Selaginella moellendorffii (v1.0) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
SuperContig GL377602: 866,337-870,121 reverse strand.
This transcript has 16 exons and is annotated with 26 domains and features.
This transcript is a product of gene SELMODRAFT_443873 Show transcript tableHide transcript table
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1 ATGGGTGATTTAGCGCGTTGCAAGACGCAATTGGCCTCATTTCGAATCAAGGAGCTCAAG 60 1 ATGGGTGATTTAGCGCGTTGCAAGACGCAATTGGCCTCATTTCGAATCAAGGAGCTCAAG 60 1 -M--G--D--L--A--R--C--K--T--Q--L--A--S--F--R--I--K--E--L--K- 20 61 GATGTTCTCACCAGGCTCGGGCTTCCCAAGCAGGGGAAGAAACAGGTTCTTATGGACAAA 120 61 GATGTTCTCACCAGGCTCGGGCTTCCCAAGCAGGGGAAGAAACAGGTTCTTATGGACAAA 120 21 -D--V--L--T--R--L--G--L--P--K--Q--G--K--K--Q--V--L--M--D--K- 40 121 GTTCTCGCGGTGCTTGTTCCTTCCGAGTGGCAGCAACACCCAGTCCAGAAAGGTTTCAAG 180 121 GTTCTCGCGGTGCTTGTTCCTTCCGAGTGGCAGCAACACCCAGTCCAGAAAGGTTTCAAG 180 41 -V--L--A--V--L--V--P--S--E--W--Q--Q--H--P--V--Q--K--G--F--K- 60 181 CCTGACGGAAATAGAAGCTCTATCGCAGCGCAAGTTATAGATGACATCTATAGGAAGTTG 240 181 CCTGACGGAAATAGAAGCTCTATCGCAGCGCAAGTTATAGATGACATCTATAGGAAGTTG 240 61 -P--D--G--N--R--S--S--I--A--A--Q--V--I--D--D--I--Y--R--K--L- 80 241 CGGGGATCGGGAGCTGTGGAGTTGGCTTCCGGACACAGGAATTTCTCCGGTGCTGTGTCT 300 241 CGGGGATCGGGAGCTGTGGAGTTGGCTTCCGGACACAGGAATTTCTCCGGTGCTGTGTCT 300 81 -R--G--S--G--A--V--E--L--A--S--G--H--R--N--F--S--G--A--V--S- 100 301 GTGAGTGCCGGTCGATCGGATGAACCGGATGAAACTGAGAATCGATGTCCGTGTGGGAGT 360 301 GTGAGTGCCGGTCGATCGGATGAACCGGATGAAACTGAGAATCGATGTCCGTGTGGGAGT 360 101 -V--S--A--G--R--S--D--E--P--D--E--T--E--N--R--C--P--C--G--S- 120 361 CCGCTGGATACTGGAACTATGATCCAGTGTGACAACCAAGCCTGCAAAGTGTGGCAGCAC 420 361 CCGCTGGATACTGGAACTATGATCCAGTGTGACAACCAAGCCTGCAAAGTGTGGCAGCAC 420 121 -P--L--D--T--G--T--M--I--Q--C--D--N--Q--A--C--K--V--W--Q--H- 140 421 CTTAACTGCGTGGTGATTCCTGAGAATGCAGCCGAGGGTGTCGAGCCCGATGTTCCATCG 480 421 CTTAACTGCGTGGTGATTCCTGAGAATGCAGCCGAGGGTGTCGAGCCCGATGTTCCATCG 480 141 -L--N--C--V--V--I--P--E--N--A--A--E--G--V--E--P--D--V--P--S- 160 481 CAATTCTACTGTGAAATTTGCAGGATTAATTATGGAGATCCTTTTTGTGTTACGTTATCG 540 481 CAATTCTACTGTGAAATTTGCAGGATTAATTATGGAGATCCTTTTTGTGTTACGTTATCG 540 161 -Q--F--Y--C--E--I--C--R--I--N--Y--G--D--P--F--C--V--T--L--S- 180 541 CAACCGTTGCCTGCAGCTAAGTTTTACGCTCCAGCGGCTCTTCAGATGGAAGGGGCGTCT 600 541 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TGTACCAGAGAGGGCACGAACAGGATCTCGCTGTCAGCGTGTGATGCCCGGCCTTTTTGT 900 841 TGTACCAGAGAGGGCACGAACAGGATCTCGCTGTCAGCGTGTGATGCCCGGCCTTTTTGT 900 281 -C--T--R--E--G--T--N--R--I--S--L--S--A--C--D--A--R--P--F--C- 300 901 ATGGGCGTTCGCATCATTCGTCGCCTTAGTGTCGAGCAGGTGATGAGTTTGATCCCGAGT 960 901 ATGGGCGTTCGCATCATTCGTCGCCTTAGTGTCGAGCAGGTGATGAGTTTGATCCCGAGT 960 301 -M--G--V--R--I--I--R--R--L--S--V--E--Q--V--M--S--L--I--P--S- 320 961 GCTGCCCGTGGCGAATCTTTCGAGGAGGCCCTGGCTCGTGTCCGTCGTTGTATAGATGGC 1020 961 GCTGCCCGTGGCGAATCTTTCGAGGAGGCCCTGGCTCGTGTCCGTCGTTGTATAGATGGC 1020 321 -A--A--R--G--E--S--F--E--E--A--L--A--R--V--R--R--C--I--D--G- 340 1021 GGTGCAAGCGATGCCGGCGATGACGATGATAGCGATCTTGAAGTTGTTGCCGACTCCGTG 1080 1021 GGTGCAAGCGATGCCGGCGATGACGATGATAGCGATCTTGAAGTTGTTGCCGACTCCGTG 1080 341 -G--A--S--D--A--G--D--D--D--D--S--D--L--E--V--V--A--D--S--V- 360 1081 ACTATGAATTTGAGTTGTCCTATGAGTGGTTCTCGGATACATATCGCTGGCCGCTTTAAA 1140 1081 ACTATGAATTTGAGTTGTCCTATGAGTGGTTCTCGGATACATATCGCTGGCCGCTTTAAA 1140 361 -T--M--N--L--S--C--P--M--S--G--S--R--I--H--I--A--G--R--F--K- 380 1141 CCATGTGCTCATATGGGCGGCTTCGACTTGAAGACATTTGTTGAGCTTAATCAAAGAGCA 1200 1141 CCATGTGCTCATATGGGCGGCTTCGACTTGAAGACATTTGTTGAGCTTAATCAAAGAGCA 1200 381 -P--C--A--H--M--G--G--F--D--L--K--T--F--V--E--L--N--Q--R--A- 400 1201 CGAAAGTGGCAATGTCCTGTGTGTATGAAGAATTACTCTCTTGATCAGCTCATCATTGAT 1260 1201 CGAAAGTGGCAATGTCCTGTGTGTATGAAGAATTACTCTCTTGATCAGCTCATCATTGAT 1260 401 -R--K--W--Q--C--P--V--C--M--K--N--Y--S--L--D--Q--L--I--I--D- 420 1261 CCTTTTTTCAATCGCATCACTCATGCGATGAAAGACTATGGAGAGGACATCAAGGAAGTG 1320 1261 CCTTTTTTCAATCGCATCACTCATGCGATGAAAGACTATGGAGAGGACATCAAGGAAGTG 1320 421 -P--F--F--N--R--I--T--H--A--M--K--D--Y--G--E--D--I--K--E--V- 440 1321 GAACTTAAGGCTGATGGTTCGTGGCGGCCAAAGCTTGAAGGCGAGACAGTGTCCAGACAA 1380 1321 GAACTTAAGGCTGATGGTTCGTGGCGGCCAAAGCTTGAAGGCGAGACAGTGTCCAGACAA 1380 441 -E--L--K--A--D--G--S--W--R--P--K--L--E--G--E--T--V--S--R--Q- 460 1381 CCATGGCGAAGTCCGGATGGCACACCGGTGCTAGCAAACGGCTTCCACAAGGCTACAGTG 1440 1381 CCATGGCGAAGTCCGGATGGCACACCGGTGCTAGCAAACGGCTTCCACAAGGCTACAGTG 1440 461 -P--W--R--S--P--D--G--T--P--V--L--A--N--G--F--H--K--A--T--V- 480 1441 AAGCAAGAGGAGGGCGTGTCTCAAGGAAGACCACCGTTAAAGATTGGCATGAAGAGAACA 1500 1441 AAGCAAGAGGAGGGCGTGTCTCAAGGAAGACCACCGTTAAAGATTGGCATGAAGAGAACA 1500 481 -K--Q--E--E--G--V--S--Q--G--R--P--P--L--K--I--G--M--K--R--T- 500 1501 CACGACGGTAGCTGGGCCGTGCTGAGACCGTCTGGCGGGGCCATCTCCAAGCCGAAGGAG 1560 1501 CACGACGGTAGCTGGGCCGTGCTGAGACCGTCTGGCGGGGCCATCTCCAAGCCGAAGGAG 1560 501 -H--D--G--S--W--A--V--L--R--P--S--G--G--A--I--S--K--P--K--E- 520 1561 CCGTCCTACTCACGTAGCACCAGCGCCACGGACACAAACAACGAGGACGACGAAAGAAGC 1620 1561 CCGTCCTACTCACGTAGCACCAGCGCCACGGACACAAACAACGAGGACGACGAAAGAAGC 1620 521 -P--S--Y--S--R--S--T--S--A--T--D--T--N--N--E--D--D--E--R--S- 540 1621 GTGAACCAGGAACCATACTCCAAAGACTACACGGGAGACAACGAGGCGGGCTTGCGGGCT 1680 1621 GTGAACCAGGAACCATACTCCAAAGACTACACGGGAGACAACGAGGCGGGCTTGCGGGCT 1680 541 -V--N--Q--E--P--Y--S--K--D--Y--T--G--D--N--E--A--G--L--R--A- 560 1681 GGAGGAGGCCTGGCTATCAACGCGTGGAAGAAGAGCAAGGCCACACTCGTAGATGAAGCT 1740 1681 GGAGGAGGCCTGGCTATCAACGCGTGGAAGAAGAGCAAGGCCACACTCGTAGATGAAGCT 1740 561 -G--G--G--L--A--I--N--A--W--K--K--S--K--A--T--L--V--D--E--A- 580 1741 CCTGCCAGTGCCGGAGATGTAATAGTTCTTAGTGATTCGGATGAAGAGTCGGGCTCGCCT 1800 1741 CCTGCCAGTGCCGGAGATGTAATAGTTCTTAGTGATTCGGATGAAGAGTCGGGCTCGCCT 1800 581 -P--A--S--A--G--D--V--I--V--L--S--D--S--D--E--E--S--G--S--P- 600 1801 GGTGGACCTTACAACAATGGCAAGCAGCAGCACAACGGTGGTGCCGCTCCTTCAAGCAGC 1860 1801 GGTGGACCTTACAACAATGGCAAGCAGCAGCACAACGGTGGTGCCGCTCCTTCAAGCAGC 1860 601 -G--G--P--Y--N--N--G--K--Q--Q--H--N--G--G--A--A--P--S--S--S- 620 1861 TATGGTGGCAGTGGGAAGAACAAGGATAGACTAGCTAACGGGGCTACAGGTGGAGCTCGA 1920 1861 TATGGTGGCAGTGGGAAGAACAAGGATAGACTAGCTAACGGGGCTACAGGTGGAGCTCGA 1920 621 -Y--G--G--S--G--K--N--K--D--R--L--A--N--G--A--T--G--G--A--R- 640 1921 GGACGACATAGCTCCTCGAGACACACAGGCTCAGATGGTGGTGGTGGTGGCGGCGGCATG 1980 1921 GGACGACATAGCTCCTCGAGACACACAGGCTCAGATGGTGGTGGTGGTGGCGGCGGCATG 1980 641 -G--R--H--S--S--S--R--H--T--G--S--D--G--G--G--G--G--G--G--M- 660 1981 GGAATGCCGCTCGAGAGCTCGCTATGGTCGCAGCCATCGCAGGAAGTTCCTTACAGTTTT 2040 1981 GGAATGCCGCTCGAGAGCTCGCTATGGTCGCAGCCATCGCAGGAAGTTCCTTACAGTTTT 2040 661 -G--M--P--L--E--S--S--L--W--S--Q--P--S--Q--E--V--P--Y--S--F- 680 2041 TTTGACGCTGCCGGTCCCGCGCGGCAAGCCAAAAACTCGGAGCTCGACTTCGCGTACCAA 2100 2041 TTTGACGCTGCCGGTCCCGCGCGGCAAGCCAAAAACTCGGAGCTCGACTTCGCGTACCAA 2100 681 -F--D--A--A--G--P--A--R--Q--A--K--N--S--E--L--D--F--A--Y--Q- 700 2101 GCTTACGAGATGGACGAAGATGGTGGCGGCGACGATACGGGGCCATCAAAGTCGGGCTTT 2160 2101 GCTTACGAGATGGACGAAGATGGTGGCGGCGACGATACGGGGCCATCAAAGTCGGGCTTT 2160 701 -A--Y--E--M--D--E--D--G--G--G--D--D--T--G--P--S--K--S--G--F- 720 2161 CGGCTGTTTCTTCCGCCACAGCCGGCGAGGGAGCAGCGGCAGACGTTGCAAAATCCGGCG 2220 2161 CGGCTGTTTCTTCCGCCACAGCCGGCGAGGGAGCAGCGGCAGACGTTGCAAAATCCGGCG 2220 721 -R--L--F--L--P--P--Q--P--A--R--E--Q--R--Q--T--L--Q--N--P--A- 740 2221 ATCTCTCCTGGTGAGCAGCTGGATGAAGATTGGTTCTCGCTGAGCCTTGGTGGTGGTGAC 2280 2221 ATCTCTCCTGGTGAGCAGCTGGATGAAGATTGGTTCTCGCTGAGCCTTGGTGGTGGTGAC 2280 741 -I--S--P--G--E--Q--L--D--E--D--W--F--S--L--S--L--G--G--G--D- 760 2281 AACGTTCTCAACGCCGCCAACGATAACACTGGACTAGGCCTTCCATTGTCTTCTTCTCGT 2340 2281 AACGTTCTCAACGCCGCCAACGATAACACTGGACTAGGCCTTCCATTGTCTTCTTCTCGT 2340 761 -N--V--L--N--A--A--N--D--N--T--G--L--G--L--P--L--S--S--S--R- 780 2341 GAGTATACCAGGCCAGCAAGGGAGCGCCTGGATTCACTTGCAAACACAGCGACGGTTCTT 2400 2341 GAGTATACCAGGCCAGCAAGGGAGCGCCTGGATTCACTTGCAAACACAGCGACGGTTCTT 2400 781 -E--Y--T--R--P--A--R--E--R--L--D--S--L--A--N--T--A--T--V--L- 800 2401 CTCGGTCTAAACAACAATAATGGAGCTGGTCATTCGCGAAGGAACCAGCACTTATCTCGA 2460 2401 CTCGGTCTAAACAACAATAATGGAGCTGGTCATTCGCGAAGGAACCAGCACTTATCTCGA 2460 801 -L--G--L--N--N--N--N--G--A--G--H--S--R--R--N--Q--H--L--S--R- 820 2461 CAACGTAGCTACTTTCGAGCTGAATCCCAGTCCGAGTGAAGATGGAGTGGAAGCTTTCGC 2520 2461 CAACGTAGCTACTTTCGAGCTGAATCCCAGTCCGAGTGA..................... 2499 821 -Q--R--S--Y--F--R--A--E--S--Q--S--E--*-..................... 832 2521 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