Solanum tuberosum (SolTub_3.0)
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NSFL1 cofactor p47 [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG400016724]

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This transcript has 4 exons and is annotated with 20 domains and features.

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-PGSC0003DMT4000431091351304aa
 
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M1BE38 Ensembl Canonical
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     1 ATTGGCACCCCCAAACAAGACAAAAGAGGAGAAGAATAAATAAATAAAAAGCCCTAGAAT     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 TAGGTGATTAGTATAATCATTGAATCGAATCGTATTCCCCTCATTCTCGAAGTTGCAGCA    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 ACAGAGTAGAATCAATGTCCTCACGCGATAGCAAGAAACCCTCTAGGCAAACCTCCGGTA    180
       ..............ATGTCCTCACGCGATAGCAAGAAACCCTCTAGGCAAACCTCCGGTA     46
       ..............-M--S--S--R--D--S--K--K--P--S--R--Q--T--S--G--     15

                                                                          
   181 GCCGTGCCGGTGGAATTCGTACACTTTCCGATCTCAATCGTCCATCCGGTCACGATTCCG    240
    47 GCCGTGCCGGTGGAATTCGTACACTTTCCGATCTCAATCGTCCATCCGGTCACGATTCCG    106
    16 S--R--A--G--G--I--R--T--L--S--D--L--N--R--P--S--G--H--D--S--     35

                                                                          
   241 ACAGCGATTCCGATGGTCCCCAAGAATACTACACCGGTGGTGAAAAAAGTGGAATGCTTG    300
   107 ACAGCGATTCCGATGGTCCCCAAGAATACTACACCGGTGGTGAAAAAAGTGGAATGCTTG    166
    36 D--S--D--S--D--G--P--Q--E--Y--Y--T--G--G--E--K--S--G--M--L--     55

                                                                          
   301 TTCAAGATCCTTTAAAGCATAATGATGTGGACTCCATCTTTGACCGAGCTAGGCAAGTGG    360
   167 TTCAAGATCCTTTAAAGCATAATGATGTGGACTCCATCTTTGACCGAGCTAGGCAAGTGG    226
    56 V--Q--D--P--L--K--H--N--D--V--D--S--I--F--D--R--A--R--Q--V--     75

                                                                          
   361 GTGCCACGCAAGGTCCTTTGGAAAATGTCGTCCCTAGTTCAAGCTCAACAAGCTTTACTG    420
   227 GTGCCACGCAAGGTCCTTTGGAAAATGTCGTCCCTAGTTCAAGCTCAACAAGCTTTACTG    286
    76 G--A--T--Q--G--P--L--E--N--V--V--P--S--S--S--S--T--S--F--T--     95

                                                                          
   421 GATCTGCGAGAACACTTGCAGGGGAGACAGTGCCAACATCAGCTCCTCAACCACCCGAGT    480
   287 GATCTGCGAGAACACTTGCAGGGGAGACAGTGCCAACATCAGCTCCTCAACCACCCGAGT    346
    96 G--S--A--R--T--L--A--G--E--T--V--P--T--S--A--P--Q--P--P--E--    115

                                                                          
   481 CCATCGTGCACAATATTGTCTTCTGGAGAAACGGTTTCACTGTAAATGATGGTTCTTTGA    540
   347 CCATCGTGCACAATATTGTCTTCTGGAGAAACGGTTTCACTGTAAATGATGGTTCTTTGA    406
   116 S--I--V--H--N--I--V--F--W--R--N--G--F--T--V--N--D--G--S--L--    135

                                                                          
   541 GAAGGCTGGATGATCCTGAAAATGCATCTTTTCTGGAGAGTATCACAAAGTCTGAATGTC    600
   407 GAAGGCTGGATGATCCTGAAAATGCATCTTTTCTGGAGAGTATCACAAAGTCTGAATGTC    466
   136 R--R--L--D--D--P--E--N--A--S--F--L--E--S--I--T--K--S--E--C--    155

                                                                          
   601 CTAGAGAGTTGGCTCCTGCAGATACCAGATCCCAGGTGCATTGCAACCTCATAAGAAGGG    660
   467 CTAGAGAGTTGGCTCCTGCAGATACCAGATCCCAGGTGCATTGCAACCTCATAAGAAGGG    526
   156 P--R--E--L--A--P--A--D--T--R--S--Q--V--H--C--N--L--I--R--R--    175

                                                                          
   661 ATGAGAACTGTCCTGAACCAGAGAAACACCAAGTTTCGTTTCAGGGAGTGGGAAGAACAC    720
   527 ATGAGAACTGTCCTGAACCAGAGAAACACCAAGTTTCGTTTCAGGGAGTGGGAAGAACAC    586
   176 D--E--N--C--P--E--P--E--K--H--Q--V--S--F--Q--G--V--G--R--T--    195

                                                                          
   721 TTGGAAGCAGCGCAACTCCAGCAACTTCTGAGCCATCTGCTTCTGCTCCCACAAGCACAG    780
   587 TTGGAAGCAGCGCAACTCCAGCAACTTCTGAGCCATCTGCTTCTGCTCCCACAAGCACAG    646
   196 L--G--S--S--A--T--P--A--T--S--E--P--S--A--S--A--P--T--S--T--    215

                                                                          
   781 TCCCAGCAGCTTCCACTAGTGTTCTGGATGAATCATTGCCTTCGACCTCGCTTCAAATTA    840
   647 TCCCAGCAGCTTCCACTAGTGTTCTGGATGAATCATTGCCTTCGACCTCGCTTCAAATTA    706
   216 V--P--A--A--S--T--S--V--L--D--E--S--L--P--S--T--S--L--Q--I--    235

                                                                          
   841 GATTGGCAGATGGAAGTCGCATGGTTGCACACTTCAACTTCCACCAAACTGTTGGTGACA    900
   707 GATTGGCAGATGGAAGTCGCATGGTTGCACACTTCAACTTCCACCAAACTGTTGGTGACA    766
   236 R--L--A--D--G--S--R--M--V--A--H--F--N--F--H--Q--T--V--G--D--    255

                                                                          
   901 TCCGTGCCTTTATTGATGCTTCAAGGCCAAGTGACACCAGAGCATATCAACTACAAACTG    960
   767 TCCGTGCCTTTATTGATGCTTCAAGGCCAAGTGACACCAGAGCATATCAACTACAAACTG    826
   256 I--R--A--F--I--D--A--S--R--P--S--D--T--R--A--Y--Q--L--Q--T--    275

                                                                          
   961 TTGGATTTCCTCCTAAAATGCTCAGTGACCCAACCCAAACGATTGAGCAAGCAGGACTCG   1020
   827 TTGGATTTCCTCCTAAAATGCTCAGTGACCCAACCCAAACGATTGAGCAAGCAGGACTCG    886
   276 V--G--F--P--P--K--M--L--S--D--P--T--Q--T--I--E--Q--A--G--L--    295

                                                                          
  1021 CAAATTCAGTGGTTATACAAAAGTTTTAGTGAGCTGCGAAAACTCTCTTTTCGTTTTATT   1080
   887 CAAATTCAGTGGTTATACAAAAGTTTTAG...............................    915
   296 A--N--S--V--V--I--Q--K--F--*-...............................    304

                                                                          
  1081 ATTTCCAGACGTTTCGATCTTATTTACTACTGGATATTATTTTTAATCTTTGTGAATCTA   1140
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1141 AAGCTGTACCAAGACAGCAGCAGGTGTTGTTTAAAATTCAAATTTTCTTAAATGCAACGT   1200
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1201 TGTACGGGTCTGTCCCCCAATTATGTGTCATATGGTACTTTCATCTCCTGTAAGAACAGC   1260
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1261 TGCTGTGTGGAAATGAAGTAGAATGGTTTGTATGATTTGAGCATTCAAGACTTGGTGATA   1320
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1321 TCACAGAATATGATTTACTGATGAATTGCAG                                1351
       ...............................                                    
       ...............................