Transcript: Os11t0265200-00
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- Os11t0265200-00 1622 457aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0P0Y189 Q53LT0 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 C TCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGCTTCTCTCTCCTCCTCCTCTTCTCCCCATTCTGATCTC 60
............................................................
............................................................
61 TGACACCGCGGCGGCCATCTCCCCCATCTCG ATG GCG GCG CCG CCG CAG CCG CAG CCG GA 120
...............................ATGGCGGCGCCGCCGCAGCCGCAGCCGGA 29
...............................-M--A--A--P--P--Q--P--Q--P--E 10
121 G CCG GAG CCC GCC GCG GGC GGC GCG GGG CTG GAG GCG CTG GAG GGG CTC GCG CTG GAC AC 180
30 GCCGGAGCCCGCCGCGGGCGGCGCGGGGCTGGAGGCGCTGGAGGGGCTCGCGCTGGACAC 89
10 --P--E--P--A--A--G--G--A--G--L--E--A--L--E--G--L--A--L--D--T 30
181 C GTC ATC GCC AAG GCC GGG GCG CGC CAG GCC GCG GCG CTG GCC TGC GCC AGC ACG CGC CT 240
90 CGTCATCGCCAAGGCCGGGGCGCGCCAGGCCGCGGCGCTGGCCTGCGCCAGCACGCGCCT 149
30 --V--I--A--K--A--G--A--R--Q--A--A--A--L--A--C--A--S--T--R--L 50
241 C CGC GAC GCC GCG GGC GAC GAC GCG CTG TGG CGC CGC TTC TGC GCC GAC GAC CTC GCC CT 300
150 CCGCGACGCCGCGGGCGACGACGCGCTGTGGCGCCGCTTCTGCGCCGACGACCTCGCCCT 209
50 --R--D--A--A--G--D--D--A--L--W--R--R--F--C--A--D--D--L--A--L 70
301 C CAC GCG CCG CTC GCC CCC GAC GGC CGC GCG CTC CCT TCC TTC AAG GAT GCC TAT AAA GT 360
210 CCACGCGCCGCTCGCCCCCGACGGCCGCGCGCTCCCTTCCTTCAAGGATGCCTATAAAGT 269
70 --H--A--P--L--A--P--D--G--R--A--L--P--S--F--K--D--A--Y--K--V 90
361 T TGG TTG GAG TCT TTT GGC ATG TAT CCT TTA CCT CTG GTA AGG AGA GTG AAA ATT TTC TG 420
270 TTGGTTGGAGTCTTTTGGCATGTATCCTTTACCTCTGGTAAGGAGAGTGAAAATTTTCTG 329
90 --W--L--E--S--F--G--M--Y--P--L--P--L--V--R--R--V--K--I--F--W 110
421 G AGT TCG CTG AAG AGC TGG CTG TCT GAA AAC TTC CCT GAA GCA CAC AAG ACA TTG AAT AA 480
330 GAGTTCGCTGAAGAGCTGGCTGTCTGAAAACTTCCCTGAAGCACACAAGACATTGAATAA 389
110 --S--S--L--K--S--W--L--S--E--N--F--P--E--A--H--K--T--L--N--K 130
481 A GGT GTT TCT GAA GCT CAG ATA CAA TCA GCA GAG GAT GAT CTT GGA TTC AAG CTC CCT TT 540
390 AGGTGTTTCTGAAGCTCAGATACAATCAGCAGAGGATGATCTTGGATTCAAGCTCCCTTT 449
130 --G--V--S--E--A--Q--I--Q--S--A--E--D--D--L--G--F--K--L--P--L 150
541 G CCG ACA AAG CTG CTC TAT CGT TTT TGC AAT GGT CAG CTG CCC CTT AGT GAA CAT CAT CA 600
450 GCCGACAAAGCTGCTCTATCGTTTTTGCAATGGTCAGCTGCCCCTTAGTGAACATCATCA 509
150 --P--T--K--L--L--Y--R--F--C--N--G--Q--L--P--L--S--E--H--H--H 170
601 C GAG AAT ATG CGA ATG GCT CAT CTT GGT ATT ATA GGA GGC TAT GTG TTT TAT GAC CAC TT 660
510 CGAGAATATGCGAATGGCTCATCTTGGTATTATAGGAGGCTATGTGTTTTATGACCACTT 569
170 --E--N--M--R--M--A--H--L--G--I--I--G--G--Y--V--F--Y--D--H--L 190
661 G ATC AAT GTT CAC CTG TCA CCA CTT GAG CAA ATT GTT GAA GAG ACG AAA GAA TTT TAT CG 720
570 GATCAATGTTCACCTGTCACCACTTGAGCAAATTGTTGAAGAGACGAAAGAATTTTATCG 629
190 --I--N--V--H--L--S--P--L--E--Q--I--V--E--E--T--K--E--F--Y--R 210
721 T GAG TTC TAT GAC CAA GGT GTT TTT AAT ATG ACA AAT CTC ATT ATA GTG GCA ACT TCA TG 780
630 TGAGTTCTATGACCAAGGTGTTTTTAATATGACAAATCTCATTATAGTGGCAACTTCATG 689
210 --E--F--Y--D--Q--G--V--F--N--M--T--N--L--I--I--V--A--T--S--W 230
781 G TAT CGT CCA AAA ACA TTT TTC CTT AAT TGT TCA GAT GAC CAA CTC TAT GTT GGC ACC AT 840
690 GTATCGTCCAAAAACATTTTTCCTTAATTGTTCAGATGACCAACTCTATGTTGGCACCAT 749
230 --Y--R--P--K--T--F--F--L--N--C--S--D--D--Q--L--Y--V--G--T--I 250
841 C AAT TTA CAA GAT GGA GAA ATG TTG CCA TGT GTA CCG AAA TCA CTG ATA AGG CCA ACT AA 900
750 CAATTTACAAGATGGAGAAATGTTGCCATGTGTACCGAAATCACTGATAAGGCCAACTAA 809
250 --N--L--Q--D--G--E--M--L--P--C--V--P--K--S--L--I--R--P--T--N 270
901 T ACT GAT ATG CCC CAA GAT GGA TTG CTT CTG TGG TTA GAA GAG CAT CTT AGG CGT TTA CA 960
810 TACTGATATGCCCCAAGATGGATTGCTTCTGTGGTTAGAAGAGCATCTTAGGCGTTTACA 869
270 --T--D--M--P--Q--D--G--L--L--L--W--L--E--E--H--L--R--R--L--Q 290
961 G AAT GGC ATG ATC AAG ATC CGT ATG CTT AAG ACG TCA AGG TAT ATC AGC TTA TTT CCA GA 1020
870 GAATGGCATGATCAAGATCCGTATGCTTAAGACGTCAAGGTATATCAGCTTATTTCCAGA 929
290 --N--G--M--I--K--I--R--M--L--K--T--S--R--Y--I--S--L--F--P--E 310
1021 A GCA TCC CCA TCA TGT ACG TCC GCA ATG ACA AAT GGT GTG AAG GTA CGT GCA TCT GCT GT 1080
930 AGCATCCCCATCATGTACGTCCGCAATGACAAATGGTGTGAAGGTACGTGCATCTGCTGT 989
310 --A--S--P--S--C--T--S--A--M--T--N--G--V--K--V--R--A--S--A--V 330
1081 C TTT GCA CCA GAG CAC CCT GAA AGT AGG CGG CCT GGG GCT AAA TGT TTA TAT GCA TAC TC 1140
990 CTTTGCACCAGAGCACCCTGAAAGTAGGCGGCCTGGGGCTAAATGTTTATATGCATACTC 1049
330 --F--A--P--E--H--P--E--S--R--R--P--G--A--K--C--L--Y--A--Y--S 350
1141 C ATT CGC CTG TCA GTT CCA GAG GCA TGC ATG CTA GGT GGT GTG TAC TAT TCC TCG TGC CA 1200
1050 CATTCGCCTGTCAGTTCCAGAGGCATGCATGCTAGGTGGTGTGTACTATTCCTCGTGCCA 1109
350 --I--R--L--S--V--P--E--A--C--M--L--G--G--V--Y--Y--S--S--C--Q 370
1201 G CTT TAC TCG CGC CAC TGG ATC ATC CGA TGG AGA GAC CGG GTT GTT TCT GAT GTG AAC GG 1260
1110 GCTTTACTCGCGCCACTGGATCATCCGATGGAGAGACCGGGTTGTTTCTGATGTGAACGG 1169
370 --L--Y--S--R--H--W--I--I--R--W--R--D--R--V--V--S--D--V--N--G 390
1261 G GAA GGT GTT ATT GGG AAG T AC CCT CTA CTA ACT ACA GGC CAG GAA GAG TTT GTG TAT GA 1320
1170 GGAAGGTGTTATTGGGAAGTACCCTCTACTAACTACAGGCCAGGAAGAGTTTGTGTATGA 1229
390 --E--G--V--I--G--K--Y--P--L--L--T--T--G--Q--E--E--F--V--Y--E 410
1321 G AGT TGC ACG CCT CTG CCT GAC AGT CCC GGA TCT GTG GAG GGC TCT TTC ACG TTT GTT CC 1380
1230 GAGTTGCACGCCTCTGCCTGACAGTCCCGGATCTGTGGAGGGCTCTTTCACGTTTGTTCC 1289
410 --S--C--T--P--L--P--D--S--P--G--S--V--E--G--S--F--T--F--V--P 430
1381 G GGG AA G TTG AGC CGG CCT GAA GGA AAG CCA TTT GAG GTC ACG GTG GCT GCG TTC CCT CT 1440
1290 GGGGAAGTTGAGCCGGCCTGAAGGAAAGCCATTTGAGGTCACGGTGGCTGCGTTCCCTCT 1349
430 --G--K--L--S--R--P--E--G--K--P--F--E--V--T--V--A--A--F--P--L 450
1441 G GAA ATA CCA GAG TAC ATC TTC TGA TTTCTGAGGATTGTACATAGTATGATGCAATAATG 1500
1350 GGAAATACCAGAGTACATCTTCTGA................................... 1374
450 --E--I--P--E--Y--I--F--*-................................... 457
1501 CACCTGCATAGATTTAGTAGTACTTGTTTCATGTAGCAGCAAGAATGGGATTTGCTTGTA 1560
............................................................
............................................................
1561 ATGATCTTGTGAATGCGGCATAAATTGTGGCACCTGGAAGTAAGCCCTTTTTTTTGGCGC 1620
............................................................
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1621 GT 1622
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