Oryza sativa Japonica Group (IRGSP-1.0) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationExternal ReferencesSupporting evidenceID History.
Chromosome 4: 29,213,355-29,214,344 reverse strand.
This transcript has 1 exon, is annotated with 8 domains and features, is associated with 29 variant alleles and maps to 48 oligo probes.
This transcript is a product of gene Os04g0579200 Show transcript tableHide transcript table
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1 GTGTGAGCGCGGGAGCACCTCTCCCGACGAGCCTTCCCTTCTCCTCCTCGCCTTCGCGTC 60 ............................................................ ............................................................ 61 AGCCCGGCATGGGGTTCCCGGTCTGCTGCTACTCCGAGCTGCTGCTCCCCAAGCAGCTGC 120 ........ATGGGGTTCCCGGTCTGCTGCTACTCCGAGCTGCTGCTCCCCAAGCAGCTGC 52 ........-M--G--F--P--V--C--C--Y--S--E--L--L--L--P--K--Q--L-- 17 121 TCCACCTCCTCCTGCTGCTCGGCTACATCCGCCGCTTCCTCCTCTGGGCGTTCCACGCCG 180 53 TCCACCTCCTCCTGCTGCTCGGCTACATCCGCCGCTTCCTCCTCTGGGCGTTCCACGCCG 112 18 L--H--L--L--L--L--L--G--Y--I--R--R--F--L--L--W--A--F--H--A-- 37 181 TCGGCCTCGGGGACCTGCTGGATCTCGGGGACGAGCAGCAGGCGGTGCTGCAGGACCACG 240 113 TCGGCCTCGGGGACCTGCTGGATCTCGGGGACGAGCAGCAGGCGGTGCTGCAGGACCACG 172 38 V--G--L--G--D--L--L--D--L--G--D--E--Q--Q--A--V--L--Q--D--H-- 57 241 CGCGCGAGCACCGCGCGCCGGCGCAGGCGCTGCCGCCACAGCAGCAGCACCGCCGCGCCG 300 173 CGCGCGAGCACCGCGCGCCGGCGCAGGCGCTGCCGCCACAGCAGCAGCACCGCCGCGCCG 232 58 A--R--E--H--R--A--P--A--Q--A--L--P--P--Q--Q--Q--H--R--R--A-- 77 301 AGTTCCGGACGGTGCCGGCGATGGTCATCGAGGAGGTTCTGCCGGTGGTGCGGTTCGACG 360 233 AGTTCCGGACGGTGCCGGCGATGGTCATCGAGGAGGTTCTGCCGGTGGTGCGGTTCGACG 292 78 E--F--R--T--V--P--A--M--V--I--E--E--V--L--P--V--V--R--F--D-- 97 361 AGCTGGTGGCCGCGGCCCCGGCGGTTTGCGGCGGCGGGGACTGCGCGGTGTGCCTCAGCG 420 293 AGCTGGTGGCCGCGGCCCCGGCGGTTTGCGGCGGCGGGGACTGCGCGGTGTGCCTCAGCG 352 98 E--L--V--A--A--A--P--A--V--C--G--G--G--D--C--A--V--C--L--S-- 117 421 GCATCGGCGGCGGCGACGAGGTGCGCAGGCTCAGCAATTGCCGCCACGTGTTCCACCGGG 480 353 GCATCGGCGGCGGCGACGAGGTGCGCAGGCTCAGCAATTGCCGCCACGTGTTCCACCGGG 412 118 G--I--G--G--G--D--E--V--R--R--L--S--N--C--R--H--V--F--H--R-- 137 481 GCTGCCTGGACCGCTGGATGGAGCACGACGACCAGCGCACCTGCCCGCTCTGCCGCGCGC 540 413 GCTGCCTGGACCGCTGGATGGAGCACGACGACCAGCGCACCTGCCCGCTCTGCCGCGCGC 472 138 G--C--L--D--R--W--M--E--H--D--D--Q--R--T--C--P--L--C--R--A-- 157 541 CGCTCATCCCCGACGAGATGGCCAGCGCGCTCTGGGCCGCCGCCGGCGTGCCCGACGCCT 600 473 CGCTCATCCCCGACGAGATGGCCAGCGCGCTCTGGGCCGCCGCCGGCGTGCCCGACGCCT 532 158 P--L--I--P--D--E--M--A--S--A--L--W--A--A--A--G--V--P--D--A-- 177 601 CCGACTTCGACTTCTCCTACTTCGGCGCGCCCCTCACGCCGATGCCCACGCCGACTCTGC 660 533 CCGACTTCGACTTCTCCTACTTCGGCGCGCCCCTCACGCCGATGCCCACGCCGACTCTGC 592 178 S--D--F--D--F--S--Y--F--G--A--P--L--T--P--M--P--T--P--T--L-- 197 661 TACGGCCGCACGAGCTGCTGCTCACTGGCCTTGGCGGCTACCAGTAACCAGTGAACCGCC 720 593 TACGGCCGCACGAGCTGCTGCTCACTGGCCTTGGCGGCTACCAGTAA............. 639 198 L--R--P--H--E--L--L--L--T--G--L--G--G--Y--Q--*-............. 212 721 GCTGTTGGTTCACGGAGTTGGCAATATCCACCTACTGCACAGCAGGGCACCGGCGACCCG 780 ............................................................ ............................................................ 781 GAATGCGCAGTTTTTACAACGACTGAATTGGTCGTCGTGTTCGGGGAAGACCAAGAACAG 840 ............................................................ ............................................................ 841 GAGGCGCCTTCAACTGTACATAGGCAAAAATGAGTAAAGCAAACCCCCCAAAAAAGGCTA 900 ............................................................ ............................................................ 901 GATGATTAGTAGATTTTTATTTTTGTTTTTGTTTTTGTACAGAAGATTCCATCTTCCAGG 960 ............................................................ ............................................................ 961 TTTGAGAAGTAGTGAATCTTTGTGCTGATT 990 .............................. ..............................
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