Oryza sativa Japonica Group (IRGSP-1.0) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID History.
Chromosome 8: 4,692,655-4,696,632 forward strand.
This transcript has 12 exons, is annotated with 9 domains and features and is associated with 35 variant alleles.
This transcript is a product of gene Os08g0180100 Show transcript tableHide transcript table
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1 AGGGTCTTGGAGTTGTTTGTAACAAAACGGGTGGATTTGGTGTAGACGACTTTGTCATCG 60 ..GGTCTTGGAGTTGTTTGTAACAAAACGGGTGGATTTGGTGTAGACGACTTTGTCATCG 58 ..-G--L--G--V--V--C--N--K--T--G--G--F--G--V--D--D--F--V--I-- 19 61 AGTTCTTTGGGGAGGTATACCCTTCTTGGAGATGGTATGAAAAACAAGATGGCATTAAGC 120 59 AGTTCTTTGGGGAGGTATACCCTTCTTGGAGATGGTATGAAAAACAAGATGGCATTAAGC 118 20 E--F--F--G--E--V--Y--P--S--W--R--W--Y--E--K--Q--D--G--I--K-- 39 121 ATATACAAAACAATAGCGACGATCAAGCTCCTGAGTTTTACAACATTATGCTAGAACGGC 180 119 ATATACAAAACAATAGCGACGATCAAGCTCCTGAGTTTTACAACATTATGCTAGAACGGC 178 40 H--I--Q--N--N--S--D--D--Q--A--P--E--F--Y--N--I--M--L--E--R-- 59 181 CAAAGGGAGACCGTGATGGGTATGACTTGGTTTTCGTTGATGCAATGCATAAGGCTAACT 240 179 CAAAGGGAGACCGTGATGGGTATGACTTGGTTTTCGTTGATGCAATGCATAAGGCTAACT 238 60 P--K--G--D--R--D--G--Y--D--L--V--F--V--D--A--M--H--K--A--N-- 79 241 ATGCGAGCAGAATTTGTCACTCCTGCAACCCTAACTGTGAAGCAAAAGTAACGGCTGTGG 300 239 ATGCGAGCAGAATTTGTCACTCCTGCAACCCTAACTGTGAAGCAAAAGTAACGGCTGTGG 298 80 Y--A--S--R--I--C--H--S--C--N--P--N--C--E--A--K--V--T--A--V-- 99 301 ATGGTCATTATCAGATTGGAATTTACACTGTTCGACCAATTGCAGAAGGCGAGGAAATCA 360 299 ATGGTCATTATCAGATTGGAATTTACACTGTTCGACCAATTGCAGAAGGCGAGGAAATCA 358 100 D--G--H--Y--Q--I--G--I--Y--T--V--R--P--I--A--E--G--E--E--I-- 119 361 CTTTTGATTACAACTCTGTTACTGAGAGTAAAGAAGAGCACGAAGCGTCAGTTTGTCTCT 420 359 CTTTTGATTACAACTCTGTTACTGAGAGTAAAGAAGAGCACGAAGCGTCAGTTTGTCTCT 418 120 T--F--D--Y--N--S--V--T--E--S--K--E--E--H--E--A--S--V--C--L-- 139 421 GTGGAAGTCAAATATGCAGGGGCAGCTATTTAAATTTTTCTGGGGAAGGAGCTTTTGAAA 480 419 GTGGAAGTCAAATATGCAGGGGCAGCTATTTAAATTTTTCTGGGGAAGGAGCTTTTGAAA 478 140 C--G--S--Q--I--C--R--G--S--Y--L--N--F--S--G--E--G--A--F--E-- 159 481 AGGTCTTGATGGAATTCCATGGTGTGCTCGATCGACATAGTCTTCTGTTACAGGCTTGTG 540 479 AGGTCTTGATGGAATTCCATGGTGTGCTCGATCGACATAGTCTTCTGTTACAGGCTTGTG 538 160 K--V--L--M--E--F--H--G--V--L--D--R--H--S--L--L--L--Q--A--C-- 179 541 AAGCAAACTCTGTTTCTCAACAAGACTTAATTGACTTGGGGAGAGCTGGTCTTGGTACCT 600 539 AAGCAAACTCTGTTTCTCAACAAGACTTAATTGACTTGGGGAGAGCTGGTCTTGGTACCT 598 180 E--A--N--S--V--S--Q--Q--D--L--I--D--L--G--R--A--G--L--G--T-- 199 601 GTTTGCTTGCTGGTTTGCCTGGATGGCTTGTTGCTTACACTGCTCACCTGGTGCGGTTTA 660 599 GTTTGCTTGCTGGTTTGCCTGGATGGCTTGTTGCTTACACTGCTCACCTGGTGCGGTTTA 658 200 C--L--L--A--G--L--P--G--W--L--V--A--Y--T--A--H--L--V--R--F-- 219 661 TATTCTTTGAGAGACAGAAACTTCCTCATGAGATCTTTAAACACAATGTGGACGAGAAGC 720 659 TATTCTTTGAGAGACAGAAACTTCCTCATGAGATCTTTAAACACAATGTGGACGAGAAGC 718 220 I--F--F--E--R--Q--K--L--P--H--E--I--F--K--H--N--V--D--E--K-- 239 721 GCCAGTTTTTCACAGATATAAACATGGATTCCGAGAAGAATGATGCCGAGGTTCAGGCCG 780 719 GCCAGTTTTTCACAGATATAAACATGGATTCCGAGAAGAATGATGCCGAGGTTCAGGCCG 778 240 R--Q--F--F--T--D--I--N--M--D--S--E--K--N--D--A--E--V--Q--A-- 259 781 AGGGAGTTCTGAATTCAAGATTACAGAATTTGACTCATACACTTGACAAGGTAAGATATG 840 779 AGGGAGTTCTGAATTCAAGATTACAGAATTTGACTCATACACTTGACAAGGTAAGATATG 838 260 E--G--V--L--N--S--R--L--Q--N--L--T--H--T--L--D--K--V--R--Y-- 279 841 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