GAA CAG GCA TTA CCT CCT GGA TTC AAG TTT GGC CAT GGG TGG GTTGCATCCCAGAAAATTGAACAGGCATTACCTCCTGGATTCAAGTTTGGCCATGGGTGG -V--A--S--Q--K--I--E--Q--A--L--P--P--G--F--K--F--G--H--G--W- GTT GGG GAA TAC GAG CCA CTT CCA ACC CCC GTT TTG GTG CTT GAG AAC TAT ACC TTG AAG GTTGGGGAATACGAGCCACTTCCAACCCCCGTTTTGGTGCTTGAGAACTATACCTTGAAG -V--G--E--Y--E--P--L--P--T--P--V--L--V--L--E--N--Y--T--L--K- GAA CCT CCA TTC TTC TCC AAG TCT GTA CAT ACG TTT GGA GCT CAA AAG AAT GAG AAA ACA GAACCTCCATTCTTCTCCAAGTCTGTACATACGTTTGGAGCTCAAAAGAATGAGAAAACA -E--P--P--F--F--S--K--S--V--H--T--F--G--A--Q--K--N--E--K--T- TCC GAG GAC GCA ATT GCT CCA AAA GAT AAA CCT CTT TCT AGG CCT ATG TTA GAA GGA AAA TCCGAGGACGCAATTGCTCCAAAAGATAAACCTCTTTCTAGGCCTATGTTAGAAGGAAAA -S--E--D--A--I--A--P--K--D--K--P--L--S--R--P--M--L--E--G--K- TCA CCA TAT CTT GGT TCA GCT AAG GGT AAG TCC ATG GAG AGT GGT TTG AAT GTC TTG ATT TCACCATATCTTGGTTCAGCTAAGGGTAAGTCCATGGAGAGTGGTTTGAATGTCTTGATT -S--P--Y--L--G--S--A--K--G--K--S--M--E--S--G--L--N--V--L--I- CCC ACG AAG GAA CAA TCT CCT AGG GAG GTC AAT CTA GAA GGA AGG TCA TCG TTT CTT TCT CCCACGAAGGAACAATCTCCTAGGGAGGTCAATCTAGAAGGAAGGTCATCGTTTCTTTCT -P--T--K--E--Q--S--P--R--E--V--N--L--E--G--R--S--S--F--L--S- TCT GGA AAG AAA CCT GCT GTT TGT GCT AGC CCC AGA TAC CAG CAT CCT GAT TTG CGA TCC TCTGGAAAGAAACCTGCTGTTTGTGCTAGCCCCAGATACCAGCATCCTGATTTGCGATCC -S--G--K--K--P--A--V--C--A--S--P--R--Y--Q--H--P--D--L--R--S- AGA AAT TTC AAT GAA CCT GAT AAA AAG ATC CAT TTC AAA TCT GAA CCT GAG AAA AAG ATC AGAAATTTCAATGAACCTGATAAAAAGATCCATTTCAAATCTGAACCTGAGAAAAAGATC -R--N--F--N--E--P--D--K--K--I--H--F--K--S--E--P--E--K--K--I- AAT TTC AAA ACT GAA CCT GAT AAA AAA CTG CAG AAG CAG GTT GAG TTA AAT TGC CCA CCC AATTTCAAAACTGAACCTGATAAAAAACTGCAGAAGCAGGTTGAGTTAAATTGCCCACCC -N--F--K--T--E--P--D--K--K--L--Q--K--Q--V--E--L--N--C--P--P- TCA GCC AGT CCA AGG AAT TCT GAA ATT ACC AGA AAG AGT AAT GTT ACC GTT ACT TCT GAA TCAGCCAGTCCAAGGAATTCTGAAATTACCAGAAAGAGTAATGTTACCGTTACTTCTGAA -S--A--S--P--R--N--S--E--I--T--R--K--S--N--V--T--V--T--S--E- ACA CCT GGA TCA AGG TCT ACT GGG GTA AGT CCG AGG AAC CCA TTC TCA TCA GGG TCT TTT ACACCTGGATCAAGGTCTACTGGGGTAAGTCCGAGGAACCCATTCTCATCAGGGTCTTTT -T--P--G--S--R--S--T--G--V--S--P--R--N--P--F--S--S--G--S--F- AAG CAA TCA GCC AAG AAT GGA ACT GCT GTT GGA GGA ATG GCC AAT GGG AGA GCA GTG AAT AAGCAATCAGCCAAGAATGGAACTGCTGTTGGAGGAATGGCCAATGGGAGAGCAGTGAAT -K--Q--S--A--K--N--G--T--A--V--G--G--M--A--N--G--R--A--V--N- AAC AAC CCA GAC ACT ACA CCA GCA GCG CAT TTA ACT GCT GAT AAA GTT CCA ACA GTG AGA AACAACCCAGACACTACACCAGCAGCGCATTTAACTGCTGATAAAGTTCCAACAGTGAGA -N--N--P--D--T--T--P--A--A--H--L--T--A--D--K--V--P--T--V--R- AAA GTT GCA GGT TTC TTT CAC CAA GAA CAG GAG CAG GGC CTT AGT GAC CCT GTT CAG TTG AAAGTTGCAGGTTTCTTTCACCAAGAACAGGAGCAGGGCCTTAGTGACCCTGTTCAGTTG -K--V--A--G--F--F--H--Q--E--Q--E--Q--G--L--S--D--P--V--Q--L- ATG AGA ATG TTG TCT GAA AAA GCT CAA AAT CAA CAG AAC TCT TTG AGT CAG TCC CTA ACT ATGAGAATGTTGTCTGAAAAAGCTCAAAATCAACAGAACTCTTTGAGTCAGTCCCTAACT -M--R--M--L--S--E--K--A--Q--N--Q--Q--N--S--L--S--Q--S--L--T- GAT GCT TCT CCA ATT TCT CCT GTG ACT CCA TCT GTG AGG AAA GAT GAT TCA GGA AAT GCC GATGCTTCTCCAATTTCTCCTGTGACTCCATCTGTGAGGAAAGATGATTCAGGAAATGCC -D--A--S--P--I--S--P--V--T--P--S--V--R--K--D--D--S--G--N--A- GCT GCC ACT GCT GCC CGA GCA TGG ATG TCA GTT GGG GCA GGA GGT TTC AGA CAA GGC ATG GCTGCCACTGCTGCCCGAGCATGGATGTCAGTTGGGGCAGGAGGTTTCAGACAAGGCATG -A--A--T--A--A--R--A--W--M--S--V--G--A--G--G--F--R--Q--G--M- GAA ACA GCA AGC TTG CAG AAT AGT CAT ATT TCT GCT GAT TCA TTG TAT AAC CCT TCT CGC GAAACAGCAAGCTTGCAGAATAGTCATATTTCTGCTGATTCATTGTATAACCCTTCTCGC -E--T--A--S--L--Q--N--S--H--I--S--A--D--S--L--Y--N--P--S--R- AAT GTC CAG CAA CAA ACT TCA CGA GTT CGG GGT GAA CAT CCT GCA TCA GCA ATG CAC TTT AATGTCCAGCAACAAACTTCACGAGTTCGGGGTGAACATCCTGCATCAGCAATGCACTTT -N--V--Q--Q--Q--T--S--R--V--R--G--E--H--P--A--S--A--M--H--F- CAG GCT GAG AAC AGT AGT CCA CTT CAT GCT TTT GTG CCT CAT CCT GCA AGA GTG GGC AGT CAGGCTGAGAACAGTAGTCCACTTCATGCTTTTGTGCCTCATCCTGCAAGAGTGGGCAGT -Q--A--E--N--S--S--P--L--H--A--F--V--P--H--P--A--R--V--G--S- GAA GCT CAA TTT CAG AAT CCG CAA ATG ATT TTC CGC CAA TCA ATA CCT GCT GAC TTG TCT GAAGCTCAATTTCAGAATCCGCAAATGATTTTCCGCCAATCAATACCTGCTGACTTGTCT -E--A--Q--F--Q--N--P--Q--M--I--F--R--Q--S--I--P--A--D--L--S- AGG TTC CAG GTA CAA TCT GCT TGG CAG GGG TTT AAT CAA CCA GCA CAG CCA AGG CAG AAG AGGTTCCAGGTACAATCTGCTTGGCAGGGGTTTAATCAACCAGCACAGCCAAGGCAGAAG -R--F--Q--V--Q--S--A--W--Q--G--F--N--Q--P--A--Q--P--R--Q--K- CAG GAT TCC CTC CCC CCT GAC TTA AAC ATT AGT TTC CAG TCA TCT GGG TCT CCT GGT CGT CAGGATTCCCTCCCCCCTGACTTAAACATTAGTTTCCAGTCATCTGGGTCTCCTGGTCGT -Q--D--S--L--P--P--D--L--N--I--S--F--Q--S--S--G--S--P--G--R- CCA TCT TCA ACT GTT TTG GTT GAT TCT CAG CAG CCA GAC CTG GCC TTG CAA TTA TGA GAC CCATCTTCAACTGTTTTGGTTGATTCTCAGCAGCCAGACCTGGCCTTGCAATTATGA... -P--S--S--T--V--L--V--D--S--Q--Q--P--D--L--A--L--Q--L--*-... CAAGCAATTTCTGATAAAATATTTGAAGAGGTCTGAACCTACAAGAGCCTTTGGATCTTT ............................................................ ............................................................ TGGCTGGCATGTCTGAATCTTCTTTTTCGGCATCACTGCTTCAGCAAACTACTAGCATCT ............................................................ ............................................................ GCCTGTAATTGCTGAAGGCTTTGATATCGGGTCTCATTTCGTTGAACTTTAAGTTGGCAA ............................................................ ............................................................ CTCATCAATTGGAGTCAACTGCTTCATTTATTTTTTTGGGATGTTCCGAGGTATTATTTC ............................................................ ............................................................ TTCACTGGCTATGTTGTAGTGATGGAAAAGGCAATAGATCTAGTTCAGGTTTAGGATAGG ............................................................ ............................................................ CAGCAGGCACAACTGGAGGATCACTGTCCAGGTCACAAATCGTGGATCGTTTCATGTCAA ............................................................ ............................................................ TCACTGACTTGGAATTGTGATTTAGATAGCTGAAGAAGTAAGCATATTACATTAATACTA ............................................................ ............................................................ GTTCGTTCGTTTGTTGCAGTGTTTGCTATATGGTCATTTACTGATAGAAATGCTTTAATT ............................................................ ............................................................ CATTGTACATTGGAGTAAGGTGGGACTAGTCTTTGGAGTTTTTGTCATTTTTACTTCAAT ............................................................ ............................................................ TATTGTAGTTCTACCTCATTTTCCTCCTTGCTCGACTATATGTAATGGCGTAAATTTCAG ............................................................ ............................................................ AGAAATATAAAAGAATTGGTATTCTTTTTTT ............................... ............................... .
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use
![[RSS logo]](/i/rss_icon_16.png "Ensembl blog"){kind=icon}
![[twitter logo]](/i/twitter.png "Follow us on Twitter!")
