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Oryza sativa Japonica Group (IRGSP-1.0)
Location
About this transcript

This transcript has 1 exon, is annotated with 15 domains and features and is associated with 76 variant alleles.

Gene
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  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-Os01t0266100-01926204aa
 
Protein coding
A0A9K3Y7S8 Q9LJ01 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 TTTTCCAGCCCAAAGCCAAGCGCCTCGGCTCGCTCTCGCCGCCTCGCCGCGCGCCGCGCG     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 CTCGCCATGGAGATCGGTGGCGTGCTCGTGTCGCTGCTCTTCGCCGCCTTCTCCCTCCCC    120
       ......ATGGAGATCGGTGGCGTGCTCGTGTCGCTGCTCTTCGCCGCCTTCTCCCTCCCC     54
       ......-M--E--I--G--G--V--L--V--S--L--L--F--A--A--F--S--L--P-     18

                                                                          
   121 TGCCTCCTCCTCCTCCTCGTCCTCGCCGAGGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCCCTCGCGCTC    180
    55 TGCCTCCTCCTCCTCCTCGTCCTCGCCGAGGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCCCTCGCGCTC    114
    19 -C--L--L--L--L--L--V--L--A--E--A--G--L--R--L--A--S--L--A--L-     38

                                                                          
   181 CGCGGCGGCCGCTACGCCTGGCCCACCCGCTCCGACTTCCTCGGCTACCGCATCGCCCGC    240
   115 CGCGGCGGCCGCTACGCCTGGCCCACCCGCTCCGACTTCCTCGGCTACCGCATCGCCCGC    174
    39 -R--G--G--R--Y--A--W--P--T--R--S--D--F--L--G--Y--R--I--A--R-     58

                                                                          
   241 CGCCGCCGCGCCGCCGTCTCCGGCGGCGCCGGCGGGGCGGACGGCGAGGAGGAGGCGCAG    300
   175 CGCCGCCGCGCCGCCGTCTCCGGCGGCGCCGGCGGGGCGGACGGCGAGGAGGAGGCGCAG    234
    59 -R--R--R--A--A--V--S--G--G--A--G--G--A--D--G--E--E--E--A--Q-     78

                                                                          
   301 CCGACGGCGGAGTGCTGCGACCGCCTTGCCGTGGCGATGTACCGGCGCGGGCGCGACGCG    360
   235 CCGACGGCGGAGTGCTGCGACCGCCTTGCCGTGGCGATGTACCGGCGCGGGCGCGACGCG    294
    79 -P--T--A--E--C--C--D--R--L--A--V--A--M--Y--R--R--G--R--D--A-     98

                                                                          
   361 GCTCCCGTGGACTGCGTGTTCTGCCTGTCGCGGGTGGACGACGGCGAGGAGGTCCGCGAG    420
   295 GCTCCCGTGGACTGCGTGTTCTGCCTGTCGCGGGTGGACGACGGCGAGGAGGTCCGCGAG    354
    99 -A--P--V--D--C--V--F--C--L--S--R--V--D--D--G--E--E--V--R--E-    118

                                                                          
   421 CTCCGGTGCCGCCACGTCTTCCACCGCGCCTGCCTCGACGCCTGGCTCGTCCTCCCGCGC    480
   355 CTCCGGTGCCGCCACGTCTTCCACCGCGCCTGCCTCGACGCCTGGCTCGTCCTCCCGCGC    414
   119 -L--R--C--R--H--V--F--H--R--A--C--L--D--A--W--L--V--L--P--R-    138

                                                                          
   481 GCCACCTGCCCGCTCTGCCGCGACTGCCTCCTCCCGCCGCCGTGCGAGCCGCCGCGCAGC    540
   415 GCCACCTGCCCGCTCTGCCGCGACTGCCTCCTCCCGCCGCCGTGCGAGCCGCCGCGCAGC    474
   139 -A--T--C--P--L--C--R--D--C--L--L--P--P--P--C--E--P--P--R--S-    158

                                                                          
   541 TTCCCGCTCGACTACTACGACGACGACGACGACGTCCACTTCGGCTTCAACGACTTCTCC    600
   475 TTCCCGCTCGACTACTACGACGACGACGACGACGTCCACTTCGGCTTCAACGACTTCTCC    534
   159 -F--P--L--D--Y--Y--D--D--D--D--D--V--H--F--G--F--N--D--F--S-    178

                                                                          
   601 ATCACCTCCTCCACCACCACCACCACCTCCGCCGCCGCCGCCGTCGCCTACCCACACGGC    660
   535 ATCACCTCCTCCACCACCACCACCACCTCCGCCGCCGCCGCCGTCGCCTACCCACACGGC    594
   179 -I--T--S--S--T--T--T--T--T--S--A--A--A--A--V--A--Y--P--H--G-    198

                                                                          
   661 GTCGCGCTCTGGCCCATGTAATAAATGTAATAATCGCCATTGCTGCCGCTGCCGGCTGCC    720
   595 GTCGCGCTCTGGCCCATGTAA.......................................    615
   199 -V--A--L--W--P--M--*-.......................................    204

                                                                          
   721 GCCATGCGAGAAGCCGAGGAGCAGAGTGTTCTCTCTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTGG    780
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   781 TTTCTTTTTGCATAGTTTTTTTTAGTAATTAGTTGCTAATTAATTTGGGACTGATTGCTT    840
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   841 GATTAATCTAATGTAATCTAAGATGATCTGGCTAGGTGGCCCATGTAAAGTAATGTAATA    900
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   901 ATCTCCAATTCTCCATTGTTGCTGCC                                      926
       ..........................                                         
       ..........................