Transcript: PGSC0003DMT400020556
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Description
WD-repeat protein [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG400007963]
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- PGSC0003DMT400020555 1887 628aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1ADP7 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - PGSC0003DMT400020556 1776 448aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1ADP8 -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 C TCGCGCAAAAACTCAAACTATTCCGGCAGTGAGTGCTTCTTGCAAAACCTACTAA ATG A 60
........................................................ATGA 4
........................................................-M-- 1
61 CG GAG CCG GAA TTG GTA ATC GCT TCA TCG CCG ACC GAC GCC GGT ATT GGA TGT TGG GAC C 120
5 CGGAGCCGGAATTGGTAATCGCTTCATCGCCGACCGACGCCGGTATTGGATGTTGGGACC 64
2 T--E--P--E--L--V--I--A--S--S--P--T--D--A--G--I--G--C--W--D-- 21
121 TC CAT ACC GGC GCT GAG CAC CTC CGT TAT CGA ACT TGC TCC TCC CCT TCC CAC GGC CTT A 180
65 TCCATACCGGCGCTGAGCACCTCCGTTATCGAACTTGCTCCTCCCCTTCCCACGGCCTTA 124
22 L--H--T--G--A--E--H--L--R--Y--R--T--C--S--S--P--S--H--G--L-- 41
181 CC TGT GTC GGC GGC CGC TTT CTC GCC TCT TCT CAA CTC CGT GAA ACT AAA TCT TCC TCA G 240
125 CCTGTGTCGGCGGCCGCTTTCTCGCCTCTTCTCAACTCCGTGAAACTAAATCTTCCTCAG 184
42 T--C--V--G--G--R--F--L--A--S--S--Q--L--R--E--T--K--S--S--S-- 61
241 GC TCT ATC CTT TAC TGG TCC TGG AAC AAG C CT CAA GTG GAA GTT AAA AGC TTC CCA GCG G 300
185 GCTCTATCCTTTACTGGTCCTGGAACAAGCCTCAAGTGGAAGTTAAAAGCTTCCCAGCGG 244
62 G--S--I--L--Y--W--S--W--N--K--P--Q--V--E--V--K--S--F--P--A-- 81
301 AA CCT ATA AAT CCA CTT GTT TCC AAC AGT GAG GGA ACT TAT ATA GCC GGA GGA GGT GCA T 360
245 AACCTATAAATCCACTTGTTTCCAACAGTGAGGGAACTTATATAGCCGGAGGAGGTGCAT 304
82 E--P--I--N--P--L--V--S--N--S--E--G--T--Y--I--A--G--G--G--A-- 101
361 CC GGC GAA ATT TAC TTG TGG CAG GTT GCT ACT GGT AAA CTA CTT AAG AAG TGG CAT GCT C 420
305 CCGGCGAAATTTACTTGTGGCAGGTTGCTACTGGTAAACTACTTAAGAAGTGGCATGCTC 364
102 S--G--E--I--Y--L--W--Q--V--A--T--G--K--L--L--K--K--W--H--A-- 121
421 AC TAT AGG GCG GTT ACT TGC TTG TTA TTC AAT GAT GAT CAA TCA CTT CTG ATT TCT GGT T 480
365 ACTATAGGGCGGTTACTTGCTTGTTATTCAATGATGATCAATCACTTCTGATTTCTGGTT 424
122 H--Y--R--A--V--T--C--L--L--F--N--D--D--Q--S--L--L--I--S--G-- 141
481 CA GAG GAT GGA TCA GTT CGA GTT TGG TCT CTT ATA AT G GTA TTT GAT GAC TTG TTG AGA G 540
425 CAGAGGATGGATCAGTTCGAGTTTGGTCTCTTATAATGGTATTTGATGACTTGTTGAGAG 484
142 S--E--D--G--S--V--R--V--W--S--L--I--M--V--F--D--D--L--L--R-- 161
541 GG AAA GCA AGA CAA CCT TAT GAG TTT AGT TTC TCA GAG CAT TCT TTG AAG GTG ACT GAT G 600
485 GGAAAGCAAGACAACCTTATGAGTTTAGTTTCTCAGAGCATTCTTTGAAGGTGACTGATG 544
162 G--K--A--R--Q--P--Y--E--F--S--F--S--E--H--S--L--K--V--T--D-- 181
601 TT GTG ATT GGG TAC GGC GGA GCT AAT GCA ATT ATT GTT TCT GCT TCA GAA GAT AGA ACT T 660
545 TTGTGATTGGGTACGGCGGAGCTAATGCAATTATTGTTTCTGCTTCAGAAGATAGAACTT 604
182 V--V--I--G--Y--G--G--A--N--A--I--I--V--S--A--S--E--D--R--T-- 201
661 GC AAG G TT TGG AGT CTT TCT AGG GGA AAA TTG TTG AGA AAC ATT GTG TTT CCA TCA ATA A 720
605 GCAAGGTTTGGAGTCTTTCTAGGGGAAAATTGTTGAGAAACATTGTGTTTCCATCAATAA 664
202 C--K--V--W--S--L--S--R--G--K--L--L--R--N--I--V--F--P--S--I-- 221
721 TT GAC GCA ATT GCA TTA GAC CCC GGA GAA GAT GTC TTC TAT GCT GGT GGT AGA GAT GGG A 780
665 TTGACGCAATTGCATTAGACCCCGGAGAAGATGTCTTCTATGCTGGTGGTAGAGATGGGA 724
222 I--D--A--I--A--L--D--P--G--E--D--V--F--Y--A--G--G--R--D--G-- 241
781 AA ATA TAC ATA GCT GCA CTA AAT GCT GTT GCA GAC CCC AAT AAT AAT TAT GGA TTG CAC A 840
725 AAATATACATAGCTGCACTAAATGCTGTTGCAGACCCCAATAATAATTATGGATTGCACA 784
242 K--I--Y--I--A--A--L--N--A--V--A--D--P--N--N--N--Y--G--L--H-- 261
841 TT CTT GGG TTT CTC TCT GAG CAA AG C AAG GCT ATT ACA TGC TTA GCA TTA AGC ACG GAT G 900
785 TTCTTGGGTTTCTCTCTGAGCAAAGCAAGGCTATTACATGCTTAGCATTAAGCACGGATG 844
262 I--L--G--F--L--S--E--Q--S--K--A--I--T--C--L--A--L--S--T--D-- 281
901 GC AGC TTG CTA ATT TCT GGA TCA GAG GAT GGC ATG GTT CGA GTG TGG AAC ACC AAA AAC C 960
845 GCAGCTTGCTAATTTCTGGATCAGAGGATGGCATGGTTCGAGTGTGGAACACCAAAAACC 904
282 G--S--L--L--I--S--G--S--E--D--G--M--V--R--V--W--N--T--K--N-- 301
961 AT AAC ATC ACC CGA ATT TTT AGG CAT GCA AAA G GT CCA ATT AAC AAT GTT GTA GTT GTT A 1020
905 ATAACATCACCCGAATTTTTAGGCATGCAAAAGGTCCAATTAACAATGTTGTAGTTGTTA 964
302 H--N--I--T--R--I--F--R--H--A--K--G--P--I--N--N--V--V--V--V-- 321
1021 GA CAA TCA TCT CTT ATG AGT AAC CGA GGA ACC GTG AAT TCT CAA ATG CCT TCC GTT AAG A 1080
965 GACAATCATCTCTTATGAGTAACCGAGGAACCGTGAATTCTCAAATGCCTTCCGTTAAGA 1024
322 R--Q--S--S--L--M--S--N--R--G--T--V--N--S--Q--M--P--S--V--K-- 341
1081 GA CAC GGG GTA TCA TTA CCT CCA CCA TTG GAA AAG TGT GCT AAT TCA GCA GAT GAA AAT G 1140
1025 GACACGGGGTATCATTACCTCCACCATTGGAAAAGTGTGCTAATTCAGCAGATGAAAATG 1084
342 R--H--G--V--S--L--P--P--P--L--E--K--C--A--N--S--A--D--E--N-- 361
1141 AC TAT AAG GCA GTA ATT GGC CCC CGG ATC GAT CCT GAT AGA TCT GTT GAA ACT TCA TAT A 1200
1085 ACTATAAGGCAGTAATTGGCCCCCGGATCGATCCTGATAGATCTGTTGAAACTTCATATA 1144
362 D--Y--K--A--V--I--G--P--R--I--D--P--D--R--S--V--E--T--S--Y-- 381
1201 TC AGT ATT CAG TCC CTA AGT AAT CAA ATC TTA GAA CTT CAG AGA CAA GGG TCT TCT GCT G 1260
1145 TCAGTATTCAGTCCCTAAGTAATCAAATCTTAGAACTTCAGAGACAAGGGTCTTCTGCTG 1204
382 I--S--I--Q--S--L--S--N--Q--I--L--E--L--Q--R--Q--G--S--S--A-- 401
1261 CT GCT GAA ATG GAG ATC GAA AGG CTA AAA CTC GAC CGC AGC AGG TCC ATG CAA ATG ATT C 1320
1205 CTGCTGAAATGGAGATCGAAAGGCTAAAACTCGACCGCAGCAGGTCCATGCAAATGATTC 1264
402 A--A--E--M--E--I--E--R--L--K--L--D--R--S--R--S--M--Q--M--I-- 421
1321 AG CAG TGG GAA ACA AAG TTT CAA AGT CTA CAT CAG TTT TGT GTA ACC GAG CTA TTG GAT G 1380
1265 AGCAGTGGGAAACAAAGTTTCAAAGTCTACATCAGTTTTGTGTAACCGAGCTATTGGATG 1324
422 Q--Q--W--E--T--K--F--Q--S--L--H--Q--F--C--V--T--E--L--L--D-- 441
1381 GG GAA AAA GCT GGA AAT GCT TAG GGACACAGTCTTATAACATATTTTTCTAAAACACGGT 1440
1325 GGGAAAAAGCTGGAAATGCTTAG..................................... 1347
442 G--E--K--A--G--N--A--*-..................................... 448
1441 GAGCAGAAAGACGAAAGGGGAAAGCTAGATTTTAAACTTCCGCCTACATGATGGCTTGTG 1500
............................................................
............................................................
1501 ATGGTGCTCACCAAGTTAGCTAGCTCTCAACTCCAGTTTTCCATACCGATTCCTACCTGC 1560
............................................................
............................................................
1561 AACAGCTAATATTTTTTCACGTAACGATTCAGCTGCGATCAGTCGATTTAAACTATTGGT 1620
............................................................
............................................................
1621 TAACATTTGGATTCAGTCGATTCCGCAAACAAACAGATTACATTTTACATTTGATTATGT 1680
............................................................
............................................................
1681 ATCTTAATGTAAGATCTTGAACTATTTCACTAGCTGCTATGGGATATAATCTTAATGCTT 1740
............................................................
............................................................
1741 GTCAAATATTATTTTGTTCTCTTTTACATGCTAGAG 1776
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