Transcript: PGSC0003DMT400017985
.
Description
Cleavage and polyadenylation specificity factor [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG400006990]
Show/hide columns (1 hidden)
- PGSC0003DMT400017985 1845 396aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
M1A9V6 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
GGTGTCTGTACTCTCAAGCGCGTGTGCACCAGAAATGCGTCATTTCACTTTCCTAACCCA ............................................................ ............................................................ AATTCAATATCACCATTTTGTCTGAAAATCAACCCTACCTGAAACAAACTTCTATTTCCC ............................................................ ............................................................ GTCGTTTTCTTCACACTAATTTTCCGGCG ATG TCT ACG GCA ACA GCC GCC AAT GAT AAC A .............................ATGTCTACGGCAACAGCCGCCAATGATAACA .............................-M--S--T--A--T--A--A--N--D--N-- TA CCT AAC ACC GAC GTT AGC CCA AGT GAC GGT GTC GGA ATT GAC ACG ACG CCG TTT CTC A TACCTAACACCGACGTTAGCCCAAGTGACGGTGTCGGAATTGACACGACGCCGTTTCTCA I--P--N--T--D--V--S--P--S--D--G--V--G--I--D--T--T--P--F--L-- CT AGC CAG AAT TCC AGG AAC CGA CGT TCG TTC CGT CGC CCT CCG AGC CTC AGA GGA GCT G CTAGCCAGAATTCCAGGAACCGACGTTCGTTCCGTCGCCCTCCGAGCCTCAGAGGAGCTG T--S--Q--N--S--R--N--R--R--S--F--R--R--P--P--S--L--R--G--A-- CT GGA TTT CTA CGG CGT GCA AGT AGC CGC CGA TTG ATG CGT GAG CCG TCG ATG CGA GTA A CTGGATTTCTACGGCGTGCAAGTAGCCGCCGATTGATGCGTGAGCCGTCGATGCGAGTAA A--G--F--L--R--R--A--S--S--R--R--L--M--R--E--P--S--M--R--V-- GA GAA GCC GCT GCT GAG CAA ATC GAG GAG CGG CAA AGT GAT TGG GCT TAC TCA AAA CCT A GAGAAGCCGCTGCTGAGCAAATCGAGGAGCGGCAAAGTGATTGGGCTTACTCAAAACCTA R--E--A--A--A--E--Q--I--E--E--R--Q--S--D--W--A--Y--S--K--P-- TA GTG ATA ATA GAT CTT TTA TGG AAC TTA GCT TTT GTT ATT GTA TCG ATT TCT GTG CTT G TAGTGATAATAGATCTTTTATGGAACTTAGCTTTTGTTATTGTATCGATTTCTGTGCTTG I--V--I--I--D--L--L--W--N--L--A--F--V--I--V--S--I--S--V--L-- TA CTG AGC CGA AAT GAG TCT CCT TCT ATG CCG TTA AGG CTT TGG ATT GTT GGA TAT GCT T TACTGAGCCGAAATGAGTCTCCTTCTATGCCGTTAAGGCTTTGGATTGTTGGATATGCTT V--L--S--R--N--E--S--P--S--M--P--L--R--L--W--I--V--G--Y--A-- TA CAG AGT GTG CTT CAT ATG GTT TGT GTT TTC GTT GAG TAT AGA CGC CGA CGG TTA AGG G TACAGAGTGTGCTTCATATGGTTTGTGTTTTCGTTGAGTATAGACGCCGACGGTTAAGGG L--Q--S--V--L--H--M--V--C--V--F--V--E--Y--R--R--R--R--L--R-- AG TCC TCT GAA AAT TTG AGT AGT TCT GAG CAG AGA AGC GGG AGT GCT AGT TGG AAT ACC G AGTCCTCTGAAAATTTGAGTAGTTCTGAGCAGAGAAGCGGGAGTGCTAGTTGGAATACCG E--S--S--E--N--L--S--S--S--E--Q--R--S--G--S--A--S--W--N--T-- GA GTT GGG AAC TTG AGT TCG GAG AGT GAC GGA GGG GAG TCT GGT GAT TAT TCG CAG GAG A GAGTTGGGAACTTGAGTTCGGAGAGTGACGGAGGGGAGTCTGGTGATTATTCGCAGGAGA G--V--G--N--L--S--S--E--S--D--G--G--E--S--G--D--Y--S--Q--E-- GG AAT CAA AAC GAG GAT GAA ACT AG T GTT GCC AAG CAT CTG GAG TCT GCA AAC ACC ATG T GGAATCAAAACGAGGATGAAACTAGTGTTGCCAAGCATCTGGAGTCTGCAAACACCATGT R--N--Q--N--E--D--E--T--S--V--A--K--H--L--E--S--A--N--T--M-- TT TCT TTC ATT TGG TGG ATA ATT GGG TTC TAC TGG GTA TCT GCT GGT GGC CAG ACT ATG C TTTCTTTCATTTGGTGGATAATTGGGTTCTACTGGGTATCTGCTGGTGGCCAGACTATGC F--S--F--I--W--W--I--I--G--F--Y--W--V--S--A--G--G--Q--T--M-- CC CGT GAT GCA CCT CAA CTT TAC TG G CTT TGT ATC ACA TTT CTG GCG TTT GAT GTG TTT T CCCGTGATGCACCTCAACTTTACTGGCTTTGTATCACATTTCTGGCGTTTGATGTGTTTT P--R--D--A--P--Q--L--Y--W--L--C--I--T--F--L--A--F--D--V--F-- TT GTT GTT ATA TGT GTT GCT GTG GCT TGT GTC ATT GGA ATT GCT GTT TGC TGC TGT CTC C TTGTTGTTATATGTGTTGCTGTGGCTTGTGTCATTGGAATTGCTGTTTGCTGCTGTCTCC F--V--V--I--C--V--A--V--A--C--V--I--G--I--A--V--C--C--C--L-- CA TGT ATT ATT GCA ATC TTA TAT GCA GTG ACA GAT CAG GAA GGT GCA ACT AAG GAA GAT G CATGTATTATTGCAATCTTATATGCAGTGACAGATCAGGAAGGTGCAACTAAGGAAGATG P--C--I--I--A--I--L--Y--A--V--T--D--Q--E--G--A--T--K--E--D-- TT GAA AGA CTG CCT AAG TAC AAG TTT AAG AGA CTA GGC AAC TTT GAA AAA GAG AAT GGT G TTGAAAGACTGCCTAAGTACAAGTTTAAGAGACTAGGCAACTTTGAAAAAGAGAATGGTG V--E--R--L--P--K--Y--K--F--K--R--L--G--N--F--E--K--E--N--G-- AT ATC CAA GAA TCA TTT GGA GGA GTA ATG GTT GAA TGC GAC ACC GAT ACA CCT ACT GAG C ATATCCAAGAATCATTTGGAGGAGTAATGGTTGAATGCGACACCGATACACCTACTGAGC D--I--Q--E--S--F--G--G--V--M--V--E--C--D--T--D--T--P--T--E-- AT GTT CTT CCA CCA GAA GAT GCT G AA TGT TGC ATT TGC CTT TGT TCC TAT GAA GAT GGA A ATGTTCTTCCACCAGAAGATGCTGAATGTTGCATTTGCCTTTGTTCCTATGAAGATGGAA H--V--L--P--P--E--D--A--E--C--C--I--C--L--C--S--Y--E--D--G-- TC GAG CTG CGT GAG CTC CCA TGT CAT CAC CAT TTT CAC GCA GCC TGC ATA GAC AAG TGG T TCGAGCTGCGTGAGCTCCCATGTCATCACCATTTTCACGCAGCCTGCATAGACAAGTGGT I--E--L--R--E--L--P--C--H--H--H--F--H--A--A--C--I--D--K--W-- TG TAT ATA AAT GCG ACC TGT CCT CTT TGC AAG TTC AAC ATA CTC AAA TAT GGC AAT CAA A TGTATATAAATGCGACCTGTCCTCTTTGCAAGTTCAACATACTCAAATATGGCAATCAAA L--Y--I--N--A--T--C--P--L--C--K--F--N--I--L--K--Y--G--N--Q-- GT GGC AGT GAA GAA GCA TAA GCAAGCGCCGCCACTTATACATCCTTCACATTAAAGATCT GTGGCAGTGAAGAAGCATAA........................................ S--G--S--E--E--A--*-........................................ TGATATAAGTTCTGGGATTCGATCGTCTCATCAACCGGGAAATGCTTCACCAGGTTCAGA ............................................................ ............................................................ CTCAGACAGCCCAGAACTTGCTTCTGCTCTCTTATCTTTTCAGTATATATGGCTGTTTAC ............................................................ ............................................................ TTCTGTGCTCAATATAATATCAGTATAGGTGGCAGTATTTTGCTTTTATATATACCTTGT ............................................................ ............................................................ GTTTGGTTTCTTCACAGTATGTCTTACAAGGGTATGTTGCATGAAAATAACCCAGATTTG ............................................................ ............................................................ GTTAACCCGCCCGTATTCTGATTTTCTTACATATATACATAAAAAGGGTCAAATTTATTT ............................................................ ............................................................ TTAATATTGTTTATCCAACCTATATTTGATTGCAGGAAATATGGACGGGTTGAGTTGTGA ............................................................ ............................................................ TCCATTTTTATTTGATTCGTTTTCGACTTGCTCAAACCCAACTAACCACTATATGAAATC ............................................................ ............................................................ AAGTCATCTTTTACTGCCAGCAATATTCTGGAATTGCCTCGTTAT ............................................. ............................................. .
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use
![[RSS logo]](/i/rss_icon_16.png "Ensembl blog"){kind=icon}
![[twitter logo]](/i/twitter.png "Follow us on Twitter!")
