Solanum tuberosum (SolTub_3.0)
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RING zinc finger protein 1 [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG400001182]

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This transcript has 2 exons and is annotated with 20 domains and features.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-PGSC0003DMT400003001828275aa
 
Protein coding
M0ZL06 Ensembl Canonical
-PGSC0003DMT4000030031287221aa
 
Protein coding
M0ZL08 -
-PGSC0003DMT4000030021225221aa
 
Protein coding
M0ZL08 -
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     1 CCAACAGTTGTTGAGTTTTAAGTGGACTTGAGAATATTATGAGGCCCAAAAACAAGGAGA     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 AGCTGAAGTTAGATCCGAAAGCCCCTGGAAGCTTCCTATGACAGTAATATCCTAAATTTT    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 CTCCTTTGAATCGAAGATTTTGAATTCCAAAGTGTGTAGAAGGCCCTAGAATCTTCCATG    180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   181 GGGTCAATTATTTTTAACATATATTACCAGAAATCAGCAGAATGATTACAGTTTGAAGTC    240
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   241 ATCATCATTCCTTCCCAATTTATCATTCTTCCTCCGCCAAATCTGTGAAGTGCATTTTTG    300
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   301 TGTGCAAATTGTGACATTGAGTGAAATATGCAGAACTCAACTGCCACAACATTTGAGAGT    360
       ...........................ATGCAGAACTCAACTGCCACAACATTTGAGAGT     33
       ...........................-M--Q--N--S--T--A--T--T--F--E--S-     11

                                                                          
   361 TCTTCGTCCTCAGGGAATGGCAGTAATGATGCTGGTGATTTTGAATGCAACATCTGCTTT    420
    34 TCTTCGTCCTCAGGGAATGGCAGTAATGATGCTGGTGATTTTGAATGCAACATCTGCTTT     93
    12 -S--S--S--S--G--N--G--S--N--D--A--G--D--F--E--C--N--I--C--F-     31

                                                                          
   421 GAATTGGCACAAGATCCTATTGTGACCCTCTGTGGTCACCTCTACTGTTGGCCATGTCTG    480
    94 GAATTGGCACAAGATCCTATTGTGACCCTCTGTGGTCACCTCTACTGTTGGCCATGTCTG    153
    32 -E--L--A--Q--D--P--I--V--T--L--C--G--H--L--Y--C--W--P--C--L-     51

                                                                          
   481 TATAGATGGCTAAGGCTTCATTCACAATCCCATGAGTGCCCTGTTTGTAAGGCTCTAATA    540
   154 TATAGATGGCTAAGGCTTCATTCACAATCCCATGAGTGCCCTGTTTGTAAGGCTCTAATA    213
    52 -Y--R--W--L--R--L--H--S--Q--S--H--E--C--P--V--C--K--A--L--I-     71

                                                                          
   541 CAAGAGGAAAAGCTTGTTCCTCTTTATGGAAGAGGGAGGACTTCAACTGATCCCAGATCA    600
   214 CAAGAGGAAAAGCTTGTTCCTCTTTATGGAAGAGGGAGGACTTCAACTGATCCCAGATCA    273
    72 -Q--E--E--K--L--V--P--L--Y--G--R--G--R--T--S--T--D--P--R--S-     91

                                                                          
   601 AAACCAGTACCTGGAGTTGAAATTCCTAGAAGGCCAGCAGGGCAAAGACCTGAAACGGCG    660
   274 AAACCAGTACCTGGAGTTGAAATTCCTAGAAGGCCAGCAGGGCAAAGACCTGAAACGGCG    333
    92 -K--P--V--P--G--V--E--I--P--R--R--P--A--G--Q--R--P--E--T--A-    111

                                                                          
   661 CCTCCACCAGAATCGCATACTTTTCCTAATCCCGGGTTTGGTCTTATGGGAGGATTGTTT    720
   334 CCTCCACCAGAATCGCATACTTTTCCTAATCCCGGGTTTGGTCTTATGGGAGGATTGTTT    393
   112 -P--P--P--E--S--H--T--F--P--N--P--G--F--G--L--M--G--G--L--F-    131

                                                                          
   721 CCAGGAGCAACTGCAAGTTTTGGTAACTTCACAATGTCTGCTGGTTTTGGTGGATTATTC    780
   394 CCAGGAGCAACTGCAAGTTTTGGTAACTTCACAATGTCTGCTGGTTTTGGTGGATTATTC    453
   132 -P--G--A--T--A--S--F--G--N--F--T--M--S--A--G--F--G--G--L--F-    151

                                                                          
   781 CCATCATTGCTCAGTTTTCAGTTTAATGGATTCCAAGGTCCAGCTGCATTTGGTACAGCA    840
   454 CCATCATTGCTCAGTTTTCAGTTTAATGGATTCCAAGGTCCAGCTGCATTTGGTACAGCA    513
   152 -P--S--L--L--S--F--Q--F--N--G--F--Q--G--P--A--A--F--G--T--A-    171

                                                                          
   841 CCAAATTACCCATTTGGGTATCCTCCTGCATATCATGGCGCGAATGTTCACAATGCTGCT    900
   514 CCAAATTACCCATTTGGGTATCCTCCTGCATATCATGGCGCGAATGTTCACAATGCTGCT    573
   172 -P--N--Y--P--F--G--Y--P--P--A--Y--H--G--A--N--V--H--N--A--A-    191

                                                                          
   901 GCACAATCATCCCAAGGACAGGCAGATAATAATCTGAAGTTTATGTTCTTGCTTGTTGGA    960
   574 GCACAATCATCCCAAGGACAGGCAGATAATAATCTGAAGTTTATGTTCTTGCTTGTTGGA    633
   192 -A--Q--S--S--Q--G--Q--A--D--N--N--L--K--F--M--F--L--L--V--G-    211

                                                                          
   961 TTTCTTGTATTCCTATATTTGTTTGGTTATTGAATGAACTTTCTCCTTTAGCTGTTGCCC   1020
   634 TTTCTTGTATTCCTATATTTGTTTGGTTATTGA...........................    666
   212 -F--L--V--F--L--Y--L--F--G--Y--*-...........................    221

                                                                          
  1021 GAATACTGACTTGTAGTAATCATTCTTAATGGTTGTAAATATGTTGAATTTTTGCACTCT   1080
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1081 GAAGTTGCAACACAAAGATGAACTGATGTGATTAGTGGAATCTGCGTTGCAACACGAGAA   1140
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1141 TTGTGGTTCTTGATTGTTCATTAAAGTTGGTTTTTCCATTCCATGTTGGCTGAGAAAATG   1200
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1201 AGTTAAAATGGTGATTAGCGTGACA                                      1225
       .........................                                          
       .........................