Transcript: Os08t0162400-02 P0577B11.136-202
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P0577B11.136-201 Os08t0162400-01 1953 455aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
Q0J7U4 Q84SC7 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, P0577B11.136-202 Os08t0162400-02 1873 455aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
Q0J7U4 Q84SC7 -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATTCCCATTTCCTAAAAAAAAAATCCCCAAATCTCCACATGATTCCTCCGTAATTCGGCG 60
............................................................
............................................................
61 CGCCCTCTCATGGCGTCCCTCGCCGAATTCCCCCTCCCGGTGATCTCTCCGACTTGCTGG 120
............................................................
............................................................
121 AGCTATCGGTAGCGGGAGGAATCAATCAATCAATCCCCCACGCTGGGTGGTTCTTGAGCA 180
............................................................
............................................................
181 AGAACGGCTCGTCGCCGTGCCGATCGATCACGTCGGCCGCCGGGGAAATCCTCTGGGGAT 240
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............................................................
241 TTGTGGGTGGTTTTGGGCTAAAGATTCCGTTTCTTTCGAGCCCTTTTGGTCTCGGGTGGA 300
............................................................
............................................................
301 TCCGCTTAGCTTTGGTTCTTTTGCTGGTTGGGGGGC ATG GCG GCG GAG TCG TCG GCT GCT 360
....................................ATGGCGGCGGAGTCGTCGGCTGCT 24
....................................-M--A--A--E--S--S--A--A- 8
361 GCT GCT GCG GGC GGG GGC GAG AGG AGG GGC CCG ATG GAT CTG AAC CTG TAT CTC GGC CTC 420
25 GCTGCTGCGGGCGGGGGCGAGAGGAGGGGCCCGATGGATCTGAACCTGTATCTCGGCCTC 84
9 -A--A--A--G--G--G--E--R--R--G--P--M--D--L--N--L--Y--L--G--L- 28
421 CCT CCG CTG CCG CCG CCT CCG GGA AGG CTG GAT GTC GCC GCC GAT TAC CCG TCG CTG CTG 480
85 CCTCCGCTGCCGCCGCCTCCGGGAAGGCTGGATGTCGCCGCCGATTACCCGTCGCTGCTG 144
29 -P--P--L--P--P--P--P--G--R--L--D--V--A--A--D--Y--P--S--L--L- 48
481 CTG AAC TCC GCC GCC ACG GTG GCG AAC GAG CAA AGG GGC TCG GTG GTG GTG GCG GCA CCG 540
145 CTGAACTCCGCCGCCACGGTGGCGAACGAGCAAAGGGGCTCGGTGGTGGTGGCGGCACCG 204
49 -L--N--S--A--A--T--V--A--N--E--Q--R--G--S--V--V--V--A--A--P- 68
541 CCT CCG GCG GCG GCG GCG TAC TCG CCG TCG AAC GCG CTG TCA GCG CCG GAG CAG GTG CTG 600
205 CCTCCGGCGGCGGCGGCGTACTCGCCGTCGAACGCGCTGTCAGCGCCGGAGCAGGTGCTG 264
69 -P--P--A--A--A--A--Y--S--P--S--N--A--L--S--A--P--E--Q--V--L- 88
601 GTA GAT CCT GTT GCA GCG TGG CTT GTT GAT CCC GGT GAG CAG CAG CCG GTG CCG CCG CTC 660
265 GTAGATCCTGTTGCAGCGTGGCTTGTTGATCCCGGTGAGCAGCAGCCGGTGCCGCCGCTC 324
89 -V--D--P--V--A--A--W--L--V--D--P--G--E--Q--Q--P--V--P--P--L- 108
661 GAG ACG CCA TCG TAC ATG GCC AGG GCC TCG TCG ACG CTG CCA CAG ATT TTT GCT TGT GCA 720
325 GAGACGCCATCGTACATGGCCAGGGCCTCGTCGACGCTGCCACAGATTTTTGCTTGTGCA 384
109 -E--T--P--S--Y--M--A--R--A--S--S--T--L--P--Q--I--F--A--C--A- 128
721 GCG TTG GAA ATG CTT GTG CAG ACC GGT GGA GCA ATC CCA CCT ACT GGT CTT ATA AGG GGA 780
385 GCGTTGGAAATGCTTGTGCAGACCGGTGGAGCAATCCCACCTACTGGTCTTATAAGGGGA 444
129 -A--L--E--M--L--V--Q--T--G--G--A--I--P--P--T--G--L--I--R--G- 148
781 GCA GAG ATT GCT GCT GCA AGC CGC CCT ATG ACG CCG GAG AAT CGG CTG CGG AGG TTG ATC 840
445 GCAGAGATTGCTGCTGCAAGCCGCCCTATGACGCCGGAGAATCGGCTGCGGAGGTTGATC 504
149 -A--E--I--A--A--A--S--R--P--M--T--P--E--N--R--L--R--R--L--I- 168
841 CAG GTG AGC GAT CAA CAC GGC GTC GGG AAT GGG AGG GCG GGG ACT GGG CCA GTG AGC CGC 900
505 CAGGTGAGCGATCAACACGGCGTCGGGAATGGGAGGGCGGGGACTGGGCCAGTGAGCCGC 564
169 -Q--V--S--D--Q--H--G--V--G--N--G--R--A--G--T--G--P--V--S--R- 188
901 AGC CGA CGG GCG AAT AGC CCG GAA GCC GAT AAT CTG GCG CGG GCC ATC CAG AGG TCT CAT 960
565 AGCCGACGGGCGAATAGCCCGGAAGCCGATAATCTGGCGCGGGCCATCCAGAGGTCTCAT 624
189 -S--R--R--A--N--S--P--E--A--D--N--L--A--R--A--I--Q--R--S--H- 208
961 AAT TCT CTT GAG GCA TCA AGG AGG CAG ATG CTT GAT GGT GAT GGC AGT GAT GCC ACC AAG 1020
625 AATTCTCTTGAGGCATCAAGGAGGCAGATGCTTGATGGTGATGGCAGTGATGCCACCAAG 684
209 -N--S--L--E--A--S--R--R--Q--M--L--D--G--D--G--S--D--A--T--K- 228
1021 AAG GAT GAC GGT TGC GGA TGC AAC GGC AGC TTC GAA TGC AAT ATC TGC TTT GAA TCA GCT 1080
685 AAGGATGACGGTTGCGGATGCAACGGCAGCTTCGAATGCAATATCTGCTTTGAATCAGCT 744
229 -K--D--D--G--C--G--C--N--G--S--F--E--C--N--I--C--F--E--S--A- 248
1081 AAA GAT CCT GTG GTT ACC CCT TGT GGC CAC CTC TTC TGC TGG CCT TGC ATA TAC CAG TGG 1140
745 AAAGATCCTGTGGTTACCCCTTGTGGCCACCTCTTCTGCTGGCCTTGCATATACCAGTGG 804
249 -K--D--P--V--V--T--P--C--G--H--L--F--C--W--P--C--I--Y--Q--W- 268
1141 CTT CAT GGA CAT TCA GAG CAC TCT GAT TGC CCT GTC TGC AAG GGC GAG GTG CTC GAA GTA 1200
805 CTTCATGGACATTCAGAGCACTCTGATTGCCCTGTCTGCAAGGGCGAGGTGCTCGAAGTA 864
269 -L--H--G--H--S--E--H--S--D--C--P--V--C--K--G--E--V--L--E--V- 288
1201 AAC GTC ACA CCG ATT TAT GGA AGA GGA GGT GGC GAG GAG AAC TCC TCC AGA AAT GAT ATC 1260
865 AACGTCACACCGATTTATGGAAGAGGAGGTGGCGAGGAGAACTCCTCCAGAAATGATATC 924
289 -N--V--T--P--I--Y--G--R--G--G--G--E--E--N--S--S--R--N--D--I- 308
1261 CAA ATC CCT CCC AGG CCG AGT GCG CAG AGG ACC GAG AGC TTG AGG CAG CAG CTG CAA AGG 1320
925 CAAATCCCTCCCAGGCCGAGTGCGCAGAGGACCGAGAGCTTGAGGCAGCAGCTGCAAAGG 984
309 -Q--I--P--P--R--P--S--A--Q--R--T--E--S--L--R--Q--Q--L--Q--R- 328
1321 CCA GAC ACA AGA GGA GGC ATT GCA AAC ATG GTG AGG CGG TTG ATG CAA AAC CAA GAT ATA 1380
985 CCAGACACAAGAGGAGGCATTGCAAACATGGTGAGGCGGTTGATGCAAAACCAAGATATA 1044
329 -P--D--T--R--G--G--I--A--N--M--V--R--R--L--M--Q--N--Q--D--I- 348
1381 GTG GTA GGC CAG GCG GCT TCA TCT GCA CCC CGG CCA AGG GGT AGG GGT CGA AGG CAG GCA 1440
1045 GTGGTAGGCCAGGCGGCTTCATCTGCACCCCGGCCAAGGGGTAGGGGTCGAAGGCAGGCA 1104
349 -V--V--G--Q--A--A--S--S--A--P--R--P--R--G--R--G--R--R--Q--A- 368
1441 AGA CAA GAT GCG CCT TCT GCA CCA GCA ACA CAG CAG CAG GTG GTC AAT GCT GAT GCT GGG 1500
1105 AGACAAGATGCGCCTTCTGCACCAGCAACACAGCAGCAGGTGGTCAATGCTGATGCTGGG 1164
369 -R--Q--D--A--P--S--A--P--A--T--Q--Q--Q--V--V--N--A--D--A--G- 388
1501 AGT GGC AAT CAG GCT CCT TTG CCA CCT CCT GAT GCT AAT GGT GCT GCA CCG GCT GCT GCT 1560
1165 AGTGGCAATCAGGCTCCTTTGCCACCTCCTGATGCTAATGGTGCTGCACCGGCTGCTGCT 1224
389 -S--G--N--Q--A--P--L--P--P--P--D--A--N--G--A--A--P--A--A--A- 408
1561 GTC GCT CCC CAA CAG TCA TCA TCT GTG GAG CAA GCG TCG ACT TCT AGC ACC GTG GGT GTT 1620
1225 GTCGCTCCCCAACAGTCATCATCTGTGGAGCAAGCGTCGACTTCTAGCACCGTGGGTGTT 1284
409 -V--A--P--Q--Q--S--S--S--V--E--Q--A--S--T--S--S--T--V--G--V- 428
1621 ATA GCG GGA GGG CCA GCA CAA GGT AGG AGG TCA AGA GTT TCT GAA TCC ACC CCT GCA AGG 1680
1285 ATAGCGGGAGGGCCAGCACAAGGTAGGAGGTCAAGAGTTTCTGAATCCACCCCTGCAAGG 1344
429 -I--A--G--G--P--A--Q--G--R--R--S--R--V--S--E--S--T--P--A--R- 448
1681 AGG ACA AGG AGG AGG CAT CAG TAG GTAACTTAGAGTTGTTACTGTAATAGAACATATACA 1740
1345 AGGACAAGGAGGAGGCATCAGTAG.................................... 1368
449 -R--T--R--R--R--H--Q--*-.................................... 455
1741 CCATGTTTCCTTGTAACCTTGATCATATTTAGGCTCATCCCAAAATTATGTAGAATTGTG 1800
............................................................
............................................................
1801 GATGAAATCTTTTCTTTTATTTACCTTGTATCCACCATTTTACCTTAGGCAAAGGAATAA 1860
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1861 AGATTTCGATTTC 1873
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