Solanum tuberosum (SolTub_3.0)
Description

P-type trefoil [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG400011060]

Location
About this gene

This gene has 1 transcript (splice variant), 1 orthologue and 2 paralogues.

Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-PGSC0003DMT40002873332251074aa
 
Protein coding
M1ARL6 Ensembl Canonical
Exons
  • PGSC0003DMG400011060 exons
  • All exons in this region
Variants
  • loading
Markup
  • loading
>chromosome:SolTub_3.0:10:54437455:54444676:1
CAATCGTGCACCACAAATAATGTATCAATCAAATTAAGTTATAATATAATAACATTAAAA
AGGAAAAAAACTTTTTAGCTAGAATGATGGGATTTCCAAATCGTTTGCAAATAAATATAA
GGAATATCTATTATTTTAACCATAATAATTGAGAGTTCAATGGGAAACCAAAAGAAAAAT
GCATATTAAATCTAAACTGTTGATTTCAATTTGGAATGTGTCTTCTATCGAATTAAAAAA
ACTTAGGAAATGAAAAGAATGGTACGTGGAGACTGGAGAGGAGCTGGACCCCGAAATCCC
AATTTCTTTAAGGTTTGATTCCAGAATCCAGACATATATTAGTTGACTGAAAAGATTCAA
TATAAATTCCTCCCTCAATGCCACTTTGTTTTTGTAACCTACACCTACATTTGATCATAT
GCATTTTTATAGCAACTTTTTCGTAGTATTAATCGTTATCACCTGCCATCAGCTTTTGAC
TTGTTGATAATGTGAGACTTAAGAGGTACTTCAAGCCTGATTTCTAGAAGAGAACGAGTT
ATCTTTTTCTATATTCGTTTATTAAAATCTGATTATATCCTAAGTATGGCAACTACAACT
ATGGCTAAGCGAGATCAAGCCATGTGGCGAATGAGGCTACATTCGGCCATTCGTACCGCC
TTAGCATGCATAATAATCGGCTGCACCACCCTACTCAGCCCGCCCTCTATTGCAAGACAT
CTGGCATTTCCCTCCTTTTCATATGTAACGGCCATAATTATTGTGCCAGATGCCACCCTA
GGAAAAGTTTTAAGGGGCTGTTGGAGCGCGTGTTGTGCCACGCTCCAAGTCATGCCCCTT
TCTATGGTTGGGTTATGGATTCATGGCTTCGCCACTGATGATATCAACTTCTCGCCCCTA
GTAGCTGCTGTGATGGTGGCGGGGAGTGCTTTTTTGGTGGCATTGCCGGGGAATACGGAT
TTGATGTCTAAGCGGATTGCTTTCGGACAGCTGGTTGTTGTGTATGTGGATTCTGTTATT
CATGGAATTCGTGTGAATATAGTGATGCACCCTCTACGAGTTGCATCTAGTACTGCTCTT
GGAGCTGTGGCTTCTGTTCTTGCTTTGTTGCTGTTCTTCCCCTGGCTAGCTTATTTTGAG
GTAATCATGATATCTAAGATAAAATTACATGAATCAATCAGATAATAATGCAAATTTTCT
CCATTGAGCCGAGTTCTATCAGAAACAGTTACATTAGTCCATTAAATAGGGGTAATGGGG
TAGTAGTGCGGAACCACAAGGAGATTCAAAATGTGTAGAAGTTAAATAGAGACGAATTTA
GATTTTAAAGTTTATAGTTTCCTATAAGAATCTCAAGTTGGTGTAAAATAATATCATGAA
CTACTTATAAATATTTTGTTGATTTCTTAATACAAATTCATGGTATGAACAAAAGTCACT
AGTTTCGTGAACCCACATTTTTTTTTATATTTATTTAAATCTTGATGAACATAGTTAGTG
AATACTAGGTCCAAAAGTACACCACGATCATAAAATCCATTACAAAGTGTAGTTCATAAA
ACCAGCTAGTTTATTAATATCCATATACTATATTGCTTAAATTTTTTCGACATTTTTCTT
TGGAAATTAAAGTTGATCATACACAGGAAACAAAAATATCATTGTCTACTTGGTCCAACA
AAATCATTGACGCATGTGATATCAACATCGACTAGCCTGTTAACAAGAATAACCCAACTT
TTCAAATAGTAATAAAAAAGAAAGGCCAATCAATTTTTCTAATGCAAGATGAAAGGGATC
AAGTCCTTTATGAATAAAATAATTGTGAGTCCCAGAAAAATTCAAGGCCTACACAACATA
AACAAAAAGGTACTATTAGTATATGAGTCGAACATGAATGAATTGACAAGTTTTTCGCTG
GTTGTCACTTGTCAACTTACGACGTCTAACTTCTAAACACTTACTGATGTATAAAAAAAA
TTTCACCACCAACTAAAATAGTTTGATATAACTTTAAAAAAAAGTCCATCACACTTGTTT
ACAATGATACCATTGCTAATATATTTATAAAATTTGCTTACAGGTGAGGAAACTATATGG
TATTTATGCTGAAAATGCTTCAGAGAGATTGAATCTTTACCTCAAAGCCCTCCATTCTCC
AAATGAACAAATAGCTATGGAGATCCTATCACAAGCCAAACCAATTTCCGTAACAGGATC
CAAGCTTCTTCAAAGTATCAAACTCTTAGAGGTATGATTAATTATGTCACAGCGTAAAGA
ATTTTTACACTATCAGTGGAATTAGTTAAACAGTCAAAAGCATACTATTATTTCTCCGCT
TTCCAGATCAATTTAACCTTATTAGGTAAAAATTCTTGCATGGGACATTTTCGTGGTCTA
TGCCTATACGCGACCAGAAAAAATTTGATCGATTTAACCTGGTACAGAGTTGTAGGTCAA
TTTAGAGAAAATCCAGATTCACATGTTGTGTACCAACAGTGTGATTGAAATATTCTTATT
GTTGTATACTATTAAGGTATACCAGAATGTGAGTTGTATACCTCGACGATATACAATGTA
ACTTTTTTAGGGGCGAATTCTATAAATTGGTATATGTAGGTAAGTATTTTTATTCCTTTT
GTCGTTCAGTTACCTAAATATCCATTTGTACATGAGCAGGGAAGTTTACGATGGGAGAAA
CCTTGGCTAAGATTCATAGTCCCCTGTTTCACTGATCCTGGAAATGGTTTGCATGACATA
GAAAGTCCAATGAAAGGAATGGAAATTGCTTTAACTTCTTGTCCTTGTTTTCAAACAACA
ATTATAGATGAAAAGCTCATACGCGTCTCACATCGCGTGCTACAGCTACTCGGTCTAAAA
CTGGAGCAAGCTCGTTGCCTTTTGCGAACACATTCAATGATAGCTACAGAAACAGAAGGG
GTATTCGACAATGAGTTTACCAGTTTGTCCCCTGAGTCAATTTCCCTGACAAGTCTAGAT
CAACCAGCAATTTTCTTCTTGTCTTGTATCAAAATGTGCATAAATGATCTAATCATGACT
AAAGGATCCAAAGATTCAGGAGGAAGTGATAAAGCTAGCTCGAAACGAGTCTGCATCAAT
TGGACTAACCTAATGAACCGTGAAAGCCTAGTATTCGCGTGCAAGTGTTCAATTTCGTTA
GGTCTGGCTGTACTACTTGGTCTGCTATTTAACAAACGGAATGGATATTGGTCAGGGCTT
ACAACAGCCATCAGCTTTGAAACAGGAAAAATAGCAATTTTTACGGTTGCAAATGCTCGA
GCACAAGGAACAGCTCTAGGATCAGTCTATGGAGTACTAGGCTGCACTGTTTTTCAAAAT
TTCGCGAGAATAAGATTCATAGCTATGATCCCTTGGATAATTTTCGCGTCAATTTTAAGG
CACAGTAAAATGTACTCTACAGCAGGAGGAGATGCAGCAGTTATCGGAGCATTACTGATT
CTAGGCAGAAAACGTTATGGTCCCCCGAGTGAATTTGCTATTGCTAGACTCACCGAGGCC
TTAATTGGATTATCATGTTTCATCATCATAGAGCTTGTTATCCAACCAACACGAGCAGCA
ACAATCGCGAAAAATCATCTTCTTCTGTGCTTTGAAACACTTAAAAGTTGTACTAAACAA
ATTGACCTGGACTCAAGGAAGATCAATAGCTTTATGAAGAAGCAAAGACAATTGAATTCT
CAAGTAGAGAAGTTGCATAAGTTCATAGTAGATGCAGAGTTGGAGCCTGGTTTCTGGTTT
ACGCCTTTTCCTGTTTCATGCTACCAAAACCTTCAACGATCTCTATCAAACGTCGTGCAC
TTACTGTATTTCATGGCCTACAGTATAGAATCTCTTATACAAGCATTAGATAGTTGTGAT
GCTGATAGAAACAAGATCCAGGAACACTTAAACAAAGACAGACAGATTGTCAATGACGCG
ATAACCTCTTCAATGAAATGTATCGAGACAACTATTTCTATCGGAATGTCAAGAGCTTTC
CAAGATCAACCAGAAGATCATAAAATTGTTTATGACCTCGAGGAGGGAAAGTCACAACGC
GATTATACAACTACTTCTACGAGCAATAAGGAATGGAAAGCTTCAAGTGATTTTCTTGAG
CACTCAAAAGAAGTTGTAGATAACATGACATCACTTGAAGGAAAAGAAGAGGTTATTAGA
AAGATAATTTTTTGTTTGTGTTCAATAGGATTTTGCATGAGTTGTTTGATGAGAGAAGTA
AAAGAGTTAGAGAAAGGTATAAAAGAAATGGTGAATTGGGAACATCCATAAATAGGCCAT
AAAATTCACTAATTAAATTTTGCAATAATATTCCCACACTATTTGTTTATTGTTAATGGT
CAAAAACAAATTCAAAGTATCCTGATTTTTCAAGTTTCATACTTGAACTATACATATGTG
TGAATTATCTATTTAAACTATTTATCAAAACATATAACTCAACTATCGATTGTTCCCGTT
TAAATCTTAAACTACCAATTTTGATTTCTCAAGAAGGCCAAACAATAGATATTTCGAAGT
TCCATAATTATTCAATTCAAATAAAGTTGGATGTTTATTAAATCCACATATTTTATACTT
TAAATAATTAATGTGAACTTGTATACGGTAAGTCAATTTATTTTTAAAAAAATAAGCAAT
GAAGAGGAAGAATGATAAGCAACACAGAAGCCGAAACAAAAGAAGAAAAGAAGTGCCAAA
TATGTAACTAAAAGTTATCAGTCTTCTAGACGATATAATTTTATGAATAATGAGAATCTC
TATAAATAATTCTCTACGTATTAAATTGTATTATAAGTGTTCAGTCAAAAAAAATTATTA
CTATAAATAATAAATATATTAAGCCATAGGTAAGTTTCCAAATAAATATGCGAGTACAAT
TAAGTTTTTACTTTAGCCCTTTCTTTTCCTTATTAAAAGTTTCCAAAAACAAAAATATTT
TAGCCGAAACCAAATCAAACAAGAAATCCAACTAAAAACTCATTTACTAAAACATAGAAA
AGGAAATTAACTTAAACCCAAACCAAATTAAAGTGGGAAGAAAATAATCTCTATTAATAC
TTTGCTCCAATGCAAACTATAGTACTCTGTTCAAACTCAAAAGTATTCTGTTCCTTAATT
TCTTTCTTGATCAAAAAGAAACAATGACTTCTCATCGTTCTTTCCATAATGGCAATCATC
ACCAACGAGGCTATAATTCGCGTAGACGCCTCAATTATCAGCCTTCTAGTCAATATAATT
TTGATGATTATGTTAATCCAAACACATATGATGCATCGTTTGCTCAATATGAGTACAGTG
CTCGACAATTTAGAAATGGCAATCATCAACAACGAGGCTATAATTCGCATAGACGCTCCA
ATTATCAGACTTCTAGACAATATAATCTCGATGATTATGTTAATCCAAACGCATATGATG
CATCGTTTGCTCAATATGAGTACATTTCTCGATAATTTAGGAATGGCAATCATCAACAAC
GAGGCTATAATTCGCGTAGACGCCCCAATTATCAGACTTCTAGACAATATAATCTCGATG
ATTATGTTAATCCAAACGCATATGATGCATCGTTTGCTCAATATGAGTACACTGCTCGAC
AATTTAGGAATGGCTTCAGCCTTCTAGACAATATGATCTCGATGATTATGTTAATCCAAA
CGCATATGATGCATTGTTTAGACGCCCCAATTATCAGCCTTCTAGACAATATGATCTCGA
TGATTATGTTAATCCAAACGCATATGATGCATTGTTTAGACGCCCCAATTATCAGCCTTC
TAGACAATATGATCTCGATGATTATGTTAATCCAAACGCATATGATGCATCGTTTGCTCA
ATATGAGTACATTGATCGACAATTTAGGAATGGCTATCATCAACAACGTCAACAACAACG
ATGCTATAATTCACGTAATGCTCCAAGACGCCCCAATTATCAGCCTTCTAGACAGTATGA
TCTCAATGATTATGTTAATCCAAACACATATGATGCATCGTTTACTCAATATGAGTACAT
TGATCCACAATTTAGAAATAGCTATCATCAACAACGAAGCTATAATACGCGTAATGCTCC
AAGACACCACAATTATCAGTCTTCTAGACATTATGATCTCGATGATTTTATTAATCCACA
CCCAATTCATGCTTTTCAACCTCCTCTGCCCTACTATTATTCAGTCTTAGAATCACTTGG
AGTAAATACCTATCCTCTCTCATATTATCAACGCATGGAAAATGCCAATAGGTCTCAACA
TGTCAACTTCTGGACTAGACTACTGAATTTTCGAGAGAGAAATTCGAGATTTCGTTTTCG
TCCTCGAAATAATCATGATCATGGTGATGTACTGAAGTATTTGAAAATAAGAATCCATCA
TGCTCCTGAAGTAGTAGCACCTGATGTAGAATCAGATATCTGTGCTATATGTCAATCTGA
ATATGAAAACGAAGAGAATTTAGGAGCGTTGCAATGTGGACACGAGTATCATACAGATTG
CATCAAACAATGGCTGATGAGGAAGACAGATTGTCCGATGTGCAGAGCTTCAGTTTTGCC
TTCACAAGAACAGAAACTATAGAGACGTTATTTTGTTTTGATTTTACTGAATATAGGAGT
GTGCATTGTTCGGATTAAATCGAAAAATCAAACAAAATCGAACCAAATTTTAATTTGAAT
TGGAGTTTTTATTTTTTGGTTTGATTTTGGATTTAAAAAAATTGTTTAGTTTTTTGGTTT
GATTTCGGATTTAGAAAAAAAAAACTGAATTATATATATTATTGATTACATATATAATAT
ATTTAGGTTTTGAATTAAGTTGGAGTTAACGACTTTAGTCCCTTTTTAGTTATTGCCTTT
CGTTATGATACAATTTATATTTTACTTTTAAATATTGAGTTTTAAGTTTTACTTGTGATT
GTATTATTAATGCATTCAATATTATTACTTCTCCTTGTATATATATTTTTTTTTCAATTT
ACAAATATAACTTTGATTATGTTACTTAATTATTGATAAAATCAAATAACCAAACCAAAA
GCAAAATTGGGTTACACTTACACTTTTTTAAGATCGAAATATCCAAACCGAATAGTACAA
ATACAAAACAAAAAACCAAATGTACATCCCACGTTGCTTGTTTATTTTGATAACCAAGAC
AAAACTCAAAACTCAAAACTCG