Transcript: PGSC0003DMT400033530
.
Description
Armadillo/beta-catenin repeat family protein [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG400012880]
Show/hide columns (1 hidden)
- PGSC0003DMT400033530 2633 708aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1AZA4 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - PGSC0003DMT400033529 2628 366aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1AZA3 - - PGSC0003DMT400033536 561 79aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1AZA6 - - PGSC0003DMT400033531 438 85aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1AZA5 -
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 G CGGGCGTTGCCCCCAGAAAGGGTCCGGTTCCGGGTACAAAAACCCAAAACCAACCACTC 60
............................................................
............................................................
61 CCACAAATATTTCATTTTATCCCTAAAGTGCCCCCCGCACACATTACACACACTGATTAC 120
............................................................
............................................................
121 TCTGTATCACACCTTTTCTCCTCTTCCTCATTTCCTCTCTCCC ATG GAG AAC CAG AAG CT 180
...........................................ATGGAGAACCAGAAGCT 17
...........................................-M--E--N--Q--K--L 6
181 T ACC GAG CGT TCG TCA AGT TCT GCG AGG AGG AGC TTG AAG AGA AAG CTA GAG GAA GAT CT 240
18 TACCGAGCGTTCGTCAAGTTCTGCGAGGAGGAGCTTGAAGAGAAAGCTAGAGGAAGATCT 77
6 --T--E--R--S--S--S--S--A--R--R--S--L--K--R--K--L--E--E--D--L 26
241 C CAA GAC GAT CGT AAG GTT TCT CCT TCT CTA TCT TCG GAA GAT GGT CAT CAA GAT CTG GA 300
78 CCAAGACGATCGTAAGGTTTCTCCTTCTCTATCTTCGGAAGATGGTCATCAAGATCTGGA 137
26 --Q--D--D--R--K--V--S--P--S--L--S--S--E--D--G--H--Q--D--L--E 46
301 A CGT GAA GTT CGT ACA CAG GTG GAG ATT CTT GAG TCA TCT TTT TCT TCA TCC GAG TCA GA 360
138 ACGTGAAGTTCGTACACAGGTGGAGATTCTTGAGTCATCTTTTTCTTCATCCGAGTCAGA 197
46 --R--E--V--R--T--Q--V--E--I--L--E--S--S--F--S--S--S--E--S--D 66
361 T CGA GCC TCT TCC AAA CGC GCT ATA CAT GTT CTC TCT GAA TTT GCC AAA AAC G AG GAA AT 420
198 TCGAGCCTCTTCCAAACGCGCTATACATGTTCTCTCTGAATTTGCCAAAAACGAGGAAAT 257
66 --R--A--S--S--K--R--A--I--H--V--L--S--E--F--A--K--N--E--E--I 86
421 T GTG AAC GTA ATT GTA GAT TGC GGC GCT GTT CCG GCT TTG GTG CAG CAT CTA CAG GCG CC 480
258 TGTGAACGTAATTGTAGATTGCGGCGCTGTTCCGGCTTTGGTGCAGCATCTACAGGCGCC 317
86 --V--N--V--I--V--D--C--G--A--V--P--A--L--V--Q--H--L--Q--A--P 106
481 G CCT CAT GTA AAT GAA GGT GAA GGT AGT CAC ATG CCA TAC GAA CAT GAG GTT GAG AAA GG 540
318 GCCTCATGTAAATGAAGGTGAAGGTAGTCACATGCCATACGAACATGAGGTTGAGAAAGG 377
106 --P--H--V--N--E--G--E--G--S--H--M--P--Y--E--H--E--V--E--K--G 126
541 A AGT GCT TTT ACG CTT GGG CTT CTT GCT ATA AAA C CG GAG CAC CAA CAA CTG ATT GTT GA 600
378 AAGTGCTTTTACGCTTGGGCTTCTTGCTATAAAACCGGAGCACCAACAACTGATTGTTGA 437
126 --S--A--F--T--L--G--L--L--A--I--K--P--E--H--Q--Q--L--I--V--D 146
601 T GCT GGA GCT TTG CCT CAT CTT GTT AAT TTG CTG AAG AGG CAT AGA GAT GCT CAG AAC TC 660
438 TGCTGGAGCTTTGCCTCATCTTGTTAATTTGCTGAAGAGGCATAGAGATGCTCAGAACTC 497
146 --A--G--A--L--P--H--L--V--N--L--L--K--R--H--R--D--A--Q--N--S 166
661 T CGC GCA GTC AAT GGT GTT ATT CGG CGC GCA GCT GAT GCA GTC ACA AAT CTT GCT CAT GA 720
498 TCGCGCAGTCAATGGTGTTATTCGGCGCGCAGCTGATGCAGTCACAAATCTTGCTCATGA 557
166 --R--A--V--N--G--V--I--R--R--A--A--D--A--V--T--N--L--A--H--E 186
721 A AAC AGT AGC ATC AAA ACT CGT GTT AG G GTT GAA GGT GGC ATC CCT CCA CTT GTT GAG TT 780
558 AAACAGTAGCATCAAAACTCGTGTTAGGGTTGAAGGTGGCATCCCTCCACTTGTTGAGTT 617
186 --N--S--S--I--K--T--R--V--R--V--E--G--G--I--P--P--L--V--E--L 206
781 G CTT GAG TTT GTT GAT TCA AAG GTG CAG AGA GCA GCT GCA GGA TCC TTA CGA ACG TTA GC 840
618 GCTTGAGTTTGTTGATTCAAAGGTGCAGAGAGCAGCTGCAGGATCCTTACGAACGTTAGC 677
206 --L--E--F--V--D--S--K--V--Q--R--A--A--A--G--S--L--R--T--L--A 226
841 A TTT AAG AAT GAT GAA AAC AAA AAT CAG ATT GTG GAA TGC AGT GCA CTC CCC ACT CTT AT 900
678 ATTTAAGAATGATGAAAACAAAAATCAGATTGTGGAATGCAGTGCACTCCCCACTCTTAT 737
226 --F--K--N--D--E--N--K--N--Q--I--V--E--C--S--A--L--P--T--L--I 246
901 A CTA ATG CTT CGG TCT GAA GAT ACT GCT ATA CAC TAT GAA GCG GTT GGA GTC ATT GGA AA 960
738 ACTAATGCTTCGGTCTGAAGATACTGCTATACACTATGAAGCGGTTGGAGTCATTGGAAA 797
246 --L--M--L--R--S--E--D--T--A--I--H--Y--E--A--V--G--V--I--G--N 266
961 T CTG GTG CAC TCG TCA CCA AAT ATC AAG AAA GAA GTT CTT CTT GCA GGA GCT TTA CAA CC 1020
798 TCTGGTGCACTCGTCACCAAATATCAAGAAAGAAGTTCTTCTTGCAGGAGCTTTACAACC 857
266 --L--V--H--S--S--P--N--I--K--K--E--V--L--L--A--G--A--L--Q--P 286
1021 T GTA ATT GGG TTG CTT AG T TCC TCC TGT TCA GAG AGC CAA AGG GAA GCT GCT TTA CTG CT 1080
858 TGTAATTGGGTTGCTTAGTTCCTCCTGTTCAGAGAGCCAAAGGGAAGCTGCTTTACTGCT 917
286 --V--I--G--L--L--S--S--S--C--S--E--S--Q--R--E--A--A--L--L--L 306
1081 A GGA CAA TTT GCA GCA ACT GAT TCA GAC TGT AAG ATT CAT ATT GTT CAA AGA GGT GCA GT 1140
918 AGGACAATTTGCAGCAACTGATTCAGACTGTAAGATTCATATTGTTCAAAGAGGTGCAGT 977
306 --G--Q--F--A--A--T--D--S--D--C--K--I--H--I--V--Q--R--G--A--V 326
1141 T CCA CCA TTA ATT GAG ATG CTT CAA TCT CCA GAT GCT CAA CTT AGA GAA ATG TCG GCC TT 1200
978 TCCACCATTAATTGAGATGCTTCAATCTCCAGATGCTCAACTTAGAGAAATGTCGGCCTT 1037
326 --P--P--L--I--E--M--L--Q--S--P--D--A--Q--L--R--E--M--S--A--F 346
1201 T GCC CTA GGA AGG TTG GCG CAG GAC ACA CAC AAT CAG GCT GGT ATT GCT CAC TGT GGT GG 1260
1038 TGCCCTAGGAAGGTTGGCGCAGGACACACACAATCAGGCTGGTATTGCTCACTGTGGTGG 1097
346 --A--L--G--R--L--A--Q--D--T--H--N--Q--A--G--I--A--H--C--G--G 366
1261 A ATT ATC CCA TTG TTG AAG CTC CTT GAT TCA AAA AAT GGA TCA TTA CAA CAT AAT GCT GC 1320
1098 AATTATCCCATTGTTGAAGCTCCTTGATTCAAAAAATGGATCATTACAACATAATGCTGC 1157
366 --I--I--P--L--L--K--L--L--D--S--K--N--G--S--L--Q--H--N--A--A 386
1321 A TTT GCT CTT TAT GGG CTT GCT GAT AAT GAG G AC AAT GTA GCT GAT CTT ATA AAG GTC GG 1380
1158 ATTTGCTCTTTATGGGCTTGCTGATAATGAGGACAATGTAGCTGATCTTATAAAGGTCGG 1217
386 --F--A--L--Y--G--L--A--D--N--E--D--N--V--A--D--L--I--K--V--G 406
1381 A GGT GTT CAA AAG CTT CAG GAT GGA GAA TTT ATT GTC CAA C CA ACT AGA GAT TGT GTG GC 1440
1218 AGGTGTTCAAAAGCTTCAGGATGGAGAATTTATTGTCCAACCAACTAGAGATTGTGTGGC 1277
406 --G--V--Q--K--L--Q--D--G--E--F--I--V--Q--P--T--R--D--C--V--A 426
1441 G AAG ACA TTG AAG AGA TTA GAA GAG AAG ATC CAT GGT CGA ATA TTG GGC CAT CTG TTA TA 1500
1278 GAAGACATTGAAGAGATTAGAAGAGAAGATCCATGGTCGAATATTGGGCCATCTGTTATA 1337
426 --K--T--L--K--R--L--E--E--K--I--H--G--R--I--L--G--H--L--L--Y 446
1501 T TTG ATG CGT ATT GGG GAG AAG GTT ATT CAG AGA CGA GTT GCA TTA GCC CTT GCC CAT CT 1560
1338 TTTGATGCGTATTGGGGAGAAGGTTATTCAGAGACGAGTTGCATTAGCCCTTGCCCATCT 1397
446 --L--M--R--I--G--E--K--V--I--Q--R--R--V--A--L--A--L--A--H--L 466
1561 T TGC GCA CCA GAT GAC CAA AAG ATT ATT TTC ATT GAT AAC AGT G GA TTA GAA TTG CTT TT 1620
1398 TTGCGCACCAGATGACCAAAAGATTATTTTCATTGATAACAGTGGATTAGAATTGCTTTT 1457
466 --C--A--P--D--D--Q--K--I--I--F--I--D--N--S--G--L--E--L--L--L 486
1621 G GAG CTC TTT GAC TCA ACA AAC TTG AAA CAC AAA AGA GAT GGC TCT GCA GCT TTA TGC AA 1680
1458 GGAGCTCTTTGACTCAACAAACTTGAAACACAAAAGAGATGGCTCTGCAGCTTTATGCAA 1517
486 --E--L--F--D--S--T--N--L--K--H--K--R--D--G--S--A--A--L--C--K 506
1681 A TTG GCT AAT AAA GCT AGC TCA CTT TCA CAA GTC GAT GCT GCT CCT CCA TCC CCA GTG CC 1740
1518 ATTGGCTAATAAAGCTAGCTCACTTTCACAAGTCGATGCTGCTCCTCCATCCCCAGTGCC 1577
506 --L--A--N--K--A--S--S--L--S--Q--V--D--A--A--P--P--S--P--V--P 526
1741 T CAG GTC TAT CTG GGT GAA CAG TAT GTA AAT AAT TCT ACA CTG TCT GAT GTA ACA TTT TT 1800
1578 TCAGGTCTATCTGGGTGAACAGTATGTAAATAATTCTACACTGTCTGATGTAACATTTTT 1637
526 --Q--V--Y--L--G--E--Q--Y--V--N--N--S--T--L--S--D--V--T--F--L 546
1801 A GTT GAG G G C AAA CGG TTT TAT GCC CAT AGG ATT TGT TTA CTA GCT TCT TCT GAT GCA TT 1860
1638 AGTTGAGGGCAAACGGTTTTATGCCCATAGGATTTGTTTACTAGCTTCTTCTGATGCATT 1697
546 --V--E--G--K--R--F--Y--A--H--R--I--C--L--L--A--S--S--D--A--F 566
1861 T CGA GCT ATG TTT GAT GGT GGC TAC CGG G AG AGA GAT GCC AAA GAC ATA GAA ATC CCA AA 1920
1698 TCGAGCTATGTTTGATGGTGGCTACCGGGAGAGAGATGCCAAAGACATAGAAATCCCAAA 1757
566 --R--A--M--F--D--G--G--Y--R--E--R--D--A--K--D--I--E--I--P--N 586
1921 T ATC AGA TGG GAC GTT TTT GAG TTG ATG ATG AG G TAC ATA TAC ACA GGA TCT GTT GAT GT 1980
1758 TATCAGATGGGACGTTTTTGAGTTGATGATGAGGTACATATACACAGGATCTGTTGATGT 1817
586 --I--R--W--D--V--F--E--L--M--M--R--Y--I--Y--T--G--S--V--D--V 606
1981 T AAT TTG GAT GTT GCA CAG GAT CTT CTA AGA GCT GCA GAC CAG TAT CTA TTA GAG GGC CT 2040
1818 TAATTTGGATGTTGCACAGGATCTTCTAAGAGCTGCAGACCAGTATCTATTAGAGGGCCT 1877
606 --N--L--D--V--A--Q--D--L--L--R--A--A--D--Q--Y--L--L--E--G--L 626
2041 T AAA CGT CTT TGC GAG TAT GCC ATT GCA CAG G AT ATA TCT GTG GAA AGT GTC TCT CTC AT 2100
1878 TAAACGTCTTTGCGAGTATGCCATTGCACAGGATATATCTGTGGAAAGTGTCTCTCTCAT 1937
626 --K--R--L--C--E--Y--A--I--A--Q--D--I--S--V--E--S--V--S--L--M 646
2101 G TTT GAG TTG TCG GAG GCA TTT AAC GCT TTG ACG TTA CGT AAT GCT TGC ATT CTA TTC AT 2160
1938 GTTTGAGTTGTCGGAGGCATTTAACGCTTTGACGTTACGTAATGCTTGCATTCTATTCAT 1997
646 --F--E--L--S--E--A--F--N--A--L--T--L--R--N--A--C--I--L--F--I 666
2161 T TTG GAA AAG TTT GAC CAA TTA AGT GTC ATG CCA TG G TAT TCA CAT TTG ATT CAA CGT GT 2220
1998 TTTGGAAAAGTTTGACCAATTAAGTGTCATGCCATGGTATTCACATTTGATTCAACGTGT 2057
666 --L--E--K--F--D--Q--L--S--V--M--P--W--Y--S--H--L--I--Q--R--V 686
2221 A TTA CCT GAA ACT CGA AGT TAC TTT GTA AGG GCA CTT ACC AGG GCT ATT CAA GCT GAC AT 2280
2058 ATTACCTGAAACTCGAAGTTACTTTGTAAGGGCACTTACCAGGGCTATTCAAGCTGACAT 2117
686 --L--P--E--T--R--S--Y--F--V--R--A--L--T--R--A--I--Q--A--D--M 706
2281 G CGG GTC TAG ATGTTTCTGATTCAGTTTTGTTTTTTTATTAATTGTAACCGGGGGAAGGT 2340
2118 GCGGGTCTAG.................................................. 2127
706 --R--V--*-.................................................. 708
2341 AGTATGTACAGGAGTGGTTACTATTGTAATAGTCTCAAAATGAGCGCTAATGTAAAATTA 2400
............................................................
............................................................
2401 CTCAAAGATGCACCAATATTAGTAGATCTTTGGGTCAACTTAGCTTATTATAAGGTTTCA 2460
............................................................
............................................................
2461 ACGCCTGCTATGTTGTTAATGGTCTTTGATGAGGTGAAAGAATGAGTATTTACATTGAAA 2520
............................................................
............................................................
2521 ATCTTGATATAGTGGGTGTCGTAGTCAGATTTTTATAGAACCCTTTGGAGTTGTACACTA 2580
............................................................
............................................................
2581 AACTTGATATTAGATTATTCATTTTTATGTTGGTAACCAATATATGATAGGTG 2633
.....................................................
.....................................................
.
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use