Transcript: PGSC0003DMT400009971
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DNA binding protein [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG400003902]
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 T TTTCACGCTCTCTGCCTCCCTTACCCCATCCCCCTAATAACACCCCACCCAATGCTCCG 60
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61 TCTTCTTCTCACAAATTCCTCTGAAGGGTTTCAGTTTCACTCAAATTCTCCCTTTTTCTC 120
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121 AGATCCATAGCTCACTTTTTTCCGATGACGGCGCCGATGGCCGAGTCTCCGATTGTCAAA 180
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181 GCCGGAGCCGGAATTGGTACCGGTACTGGTGATCCGTGTTGCATTGAACAGGAATCGAAC 240
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241 GGTTCGGTTCATGGCGTTAGGTACAACGAAGTTGCTTCTGTTAAGGATCGTGATAGGAAT 300
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301 GGAGTTGTTGTGTATAGGAGGAACAAGAGGTTGAAGAGAGCGGCTAATGTTGATGGCGGT 360
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361 GAATCGACTGATTCGAAGTTTAATAATTCAGGTGGTAAATGTGTGATTAAGGATGGTACA 420
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421 GAGGGTATTTCCGGCAATGTGGAGAGTGTGAAGGAAATGGTGGAGGTTGAAGTCAAAGAG 480
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481 GAGTCAACGTTGACAGTGAACTGTGCTACTGTTGCTGGGAGGAGGCTTACAAGGTCGGTT 540
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541 TTGAAGCTGAATGTGGAACCTCTTGATATGTCGAATGAGAATTTGGAAGTGTTGGACGGG 600
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601 AAATTGATCACATGTAATGGTGCATCTCCTGCAGAAGAATCAGAGATGGAAATATCGAAG 660
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661 AAGATTTCGATTATAGGAAGGCCTACTACCGTTAGGGAGCTTTTTGAGACTGGTTTGCTC 720
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721 GAGGGCTATCCGGTTTTCTATAATGGTGGCAAGAGG GGAATTCCACTGAGAGGAACAGTC 780
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781 AAAGATATTGGAATTCTATGTTCTTGTGATCTGTGCAAGGGTGCCAGG GTTGTTCCTCCT 840
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841 GGCAAATTTGAGATCCATGCATGTAAAACTTATAGACGTGCATCACAGTATATCTGCCTG 900
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901 GAAAATGGAAAGAGTCTCCTTGATGTGGTCAAAGAATGTAGGAAAGGTTCTTTGAAGAAC 960
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961 TTGGAAGCAACAATTCGAAGCTTCATTGGCCCGATTCCTGTGAAGGAAAATATCATATGT 1020
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1021 CAGAATTGCAATG G GTCTTTTGCTGCAACTTCAGTTGGAAAAATTGACCAAATTTGTGAT 1080
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1081 TCTTGCATAATCTCTTTAAGATCAGAAGCCACTCCATCTCAGTCAATAAAAGTTGAAGCT 1140
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1141 GG G ATATCTGAGCCTGACCTGAACATAAATTCCTCTGAAGCTTCAACTGCGTCAGATACT 1200
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1201 TCTCTAAAAAGGCGTAGAGGAAGAAAAAAGAAAAA G CCTGTGGAAATATGTTCAAGGAAA 1260
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1261 AAGTCCCTTAGAATATCTTCAGCACATACAATCTCAGGAAGGAAGGATCAGTTGAAGACA 1320
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1321 CCAAACAA G TTATCCAATCCAGTTCTTTCTCCACACTCAA ATG AAG CTT CCC CGA TGT GC 1380
........................................ATGAAGCTTCCCCGATGTGC 20
........................................-M--K--L--P--R--C--A 7
1381 A ACT CTT TCA GAG ATA AAA TGC AGA GCA AGA TCT CAA AAA A C T TCA AAT TCC TCA ACA AT 1440
21 AACTCTTTCAGAGATAAAATGCAGAGCAAGATCTCAAAAAACTTCAAATTCCTCAACAAT 80
7 --T--L--S--E--I--K--C--R--A--R--S--Q--K--T--S--N--S--S--T--I 27
1441 T GGT TCT CTT GGT GTT TCA GTA CAC TCT AGG ACC CAA TGG AAA ATT ACA AAG AA G GAT CA 1500
81 TGGTTCTCTTGGTGTTTCAGTACACTCTAGGACCCAATGGAAAATTACAAAGAAGGATCA 140
27 --G--S--L--G--V--S--V--H--S--R--T--Q--W--K--I--T--K--K--D--Q 47
1501 G AAA ATG CAT TGG TTG GTT TTT GAG GAA GGT GGA CTG CCC GAT GGG ACT GAA GTT GCT TA 1560
141 GAAAATGCATTGGTTGGTTTTTGAGGAAGGTGGACTGCCCGATGGGACTGAAGTTGCTTA 200
47 --K--M--H--W--L--V--F--E--E--G--G--L--P--D--G--T--E--V--A--Y 67
1561 T TAT TCT CGT GGA AAG AAA TTG CTT GTC GGT TAT AAG CAG GGA TCT GGT ATA GTG TGT TC 1620
201 TTATTCTCGTGGAAAGAAATTGCTTGTCGGTTATAAGCAGGGATCTGGTATAGTGTGTTC 260
67 --Y--S--R--G--K--K--L--L--V--G--Y--K--Q--G--S--G--I--V--C--S 87
1621 T TGC TGC AAC TCT GAG G TT AGT CCA TCA CAA TTT GAA GCT CAT GCA GGT TGG GCA TCG CG 1680
261 TTGCTGCAACTCTGAGGTTAGTCCATCACAATTTGAAGCTCATGCAGGTTGGGCATCGCG 320
87 --C--C--N--S--E--V--S--P--S--Q--F--E--A--H--A--G--W--A--S--R 107
1681 C AAA AAA CC C TAT GGA TAC ATT TAC GCT TCA AAT GGA GTG TCT CTA CAT GAA TTT GCT AT 1740
321 CAAAAAACCCTATGGATACATTTACGCTTCAAATGGAGTGTCTCTACATGAATTTGCTAT 380
107 --K--K--P--Y--G--Y--I--Y--A--S--N--G--V--S--L--H--E--F--A--M 127
1741 G TCC CTA TTG AGA GGT CGT AAG TCT TCT GTC AAA GAC AGT GAT GAT CTG TGC ATC ATA TG 1800
381 GTCCCTATTGAGAGGTCGTAAGTCTTCTGTCAAAGACAGTGATGATCTGTGCATCATATG 440
127 --S--L--L--R--G--R--K--S--S--V--K--D--S--D--D--L--C--I--I--C 147
1801 C GCA GAT GGT GGA ATA CTG GTG CTT TGT GAT GGA TGT CCA AGG GCC TTC CAT AAA G A G TG 1860
441 CGCAGATGGTGGAATACTGGTGCTTTGTGATGGATGTCCAAGGGCCTTCCATAAAGAGTG 500
147 --A--D--G--G--I--L--V--L--C--D--G--C--P--R--A--F--H--K--E--C 167
1861 T GCA TCA TTG TCA GCT GTT CCC CGT GGT AAA TGG TAC TGT AAG TAT TGT GAA AAC AAG TT 1920
501 TGCATCATTGTCAGCTGTTCCCCGTGGTAAATGGTACTGTAAGTATTGTGAAAACAAGTT 560
167 --A--S--L--S--A--V--P--R--G--K--W--Y--C--K--Y--C--E--N--K--F 187
1921 T CAG AGG GAG AAG TTT GTG GAG CAC AAT GCT AAT GCC ATT GCT GCT GGG AGG ATT TCT GG 1980
561 TCAGAGGGAGAAGTTTGTGGAGCACAATGCTAATGCCATTGCTGCTGGGAGGATTTCTGG 620
187 --Q--R--E--K--F--V--E--H--N--A--N--A--I--A--A--G--R--I--S--G 207
1981 T ATT GAC CCC ATA GAT CAA ATA AGT AAG CGT TGC ATG CGT ACT GTC AAG AAC CCA GAA GA 2040
621 TATTGACCCCATAGATCAAATAAGTAAGCGTTGCATGCGTACTGTCAAGAACCCAGAAGA 680
207 --I--D--P--I--D--Q--I--S--K--R--C--M--R--T--V--K--N--P--E--E 227
2041 G GCA GAA GTT ATA GCA TGT GCT TTA TGC AG G TGT TAT GAT TTT AGC AAG TCT GGA TTT GG 2100
681 GGCAGAAGTTATAGCATGTGCTTTATGCAGGTGTTATGATTTTAGCAAGTCTGGATTTGG 740
227 --A--E--V--I--A--C--A--L--C--R--C--Y--D--F--S--K--S--G--F--G 247
2101 T CCA CGC ACG GTT ATC CTC TGT GAC CAG TGT GAG AAG GAA TAT CAT GTT GGC TGC TTG AA 2160
741 TCCACGCACGGTTATCCTCTGTGACCAGTGTGAGAAGGAATATCATGTTGGCTGCTTGAA 800
247 --P--R--T--V--I--L--C--D--Q--C--E--K--E--Y--H--V--G--C--L--K 267
2161 G AAA CGC AAG ATA GCA GAG TTA AAG G AG TTG CCT AAA GGA AAA TGG TTC TGC TGT GCG GA 2220
801 GAAACGCAAGATAGCAGAGTTAAAGGAGTTGCCTAAAGGAAAATGGTTCTGCTGTGCGGA 860
267 --K--R--K--I--A--E--L--K--E--L--P--K--G--K--W--F--C--C--A--D 287
2221 T TGC AAG AGG ATA TAT TCT GCA CTG CAA AAT TCA CTG AAC TCA GGA GAA GAA AGA CTG TC 2280
861 TTGCAAGAGGATATATTCTGCACTGCAAAATTCACTGAACTCAGGAGAAGAAAGACTGTC 920
287 --C--K--R--I--Y--S--A--L--Q--N--S--L--N--S--G--E--E--R--L--S 307
2281 A GAA TCT TGC CTA GGT GCA GTA AGG ATG AAG CTA AAG GAA AAA CGT ATG GAT TTT GTT GG 2340
921 AGAATCTTGCCTAGGTGCAGTAAGGATGAAGCTAAAGGAAAAACGTATGGATTTTGTTGG 980
307 --E--S--C--L--G--A--V--R--M--K--L--K--E--K--R--M--D--F--V--G 327
2341 T GAT CTA GAT GTG AGA TGG AGA CTT ATC AGT GGC AAA ATT ACT TCT CGT GAA ACC AGA GT 2400
981 TGATCTAGATGTGAGATGGAGACTTATCAGTGGCAAAATTACTTCTCGTGAAACCAGAGT 1040
327 --D--L--D--V--R--W--R--L--I--S--G--K--I--T--S--R--E--T--R--V 347
2401 G TTA TTA GCA GAA GCT GTT TCA ATC TTC CAT G AT TGC TTT GAT CCT ATT GTT GAT TCG GC 2460
1041 GTTATTAGCAGAAGCTGTTTCAATCTTCCATGATTGCTTTGATCCTATTGTTGATTCGGC 1100
347 --L--L--A--E--A--V--S--I--F--H--D--C--F--D--P--I--V--D--S--A 367
2461 A ACT GGA CGT GAT TTC ATT CCA TCT ATG GTC TAT GG A AGG AAT ATT AGG GGC CAA GAC TT 2520
1101 AACTGGACGTGATTTCATTCCATCTATGGTCTATGGAAGGAATATTAGGGGCCAAGACTT 1160
367 --T--G--R--D--F--I--P--S--M--V--Y--G--R--N--I--R--G--Q--D--F 387
2521 T GGG GGG ATG TAC TGT GCT ATA TTG ACA GTA AA T TCA ATA GTA GTA TCA GCA GGG ATC CT 2580
1161 TGGGGGGATGTACTGTGCTATATTGACAGTAAATTCAATAGTAGTATCAGCAGGGATCCT 1220
387 --G--G--M--Y--C--A--I--L--T--V--N--S--I--V--V--S--A--G--I--L 407
2581 C CGT ATT TTT GGT CAG GAT ATG GCA GAG CTT CCT CTT GTG GCA ACA CGT ATT GGT AGC CA 2640
1221 CCGTATTTTTGGTCAGGATATGGCAGAGCTTCCTCTTGTGGCAACACGTATTGGTAGCCA 1280
407 --R--I--F--G--Q--D--M--A--E--L--P--L--V--A--T--R--I--G--S--Q 427
2641 G GGC CAG GGT TAC TTT CAG TTG CTC CTC TCC TGC ATA GAG AAA TTG CTT GCA TTT TTG AA 2700
1281 GGGCCAGGGTTACTTTCAGTTGCTCCTCTCCTGCATAGAGAAATTGCTTGCATTTTTGAA 1340
427 --G--Q--G--Y--F--Q--L--L--L--S--C--I--E--K--L--L--A--F--L--N 447
2701 T GTA AGA AGA TTT ATA CTC CCT TCT GCT GTT GAA GCA ATG TCA ATA TGG ACC GAG AAA TT 2760
1341 TGTAAGAAGATTTATACTCCCTTCTGCTGTTGAAGCAATGTCAATATGGACCGAGAAATT 1400
447 --V--R--R--F--I--L--P--S--A--V--E--A--M--S--I--W--T--E--K--F 467
2761 T GGA TTC AAA GAG ATA CCA CCA GAT CTG C TT GTC AGC TAC AAA AAA ACC TGT TGG CAA TT 2820
1401 TGGATTCAAAGAGATACCACCAGATCTGCTTGTCAGCTACAAAAAAACCTGTTGGCAATT 1460
467 --G--F--K--E--I--P--P--D--L--L--V--S--Y--K--K--T--C--W--Q--L 487
2821 G ATT ACC TTC AAA GGA ACA TGT ATG CTG GAA AAA ATG GTT CCT AAA TGT CGA ATC ATT CG 2880
1461 GATTACCTTCAAAGGAACATGTATGCTGGAAAAAATGGTTCCTAAATGTCGAATCATTCG 1520
487 --I--T--F--K--G--T--C--M--L--E--K--M--V--P--K--C--R--I--I--R 507
2881 G CAT GAG GAA ACT GAA GCT GAA GCT GAA GCT GAA ACT GAA ACT GAA ACT GAA ACT GAA AC 2940
1521 GCATGAGGAAACTGAAGCTGAAGCTGAAGCTGAAACTGAAACTGAAACTGAAACTGAAAC 1580
507 --H--E--E--T--E--A--E--A--E--A--E--T--E--T--E--T--E--T--E--T 527
2941 T GAA AGT GAT GCA CCA GAT GAG TAG AGGTAGCCAAAGATGATTTCCCCCCCATTTTGTAG 3000
1581 TGAAAGTGATGCACCAGATGAGTAG................................... 1605
527 --E--S--D--A--P--D--E--*-................................... 534
3001 AGCGATTTCTGATCACATATGTATATTTGAGTCTTATTTTATCAAAGAGGGATGGATTTG 3060
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3061 AGAGTATCAAATTTTTGTAAAGAAGGTTCTTATTACTCAAAAGTTATAGCTGGTTGCATG 3120
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3121 TTTATATGCCAGGTAATAAATTTAGCCCACAAAGAGTTTTGATATCTTAATGAATTTCCA 3180
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3181 CCACCTCTTAATATCAAATTAGTGTTGCCA 3210
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