Transcript: Os01t0377700-02
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- Os01t0377700-02 1469 415aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
Q9AS33 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - Os01t0377700-01 2089 351aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A AGTACCGAGATCCCCAACCCAACCCAAGCCGCG ATG ATC CTC CGC ATC CGC AGC CGC GA 60
..................................ATGATCCTCCGCATCCGCAGCCGCGA 26
..................................-M--I--L--R--I--R--S--R--D 9
61 C GGC ACG GAC CGC ATC ACC GTG CCG GAC CCG GCC GCC GCC ACC GTC GGC GAC CTG CAG CG 120
27 CGGCACGGACCGCATCACCGTGCCGGACCCGGCCGCCGCCACCGTCGGCGACCTGCAGCG 86
9 --G--T--D--R--I--T--V--P--D--P--A--A--A--T--V--G--D--L--Q--R 29
121 T CTC ATC GCG GCG CGC GTC ACC GTC CCC GTC CCG CTC CAG CGC CTC TCC CTC GAC CCG GC 180
87 TCTCATCGCGGCGCGCGTCACCGTCCCCGTCCCGCTCCAGCGCCTCTCCCTCGACCCGGC 146
29 --L--I--A--A--R--V--T--V--P--V--P--L--Q--R--L--S--L--D--P--A 49
181 G CTC CTC CTC CCC TCC TCC GCC TCC GCC GCC CTG CTC GCC GAC CCG GCC GCC CCG CTC TC 240
147 GCTCCTCCTCCCCTCCTCCGCCTCCGCCGCCCTGCTCGCCGACCCGGCCGCCCCGCTCTC 206
49 --L--L--L--P--S--S--A--S--A--A--L--L--A--D--P--A--A--P--L--S 69
241 C TCC CTC CGC CTC TCC AAT GGC TCC TTC GTC TAC CTC TCC TAC CCG CCC GAC GCC CGC TC 300
207 CTCCCTCCGCCTCTCCAATGGCTCCTTCGTCTACCTCTCCTACCCGCCCGACGCCCGCTC 266
69 --S--L--R--L--S--N--G--S--F--V--Y--L--S--Y--P--P--D--A--R--S 89
301 C TCC CAG CCG CCT CCC CCC AAA GCC CTC TCC GCC GCC GGC TCC TTC GGC AAG AAG ATG AC 360
267 CTCCCAGCCGCCTCCCCCCAAAGCCCTCTCCGCCGCCGGCTCCTTCGGCAAGAAGATGAC 326
89 --S--Q--P--P--P--P--K--A--L--S--A--A--G--S--F--G--K--K--M--T 109
361 C ATG GAC GAC CTC ATC GCG CGC CAG ATC CGC GTC ACC CGC CAG GAG GCC CCG CTC TGC GC 420
327 CATGGACGACCTCATCGCGCGCCAGATCCGCGTCACCCGCCAGGAGGCCCCGCTCTGCGC 386
109 --M--D--D--L--I--A--R--Q--I--R--V--T--R--Q--E--A--P--L--C--A 129
421 C GCC GCC TCC TTC GAC CGC GAC TCC GCC AAC GCC TTC CAG CTC CAC GTC GCC GAG TCG CT 480
387 CGCCGCCTCCTTCGACCGCGACTCCGCCAACGCCTTCCAGCTCCACGTCGCCGAGTCGCT 446
129 --A--A--S--F--D--R--D--S--A--N--A--F--Q--L--H--V--A--E--S--L 149
481 C GCC TTC GCT ACC AAG CGC GCC GGC TTC CTC TAC GGC CGC GTC GAC GCC GAC ACC AAG GA 540
447 CGCCTTCGCTACCAAGCGCGCCGGCTTCCTCTACGGCCGCGTCGACGCCGACACCAAGGA 506
149 --A--F--A--T--K--R--A--G--F--L--Y--G--R--V--D--A--D--T--K--E 169
541 G GTC TTC GTC GAT TTC ATC TAC GAG CCG CCG CAG GTC GGC ACC GAG GAC GTT GTC CAG CT 600
507 GGTCTTCGTCGATTTCATCTACGAGCCGCCGCAGGTCGGCACCGAGGACGTTGTCCAGCT 566
169 --V--F--V--D--F--I--Y--E--P--P--Q--V--G--T--E--D--V--V--Q--L 189
601 C ATG CGG GAC GCG CAG GAG GAG GCC CGC GTC GAC GCC ATC GCC CAC GGC CTC GGG ATG CG 660
567 CATGCGGGACGCGCAGGAGGAGGCCCGCGTCGACGCCATCGCCCACGGCCTCGGGATGCG 626
189 --M--R--D--A--Q--E--E--A--R--V--D--A--I--A--H--G--L--G--M--R 209
661 C CGC GTC GGC CTG GTG TTC ACG CAG GCA GTC GGG AGG AAG ACC AGC GAC ACT GGC GAG TA 720
627 CCGCGTCGGCCTGGTGTTCACGCAGGCAGTCGGGAGGAAGACCAGCGACACTGGCGAGTA 686
209 --R--V--G--L--V--F--T--Q--A--V--G--R--K--T--S--D--T--G--E--Y 229
721 C ACC ATG TCC AAC CGC GAG GTG CTT CAG GCC ACC GAG CTG CAG GCG GAG GGC GGG ATC CC 780
687 CACCATGTCCAACCGCGAGGTGCTTCAGGCCACCGAGCTGCAGGCGGAGGGCGGGATCCC 746
229 --T--M--S--N--R--E--V--L--Q--A--T--E--L--Q--A--E--G--G--I--P 249
781 G GAG TGG GTC ACC GCC ATA GTC AAG CTC GAG GTG GGG GAT GAT GGC TCC GGT GAT GTG CA 840
747 GGAGTGGGTCACCGCCATAGTCAAGCTCGAGGTGGGGGATGATGGCTCCGGTGATGTGCA 806
249 --E--W--V--T--A--I--V--K--L--E--V--G--D--D--G--S--G--D--V--H 269
841 C TTC GAG GCG TTC CAG ATG AGT GAG ATT TGT GTG AAG CTG TTC AAG GAT GGT GTG CTG GA 900
807 CTTCGAGGCGTTCCAGATGAGTGAGATTTGTGTGAAGCTGTTCAAGGATGGTGTGCTGGA 866
269 --F--E--A--F--Q--M--S--E--I--C--V--K--L--F--K--D--G--V--L--E 289
901 G ACG GAG ATT GGG GAC AAA GAC GAT CCC CGC CTG TCC AAG ATG CGG AAA GAG GTG GTG GC 960
867 GACGGAGATTGGGGACAAAGACGATCCCCGCCTGTCCAAGATGCGGAAAGAGGTGGTGGC 926
289 --T--E--I--G--D--K--D--D--P--R--L--S--K--M--R--K--E--V--V--A 309
961 T GGG GGA AAG GAT ACT ATG GAG GTG GAC AAT GAC TTC TTC CTG GTG CCT GTC AAG ATC TC 1020
927 TGGGGGAAAGGATACTATGGAGGTGGACAATGACTTCTTCCTGGTGCCTGTCAAGATCTC 986
309 --G--G--K--D--T--M--E--V--D--N--D--F--F--L--V--P--V--K--I--S 329
1021 T GAT CAT CAG GGT CCA CTT TCA ACC GGC TTT CCT ATC GAG AAC CGT GGA AAC CCT GTA GC 1080
987 TGATCATCAGGGTCCACTTTCAACCGGCTTTCCTATCGAGAACCGTGGAAACCCTGTAGC 1046
329 --D--H--Q--G--P--L--S--T--G--F--P--I--E--N--R--G--N--P--V--A 349
1081 A ATG AGC GCG CTC AAG AGC CAC CTG GAT CGT GCT AAG CAT CTA CCA TTT GTT AAG CGG AT 1140
1047 AATGAGCGCGCTCAAGAGCCACCTGGATCGTGCTAAGCATCTACCATTTGTTAAGCGGAT 1106
349 --M--S--A--L--K--S--H--L--D--R--A--K--H--L--P--F--V--K--R--I 369
1141 C TCG GAC TTC CAC CTT CTC CTC CTG GTT GCT GCT TTC CTA GAC ATA AAA GCA GAT GTT CC 1200
1107 CTCGGACTTCCACCTTCTCCTCCTGGTTGCTGCTTTCCTAGACATAAAAGCAGATGTTCC 1166
369 --S--D--F--H--L--L--L--L--V--A--A--F--L--D--I--K--A--D--V--P 389
1201 T GCC CTC ACC GCT TGC GTA AAG AAC CAG AGC GTG GTG CCT GAA GGC TAC CAA CTG CTG AT 1260
1167 TGCCCTCACCGCTTGCGTAAAGAACCAGAGCGTGGTGCCTGAAGGCTACCAACTGCTGAT 1226
389 --A--L--T--A--C--V--K--N--Q--S--V--V--P--E--G--Y--Q--L--L--I 409
1261 C GAG TCA TTG GCT GGT GCC TGA AGTCTACCAGCTGCTGATCGAATCATTTAGCCAGTTAG 1320
1227 CGAGTCATTGGCTGGTGCCTGA...................................... 1248
409 --E--S--L--A--G--A--*-...................................... 415
1321 GCATAATGTTGATCTCTGGAAGCAAAGCACCTGGTCCCTTTAAATTTACTGCCATATATC 1380
............................................................
............................................................
1381 ATGTGTAACTTATGGTTGTCTCTGGTGTGTAAAAAAGTCTTGATCAATTCATAGGCGCTT 1440
............................................................
............................................................
1441 AACTTTACACAAGCGCAACATCGTTTTTT 1469
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