Oryza sativa Japonica Group (IRGSP-1.0) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID History.
Chromosome 7: 25,958,866-25,963,652 reverse strand.
This transcript has 9 exons, is annotated with 16 domains and features and is associated with 308 variant alleles.
This transcript is a product of gene Os07g0626600 Show transcript tableHide transcript table
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1 GACGACGAGATGGGCTCGATGGAGGCGTCCACCGCGCCGGAGAACGGCACCGCCGCCGCC 60 .........ATGGGCTCGATGGAGGCGTCCACCGCGCCGGAGAACGGCACCGCCGCCGCC 51 .........-M--G--S--M--E--A--S--T--A--P--E--N--G--T--A--A--A- 17 61 GCGGCGGCCGCGGCCTCGACGGCGTGCAACGGCGCGGGCGGCGGCGGCGGCGCCGCCGCC 120 52 GCGGCGGCCGCGGCCTCGACGGCGTGCAACGGCGCGGGCGGCGGCGGCGGCGCCGCCGCC 111 18 -A--A--A--A--A--S--T--A--C--N--G--A--G--G--G--G--G--A--A--A- 37 121 GCCTCGAACGGCGGCGGGGTAGAGAGGAGGCTGAGGTCCTCCGCCGCGTCCGCGTCGTGG 180 112 GCCTCGAACGGCGGCGGGGTAGAGAGGAGGCTGAGGTCCTCCGCCGCGTCCGCGTCGTGG 171 38 -A--S--N--G--G--G--V--E--R--R--L--R--S--S--A--A--S--A--S--W- 57 181 GCGTCGCATCTGCCGCTGGAGGTGGGCACGCGCGTGATGTGCCGGTGGCGCGACCAGAAG 240 172 GCGTCGCATCTGCCGCTGGAGGTGGGCACGCGCGTGATGTGCCGGTGGCGCGACCAGAAG 231 58 -A--S--H--L--P--L--E--V--G--T--R--V--M--C--R--W--R--D--Q--K- 77 241 CTCCATCCCGTCAAGGTCATCGAGCGCCGGAAGTCCTCCACCTCCTCCTCCCCCGCCGAT 300 232 CTCCATCCCGTCAAGGTCATCGAGCGCCGGAAGTCCTCCACCTCCTCCTCCCCCGCCGAT 291 78 -L--H--P--V--K--V--I--E--R--R--K--S--S--T--S--S--S--P--A--D- 97 301 TACGAGTACTACGTCCACTACACCGAGTTCAATAGGAGGCTCGATGAGTGGGTTAAACTT 360 292 TACGAGTACTACGTCCACTACACCGAGTTCAATAGGAGGCTCGATGAGTGGGTTAAACTT 351 98 -Y--E--Y--Y--V--H--Y--T--E--F--N--R--R--L--D--E--W--V--K--L- 117 361 GAACAACTTGATCTTGAGACTGTTGAGACCGATGTTGATGAGAAGGTAGAAGATAAGGCA 420 352 GAACAACTTGATCTTGAGACTGTTGAGACCGATGTTGATGAGAAGGTAGAAGATAAGGCA 411 118 -E--Q--L--D--L--E--T--V--E--T--D--V--D--E--K--V--E--D--K--A- 137 421 ACAAGCTTGAAGATGACACGGCACCAGAAGCGTAAAATTGATGAAACCCATGTGGAGCAA 480 412 ACAAGCTTGAAGATGACACGGCACCAGAAGCGTAAAATTGATGAAACCCATGTGGAGCAA 471 138 -T--S--L--K--M--T--R--H--Q--K--R--K--I--D--E--T--H--V--E--Q- 157 481 GGTCATGAGGAGCTTGATGCTGCTAGTTTGCGGGAACATGAAGAGTTCACAAAGGTGAAA 540 472 GGTCATGAGGAGCTTGATGCTGCTAGTTTGCGGGAACATGAAGAGTTCACAAAGGTGAAA 531 158 -G--H--E--E--L--D--A--A--S--L--R--E--H--E--E--F--T--K--V--K- 177 541 AATATAGCGAAGATAGAACTTGGGAGATATGAGATAGATACATGGTATTTCTCTCCTTTC 600 532 AATATAGCGAAGATAGAACTTGGGAGATATGAGATAGATACATGGTATTTCTCTCCTTTC 591 178 -N--I--A--K--I--E--L--G--R--Y--E--I--D--T--W--Y--F--S--P--F- 197 601 CCACCGGAGTATAATGACTCTCCAAAGCTGTTCTTCTGTGAGTTTTGCCTCAACTTCATG 660 592 CCACCGGAGTATAATGACTCTCCAAAGCTGTTCTTCTGTGAGTTTTGCCTCAACTTCATG 651 198 -P--P--E--Y--N--D--S--P--K--L--F--F--C--E--F--C--L--N--F--M- 217 661 AAGCGCAAGGAACAGCTTCAGAGGCACATGAAAAAATGTGATCTTAAACATCCCCCTGGT 720 652 AAGCGCAAGGAACAGCTTCAGAGGCACATGAAAAAATGTGATCTTAAACATCCCCCTGGT 711 218 -K--R--K--E--Q--L--Q--R--H--M--K--K--C--D--L--K--H--P--P--G- 237 721 GATGAAATATACAGAAGTGGAACCCTGTCTATGTTTGAGGTTGATGGCAAGAAGAACAAA 780 712 GATGAAATATACAGAAGTGGAACCCTGTCTATGTTTGAGGTTGATGGCAAGAAGAACAAA 771 238 -D--E--I--Y--R--S--G--T--L--S--M--F--E--V--D--G--K--K--N--K- 257 781 GTTTATGGGCAGAACCTTTGTTATCTTGCCAAACTATTTCTTGATCACAAGACACTTTAT 840 772 GTTTATGGGCAGAACCTTTGTTATCTTGCCAAACTATTTCTTGATCACAAGACACTTTAT 831 258 -V--Y--G--Q--N--L--C--Y--L--A--K--L--F--L--D--H--K--T--L--Y- 277 841 TACGATGTTGATTTGTTTTTGTTCTACGTCCTGTGTGAATGTGATGATCGGGGGTGTCAT 900 832 TACGATGTTGATTTGTTTTTGTTCTACGTCCTGTGTGAATGTGATGATCGGGGGTGTCAT 891 278 -Y--D--V--D--L--F--L--F--Y--V--L--C--E--C--D--D--R--G--C--H- 297 901 ATGGTGGGGTATTTCTCCAAGGAGAAACACTCTGAGGAATCTTACAATTTGGCTTGCATC 960 892 ATGGTGGGGTATTTCTCCAAGGAGAAACACTCTGAGGAATCTTACAATTTGGCTTGCATC 951 298 -M--V--G--Y--F--S--K--E--K--H--S--E--E--S--Y--N--L--A--C--I- 317 961 CTCACTCTCCCTCCATATCAAAGAAAAGGATATGGGAAGTTCCTGATTGCCTTCTCCTAT 1020 952 CTCACTCTCCCTCCATATCAAAGAAAAGGATATGGGAAGTTCCTGATTGCCTTCTCCTAT 1011 318 -L--T--L--P--P--Y--Q--R--K--G--Y--G--K--F--L--I--A--F--S--Y- 337 1021 GAGCTTTCTAAGAAGGAAGGTAAAGTAGGGACACCGGAGCGCCCTCTTTCTGATCTTGGT 1080 1012 GAGCTTTCTAAGAAGGAAGGTAAAGTAGGGACACCGGAGCGCCCTCTTTCTGATCTTGGT 1071 338 -E--L--S--K--K--E--G--K--V--G--T--P--E--R--P--L--S--D--L--G- 357 1081 CTGCTCAGTTATAGAGGTTATTGGACTAGAGTGCTTCTAGAGATTTTAAAGAAACATAAG 1140 1072 CTGCTCAGTTATAGAGGTTATTGGACTAGAGTGCTTCTAGAGATTTTAAAGAAACATAAG 1131 358 -L--L--S--Y--R--G--Y--W--T--R--V--L--L--E--I--L--K--K--H--K- 377 1141 AGCAACATATCCATTAAGGAGCTTAGCGATATGACGGCAATAAAAGCGGACGACATCTTG 1200 1132 AGCAACATATCCATTAAGGAGCTTAGCGATATGACGGCAATAAAAGCGGACGACATCTTG 1191 378 -S--N--I--S--I--K--E--L--S--D--M--T--A--I--K--A--D--D--I--L- 397 1201 AGCACGCTTCAGAGTCTGGACCTGATCCAGTACCGGAAAGGTCAGCACGTCATCTGCGCT 1260 1192 AGCACGCTTCAGAGTCTGGACCTGATCCAGTACCGGAAAGGTCAGCACGTCATCTGCGCT 1251 398 -S--T--L--Q--S--L--D--L--I--Q--Y--R--K--G--Q--H--V--I--C--A- 417 1261 GACCCCAAGGTTCTCGACCGCCACCTCAAGGCCGCCGGCCGGGGTGGCCTCGAGGTCGAC 1320 1252 GACCCCAAGGTTCTCGACCGCCACCTCAAGGCCGCCGGCCGGGGTGGCCTCGAGGTCGAC 1311 418 -D--P--K--V--L--D--R--H--L--K--A--A--G--R--G--G--L--E--V--D- 437 1321 GTTAGCAAGCTGATCTGGACACCCTACAAGGAACAAGGCTAAGCTAAGCTCTCGTGCAAA 1380 1312 GTTAGCAAGCTGATCTGGACACCCTACAAGGAACAAGGCTAA.................. 1353 438 -V--S--K--L--I--W--T--P--Y--K--E--Q--G--*-.................. 450 1381 ACGAATTAGATAAAAAGAAAATCTGACCAGCTCAATCCTGTACATTTCCCACTTAGGATC 1440 ............................................................ ............................................................ 1441 TCCCCCTCTCTTTCTCCCTCACTTGTGTACCGTAACTGTAGTGTTGTAAACATCGACATT 1500 ............................................................ ............................................................ 1501 GTTATTTGTGTTGCAGTAATCCATGAAAGAAACAATAGCTCTCGCTTCCCT 1551 ................................................... ...................................................
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