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Oryza sativa Japonica Group (IRGSP-1.0)
Location
About this transcript

This transcript has 2 exons, is annotated with 16 domains and features and is associated with 210 variant alleles.

Gene
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  • Name
  • Transcript ID
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  • UniProt
  • RefSeq
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
-Os01t0377700-021469415aa
 
Protein coding
Q9AS33 -Ensembl Canonical
-Os01t0377700-012089351aa
 
Protein coding
---
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 AAGTACCGAGATCCCCAACCCAACCCAAGCCGCGATGATCCTCCGCATCCGCAGCCGCGA     60
       ..................................ATGATCCTCCGCATCCGCAGCCGCGA     26
       ..................................-M--I--L--R--I--R--S--R--D      9

                                                                          
    61 CGGCACGGACCGCATCACCGTGCCGGACCCGGCCGCCGCCACCGTCGGCGACCTGCAGCG    120
    27 CGGCACGGACCGCATCACCGTGCCGGACCCGGCCGCCGCCACCGTCGGCGACCTGCAGCG     86
     9 --G--T--D--R--I--T--V--P--D--P--A--A--A--T--V--G--D--L--Q--R     29

                                                                          
   121 TCTCATCGCGGCGCGCGTCACCGTCCCCGTCCCGCTCCAGCGCCTCTCCCTCGACCCGGC    180
    87 TCTCATCGCGGCGCGCGTCACCGTCCCCGTCCCGCTCCAGCGCCTCTCCCTCGACCCGGC    146
    29 --L--I--A--A--R--V--T--V--P--V--P--L--Q--R--L--S--L--D--P--A     49

                                                                          
   181 GCTCCTCCTCCCCTCCTCCGCCTCCGCCGCCCTGCTCGCCGACCCGGCCGCCCCGCTCTC    240
   147 GCTCCTCCTCCCCTCCTCCGCCTCCGCCGCCCTGCTCGCCGACCCGGCCGCCCCGCTCTC    206
    49 --L--L--L--P--S--S--A--S--A--A--L--L--A--D--P--A--A--P--L--S     69

                                                                          
   241 CTCCCTCCGCCTCTCCAATGGCTCCTTCGTCTACCTCTCCTACCCGCCCGACGCCCGCTC    300
   207 CTCCCTCCGCCTCTCCAATGGCTCCTTCGTCTACCTCTCCTACCCGCCCGACGCCCGCTC    266
    69 --S--L--R--L--S--N--G--S--F--V--Y--L--S--Y--P--P--D--A--R--S     89

                                                                          
   301 CTCCCAGCCGCCTCCCCCCAAAGCCCTCTCCGCCGCCGGCTCCTTCGGCAAGAAGATGAC    360
   267 CTCCCAGCCGCCTCCCCCCAAAGCCCTCTCCGCCGCCGGCTCCTTCGGCAAGAAGATGAC    326
    89 --S--Q--P--P--P--P--K--A--L--S--A--A--G--S--F--G--K--K--M--T    109

                                                                          
   361 CATGGACGACCTCATCGCGCGCCAGATCCGCGTCACCCGCCAGGAGGCCCCGCTCTGCGC    420
   327 CATGGACGACCTCATCGCGCGCCAGATCCGCGTCACCCGCCAGGAGGCCCCGCTCTGCGC    386
   109 --M--D--D--L--I--A--R--Q--I--R--V--T--R--Q--E--A--P--L--C--A    129

                                                                          
   421 CGCCGCCTCCTTCGACCGCGACTCCGCCAACGCCTTCCAGCTCCACGTCGCCGAGTCGCT    480
   387 CGCCGCCTCCTTCGACCGCGACTCCGCCAACGCCTTCCAGCTCCACGTCGCCGAGTCGCT    446
   129 --A--A--S--F--D--R--D--S--A--N--A--F--Q--L--H--V--A--E--S--L    149

                                                                          
   481 CGCCTTCGCTACCAAGCGCGCCGGCTTCCTCTACGGCCGCGTCGACGCCGACACCAAGGA    540
   447 CGCCTTCGCTACCAAGCGCGCCGGCTTCCTCTACGGCCGCGTCGACGCCGACACCAAGGA    506
   149 --A--F--A--T--K--R--A--G--F--L--Y--G--R--V--D--A--D--T--K--E    169

                                                                          
   541 GGTCTTCGTCGATTTCATCTACGAGCCGCCGCAGGTCGGCACCGAGGACGTTGTCCAGCT    600
   507 GGTCTTCGTCGATTTCATCTACGAGCCGCCGCAGGTCGGCACCGAGGACGTTGTCCAGCT    566
   169 --V--F--V--D--F--I--Y--E--P--P--Q--V--G--T--E--D--V--V--Q--L    189

                                                                          
   601 CATGCGGGACGCGCAGGAGGAGGCCCGCGTCGACGCCATCGCCCACGGCCTCGGGATGCG    660
   567 CATGCGGGACGCGCAGGAGGAGGCCCGCGTCGACGCCATCGCCCACGGCCTCGGGATGCG    626
   189 --M--R--D--A--Q--E--E--A--R--V--D--A--I--A--H--G--L--G--M--R    209

                                                                          
   661 CCGCGTCGGCCTGGTGTTCACGCAGGCAGTCGGGAGGAAGACCAGCGACACTGGCGAGTA    720
   627 CCGCGTCGGCCTGGTGTTCACGCAGGCAGTCGGGAGGAAGACCAGCGACACTGGCGAGTA    686
   209 --R--V--G--L--V--F--T--Q--A--V--G--R--K--T--S--D--T--G--E--Y    229

                                                                          
   721 CACCATGTCCAACCGCGAGGTGCTTCAGGCCACCGAGCTGCAGGCGGAGGGCGGGATCCC    780
   687 CACCATGTCCAACCGCGAGGTGCTTCAGGCCACCGAGCTGCAGGCGGAGGGCGGGATCCC    746
   229 --T--M--S--N--R--E--V--L--Q--A--T--E--L--Q--A--E--G--G--I--P    249

                                                                          
   781 GGAGTGGGTCACCGCCATAGTCAAGCTCGAGGTGGGGGATGATGGCTCCGGTGATGTGCA    840
   747 GGAGTGGGTCACCGCCATAGTCAAGCTCGAGGTGGGGGATGATGGCTCCGGTGATGTGCA    806
   249 --E--W--V--T--A--I--V--K--L--E--V--G--D--D--G--S--G--D--V--H    269

                                                                          
   841 CTTCGAGGCGTTCCAGATGAGTGAGATTTGTGTGAAGCTGTTCAAGGATGGTGTGCTGGA    900
   807 CTTCGAGGCGTTCCAGATGAGTGAGATTTGTGTGAAGCTGTTCAAGGATGGTGTGCTGGA    866
   269 --F--E--A--F--Q--M--S--E--I--C--V--K--L--F--K--D--G--V--L--E    289

                                                                          
   901 GACGGAGATTGGGGACAAAGACGATCCCCGCCTGTCCAAGATGCGGAAAGAGGTGGTGGC    960
   867 GACGGAGATTGGGGACAAAGACGATCCCCGCCTGTCCAAGATGCGGAAAGAGGTGGTGGC    926
   289 --T--E--I--G--D--K--D--D--P--R--L--S--K--M--R--K--E--V--V--A    309

                                                                          
   961 TGGGGGAAAGGATACTATGGAGGTGGACAATGACTTCTTCCTGGTGCCTGTCAAGATCTC   1020
   927 TGGGGGAAAGGATACTATGGAGGTGGACAATGACTTCTTCCTGGTGCCTGTCAAGATCTC    986
   309 --G--G--K--D--T--M--E--V--D--N--D--F--F--L--V--P--V--K--I--S    329

                                                                          
  1021 TGATCATCAGGGTCCACTTTCAACCGGCTTTCCTATCGAGAACCGTGGAAACCCTGTAGC   1080
   987 TGATCATCAGGGTCCACTTTCAACCGGCTTTCCTATCGAGAACCGTGGAAACCCTGTAGC   1046
   329 --D--H--Q--G--P--L--S--T--G--F--P--I--E--N--R--G--N--P--V--A    349

                                                                          
  1081 AATGAGCGCGCTCAAGAGCCACCTGGATCGTGCTAAGCATCTACCATTTGTTAAGCGGAT   1140
  1047 AATGAGCGCGCTCAAGAGCCACCTGGATCGTGCTAAGCATCTACCATTTGTTAAGCGGAT   1106
   349 --M--S--A--L--K--S--H--L--D--R--A--K--H--L--P--F--V--K--R--I    369

                                                                          
  1141 CTCGGACTTCCACCTTCTCCTCCTGGTTGCTGCTTTCCTAGACATAAAAGCAGATGTTCC   1200
  1107 CTCGGACTTCCACCTTCTCCTCCTGGTTGCTGCTTTCCTAGACATAAAAGCAGATGTTCC   1166
   369 --S--D--F--H--L--L--L--L--V--A--A--F--L--D--I--K--A--D--V--P    389

                                                                          
  1201 TGCCCTCACCGCTTGCGTAAAGAACCAGAGCGTGGTGCCTGAAGGCTACCAACTGCTGAT   1260
  1167 TGCCCTCACCGCTTGCGTAAAGAACCAGAGCGTGGTGCCTGAAGGCTACCAACTGCTGAT   1226
   389 --A--L--T--A--C--V--K--N--Q--S--V--V--P--E--G--Y--Q--L--L--I    409

                                                                          
  1261 CGAGTCATTGGCTGGTGCCTGAAGTCTACCAGCTGCTGATCGAATCATTTAGCCAGTTAG   1320
  1227 CGAGTCATTGGCTGGTGCCTGA......................................   1248
   409 --E--S--L--A--G--A--*-......................................    415

                                                                          
  1321 GCATAATGTTGATCTCTGGAAGCAAAGCACCTGGTCCCTTTAAATTTACTGCCATATATC   1380
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1381 ATGTGTAACTTATGGTTGTCTCTGGTGTGTAAAAAAGTCTTGATCAATTCATAGGCGCTT   1440
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1441 AACTTTACACAAGCGCAACATCGTTTTTT                                  1469
       .............................                                      
       .............................