Oryza sativa Japonica Group (IRGSP-1.0)
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This transcript has 1 exon, is annotated with 7 domains and features, is associated with 38 variant alleles and maps to 49 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
P0577B11.136-201Os08t0162400-011953455aa
 
Protein coding
Q0J7U4 Q84SC7 Ensembl Canonical
P0577B11.136-202Os08t0162400-021873455aa
 
Protein coding
Q0J7U4 Q84SC7 -
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     1 ATTCCCATTTCCTAAAAAAAAAATCCCCAAATCTCCACATGATTCCTCCGTAATTCGGCG     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 CGCCCTCTCATGGCGTCCCTCGCCGAATTCCCCCTCCCGGTGATCTCTCCGACTTGCTGG    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 AGCTATCGGTAGCGGGAGGAATCAATCAATCAATCCCCCACGCTGGGTGGTTCTTGAGCA    180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   181 AGAACGGCTCGTCGCCGTGCCGATCGATCACGTCGGCCGCCGGGGAAATCCTCTGGGGAT    240
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   241 TTGTGGGTGGTTTTGGGCTAAAGATTCCGTTTCTTTCGAGCCCTTTTGGTCTCGGGTGGA    300
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   301 TCCGCTTAGCTTTGGTTCTTTTGCTGGTTGGGGGGCATGGCGGCGGAGTCGTCGGCTGCT    360
       ....................................ATGGCGGCGGAGTCGTCGGCTGCT     24
       ....................................-M--A--A--E--S--S--A--A-      8

                                                                          
   361 GCTGCTGCGGGCGGGGGCGAGAGGAGGGGCCCGATGGATCTGAACCTGTATCTCGGCCTC    420
    25 GCTGCTGCGGGCGGGGGCGAGAGGAGGGGCCCGATGGATCTGAACCTGTATCTCGGCCTC     84
     9 -A--A--A--G--G--G--E--R--R--G--P--M--D--L--N--L--Y--L--G--L-     28

                                                                          
   421 CCTCCGCTGCCGCCGCCTCCGGGAAGGCTGGATGTCGCCGCCGATTACCCGTCGCTGCTG    480
    85 CCTCCGCTGCCGCCGCCTCCGGGAAGGCTGGATGTCGCCGCCGATTACCCGTCGCTGCTG    144
    29 -P--P--L--P--P--P--P--G--R--L--D--V--A--A--D--Y--P--S--L--L-     48

                                                                          
   481 CTGAACTCCGCCGCCACGGTGGCGAACGAGCAAAGGGGCTCGGTGGTGGTGGCGGCACCG    540
   145 CTGAACTCCGCCGCCACGGTGGCGAACGAGCAAAGGGGCTCGGTGGTGGTGGCGGCACCG    204
    49 -L--N--S--A--A--T--V--A--N--E--Q--R--G--S--V--V--V--A--A--P-     68

                                                                          
   541 CCTCCGGCGGCGGCGGCGTACTCGCCGTCGAACGCGCTGTCAGCGCCGGAGCAGGTGCTG    600
   205 CCTCCGGCGGCGGCGGCGTACTCGCCGTCGAACGCGCTGTCAGCGCCGGAGCAGGTGCTG    264
    69 -P--P--A--A--A--A--Y--S--P--S--N--A--L--S--A--P--E--Q--V--L-     88

                                                                          
   601 GTAGATCCTGTTGCAGCGTGGCTTGTTGATCCCGGTGAGCAGCAGCCGGTGCCGCCGCTC    660
   265 GTAGATCCTGTTGCAGCGTGGCTTGTTGATCCCGGTGAGCAGCAGCCGGTGCCGCCGCTC    324
    89 -V--D--P--V--A--A--W--L--V--D--P--G--E--Q--Q--P--V--P--P--L-    108

                                                                          
   661 GAGACGCCATCGTACATGGCCAGGGCCTCGTCGACGCTGCCACAGATTTTTGCTTGTGCA    720
   325 GAGACGCCATCGTACATGGCCAGGGCCTCGTCGACGCTGCCACAGATTTTTGCTTGTGCA    384
   109 -E--T--P--S--Y--M--A--R--A--S--S--T--L--P--Q--I--F--A--C--A-    128

                                                                          
   721 GCGTTGGAAATGCTTGTGCAGACCGGTGGAGCAATCCCACCTACTGGTCTTATAAGGGGA    780
   385 GCGTTGGAAATGCTTGTGCAGACCGGTGGAGCAATCCCACCTACTGGTCTTATAAGGGGA    444
   129 -A--L--E--M--L--V--Q--T--G--G--A--I--P--P--T--G--L--I--R--G-    148

                                                                          
   781 GCAGAGATTGCTGCTGCAAGCCGCCCTATGACGCCGGAGAATCGGCTGCGGAGGTTGATC    840
   445 GCAGAGATTGCTGCTGCAAGCCGCCCTATGACGCCGGAGAATCGGCTGCGGAGGTTGATC    504
   149 -A--E--I--A--A--A--S--R--P--M--T--P--E--N--R--L--R--R--L--I-    168

                                                                          
   841 CAGGTGAGCGATCAACACGGCGTCGGGAATGGGAGGGCGGGGACTGGGCCAGTGAGCCGC    900
   505 CAGGTGAGCGATCAACACGGCGTCGGGAATGGGAGGGCGGGGACTGGGCCAGTGAGCCGC    564
   169 -Q--V--S--D--Q--H--G--V--G--N--G--R--A--G--T--G--P--V--S--R-    188

                                                                          
   901 AGCCGACGGGCGAATAGCCCGGAAGCCGATAATCTGGCGCGGGCCATCCAGAGGTCTCAT    960
   565 AGCCGACGGGCGAATAGCCCGGAAGCCGATAATCTGGCGCGGGCCATCCAGAGGTCTCAT    624
   189 -S--R--R--A--N--S--P--E--A--D--N--L--A--R--A--I--Q--R--S--H-    208

                                                                          
   961 AATTCTCTTGAGGCATCAAGGAGGCAGATGCTTGATGGTGATGGCAGTGATGCCACCAAG   1020
   625 AATTCTCTTGAGGCATCAAGGAGGCAGATGCTTGATGGTGATGGCAGTGATGCCACCAAG    684
   209 -N--S--L--E--A--S--R--R--Q--M--L--D--G--D--G--S--D--A--T--K-    228

                                                                          
  1021 AAGGATGACGGTTGCGGATGCAACGGCAGCTTCGAATGCAATATCTGCTTTGAATCAGCT   1080
   685 AAGGATGACGGTTGCGGATGCAACGGCAGCTTCGAATGCAATATCTGCTTTGAATCAGCT    744
   229 -K--D--D--G--C--G--C--N--G--S--F--E--C--N--I--C--F--E--S--A-    248

                                                                          
  1081 AAAGATCCTGTGGTTACCCCTTGTGGCCACCTCTTCTGCTGGCCTTGCATATACCAGTGG   1140
   745 AAAGATCCTGTGGTTACCCCTTGTGGCCACCTCTTCTGCTGGCCTTGCATATACCAGTGG    804
   249 -K--D--P--V--V--T--P--C--G--H--L--F--C--W--P--C--I--Y--Q--W-    268

                                                                          
  1141 CTTCATGGACATTCAGAGCACTCTGATTGCCCTGTCTGCAAGGGCGAGGTGCTCGAAGTA   1200
   805 CTTCATGGACATTCAGAGCACTCTGATTGCCCTGTCTGCAAGGGCGAGGTGCTCGAAGTA    864
   269 -L--H--G--H--S--E--H--S--D--C--P--V--C--K--G--E--V--L--E--V-    288

                                                                          
  1201 AACGTCACACCGATTTATGGAAGAGGAGGTGGCGAGGAGAACTCCTCCAGAAATGATATC   1260
   865 AACGTCACACCGATTTATGGAAGAGGAGGTGGCGAGGAGAACTCCTCCAGAAATGATATC    924
   289 -N--V--T--P--I--Y--G--R--G--G--G--E--E--N--S--S--R--N--D--I-    308

                                                                          
  1261 CAAATCCCTCCCAGGCCGAGTGCGCAGAGGACCGAGAGCTTGAGGCAGCAGCTGCAAAGG   1320
   925 CAAATCCCTCCCAGGCCGAGTGCGCAGAGGACCGAGAGCTTGAGGCAGCAGCTGCAAAGG    984
   309 -Q--I--P--P--R--P--S--A--Q--R--T--E--S--L--R--Q--Q--L--Q--R-    328

                                                                          
  1321 CCAGACACAAGAGGAGGCATTGCAAACATGGTGAGGCGGTTGATGCAAAACCAAGATATA   1380
   985 CCAGACACAAGAGGAGGCATTGCAAACATGGTGAGGCGGTTGATGCAAAACCAAGATATA   1044
   329 -P--D--T--R--G--G--I--A--N--M--V--R--R--L--M--Q--N--Q--D--I-    348

                                                                          
  1381 GTGGTAGGCCAGGCGGCTTCATCTGCACCCCGGCCAAGGGGTAGGGGTCGAAGGCAGGCA   1440
  1045 GTGGTAGGCCAGGCGGCTTCATCTGCACCCCGGCCAAGGGGTAGGGGTCGAAGGCAGGCA   1104
   349 -V--V--G--Q--A--A--S--S--A--P--R--P--R--G--R--G--R--R--Q--A-    368

                                                                          
  1441 AGACAAGATGCGCCTTCTGCACCAGCAACACAGCAGCAGGTGGTCAATGCTGATGCTGGG   1500
  1105 AGACAAGATGCGCCTTCTGCACCAGCAACACAGCAGCAGGTGGTCAATGCTGATGCTGGG   1164
   369 -R--Q--D--A--P--S--A--P--A--T--Q--Q--Q--V--V--N--A--D--A--G-    388

                                                                          
  1501 AGTGGCAATCAGGCTCCTTTGCCACCTCCTGATGCTAATGGTGCTGCACCGGCTGCTGCT   1560
  1165 AGTGGCAATCAGGCTCCTTTGCCACCTCCTGATGCTAATGGTGCTGCACCGGCTGCTGCT   1224
   389 -S--G--N--Q--A--P--L--P--P--P--D--A--N--G--A--A--P--A--A--A-    408

                                                                          
  1561 GTCGCTCCCCAACAGTCATCATCTGTGGAGCAAGCGTCGACTTCTAGCACCGTGGGTGTT   1620
  1225 GTCGCTCCCCAACAGTCATCATCTGTGGAGCAAGCGTCGACTTCTAGCACCGTGGGTGTT   1284
   409 -V--A--P--Q--Q--S--S--S--V--E--Q--A--S--T--S--S--T--V--G--V-    428

                                                                          
  1621 ATAGCGGGAGGGCCAGCACAAGGTAGGAGGTCAAGAGTTTCTGAATCCACCCCTGCAAGG   1680
  1285 ATAGCGGGAGGGCCAGCACAAGGTAGGAGGTCAAGAGTTTCTGAATCCACCCCTGCAAGG   1344
   429 -I--A--G--G--P--A--Q--G--R--R--S--R--V--S--E--S--T--P--A--R-    448

                                                                          
  1681 AGGACAAGGAGGAGGCATCAGTAGGTAACTTAGAGTTGTTACTGTAATAGAACATATACA   1740
  1345 AGGACAAGGAGGAGGCATCAGTAG....................................   1368
   449 -R--T--R--R--R--H--Q--*-....................................    455

                                                                          
  1741 CCATGTTTCCTTGTAACCTTGATCATATTTAGGCTCATCCCAAAATTATGTAGAATTGTG   1800
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1801 GATGAAATCTTTTCTTTTATTTACCTTGTATCCACCATTTTACCTTAGGCAAAGGAATAA   1860
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1861 AGATTTCGATTTC                                                  1873
       .............                                                      
       .............