Transcript: Os03t0145600-01 OsWD40-62-201
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OsWD40-62-201 Os03t0145600-01 1423 427aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A3AE27 Q8H033 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants 3 prime UTR Frameshift Inframe insertion Missense Stop gained Stop lost Synonymous Other Markup Variants are filtered by consequence type ▼ ▲
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants 3 prime UTR Frameshift Inframe insertion Missense Stop gained Stop lost Synonymous Other Markup Variants are filtered by consequence type
1 A AGTCCCAACCACGACG ATG GCG GCG GTG CAG CTC CTT CCC CTT CCT CCC GCC GCC CCT C 60
.................ATGGCGGCGGTGCAGCTCCTTCCCCTTCCTCCCGCCGCCCCTC 43
.................-M--A--A--V--Q--L--L--P--L--P--P--A--A--P-- 14
61 CT CAG CCG CGC CGC GGC AAA CCT GGT TGC TGG AAC ACG CCG CCA GCG CCG CCG AAG GTT T 120
44 CTCAGCCGCGCCGCGGCAAACCTGGTTGCTGGAACACGCCGCCAGCGCCGCCGAAGGTTT 103
15 P--Q--P--R--R--G--K--P--G--C--W--N--T--P--P--A--P--P--K--V-- 34
121 GC CAC TAC TGG AAG TCC GGC AGG TGC AGC CGG AAC CCC TGC CGA TTC CTC CAC ACC GAC G 180
104 GCCACTACTGGAAGTCCGGCAGGTGCAGCCGGAACCCCTGCCGATTCCTCCACACCGACG 163
35 C--H--Y--W--K--S--G--R--C--S--R--N--P--C--R--F--L--H--T--D-- 54
M
181 CG CCT GAT CCG GCG CCG CCG ATC GCC GCC GTC AC ACG CGC AGC AAC ACG TGG GTC AAC C 240
164 CGCCTGATCCGGCGCCGCCGATCGCCGCCGTCAACACGCGCAGCAACACGTGGGTCAACC 223
55 A--P--D--P--A--P--P--I--A--A--V- -N- -T--R--S--N--T--W--V--N-- 74
241 CG TCC TGC GTC GCC GCG AAT TCG GAT GGC AAG GGT AGG GCT CCT CCG GTT CAG CCG GCG A 300
224 CGTCCTGCGTCGCCGCGAATTCGGATGGCAAGGGTAGGGCTCCTCCGGTTCAGCCGGCGA 283
75 P--S--C--V--A--A--N--S--D--G--K--G--R--A--P--P--V--Q--P--A-- 94
301 AG CGG CAG GTT GAG GCG CCG CCG GAA ACG CCT GCC AAG CGC CGA TGC GGC GGC GGC GCG T 360
284 AGCGGCAGGTTGAGGCGCCGCCGGAAACGCCTGCCAAGCGCCGATGCGGCGGCGGCGCGT 343
95 K--R--Q--V--E--A--P--P--E--T--P--A--K--R--R--C--G--G--G--A-- 114
361 GG TGC GTC GGC GAC GGC TTC TGC GGC GTC GCG CGG CTC AAG GGT CAC GCC AAG GCG GTC A 420
344 GGTGCGTCGGCGACGGCTTCTGCGGCGTCGCGCGGCTCAAGGGTCACGCCAAGGCGGTCA 403
115 W--C--V--G--D--G--F--C--G--V--A--R--L--K--G--H--A--K--A--V-- 134
R
421 CC GGC TTC GCG CTG CCG GAA GGG TCG GAC AAG CTG TTC TCC GGC AGC CTG GAC GC ACG G 480
404 CCGGCTTCGCGCTGCCGGAAGGGTCGGACAAGCTGTTCTCCGGCAGCCTGGACAGCACGG 463
135 T--G--F--A--L--P--E--G--S--D--K--L--F--S--G--S--L--D- -S- -T-- 154
S
481 TG CGC GCC TGG GAC TGC AGC A C GGG CAG TGC GTC CGC GTC GAG GAG ATG CAA GAA GGG G 540
464 TGCGCGCCTGGGACTGCAGCACCGGGCAGTGCGTCCGCGTCGAGGAGATGCAAGAAGGGG 523
155 V--R--A--W--D--C--S- -T- -G--Q--C--V--R--V--E--E--M--Q--E--G-- 174
541 AG GTG CAC AAG CTG ATC GCC ATG GGC CCG TGG GTC CTC GCC GGC GTG CGC GGC GCC GTC A 600
524 AGGTGCACAAGCTGATCGCCATGGGCCCGTGGGTCCTCGCCGGCGTGCGCGGCGCCGTCA 583
175 E--V--H--K--L--I--A--M--G--P--W--V--L--A--G--V--R--G--A--V-- 194
601 AG GCG ATC CAC ACG GGG ACC GGC AAG GAG CTC CGG CTG CGA GGG CCC GCG TCG CAG ATC A 660
584 AGGCGATCCACACGGGGACCGGCAAGGAGCTCCGGCTGCGAGGGCCCGCGTCGCAGATCA 643
195 K--A--I--H--T--G--T--G--K--E--L--R--L--R--G--P--A--S--Q--I-- 214
Y
661 CC GCC ATG CTA GCC GAG GAC GAG GAC CAC CTC TTC GCC GGC GCG GAG GAC GG GCC GTG T 720
644 CCGCCATGCTAGCCGAGGACGAGGACCACCTCTTCGCCGGCGCGGAGGACGGTGCCGTGT 703
215 T--A--M--L--A--E--D--E--D--H--L--F--A--G--A--E--D--G--A--V-- 234
Y
721 TC ATG TGG AGG ATG AAC CAA GAA CAG CAA TCG TTC GAC GAG GTC GCC GCG TC ACC GGC C 780
704 TCATGTGGAGGATGAACCAAGAACAGCAATCGTTCGACGAGGTCGCCGCGCTCACCGGCC 763
235 F--M--W--R--M--N--Q--E--Q--Q--S--F--D--E--V--A--A- -L- -T--G-- 254
781 AC TAC AAG GCC GTC GTG TCG CTC GCG CAG GGC AAG GGC GCG CTC TAC TCC GGC TCA ACA G 840
764 ACTACAAGGCCGTCGTGTCGCTCGCGCAGGGCAAGGGCGCGCTCTACTCCGGCTCAACAG 823
255 H--Y--K--A--V--V--S--L--A--Q--G--K--G--A--L--Y--S--G--S--T-- 274
841 AC GGC AGC ATC AGG GTC TGG GAC CTC GAC ACC CAC CGC TGC ATC TAC AGC TTC GCC GGC C 900
824 ACGGCAGCATCAGGGTCTGGGACCTCGACACCCACCGCTGCATCTACAGCTTCGCCGGCC 883
275 D--G--S--I--R--V--W--D--L--D--T--H--R--C--I--Y--S--F--A--G-- 294
901 AC TCG TCG ACG GTC ACC GCA TTG CTC TGC TGG GAG CGG TTC TTG CTC TCC TCG TCC GAC G 960
884 ACTCGTCGACGGTCACCGCATTGCTCTGCTGGGAGCGGTTCTTGCTCTCCTCGTCCGACG 943
295 H--S--S--T--V--T--A--L--L--C--W--E--R--F--L--L--S--S--S--D-- 314
R R R
961 AT GGC ACC GTG A G GTC TGG CA TGG A G CCT GAT CAC GAC GAC CTC GAC CTC GAG GTG C 1020
944 ATGGCACCGTGAAGGTCTGGCAGTGGAAGCCTGATCACGACGACCTCGACCTCGAGGTGC 1003
315 D--G--T--V- -K- -V--W--Q--W- -K- -P--D--H--D--D--L--D--L--E--V-- 334
Y
1021 AC TAC ACC CAC AAG GAA GAC GAA CGG GT GTT TCC ATG GAC GGA ACG TAC GAC GCC GAC G 1080
1004 ACTACACCCACAAGGAAGACGAACGGGTCGTTTCCATGGACGGAACGTACGACGCCGACG 1063
335 H--Y--T--H--K--E--D--E--R--V--V--S--M--D--G--T--Y--D--A--D-- 354
K S S Y R M
1081 AG AAG CCC GTG CTG CT GT TC CGC GGC GA GGC GTT GTC CGT TC TAC GAT TC CCG T 1140
1064 AGAAGCCCGTGCTGCTTGTCTCCCGCGGCGATGGCGTTGTCCGTGTCTACGATCTCCCGT 1123
355 E--K--P--V--L--L--V--S--R--G--D--G--V--V--R- -V- -Y--D- -L- -P-- 374
M K
1141 CG CTG AAG AAG AGA GGG GAT ATT C TGC GAC GAC GAG GTC AGG ACG ATA TCC GTC AGG T 1200
1124 CGCTGAAGAAGAGAGGGGATATTATCTGCGACGACGAGGTCAGGACGATATCCGTCAGGT 1183
375 S--L--K--K--R--G--D--I- -I- -C--D--D--E--V--R--T--I--S--V--R-- 394
K R R
1201 C CGC GGC GTC GTC TTC ACC GGA GAT GCG TCC GGC GAG GTC AGA GTG GT AG TGG ACA T 1260
1184 CGCGCGGCGTCGTCTTCACCGGAGATGCGTCCGGCGAGGTCAGAGTGGTGAAGTGGACAT 1243
395 S--R--G--V--V--F--T--G--D--A--S--G--E--V--R--V--V- -K- -W--T-- 414
R R R * * * R R Y W * *
1261 CA CTG GT GAT GCA C GAG C TA TTA GCT TG C TG AT A TTTTGATTTAAGAG 1320
1244 CACTGAGTGATGCAGCAGAGTCTTATTTAGCTATGGCCTGA................... 1284
415 S--L- -S- -D--A- -A- -E- -S- -Y- -L--A- -M- -A- -*- ................... 427
S S R Y R Y R *
1321 AACCATCA CA TTTTTGCTTTGTGGTCTTGTGAT CA TACTC GATGT TGT GTGT 1380
............................................................
............................................................
** W W Y W S W K K M
1381 A C GT TAAACAG GAACC CTA GCGGCTTGTGAAT 1423
...........................................
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