Oryza sativa Japonica Group (IRGSP-1.0) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationExternal ReferencesSupporting evidenceID History.
Chromosome 4: 33,394,508-33,397,972 forward strand.
This transcript has 6 exons, is annotated with 12 domains and features, is associated with 181 variant alleles and maps to 53 oligo probes.
This transcript is a product of gene Os04g0654700 Show transcript tableHide transcript table
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1 AAACCCCTCCTCTTCTCTTCCCCTTCCTCCTGCGTTCTAGGGTTTTGCCTCCCAGCGGCG 60 ............................................................ ............................................................ 61 ACTCGGCGAGCGAGACCACCGGCAAGCTCGTCGGCGATGGAGCCCACCTCGTCGGCGGCG 120 ....................................ATGGAGCCCACCTCGTCGGCGGCG 24 ....................................-M--E--P--T--S--S--A--A- 8 121 ATGGCGAGGCAGACGTGGGAGCTGGAGAACAACATCCCGGCGGCGGCCTCCGACCCGGAC 180 25 ATGGCGAGGCAGACGTGGGAGCTGGAGAACAACATCCCGGCGGCGGCCTCCGACCCGGAC 84 9 -M--A--R--Q--T--W--E--L--E--N--N--I--P--A--A--A--S--D--P--D- 28 181 GCCCTGGACGCGATCTACCGCTACGACGAGGCGGCGCAGGCGCGGGTGCAGCAGGAGAAG 240 85 GCCCTGGACGCGATCTACCGCTACGACGAGGCGGCGCAGGCGCGGGTGCAGCAGGAGAAG 144 29 -A--L--D--A--I--Y--R--Y--D--E--A--A--Q--A--R--V--Q--Q--E--K- 48 241 CCCTGGGCGAACGACCCCCACCCCTTCCGCCGCGCCAAGATCTCCGCCCTCGCGCTCCTC 300 145 CCCTGGGCGAACGACCCCCACCCCTTCCGCCGCGCCAAGATCTCCGCCCTCGCGCTCCTC 204 49 -P--W--A--N--D--P--H--P--F--R--R--A--K--I--S--A--L--A--L--L- 68 301 AAGATGGTCGTCCACGCCCGCGCCGGCGGCACTATCGAGGTCATGGGCCTCATGCAGGGC 360 205 AAGATGGTCGTCCACGCCCGCGCCGGCGGCACTATCGAGGTCATGGGCCTCATGCAGGGC 264 69 -K--M--V--V--H--A--R--A--G--G--T--I--E--V--M--G--L--M--Q--G- 88 361 AAGTGCGAGGGCGACGCCATCGTCGTCATGGACGCCTTCGCGCTCCCCGTCGAGGGCACC 420 265 AAGTGCGAGGGCGACGCCATCGTCGTCATGGACGCCTTCGCGCTCCCCGTCGAGGGCACC 324 89 -K--C--E--G--D--A--I--V--V--M--D--A--F--A--L--P--V--E--G--T- 108 421 GAGACCAGGGTCAACGCCCAGGCCGACGCCTACGAGTATATGGTCGAGTACTCCACCATC 480 325 GAGACCAGGGTCAACGCCCAGGCCGACGCCTACGAGTATATGGTCGAGTACTCCACCATC 384 109 -E--T--R--V--N--A--Q--A--D--A--Y--E--Y--M--V--E--Y--S--T--I- 128 481 AACAAGCAGGCTGGAAGGTTGGAGAATGTGGTTGGCTGGTATCACTCACACCCTGGTTAT 540 385 AACAAGCAGGCTGGAAGGTTGGAGAATGTGGTTGGCTGGTATCACTCACACCCTGGTTAT 444 129 -N--K--Q--A--G--R--L--E--N--V--V--G--W--Y--H--S--H--P--G--Y- 148 541 GGATGCTGGTTATCAGGCATTGATGTGTCTACTCAGATGCTTAATCAGCAATTTCAAGAG 600 445 GGATGCTGGTTATCAGGCATTGATGTGTCTACTCAGATGCTTAATCAGCAATTTCAAGAG 504 149 -G--C--W--L--S--G--I--D--V--S--T--Q--M--L--N--Q--Q--F--Q--E- 168 601 CCATTCTTGGCTGTTGTGATAGACCCTACAAGGACTGTTTCTGCTGGTAAAGTGGAAATT 660 505 CCATTCTTGGCTGTTGTGATAGACCCTACAAGGACTGTTTCTGCTGGTAAAGTGGAAATT 564 169 -P--F--L--A--V--V--I--D--P--T--R--T--V--S--A--G--K--V--E--I- 188 661 GGAGCTTTTAGGACATATCCAAAAGATTACAAGCCACCAGATGAACCTGTGTCAGAGTAT 720 565 GGAGCTTTTAGGACATATCCAAAAGATTACAAGCCACCAGATGAACCTGTGTCAGAGTAT 624 189 -G--A--F--R--T--Y--P--K--D--Y--K--P--P--D--E--P--V--S--E--Y- 208 721 CAGACGATACCACTCAACAAGATAGAAGATTTTGGTGTCCACTGCAAACAGTACTATGCT 780 625 CAGACGATACCACTCAACAAGATAGAAGATTTTGGTGTCCACTGCAAACAGTACTATGCT 684 209 -Q--T--I--P--L--N--K--I--E--D--F--G--V--H--C--K--Q--Y--Y--A- 228 781 CTGGATATAACTTATTTCAAATCATCCCTGGATTCTCATCTCCTTGATCTACTTTGGAAT 840 685 CTGGATATAACTTATTTCAAATCATCCCTGGATTCTCATCTCCTTGATCTACTTTGGAAT 744 229 -L--D--I--T--Y--F--K--S--S--L--D--S--H--L--L--D--L--L--W--N- 248 841 AAGTACTGGGTCAATACGTTATCTTCATCACCTCTCCTGGGCAACAGGGATTATGTTGCT 900 745 AAGTACTGGGTCAATACGTTATCTTCATCACCTCTCCTGGGCAACAGGGATTATGTTGCT 804 249 -K--Y--W--V--N--T--L--S--S--S--P--L--L--G--N--R--D--Y--V--A- 268 901 GGCCAGATATTTGATTTAGCTGATAAACTAGAGCAAGCTGAGGGTCAACTGGCACACAGT 960 805 GGCCAGATATTTGATTTAGCTGATAAACTAGAGCAAGCTGAGGGTCAACTGGCACACAGT 864 269 -G--Q--I--F--D--L--A--D--K--L--E--Q--A--E--G--Q--L--A--H--S- 288 961 CGATATGGCATGCTTATGCCATCGCAACGAAAGAAAGAGCAAGAGGAGTCTCCACTGGCT 1020 865 CGATATGGCATGCTTATGCCATCGCAACGAAAGAAAGAGCAAGAGGAGTCTCCACTGGCT 924 289 -R--Y--G--M--L--M--P--S--Q--R--K--K--E--Q--E--E--S--P--L--A- 308 1021 AAGGTAACTCGGGATAGCTCAAAAATTACTGCTGAACAGGTCCATGGTCTCATGTCACAG 1080 925 AAGGTAACTCGGGATAGCTCAAAAATTACTGCTGAACAGGTCCATGGTCTCATGTCACAG 984 309 -K--V--T--R--D--S--S--K--I--T--A--E--Q--V--H--G--L--M--S--Q- 328 1081 GTCATTAAGGATATCCTCTTCAACTCTGTGCACCCGTCAAACAAGGCAAGCACAAGCGCA 1140 985 GTCATTAAGGATATCCTCTTCAACTCTGTGCACCCGTCAAACAAGGCAAGCACAAGCGCA 1044 329 -V--I--K--D--I--L--F--N--S--V--H--P--S--N--K--A--S--T--S--A- 348 1141 CCAGATTCATCCGGGCCTGAGCCTATGGTTGAAGCATGAGTGTTCTACAGAATTCCTTCA 1200 1045 CCAGATTCATCCGGGCCTGAGCCTATGGTTGAAGCATGA..................... 1083 349 -P--D--S--S--G--P--E--P--M--V--E--A--*-..................... 360 1201 TTAGTTAGCCTTTTGTTGATGCTGGATTCACATACACTGGGTGCCTAGTTGTTTCATGAC 1260 ............................................................ ............................................................ 1261 TAAAAGCTGTGTCCAGCATAACTACCCGATTCAAAATGCGTTAGCTGCGTTTTATCGTCA 1320 ............................................................ ............................................................ 1321 AATCATAACTGATATGTAATTATGAGTTGCCTTCTGAATCTTTCGGCTGCCATTGTGAAG 1380 ............................................................ ............................................................ 1381 GTGCGTGGTCTACGTTAAGATAACCAATTACCTTGGCCCAACTTACCATGTTCTCTCAAC 1440 ............................................................ ............................................................ 1441 AATGAATGGTCCCAACGTCGCTAGGCACAGTGTATGTTGATTTGGATGATCTTTCTGGTA 1500 ............................................................ ............................................................ 1501 TTTATCCTCCGATTTTGGTTTCTATATTTCCAGTTC 1536 .................................... ....................................
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