Transcript: Os10t0494500-01 OsRFP-201
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OsRFP-201 Os10t0494500-01 1654 500aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0P0XWM7 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 TC CAG ATT CGC CTC AGC AAG ATC GGC TCG TCG GAC TCC GGC GCC GCC GCG TCC GGC GCG G 60
..CAGATTCGCCTCAGCAAGATCGGCTCGTCGGACTCCGGCGCCGCCGCGTCCGGCGCGG 58
..-Q--I--R--L--S--K--I--G--S--S--D--S--G--A--A--A--S--G--A-- 19
61 CG GCC GGG GCC GGC GGC GGG GTC GGA GGC GGC GGC GTA GGC GGC GCC GGC GCC GGC GCC G 120
59 CGGCCGGGGCCGGCGGCGGGGTCGGAGGCGGCGGCGTAGGCGGCGCCGGCGCCGGCGCCG 118
20 A--A--G--A--G--G--G--V--G--G--G--G--V--G--G--A--G--A--G--A-- 39
121 GC GGG GGC CCG CCG AAG TCG GCC TCG GCG GCC GCG GGC GGG GCC CCG GAG TCC GTT ACG G 180
119 GCGGGGGCCCGCCGAAGTCGGCCTCGGCGGCCGCGGGCGGGGCCCCGGAGTCCGTTACGG 178
40 G--G--G--P--P--K--S--A--S--A--A--A--G--G--A--P--E--S--V--T-- 59
181 TC GCG TGC CCC GAC CAC CTG GTG ATT GCC GAC CTC GCC GTG GCA AAG AGC CTC GGC GCC G 240
179 TCGCGTGCCCCGACCACCTGGTGATTGCCGACCTCGCCGTGGCAAAGAGCCTCGGCGCCG 238
60 V--A--C--P--D--H--L--V--I--A--D--L--A--V--A--K--S--L--G--A-- 79
241 TC ACG ACC TCC GCC GTC GCG GCC GCC CGC ACC ATC GGC CGC CGC TCC CGC CGC CCC CTC G 300
239 TCACGACCTCCGCCGTCGCGGCCGCCCGCACCATCGGCCGCCGCTCCCGCCGCCCCCTCG 298
80 V--T--T--S--A--V--A--A--A--R--T--I--G--R--R--S--R--R--P--L-- 99
301 GC GAG CGC GTC CAC ATC TGC TGC CGC TGC GAG TTC CCC ATC GCC CTC TAC GGC CGC CTC A 360
299 GCGAGCGCGTCCACATCTGCTGCCGCTGCGAGTTCCCCATCGCCCTCTACGGCCGCCTCA 358
100 G--E--R--V--H--I--C--C--R--C--E--F--P--I--A--L--Y--G--R--L-- 119
361 TT CCT TGT GAA CAT GCT TTC TGT TTA GCC TGT GCT AGA AGT GAT TCC AGC TGC TAT CT T T 420
359 TTCCTTGTGAACATGCTTTCTGTTTAGCCTGTGCTAGAAGTGATTCCAGCTGCTATCTTT 418
120 I--P--C--E--H--A--F--C--L--A--C--A--R--S--D--S--S--C--Y--L-- 139
421 GT GAT GAG CGC ATT CAG AAG ATT CAA ACT GTG AAA ATG ATG GAA GGG ATT TTT ATC TGT G 480
419 GTGATGAGCGCATTCAGAAGATTCAAACTGTGAAAATGATGGAAGGGATTTTTATCTGTG 478
140 C--D--E--R--I--Q--K--I--Q--T--V--K--M--M--E--G--I--F--I--C-- 159
481 CT GCA CCT ATG TGT CTC AAG TCT TTC CTT AAG AGA TCT GAA TTT GAT TCT CAT ATA CCT G 540
479 CTGCACCTATGTGTCTCAAGTCTTTCCTTAAGAGATCTGAATTTGATTCTCATATACCTG 538
160 A--A--P--M--C--L--K--S--F--L--K--R--S--E--F--D--S--H--I--P-- 179
541 AA GTT CAT GCC AAC CTC CTG CAC AAT ACT CCA GAG AGG GAA GAA CGT AAT GAG CCA GAT G 600
539 AAGTTCATGCCAACCTCCTGCACAATACTCCAGAGAGGGAAGAACGTAATGAGCCAGATG 598
180 E--V--H--A--N--L--L--H--N--T--P--E--R--E--E--R--N--E--P--D-- 199
601 CT CCT AAC ATT TCC CGT GCT TCT GGG GGT GAT CAA AGA CAA TCT CAG ATG CCT GAA ATG T 660
599 CTCCTAACATTTCCCGTGCTTCTGGGGGTGATCAAAGACAATCTCAGATGCCTGAAATGT 658
200 A--P--N--I--S--R--A--S--G--G--D--Q--R--Q--S--Q--M--P--E--M-- 219
661 CT ACT GCA CGT GCT CCT CCT CGG ACT GGT GTT TCA CCC TCT TCA AGT TCT CAT GTG CAA G 720
659 CTACTGCACGTGCTCCTCCTCGGACTGGTGTTTCACCCTCTTCAAGTTCTCATGTGCAAG 718
220 S--T--A--R--A--P--P--R--T--G--V--S--P--S--S--S--S--H--V--Q-- 239
721 AT CGT GAT GAC CGA TCT CGC TAC CAC CAT TCC AGA GAC CAG ACC CCA CAG AGG CCC CCT A 780
719 ATCGTGATGACCGATCTCGCTACCACCATTCCAGAGACCAGACCCCACAGAGGCCCCCTA 778
240 D--R--D--D--R--S--R--Y--H--H--S--R--D--Q--T--P--Q--R--P--P-- 259
781 TG CTA TCA AGA CCA CCA TCA TTC CAT GGT CGT CAC TCT TAT CCA CCA GGG GAT ACT CCA A 840
779 TGCTATCAAGACCACCATCATTCCATGGTCGTCACTCTTATCCACCAGGGGATACTCCAA 838
260 M--L--S--R--P--P--S--F--H--G--R--H--S--Y--P--P--G--D--T--P-- 279
841 GT GAG AAC AAC CCG CCT CAA GGA TTT GAT CGG CCC TAC AAC TGG GCT CAT GAA AAT GCA C 900
839 GTGAGAACAACCCGCCTCAAGGATTTGATCGGCCCTACAACTGGGCTCATGAAAATGCAC 898
280 S--E--N--N--P--P--Q--G--F--D--R--P--Y--N--W--A--H--E--N--A-- 299
901 CT GGG GCG ACT CCA GTC CGC CAA GAA TCA GAG CAT GGT AGT CAA GAC AAA CAG CAA ATG A 960
899 CTGGGGCGACTCCAGTCCGCCAAGAATCAGAGCATGGTAGTCAAGACAAACAGCAAATGA 958
300 P--G--A--T--P--V--R--Q--E--S--E--H--G--S--Q--D--K--Q--Q--M-- 319
961 TG CCT AAT GCG CCT TTC ATG TTT CCT CCA ATG CCT CAT CAG CCA AAC TTC ATG ATG CCC A 1020
959 TGCCTAATGCGCCTTTCATGTTTCCTCCAATGCCTCATCAGCCAAACTTCATGATGCCCA 1018
320 M--P--N--A--P--F--M--F--P--P--M--P--H--Q--P--N--F--M--M--P-- 339
1021 TG AAT ATG AAT CAG CCA TTA ATG TCC AAC ACA TCA TTC AAT TAT CCT CTC CAA CAA GAT G 1080
1019 TGAATATGAATCAGCCATTAATGTCCAACACATCATTCAATTATCCTCTCCAACAAGATG 1078
340 M--N--M--N--Q--P--L--M--S--N--T--S--F--N--Y--P--L--Q--Q--D-- 359
1081 GA AAT CCA CAG TTC TTC AGT GCC CCT TTC CAG ATG CAA CTA CCA GAT GTT GGA CTG GAT C 1140
1079 GAAATCCACAGTTCTTCAGTGCCCCTTTCCAGATGCAACTACCAGATGTTGGACTGGATC 1138
360 G--N--P--Q--F--F--S--A--P--F--Q--M--Q--L--P--D--V--G--L--D-- 379
1141 AA GGC TCA GCC TCG GGG GTC CAA CCT ACG CCA CCT GGT CCT TTA AGC TTC CCT GAG GGG C 1200
1139 AAGGCTCAGCCTCGGGGGTCCAACCTACGCCACCTGGTCCTTTAAGCTTCCCTGAGGGGC 1198
380 Q--G--S--A--S--G--V--Q--P--T--P--P--G--P--L--S--F--P--E--G-- 399
1201 TT CAG CGT CCA TGG GGC ATG GGA TTG ATG GGC AAC CCA TTT CAG TCG ATG CCA CTT GGA C 1260
1199 TTCAGCGTCCATGGGGCATGGGATTGATGGGCAACCCATTTCAGTCGATGCCACTTGGAC 1258
400 L--Q--R--P--W--G--M--G--L--M--G--N--P--F--Q--S--M--P--L--G-- 419
1261 AG GGA ATG CCT GAA GGT GCA GGT GAA CCT CAG GGA GGT GGC GGA ATG GTT TTC CTG CAA G 1320
1259 AGGGAATGCCTGAAGGTGCAGGTGAACCTCAGGGAGGTGGCGGAATGGTTTTCCTGCAAG 1318
420 Q--G--M--P--E--G--A--G--E--P--Q--G--G--G--G--M--V--F--L--Q-- 439
1321 GT GGT TTC GGA GTC ATG CCT GAT GGC TCA ATG AAT TCA GGC ATA CCA GGT AGG GAT CTT T 1380
1319 GTGGTTTCGGAGTCATGCCTGATGGCTCAATGAATTCAGGCATACCAGGTAGGGATCTTT 1378
440 G--G--F--G--V--M--P--D--G--S--M--N--S--G--I--P--G--R--D--L-- 459
1381 CT GGC CAA GGT GAC CGG GGT GTT CTA GCG CAG ATG CCC ATG CCG ATG CAA ATG CAG ATG T 1440
1379 CTGGCCAAGGTGACCGGGGTGTTCTAGCGCAGATGCCCATGCCGATGCAAATGCAGATGT 1438
460 S--G--Q--G--D--R--G--V--L--A--Q--M--P--M--P--M--Q--M--Q--M-- 479
1441 CA CTT CCC CCA CCT CCC CCT ACA CAG CCC CCT TCA GCT GGA CAG CAA ACT TTT AGC AGA A 1500
1439 CACTTCCCCCACCTCCCCCTACACAGCCCCCTTCAGCTGGACAGCAAACTTTTAGCAGAA 1498
480 S--L--P--P--P--P--P--T--Q--P--P--S--A--G--Q--Q--T--F--S--R-- 499
1501 CT TGA TGATTATTTATGTACGGTAATTTAATTGTTGCTGTCAAAATTGGATTGTACTTAT 1560
1499 CTTGA....................................................... 1503
500 T--*-....................................................... 500
1561 CGAGAAAACGGTGGTCTCATCATTCTGCGTTGCTGATGAGAAATGTGTTGTGCCATGAAC 1620
............................................................
............................................................
1621 GATCATATCCCTAATGAAATTCCTATTGAGATCG 1654
..................................
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