Selaginella moellendorffii (v1.0)
Description

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:D8QX02]

Location
About this transcript

This transcript has 6 exons and is annotated with 9 domains and features.

Gene
Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • RefSeq
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
-EFJ10683828275aa
 
Protein coding
D8QX02 -Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGCCCTCCGGGCCGACGGCGGTCGTTGCCAAGCTCCATCCGACGGTCCTCTTCAACATC     60
     1 ATGCCCTCCGGGCCGACGGCGGTCGTTGCCAAGCTCCATCCGACGGTCCTCTTCAACATC     60
     1 -M--P--S--G--P--T--A--V--V--A--K--L--H--P--T--V--L--F--N--I-     20

                                                                          
    61 TGCGATTCCTACATTCGCCGCAACGATCAGCAAGATCGGGTGATTGGGACGCTGCTGGGG    120
    61 TGCGATTCCTACATTCGCCGCAACGATCAGCAAGATCGGGTGATTGGGACGCTGCTGGGG    120
    21 -C--D--S--Y--I--R--R--N--D--Q--Q--D--R--V--I--G--T--L--L--G-     40

                                                                          
   121 TCGATTTCCAGCGATGGAACGATCGATATTCGCAATTCTTATGCTGTTCCGCACAACGAG    180
   121 TCGATTTCCAGCGATGGAACGATCGATATTCGCAATTCTTATGCTGTTCCGCACAACGAG    180
    41 -S--I--S--S--D--G--T--I--D--I--R--N--S--Y--A--V--P--H--N--E-     60

                                                                          
   181 TCGTCTGATCAGGTGGCTGTGGACATCGATTATCATAGGTCGATGTTTGAGCTTCATCAG    240
   181 TCGTCTGATCAGGTGGCTGTGGACATCGATTATCATAGGTCGATGTTTGAGCTTCATCAG    240
    61 -S--S--D--Q--V--A--V--D--I--D--Y--H--R--S--M--F--E--L--H--Q-     80

                                                                          
   241 CGAGTGAATCCCAAAGAAGTTATCATCGGATGGTACTCAACAAGCCCTGGAGTAACTGGA    300
   241 CGAGTGAATCCCAAAGAAGTTATCATCGGATGGTACTCAACAAGCCCTGGAGTAACTGGA    300
    81 -R--V--N--P--K--E--V--I--I--G--W--Y--S--T--S--P--G--V--T--G-    100

                                                                          
   301 AGCGATGCCTTGATCCAGGATTTCTACGCCAGAGAGACCTCCAATCCCATTCACCTCACT    360
   301 AGCGATGCCTTGATCCAGGATTTCTACGCCAGAGAGACCTCCAATCCCATTCACCTCACT    360
   101 -S--D--A--L--I--Q--D--F--Y--A--R--E--T--S--N--P--I--H--L--T-    120

                                                                          
   361 GTCGACACAACTTTCAGCGATGACGCCGCAAACATCAAAGCTTATGTTTCCACGGTGTTA    420
   361 GTCGACACAACTTTCAGCGATGACGCCGCAAACATCAAAGCTTATGTTTCCACGGTGTTA    420
   121 -V--D--T--T--F--S--D--D--A--A--N--I--K--A--Y--V--S--T--V--L-    140

                                                                          
   421 ACTCTCGGCGAGCGTCCGCTTGCGGCACAGTTCCATGAGGTCCAGCTCGACCTGCGACTC    480
   421 ACTCTCGGCGAGCGTCCGCTTGCGGCACAGTTCCATGAGGTCCAGCTCGACCTGCGACTC    480
   141 -T--L--G--E--R--P--L--A--A--Q--F--H--E--V--Q--L--D--L--R--L-    160

                                                                          
   481 TTGGAGGCCGAGAGAGTTGGCTTTGATATCCTGAAGAAAACACTCGTTGACAAGCTCCCA    540
   481 TTGGAGGCCGAGAGAGTTGGCTTTGATATCCTGAAGAAAACACTCGTTGACAAGCTCCCA    540
   161 -L--E--A--E--R--V--G--F--D--I--L--K--K--T--L--V--D--K--L--P-    180

                                                                          
   541 AACGATCTCCAAGGATTGGAGTCCTCGATGCAAAGGCTGCAAAACATGATCGACACGGTC    600
   541 AACGATCTCCAAGGATTGGAGTCCTCGATGCAAAGGCTGCAAAACATGATCGACACGGTC    600
   181 -N--D--L--Q--G--L--E--S--S--M--Q--R--L--Q--N--M--I--D--T--V-    200

                                                                          
   601 TTCAAGTATGTGGATGATGTCGTGGAGGGCCGTATCCCACCAGATAACACAGTCGGTCGC    660
   601 TTCAAGTATGTGGATGATGTCGTGGAGGGCCGTATCCCACCAGATAACACAGTCGGTCGC    660
   201 -F--K--Y--V--D--D--V--V--E--G--R--I--P--P--D--N--T--V--G--R-    220

                                                                          
   661 TACCTGGCCGATACTCTCTCCATGGTGCCCAAGATCTCTCCAGACACCTTCAGCAAGCTC    720
   661 TACCTGGCCGATACTCTCTCCATGGTGCCCAAGATCTCTCCAGACACCTTCAGCAAGCTC    720
   221 -Y--L--A--D--T--L--S--M--V--P--K--I--S--P--D--T--F--S--K--L-    240

                                                                          
   721 TTCAACGATAGCATGCAGGACTTGCTACTGGTCGTTTATCTTGCAAACTTGACAAGAACA    780
   721 TTCAACGATAGCATGCAGGACTTGCTACTGGTCGTTTATCTTGCAAACTTGACAAGAACA    780
   241 -F--N--D--S--M--Q--D--L--L--L--V--V--Y--L--A--N--L--T--R--T-    260

                                                                          
   781 CAACTCGCTCTCGCCGAGAAGCTCAACACCGCGGCCCAAGTTTTTTGA                828
   781 CAACTCGCTCTCGCCGAGAAGCTCAACACCGCGGCCCAAGTTTTTTGA                828
   261 -Q--L--A--L--A--E--K--L--N--T--A--A--Q--V--F--*-                275