Oryza sativa Japonica Group (IRGSP-1.0) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationExternal ReferencesSupporting evidenceID History.
Chromosome 5: 16,267,483-16,273,940 reverse strand.
This transcript has 13 exons, is annotated with 14 domains and features, is associated with 287 variant alleles and maps to 63 oligo probes.
This transcript is a product of gene Os05g0345500 Show transcript tableHide transcript table
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1 AGTCTGCCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGATCCCCATCCATCCTGCGAGGCGCGAGCGAGC 60 ............................................................ ............................................................ 61 AGGGCGCCGTCGTTCGTCATGCTGCTTCCGCCGCATCCTGCTGAAATCTGTTTACGATGA 120 ........................................................ATGA 4 ........................................................-M-- 1 121 AAGTGGAGGAGAAAAAAAGATCTATAACAGTTGCCCCCTTCGAGTGTGCTTGGGATGAGG 180 5 AAGTGGAGGAGAAAAAAAGATCTATAACAGTTGCCCCCTTCGAGTGTGCTTGGGATGAGG 64 2 K--V--E--E--K--K--R--S--I--T--V--A--P--F--E--C--A--W--D--E-- 21 181 AGTTTCGGTTCAGGGAGACTGGTCGCGGGTGCATCACCTTTGAGGCATCTGCACACAATG 240 65 AGTTTCGGTTCAGGGAGACTGGTCGCGGGTGCATCACCTTTGAGGCATCTGCACACAATG 124 22 E--F--R--F--R--E--T--G--R--G--C--I--T--F--E--A--S--A--H--N-- 41 241 ATGTTACCCTGGTGTTCCGCGAACAACCTGGGAGCCAGCATTATCACTACAAAATGGATA 300 125 ATGTTACCCTGGTGTTCCGCGAACAACCTGGGAGCCAGCATTATCACTACAAAATGGATA 184 42 D--V--T--L--V--F--R--E--Q--P--G--S--Q--H--Y--H--Y--K--M--D-- 61 301 ACAGTCGTCACTACATTGTGATCTTGGGCAGCCATAGGAACAAAAGATTGAAAATTGAAG 360 185 ACAGTCGTCACTACATTGTGATCTTGGGCAGCCATAGGAACAAAAGATTGAAAATTGAAG 244 62 N--S--R--H--Y--I--V--I--L--G--S--H--R--N--K--R--L--K--I--E-- 81 361 TAGATGGAAAGACTGTTGTTGATGTTGCTGGCATTGGCCTATGTTGCTCCTCGTCTTTTC 420 245 TAGATGGAAAGACTGTTGTTGATGTTGCTGGCATTGGCCTATGTTGCTCCTCGTCTTTTC 304 82 V--D--G--K--T--V--V--D--V--A--G--I--G--L--C--C--S--S--S--F-- 101 421 AGAGCTACTGGATCAGCATCTATGATGGACTGATAAGCATCGGGCAAGGAAGACATCCAA 480 305 AGAGCTACTGGATCAGCATCTATGATGGACTGATAAGCATCGGGCAAGGAAGACATCCAA 364 102 Q--S--Y--W--I--S--I--Y--D--G--L--I--S--I--G--Q--G--R--H--P-- 121 481 ATAACAACATCCTGTTCCAATGGCTTGACCCTGATCCCAACCGAAATGTTCAGTATGTGG 540 365 ATAACAACATCCTGTTCCAATGGCTTGACCCTGATCCCAACCGAAATGTTCAGTATGTGG 424 122 N--N--N--I--L--F--Q--W--L--D--P--D--P--N--R--N--V--Q--Y--V-- 141 541 GACTATCCAGCTGGGACAAGCATGTTGGATACAGAAATATAAGTCTTATGCCATCAGCTC 600 425 GACTATCCAGCTGGGACAAGCATGTTGGATACAGAAATATAAGTCTTATGCCATCAGCTC 484 142 G--L--S--S--W--D--K--H--V--G--Y--R--N--I--S--L--M--P--S--A-- 161 601 CTCAAAACAGCATCCTTTGGAGCCAAATTGAGTGTGCATATGTTGAGCCGGATGGTGCTG 660 485 CTCAAAACAGCATCCTTTGGAGCCAAATTGAGTGTGCATATGTTGAGCCGGATGGTGCTG 544 162 P--Q--N--S--I--L--W--S--Q--I--E--C--A--Y--V--E--P--D--G--A-- 181 661 GAGGGCATACAAGAAAACAAGAATCAAAAGATGGCTTAGACCAAAGGGCACTTGCAAACT 720 545 GAGGGCATACAAGAAAACAAGAATCAAAAGATGGCTTAGACCAAAGGGCACTTGCAAACT 604 182 G--G--H--T--R--K--Q--E--S--K--D--G--L--D--Q--R--A--L--A--N-- 201 721 TTCTAGAGAACTGGGATTTCTCAGATTCTATATTTGTGGTTGGCAGCGAAAGAAAGGTTG 780 605 TTCTAGAGAACTGGGATTTCTCAGATTCTATATTTGTGGTTGGCAGCGAAAGAAAGGTTG 664 202 F--L--E--N--W--D--F--S--D--S--I--F--V--V--G--S--E--R--K--V-- 221 781 TCCCAGCTCACAAAGTTGTCTTGGGTTCTTGTGGTGATTTCCCTTTTAACCTGATGATGA 840 665 TCCCAGCTCACAAAGTTGTCTTGGGTTCTTGTGGTGATTTCCCTTTTAACCTGATGATGA 724 222 V--P--A--H--K--V--V--L--G--S--C--G--D--F--P--F--N--L--M--M-- 241 841 GTCGACCAGCTATTGAGCTTCCATCTGTCTCCTACCCAGTTCTGCACTCCCTTCTTGAGT 900 725 GTCGACCAGCTATTGAGCTTCCATCTGTCTCCTACCCAGTTCTGCACTCCCTTCTTGAGT 784 242 S--R--P--A--I--E--L--P--S--V--S--Y--P--V--L--H--S--L--L--E-- 261 901 ACATCTACACAGGTTCTACGCAGATTTCGGAATGGCAACTGGTTTCACTGCTGGAGTTGA 960 785 ACATCTACACAGGTTCTACGCAGATTTCGGAATGGCAACTGGTTTCACTGCTGGAGTTGA 844 262 Y--I--Y--T--G--S--T--Q--I--S--E--W--Q--L--V--S--L--L--E--L-- 281 961 GTTCACAATTTAAAGTTAAACCATTGGTAATGTATTGTGAAGAAATTATTGGCTGTTTGA 1020 845 GTTCACAATTTAAAGTTAAACCATTGGTAATGTATTGTGAAGAAATTATTGGCTGTTTGA 904 282 S--S--Q--F--K--V--K--P--L--V--M--Y--C--E--E--I--I--G--C--L-- 301 1021 AGATGAGTGATGCAGTTTCTGAGTCTAGCAAAAAAATACAGTTATCAAGTGGTGGTTCTC 1080 905 AGATGAGTGATGCAGTTTCTGAGTCTAGCAAAAAAATACAGTTATCAAGTGGTGGTTCTC 964 302 K--M--S--D--A--V--S--E--S--S--K--K--I--Q--L--S--S--G--G--S-- 321 1081 AAGCTCATCAATTTTATTATTTCCCTTTCAAAGCTCCATTAAATACACAGAAAATTGAAC 1140 965 AAGCTCATCAATTTTATTATTTCCCTTTCAAAGCTCCATTAAATACACAGAAAATTGAAC 1024 322 Q--A--H--Q--F--Y--Y--F--P--F--K--A--P--L--N--T--Q--K--I--E-- 341 1141 AGTTCCTTGTAAATGGTGAGCACAGTGATGTAAATATCTATGTAAATGGACATGGTCTTG 1200 1025 AGTTCCTTGTAAATGGTGAGCACAGTGATGTAAATATCTATGTAAATGGACATGGTCTTG 1084 342 Q--F--L--V--N--G--E--H--S--D--V--N--I--Y--V--N--G--H--G--L-- 361 1201 TTACTCATGCTCACAAACTCATCCTTAGCTTGTGGAGCATGACATTTGACAAGATGTTCA 1260 1085 TTACTCATGCTCACAAACTCATCCTTAGCTTGTGGAGCATGACATTTGACAAGATGTTCA 1144 362 V--T--H--A--H--K--L--I--L--S--L--W--S--M--T--F--D--K--M--F-- 381 1261 CAAATGGAATGAAAGAAAGCAGTGCTTCAAATGTATTTTTCGAAGATGTTCCCGTCGAAG 1320 1145 CAAATGGAATGAAAGAAAGCAGTGCTTCAAATGTATTTTTCGAAGATGTTCCCGTCGAAG 1204 382 T--N--G--M--K--E--S--S--A--S--N--V--F--F--E--D--V--P--V--E-- 401 1321 CATTCTTTCTCCTCATCCAATTTATGTACAGTGGGGAACTTAAGGTGGATATCGAGGAAA 1380 1205 CATTCTTTCTCCTCATCCAATTTATGTACAGTGGGGAACTTAAGGTGGATATCGAGGAAA 1264 402 A--F--F--L--L--I--Q--F--M--Y--S--G--E--L--K--V--D--I--E--E-- 421 1381 TCACACCAGTGTTGGTTGAGCTGCTCCTATTGTCAGACCAGTTTGGGATCACGGCTCTTC 1440 1265 TCACACCAGTGTTGGTTGAGCTGCTCCTATTGTCAGACCAGTTTGGGATCACGGCTCTTC 1324 422 I--T--P--V--L--V--E--L--L--L--L--S--D--Q--F--G--I--T--A--L-- 441 1441 AGTTTGAATGCTGTAAAAGAATTATGGAATTCCTCTCAAAGGACACAGTATGTTCAGTTC 1500 1325 AGTTTGAATGCTGTAAAAGAATTATGGAATTCCTCTCAAAGGACACAGTATGTTCAGTTC 1384 442 Q--F--E--C--C--K--R--I--M--E--F--L--S--K--D--T--V--C--S--V-- 461 1501 TACGAGCAGTTTCGTCAATTCCATCTTGTAAACTGCTTGAAGAAATGTGCAAGAGGAATT 1560 1385 TACGAGCAGTTTCGTCAATTCCATCTTGTAAACTGCTTGAAGAAATGTGCAAGAGGAATT 1444 462 L--R--A--V--S--S--I--P--S--C--K--L--L--E--E--M--C--K--R--N-- 481 1561 TTGCAGAACACTTTGATTATTGCACAACTGCTTGCACAGACTTTGTGTTGTTGGATGAGG 1620 1445 TTGCAGAACACTTTGATTATTGCACAACTGCTTGCACAGACTTTGTGTTGTTGGATGAGG 1504 482 F--A--E--H--F--D--Y--C--T--T--A--C--T--D--F--V--L--L--D--E-- 501 1621 CAACATTTAAGGATATTCTTCAGCATGGGCATATGACTGTAACATCAGAAGAGAGGGTTC 1680 1505 CAACATTTAAGGATATTCTTCAGCATGGGCATATGACTGTAACATCAGAAGAGAGGGTTC 1564 502 A--T--F--K--D--I--L--Q--H--G--H--M--T--V--T--S--E--E--R--V-- 521 1681 TGGATGCCATATTAACATGGTGCATGGAGGCTTGTGACTGTTTTAACTGGACCTCTGTGC 1740 1565 TGGATGCCATATTAACATGGTGCATGGAGGCTTGTGACTGTTTTAACTGGACCTCTGTGC 1624 522 L--D--A--I--L--T--W--C--M--E--A--C--D--C--F--N--W--T--S--V-- 541 1741 ACGAGCTCTTAAGCACTTCAAGACCAGAGAAACTCTTTGGAGGGAGGCTCACTGCCATCA 1800 1625 ACGAGCTCTTAAGCACTTCAAGACCAGAGAAACTCTTTGGAGGGAGGCTCACTGCCATCA 1684 542 H--E--L--L--S--T--S--R--P--E--K--L--F--G--G--R--L--T--A--I-- 561 1801 ATACTTTGCTACCATTTGTGCGGTTCCCTTTAGTGCAACCATCTGTCCTTCACCTGATGG 1860 1685 ATACTTTGCTACCATTTGTGCGGTTCCCTTTAGTGCAACCATCTGTCCTTCACCTGATGG 1744 562 N--T--L--L--P--F--V--R--F--P--L--V--Q--P--S--V--L--H--L--M-- 581 1861 AGAAAAGTAATCTAGCAAAAAACATAGAAGCGTTCAGACAGTTGGTTGCAGAAGCCATTG 1920 1745 AGAAAAGTAATCTAGCAAAAAACATAGAAGCGTTCAGACAGTTGGTTGCAGAAGCCATTG 1804 582 E--K--S--N--L--A--K--N--I--E--A--F--R--Q--L--V--A--E--A--I-- 601 1921 AGTTCTCTAATGCGGGACTACGGATGGCAACAAATACATGTGAGAGATTTCATCATAGAC 1980 1805 AGTTCTCTAATGCGGGACTACGGATGGCAACAAATACATGTGAGAGATTTCATCATAGAC 1864 602 E--F--S--N--A--G--L--R--M--A--T--N--T--C--E--R--F--H--H--R-- 621 1981 GCTCCAGCTATAAAGAGCTTCAGTATATTTCGGATGGTGATAACAATGGTGTTATCTACT 2040 1865 GCTCCAGCTATAAAGAGCTTCAGTATATTTCGGATGGTGATAACAATGGTGTTATCTACT 1924 622 R--S--S--Y--K--E--L--Q--Y--I--S--D--G--D--N--N--G--V--I--Y-- 641 2041 ATGCCGGTACATCATTTGGTAAACACCAATGGATCAACCCTGTTTTAGCCAAGAATATTA 2100 1925 ATGCCGGTACATCATTTGGTAAACACCAATGGATCAACCCTGTTTTAGCCAAGAATATTA 1984 642 Y--A--G--T--S--F--G--K--H--Q--W--I--N--P--V--L--A--K--N--I-- 661 2101 CAGTGACAGCGAGCAGCCCAAATTCCAGGTACACGGATCCAAAGGCTTTGGTTTCAAAAA 2160 1985 CAGTGACAGCGAGCAGCCCAAATTCCAGGTACACGGATCCAAAGGCTTTGGTTTCAAAAA 2044 662 T--V--T--A--S--S--P--N--S--R--Y--T--D--P--K--A--L--V--S--K-- 681 2161 ATTACCAGGCGACTTGTTTTGCTGGGCCTCGTCTTGAAGATGGCAAGATGTGTTCTTGGT 2220 2045 ATTACCAGGCGACTTGTTTTGCTGGGCCTCGTCTTGAAGATGGCAAGATGTGTTCTTGGT 2104 682 N--Y--Q--A--T--C--F--A--G--P--R--L--E--D--G--K--M--C--S--W-- 701 2221 GGATGGTAGACATTGGACCGGATCACCAGCTTATGTGCAACTACTACACGGTGAGGCAGG 2280 2105 GGATGGTAGACATTGGACCGGATCACCAGCTTATGTGCAACTACTACACGGTGAGGCAGG 2164 702 W--M--V--D--I--G--P--D--H--Q--L--M--C--N--Y--Y--T--V--R--Q-- 721 2281 ATGGCTCCGCGACCTTCATGAGGTCGTGGGTTCTTCAGGGATCAATGGACGGCCGTAGCT 2340 2165 ATGGCTCCGCGACCTTCATGAGGTCGTGGGTTCTTCAGGGATCAATGGACGGCCGTAGCT 2224 722 D--G--S--A--T--F--M--R--S--W--V--L--Q--G--S--M--D--G--R--S-- 741 2341 GGACTAGCCTGCATGTCCACGAAGACGACCAGACCATCTGCCAGCCTGGCCAGTTCGCGT 2400 2225 GGACTAGCCTGCATGTCCACGAAGACGACCAGACCATCTGCCAGCCTGGCCAGTTCGCGT 2284 742 W--T--S--L--H--V--H--E--D--D--Q--T--I--C--Q--P--G--Q--F--A-- 761 2401 CGTGGCCGATCACCGGCCAGACGGCGTTGCTGCCGTTTCGGTTCTTCCGGGTCATGCTGA 2460 2285 CGTGGCCGATCACCGGCCAGACGGCGTTGCTGCCGTTTCGGTTCTTCCGGGTCATGCTGA 2344 762 S--W--P--I--T--G--Q--T--A--L--L--P--F--R--F--F--R--V--M--L-- 781 2461 CGGCCCCGGCGACCGGCGTCTCCAACACCTGGAATCTCTGCATCTGCTTCCTCGAGCTCT 2520 2345 CGGCCCCGGCGACCGGCGTCTCCAACACCTGGAATCTCTGCATCTGCTTCCTCGAGCTCT 2404 782 T--A--P--A--T--G--V--S--N--T--W--N--L--C--I--C--F--L--E--L-- 801 2521 ATGGCTACTTCCGGTGATTGGGACAGCTTTGCTGCACACCCCTGAGAAGAGATCGGCAGT 2580 2405 ATGGCTACTTCCGGTGA........................................... 2421 802 Y--G--Y--F--R--*-........................................... 806 2581 GAGCAATGATCTAGCTAGGTGGCTCTGTAATCCGGTGTGTTCATATCTGCACTAGTAAAG 2640 ............................................................ ............................................................ 2641 AACTTTTCGTTTTAGTTTGCTTTGGTCACTTTGGTTTTTTTTTTCTTTGCGGTATAATTA 2700 ............................................................ ............................................................ 2701 CCATAGAAAAAGTGAATAATGCTTATACGTCCTTGTAATACACATGTGTCATCTGTAAGT 2760 ............................................................ ............................................................ 2761 TGGTACAAAACCGTGATTACACGAGGAATGCTTGGACG 2798 ...................................... ......................................
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