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Solanum tuberosum (SolTub_3.0)
Description

DNA binding protein [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG400003902]

Location
About this transcript

This transcript has 21 exons and is annotated with 22 domains and features.

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  • Name
  • Transcript ID
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  • UniProt
  • RefSeq
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
-PGSC0003DMT4000099693230942aa
 
Protein coding
M0ZX84 -Ensembl Canonical
-PGSC0003DMT4000099663466504aa
 
Protein coding
M0ZX81 --
-PGSC0003DMT4000099673234486aa
 
Protein coding
M0ZX82 --
-PGSC0003DMT4000099713210534aa
 
Protein coding
M0ZX86 --
-PGSC0003DMT4000099703181445aa
 
Protein coding
M0ZX85 --
-PGSC0003DMT4000099683177513aa
 
Protein coding
M0ZX83 --
-PGSC0003DMT4000099722812504aa
 
Protein coding
M0ZX81 --
-PGSC0003DMT400009965729121aa
 
Protein coding
M0ZX80 --
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
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     1 TTTTCACGCTCTCTGCCTCCCTTACCCCATCCCCCTAATAACACCCCACCCAATGCTCCG     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 TCTTCTTCTCACAAATTCCTCTGAAGGGTTTCAGTTTCACTCAAATTCTCCCTTTTTCTC    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 AGATCCATAGCTCACTTTTTTCCGATGACGGCGCCGATGGCCGAGTCTCCGATTGTCAAA    180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   181 GCCGGAGCCGGAATTGGTACCGGTACTGGTGATCCGTGTTGCATTGAACAGGAATCGAAC    240
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   241 GGTTCGGTTCATGGCGTTAGGTACAACGAAGTTGCTTCTGTTAAGGATCGTGATAGGAAT    300
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   301 GGAGTTGTTGTGTATAGGAGGAACAAGAGGTTGAAGAGAGCGGCTAATGTTGATGGCGGT    360
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   361 GAATCGACTGATTCGAAGTTTAATAATTCAGGTGGTAAATGTGTGATTAAGGATGGTACA    420
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   421 GAGGGTATTTCCGGCAATGTGGAGAGTGTGAAGGAAATGGTGGAGGTTGAAGTCAAAGAG    480
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   481 GAGTCAACGTTGACAGTGAACTGTGCTACTGTTGCTGGGAGGAGGCTTACAAGGTCGGTT    540
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   541 TTGAAGCTGAATGTGGAACCTCTTGATATGTCGAATGAGAATTTGGAAGTGTTGGACGGG    600
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   601 AAATTGATCACATGTAATGGTGCATCTCCTGCAGAAGAATCAGAGATGGAAATATCGAAG    660
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   661 AAGATTTCGATTATAGGAAGGCCTACTACCGTTAGGGAGCTTTTTGAGACTGGTTTGCTC    720
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   721 GAGGGCTATCCGGTTTTCTATAATGGTGGCAAGAGGGGAATTCCACTGAGAGGAACAGTC    780
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   781 AAAGATATTGGAATTCTATGTTCTTGTGATCTGTGCAAGGGTGCCAGGGTTGTTCCTCCT    840
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   841 GGCAAATTTGAGATCCATGCATGTAAAACTTATAGACGTGCATCACAGTATATCTGCCTG    900
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   901 GAAAATGGAAAGAGTCTCCTTGATGTGGTCAAAGAATGTAGGAAAGGTTCTTTGAAGAAC    960
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   961 TTGGAAGCAACAATTCGAAGCTTCATTGGCCCGATTCCTGTGAAGGAAAATATCATATGT   1020
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1021 CAGAATTGCAATGGGTCTTTTGCTGCAACTTCAGTTGGAAAAATTGACCAAATTTGTGAT   1080
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1081 TCTTGCATAATCTCTTTAAGATCAGAAGCCACTCCATCTCAGTCAATAAAAGTTGAAGCT   1140
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1141 GGGATATCTGAGCCTGACCTGAACATAAATTCCTCTGAAGCTTCAACTGCGTCAGATACT   1200
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1201 TCTCTAAAAAGGCGTAGAGGAAGAAAAAAGAAAAAGCCTGTGGAAATATGTTCAAGGAAA   1260
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1261 AAGTCCCTTAGAATATCTTCAGCACATACAATCTCAGGAAGGAAGGATCAGTTGAAGACA   1320
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1321 CCAAACAAGTTATCCAATCCAGTTCTTTCTCCACACTCAAATGAAGCTTCCCCGATGTGC   1380
       ........................................ATGAAGCTTCCCCGATGTGC     20
       ........................................-M--K--L--P--R--C--A      7

                                                                          
  1381 AACTCTTTCAGAGATAAAATGCAGAGCAAGATCTCAAAAAACTTCAAATTCCTCAACAAT   1440
    21 AACTCTTTCAGAGATAAAATGCAGAGCAAGATCTCAAAAAACTTCAAATTCCTCAACAAT     80
     7 --T--L--S--E--I--K--C--R--A--R--S--Q--K--T--S--N--S--S--T--I     27

                                                                          
  1441 TGGTTCTCTTGGTGTTTCAGTACACTCTAGGACCCAATGGAAAATTACAAAGAAGGATCA   1500
    81 TGGTTCTCTTGGTGTTTCAGTACACTCTAGGACCCAATGGAAAATTACAAAGAAGGATCA    140
    27 --G--S--L--G--V--S--V--H--S--R--T--Q--W--K--I--T--K--K--D--Q     47

                                                                          
  1501 GAAAATGCATTGGTTGGTTTTTGAGGAAGGTGGACTGCCCGATGGGACTGAAGTTGCTTA   1560
   141 GAAAATGCATTGGTTGGTTTTTGAGGAAGGTGGACTGCCCGATGGGACTGAAGTTGCTTA    200
    47 --K--M--H--W--L--V--F--E--E--G--G--L--P--D--G--T--E--V--A--Y     67

                                                                          
  1561 TTATTCTCGTGGAAAGAAATTGCTTGTCGGTTATAAGCAGGGATCTGGTATAGTGTGTTC   1620
   201 TTATTCTCGTGGAAAGAAATTGCTTGTCGGTTATAAGCAGGGATCTGGTATAGTGTGTTC    260
    67 --Y--S--R--G--K--K--L--L--V--G--Y--K--Q--G--S--G--I--V--C--S     87

                                                                          
  1621 TTGCTGCAACTCTGAGGTTAGTCCATCACAATTTGAAGCTCATGCAGGTTGGGCATCGCG   1680
   261 TTGCTGCAACTCTGAGGTTAGTCCATCACAATTTGAAGCTCATGCAGGTTGGGCATCGCG    320
    87 --C--C--N--S--E--V--S--P--S--Q--F--E--A--H--A--G--W--A--S--R    107

                                                                          
  1681 CAAAAAACCCTATGGATACATTTACGCTTCAAATGGAGTGTCTCTACATGAATTTGCTAT   1740
   321 CAAAAAACCCTATGGATACATTTACGCTTCAAATGGAGTGTCTCTACATGAATTTGCTAT    380
   107 --K--K--P--Y--G--Y--I--Y--A--S--N--G--V--S--L--H--E--F--A--M    127

                                                                          
  1741 GTCCCTATTGAGAGGTCGTAAGTCTTCTGTCAAAGACAGTGATGATCTGTGCATCATATG   1800
   381 GTCCCTATTGAGAGGTCGTAAGTCTTCTGTCAAAGACAGTGATGATCTGTGCATCATATG    440
   127 --S--L--L--R--G--R--K--S--S--V--K--D--S--D--D--L--C--I--I--C    147

                                                                          
  1801 CGCAGATGGTGGAATACTGGTGCTTTGTGATGGATGTCCAAGGGCCTTCCATAAAGAGTG   1860
   441 CGCAGATGGTGGAATACTGGTGCTTTGTGATGGATGTCCAAGGGCCTTCCATAAAGAGTG    500
   147 --A--D--G--G--I--L--V--L--C--D--G--C--P--R--A--F--H--K--E--C    167

                                                                          
  1861 TGCATCATTGTCAGCTGTTCCCCGTGGTAAATGGTACTGTAAGTATTGTGAAAACAAGTT   1920
   501 TGCATCATTGTCAGCTGTTCCCCGTGGTAAATGGTACTGTAAGTATTGTGAAAACAAGTT    560
   167 --A--S--L--S--A--V--P--R--G--K--W--Y--C--K--Y--C--E--N--K--F    187

                                                                          
  1921 TCAGAGGGAGAAGTTTGTGGAGCACAATGCTAATGCCATTGCTGCTGGGAGGATTTCTGG   1980
   561 TCAGAGGGAGAAGTTTGTGGAGCACAATGCTAATGCCATTGCTGCTGGGAGGATTTCTGG    620
   187 --Q--R--E--K--F--V--E--H--N--A--N--A--I--A--A--G--R--I--S--G    207

                                                                          
  1981 TATTGACCCCATAGATCAAATAAGTAAGCGTTGCATGCGTACTGTCAAGAACCCAGAAGA   2040
   621 TATTGACCCCATAGATCAAATAAGTAAGCGTTGCATGCGTACTGTCAAGAACCCAGAAGA    680
   207 --I--D--P--I--D--Q--I--S--K--R--C--M--R--T--V--K--N--P--E--E    227

                                                                          
  2041 GGCAGAAGTTATAGCATGTGCTTTATGCAGGTGTTATGATTTTAGCAAGTCTGGATTTGG   2100
   681 GGCAGAAGTTATAGCATGTGCTTTATGCAGGTGTTATGATTTTAGCAAGTCTGGATTTGG    740
   227 --A--E--V--I--A--C--A--L--C--R--C--Y--D--F--S--K--S--G--F--G    247

                                                                          
  2101 TCCACGCACGGTTATCCTCTGTGACCAGTGTGAGAAGGAATATCATGTTGGCTGCTTGAA   2160
   741 TCCACGCACGGTTATCCTCTGTGACCAGTGTGAGAAGGAATATCATGTTGGCTGCTTGAA    800
   247 --P--R--T--V--I--L--C--D--Q--C--E--K--E--Y--H--V--G--C--L--K    267

                                                                          
  2161 GAAACGCAAGATAGCAGAGTTAAAGGAGTTGCCTAAAGGAAAATGGTTCTGCTGTGCGGA   2220
   801 GAAACGCAAGATAGCAGAGTTAAAGGAGTTGCCTAAAGGAAAATGGTTCTGCTGTGCGGA    860
   267 --K--R--K--I--A--E--L--K--E--L--P--K--G--K--W--F--C--C--A--D    287

                                                                          
  2221 TTGCAAGAGGATATATTCTGCACTGCAAAATTCACTGAACTCAGGAGAAGAAAGACTGTC   2280
   861 TTGCAAGAGGATATATTCTGCACTGCAAAATTCACTGAACTCAGGAGAAGAAAGACTGTC    920
   287 --C--K--R--I--Y--S--A--L--Q--N--S--L--N--S--G--E--E--R--L--S    307

                                                                          
  2281 AGAATCTTGCCTAGGTGCAGTAAGGATGAAGCTAAAGGAAAAACGTATGGATTTTGTTGG   2340
   921 AGAATCTTGCCTAGGTGCAGTAAGGATGAAGCTAAAGGAAAAACGTATGGATTTTGTTGG    980
   307 --E--S--C--L--G--A--V--R--M--K--L--K--E--K--R--M--D--F--V--G    327

                                                                          
  2341 TGATCTAGATGTGAGATGGAGACTTATCAGTGGCAAAATTACTTCTCGTGAAACCAGAGT   2400
   981 TGATCTAGATGTGAGATGGAGACTTATCAGTGGCAAAATTACTTCTCGTGAAACCAGAGT   1040
   327 --D--L--D--V--R--W--R--L--I--S--G--K--I--T--S--R--E--T--R--V    347

                                                                          
  2401 GTTATTAGCAGAAGCTGTTTCAATCTTCCATGATTGCTTTGATCCTATTGTTGATTCGGC   2460
  1041 GTTATTAGCAGAAGCTGTTTCAATCTTCCATGATTGCTTTGATCCTATTGTTGATTCGGC   1100
   347 --L--L--A--E--A--V--S--I--F--H--D--C--F--D--P--I--V--D--S--A    367

                                                                          
  2461 AACTGGACGTGATTTCATTCCATCTATGGTCTATGGAAGGAATATTAGGGGCCAAGACTT   2520
  1101 AACTGGACGTGATTTCATTCCATCTATGGTCTATGGAAGGAATATTAGGGGCCAAGACTT   1160
   367 --T--G--R--D--F--I--P--S--M--V--Y--G--R--N--I--R--G--Q--D--F    387

                                                                          
  2521 TGGGGGGATGTACTGTGCTATATTGACAGTAAATTCAATAGTAGTATCAGCAGGGATCCT   2580
  1161 TGGGGGGATGTACTGTGCTATATTGACAGTAAATTCAATAGTAGTATCAGCAGGGATCCT   1220
   387 --G--G--M--Y--C--A--I--L--T--V--N--S--I--V--V--S--A--G--I--L    407

                                                                          
  2581 CCGTATTTTTGGTCAGGATATGGCAGAGCTTCCTCTTGTGGCAACACGTATTGGTAGCCA   2640
  1221 CCGTATTTTTGGTCAGGATATGGCAGAGCTTCCTCTTGTGGCAACACGTATTGGTAGCCA   1280
   407 --R--I--F--G--Q--D--M--A--E--L--P--L--V--A--T--R--I--G--S--Q    427

                                                                          
  2641 GGGCCAGGGTTACTTTCAGTTGCTCCTCTCCTGCATAGAGAAATTGCTTGCATTTTTGAA   2700
  1281 GGGCCAGGGTTACTTTCAGTTGCTCCTCTCCTGCATAGAGAAATTGCTTGCATTTTTGAA   1340
   427 --G--Q--G--Y--F--Q--L--L--L--S--C--I--E--K--L--L--A--F--L--N    447

                                                                          
  2701 TGTAAGAAGATTTATACTCCCTTCTGCTGTTGAAGCAATGTCAATATGGACCGAGAAATT   2760
  1341 TGTAAGAAGATTTATACTCCCTTCTGCTGTTGAAGCAATGTCAATATGGACCGAGAAATT   1400
   447 --V--R--R--F--I--L--P--S--A--V--E--A--M--S--I--W--T--E--K--F    467

                                                                          
  2761 TGGATTCAAAGAGATACCACCAGATCTGCTTGTCAGCTACAAAAAAACCTGTTGGCAATT   2820
  1401 TGGATTCAAAGAGATACCACCAGATCTGCTTGTCAGCTACAAAAAAACCTGTTGGCAATT   1460
   467 --G--F--K--E--I--P--P--D--L--L--V--S--Y--K--K--T--C--W--Q--L    487

                                                                          
  2821 GATTACCTTCAAAGGAACATGTATGCTGGAAAAAATGGTTCCTAAATGTCGAATCATTCG   2880
  1461 GATTACCTTCAAAGGAACATGTATGCTGGAAAAAATGGTTCCTAAATGTCGAATCATTCG   1520
   487 --I--T--F--K--G--T--C--M--L--E--K--M--V--P--K--C--R--I--I--R    507

                                                                          
  2881 GCATGAGGAAACTGAAGCTGAAGCTGAAGCTGAAACTGAAACTGAAACTGAAACTGAAAC   2940
  1521 GCATGAGGAAACTGAAGCTGAAGCTGAAGCTGAAACTGAAACTGAAACTGAAACTGAAAC   1580
   507 --H--E--E--T--E--A--E--A--E--A--E--T--E--T--E--T--E--T--E--T    527

                                                                          
  2941 TGAAAGTGATGCACCAGATGAGTAGAGGTAGCCAAAGATGATTTCCCCCCCATTTTGTAG   3000
  1581 TGAAAGTGATGCACCAGATGAGTAG...................................   1605
   527 --E--S--D--A--P--D--E--*-...................................    534

                                                                          
  3001 AGCGATTTCTGATCACATATGTATATTTGAGTCTTATTTTATCAAAGAGGGATGGATTTG   3060
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3061 AGAGTATCAAATTTTTGTAAAGAAGGTTCTTATTACTCAAAAGTTATAGCTGGTTGCATG   3120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3121 TTTATATGCCAGGTAATAAATTTAGCCCACAAAGAGTTTTGATATCTTAATGAATTTCCA   3180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3181 CCACCTCTTAATATCAAATTAGTGTTGCCA                                 3210
       ..............................                                     
       ..............................