Solanum tuberosum (SolTub_3.0)
Description

ATELC [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG400008386]

Location
About this gene

This gene has 1 transcript (splice variant), 210 orthologues and 2 paralogues.

Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-PGSC0003DMT4000216161952399aa
 
Protein coding
M1AFF3 Ensembl Canonical
Exons
  • PGSC0003DMG400008386 exons
  • All exons in this region
Variants
  • loading
Markup
  • loading
>chromosome:SolTub_3.0:10:53313993:53317144:-1
TTTCAAAATAAAAGTCATCTTAAGAAATTGAGATAAATAGATATCCCCCATTTTTGTATC
ATAGACCAAGTATCTATTTTATCTATTTTCATTCTGTCTACATTTTCTTTCTAGTATATT
GATTCTGATTACTTTTTAGTATTCTATTTATCGCATCACAACAATTAGGAATTTAGAATC
TATATATTTAGATCAAAGTAGGGTCTAACTATTGGAATAATAGTATCTATAGCTATTTAA
GCCCTTGTTAGTAAAATTGGTAAATTAAGTGAAGATACAAAAAGAGAGTAAGTCAAACCT
TCGATAAACTAAAGTCTACATAACAATTTCAATGCTACGCCTTGAACCACTTGGGCATCT
ATGACACCAAAACTGAATCAGTCATAGTCCAGATTTCCTTCTTAGATAGATACGATCAAT
TAATTTTTACCAAAAAATAAGAAATATCTATTAAATAGTGATAGTTAAAAAAGTATATCT
TATAACGAAAGAAAAGTAAAATATATATATCGTATTAATTAGTTTCTTAATGAACGTGAT
TTTTGCTAAGATGACGAAAGGAGTATAAGTCAAACTCTTCCATTCTCCTCGTTGGTTAAT
TTCCCAGTTATTTCATCAAAAAACTTTCTACAATCTACACGCCTTACGCGTTACACTCTC
TCTCGAAGCAACCTCAAACTTCTTCTCTCTTAAATAAAAATTCATTCCCTTTTTCTTCAT
CTTCATCTTCAAATCTCCTTCAATGGAGCCTCCAAATCCCCAACAATTTCAGCAATTTCT
CAGCAGTGTTCTCTCTCAGCGTGGCCCATCTGCACTTCCTTATGCTGAAGATGTCAAATG
GCTGATCCGTCAACATCTCCTTTCTTTAATCGATATTTACCCTTCACTTCAGCCGAAAAC
TGCTTCATTTACTCATAATGATGGAAGGACTGTGAATCTATTGCAAGCTGTAGGTACTGT
TCCGATGGTTTATCTAGATCGTCCGTATAATATTCCGGTGATTATTTGGTTGATGGAATC
TTACCCACGTCATCCGCCTTTGGTTTTTGTGAATCCGACTAGGGATATGGTTATTAAAAA
ACCTCATCCGTTTGTGAATCCATCTGGGGTTGTGTCGATTCCATATTTGCAGAATTGGAT
ATACCCTAGTTCGAATCTTGTTGAATTGGTTCGTAATTTGAGTCATTTTTTTGGAAGGGA
TCCTCCGCTTTATGCGAAAGTACAAGCACATCCATCAAACCCTAACCCTAGTCCTACTCC
TACCTCTCATCCTCCGCCAAGTACGAGTTTTCCTAATCACAGTTCGCCAGTTGGGTCATC
TGGGATTCGGCCGGCGATACCTCCTAGGCCAGTTCAACAACCACCTTATGGTGCAGTGAA
ACAGGATGATTGGGAGGATGTTTTTAGGCGGAACGCGACAGATAAGCTGCTTGTTGACTT
GCATAATGATATAGTTGGGTTGAGGAATGCACAGGAGAAGGATATGGATGGGTTGTTTAA
TGCTCAGGGAGTGTTGAAGCAGCGGGAGGAGCAGTTGAAACAAGGGTTAAAGGAAATGCA
GGATGAGAAAGAGGGGTTGGAGCAGCAATTACAGATGGTTTTGATGAATAGTGATGTATT
AGAGGGATGGCTGAGGGAGAATGAGGGGAAAGTGACCAATTTAGGGAATGTGGATGTGGA
TACGGCCTTTGAGCCATGTGATAGTCTTTCCAAGCAGATGCTCGATTGCACGGCGTCAGA
TTTGGCATTAGAGGATGTGATTTATTCGTTGGACAAAGCTATACAGGGTGGGGCAATACC
ATTTGACCAGTACTTGAGGAACATAAGGTTGTTATCGCGTGAGCAATTCTTTCATCGTGC
TACAGCATCAAAAGTTAGGGCTGCTCAGATGCAGGCTCAAGTTGCTAATATGGCTGCTAG
AACATCACAATATGCATTGTGATAGACATCTAATCACTTGCAGGTGTGTTTGCAACAGAC
TGAAGGTCAATATATTTCTAGATTGGTTACTTGTGAATAATCTGTCAATGTGCTATAGCT
TTATCAATAGATTTTGGCACTACATTTTGGCGTGGGTGTTTAATTGGTATTTATTGGTTG
TATCATTTTGTTACCAAAAGTAGAATCACATAAAAGGGATTTTCCCTACAATGATATCCA
CGATTTTCATTTCTGTCAAGTTATCCCATTTCTATGAGATTGTGATTTTGGACCAAGATT
AGTGTTCTGTCACTCTCCCAAAAAAGAGTAGTAAGAGGTTCCAACTCTCTTGTCTTCTGC
TTTAGTCTCAGCAGTTAGCCTGTTTTTTGGATGGATGTCTATACCGATTACCGAGGAATA
ATTTCAAATCACTGTTATGGTGATAAACATTCTGTTCAAATACATATGCATATCTTTGTG
TACTTGTCTATCTAGCAATGTAGCATGTTCTATATAGGTGTTTCTCAAGCACTTTGTGTT
GTATGTGAAATCATAAAGTTTCTCCATCTGATGTTATTTGTCTAAACAGAGAGTTCAAAG
ATGTGTGACTTATATAGTTAGTGATAGCGGAACATATTACAGCAATAGTTGAGAAGTTAG
TTTAATATATATAACATTTGAAATAGTTAACTGAATTCGGTTTATTGAAAGCTGCAGAGA
AATAGAATGTATCAAAATTTTGGAACGTTCTAAATATGAAAAATGTCATATGAATTGGAA
TATTGTGTATGCATTTGGGTACAGTTCTTGCTTTCTAGTGTATTGGAAATTCGGGAAAAC
GGTAAGTACCCAAGCTAACTCGTCCCGAATTTTCAGTTACACACCTGTACTTTGTAGGAT
CTTATTAACCTTACTATTCCGAAGTGAAATAAAAACCCCTCCAAGTGTTGGCGTGGCGGA
AAAGTGAATTTGTGTGTGTAGATGACTGCATGCTTGAAATCTTGGTTTCTTGTTTAATGG
GTTCATTTCAAGAAAGTTAACCCCCTACAAAATGCAGGTGTCTAACAGCAAACCTGGGAG
TACTCATGCCTTCTCCCTGCCATTCAAATGAAATGGCTACATCCATTTGCTGTGCCATGT
AATCACACTCATAATCCAAAACCAGGAACTTGTGTGGCTCTTAAACCATATTATGAATTA
CATACATCATTATAGAGCAGGTAGCTTAGACT