Transcript: Os01t0266100-01
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- Os01t0266100-01 926 204aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A9K3Y7S8 Q9LJ01 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 T TTTCCAGCCCAAAGCCAAGCGCCTCGGCTCGCTCTCGCCGCCTCGCCGCGCGCCGCGCG 60
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61 CTCGCC ATG GAG ATC GGT GGC GTG CTC GTG TCG CTG CTC TTC GCC GCC TTC TCC CTC CCC 120
......ATGGAGATCGGTGGCGTGCTCGTGTCGCTGCTCTTCGCCGCCTTCTCCCTCCCC 54
......-M--E--I--G--G--V--L--V--S--L--L--F--A--A--F--S--L--P- 18
121 TGC CTC CTC CTC CTC CTC GTC CTC GCC GAG GCC GGC CTC CGC CTC GCC TCC CTC GCG CTC 180
55 TGCCTCCTCCTCCTCCTCGTCCTCGCCGAGGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCCCTCGCGCTC 114
19 -C--L--L--L--L--L--V--L--A--E--A--G--L--R--L--A--S--L--A--L- 38
181 CGC GGC GGC CGC TAC GCC TGG CCC ACC CGC TCC GAC TTC CTC GGC TAC CGC ATC GCC CGC 240
115 CGCGGCGGCCGCTACGCCTGGCCCACCCGCTCCGACTTCCTCGGCTACCGCATCGCCCGC 174
39 -R--G--G--R--Y--A--W--P--T--R--S--D--F--L--G--Y--R--I--A--R- 58
241 CGC CGC CGC GCC GCC GTC TCC GGC GGC GCC GGC GGG GCG GAC GGC GAG GAG GAG GCG CAG 300
175 CGCCGCCGCGCCGCCGTCTCCGGCGGCGCCGGCGGGGCGGACGGCGAGGAGGAGGCGCAG 234
59 -R--R--R--A--A--V--S--G--G--A--G--G--A--D--G--E--E--E--A--Q- 78
301 CCG ACG GCG GAG TGC TGC GAC CGC CTT GCC GTG GCG ATG TAC CGG CGC GGG CGC GAC GCG 360
235 CCGACGGCGGAGTGCTGCGACCGCCTTGCCGTGGCGATGTACCGGCGCGGGCGCGACGCG 294
79 -P--T--A--E--C--C--D--R--L--A--V--A--M--Y--R--R--G--R--D--A- 98
361 GCT CCC GTG GAC TGC GTG TTC TGC CTG TCG CGG GTG GAC GAC GGC GAG GAG GTC CGC GAG 420
295 GCTCCCGTGGACTGCGTGTTCTGCCTGTCGCGGGTGGACGACGGCGAGGAGGTCCGCGAG 354
99 -A--P--V--D--C--V--F--C--L--S--R--V--D--D--G--E--E--V--R--E- 118
421 CTC CGG TGC CGC CAC GTC TTC CAC CGC GCC TGC CTC GAC GCC TGG CTC GTC CTC CCG CGC 480
355 CTCCGGTGCCGCCACGTCTTCCACCGCGCCTGCCTCGACGCCTGGCTCGTCCTCCCGCGC 414
119 -L--R--C--R--H--V--F--H--R--A--C--L--D--A--W--L--V--L--P--R- 138
481 GCC ACC TGC CCG CTC TGC CGC GAC TGC CTC CTC CCG CCG CCG TGC GAG CCG CCG CGC AGC 540
415 GCCACCTGCCCGCTCTGCCGCGACTGCCTCCTCCCGCCGCCGTGCGAGCCGCCGCGCAGC 474
139 -A--T--C--P--L--C--R--D--C--L--L--P--P--P--C--E--P--P--R--S- 158
541 TTC CCG CTC GAC TAC TAC GAC GAC GAC GAC GAC GTC CAC TTC GGC TTC AAC GAC TTC TCC 600
475 TTCCCGCTCGACTACTACGACGACGACGACGACGTCCACTTCGGCTTCAACGACTTCTCC 534
159 -F--P--L--D--Y--Y--D--D--D--D--D--V--H--F--G--F--N--D--F--S- 178
601 ATC ACC TCC TCC ACC ACC ACC ACC ACC TCC GCC GCC GCC GCC GTC GCC TAC CCA CAC GGC 660
535 ATCACCTCCTCCACCACCACCACCACCTCCGCCGCCGCCGCCGTCGCCTACCCACACGGC 594
179 -I--T--S--S--T--T--T--T--T--S--A--A--A--A--V--A--Y--P--H--G- 198
661 GTC GCG CTC TGG CCC ATG TAA TAAATGTAATAATCGCCATTGCTGCCGCTGCCGGCTGCC 720
595 GTCGCGCTCTGGCCCATGTAA....................................... 615
199 -V--A--L--W--P--M--*-....................................... 204
721 GCCATGCGAGAAGCCGAGGAGCAGAGTGTTCTCTCTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTGG 780
............................................................
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781 TTTCTTTTTGCATAGTTTTTTTTAGTAATTAGTTGCTAATTAATTTGGGACTGATTGCTT 840
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841 GATTAATCTAATGTAATCTAAGATGATCTGGCTAGGTGGCCCATGTAAAGTAATGTAATA 900
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901 ATCTCCAATTCTCCATTGTTGCTGCC 926
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