Oryza sativa Japonica Group (IRGSP-1.0) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationExternal ReferencesSupporting evidenceID History.
Chromosome 1: 4,909,990-4,913,659 reverse strand.
This transcript has 9 exons, is annotated with 9 domains and features, is associated with 87 variant alleles and maps to 59 oligo probes.
This transcript is a product of gene Os01g0191800 Show transcript tableHide transcript table
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1 GCGGCCGCTCCTCCCCTCCCCTCTCTCTCTTGTTCCCCCATGGCGATCGCCACCGAGTCG 60 .......................................ATGGCGATCGCCACCGAGTCG 21 .......................................-M--A--I--A--T--E--S- 7 61 CGCTGCGAGGAGGAGAAGGCTTCGCCGCATTCGCAGGAGGTGAAGCGGTGGGTGTTGTCT 120 22 CGCTGCGAGGAGGAGAAGGCTTCGCCGCATTCGCAGGAGGTGAAGCGGTGGGTGTTGTCT 81 8 -R--C--E--E--E--K--A--S--P--H--S--Q--E--V--K--R--W--V--L--S- 27 121 GATTTTGACATCGGGAAGCCCCTCGGGAGGGGCAAGTTCGGCCATGTTTACTTAGCAAGA 180 82 GATTTTGACATCGGGAAGCCCCTCGGGAGGGGCAAGTTCGGCCATGTTTACTTAGCAAGA 141 28 -D--F--D--I--G--K--P--L--G--R--G--K--F--G--H--V--Y--L--A--R- 47 181 GAAAAGAGAAGTAACCATATTGTGGCTTTGAAAGTACTTTTCAAGAGCCAACTAAAGCAG 240 142 GAAAAGAGAAGTAACCATATTGTGGCTTTGAAAGTACTTTTCAAGAGCCAACTAAAGCAG 201 48 -E--K--R--S--N--H--I--V--A--L--K--V--L--F--K--S--Q--L--K--Q- 67 241 TCCCAGGTGGAGCATCAGCTACGTCGGGAAGTTGAGATTCAGAGTCATCTTCGTCATCCC 300 202 TCCCAGGTGGAGCATCAGCTACGTCGGGAAGTTGAGATTCAGAGTCATCTTCGTCATCCC 261 68 -S--Q--V--E--H--Q--L--R--R--E--V--E--I--Q--S--H--L--R--H--P- 87 301 AACATTCTACGGCTGTATGGGTATTTCTATGATCAGACCCGTGTGTACTTGATCTTGGAG 360 262 AACATTCTACGGCTGTATGGGTATTTCTATGATCAGACCCGTGTGTACTTGATCTTGGAG 321 88 -N--I--L--R--L--Y--G--Y--F--Y--D--Q--T--R--V--Y--L--I--L--E- 107 361 TATGCCTTAAAAGGTGAACTTTATAAGGAGTTGCAGAGGTGCAAGCATTTCTCTGAAAGA 420 322 TATGCCTTAAAAGGTGAACTTTATAAGGAGTTGCAGAGGTGCAAGCATTTCTCTGAAAGA 381 108 -Y--A--L--K--G--E--L--Y--K--E--L--Q--R--C--K--H--F--S--E--R- 127 421 CGTTCAGCGACTTACATTGCATCACTGGCGCATGCGCTCATCTACCTTCACGGAAAGCAT 480 382 CGTTCAGCGACTTACATTGCATCACTGGCGCATGCGCTCATCTACCTTCACGGAAAGCAT 441 128 -R--S--A--T--Y--I--A--S--L--A--H--A--L--I--Y--L--H--G--K--H- 147 481 GTGATCCATAGAGACATTAAACCTGAAAATCTTTTAATTGGGTCCCAGGGCGAACTGAAA 540 442 GTGATCCATAGAGACATTAAACCTGAAAATCTTTTAATTGGGTCCCAGGGCGAACTGAAA 501 148 -V--I--H--R--D--I--K--P--E--N--L--L--I--G--S--Q--G--E--L--K- 167 541 ATTGCAGACTTTGGTTGGTCTGTGCACACCTTCAACAGAAGAAGGACAATGTGTGGAACA 600 502 ATTGCAGACTTTGGTTGGTCTGTGCACACCTTCAACAGAAGAAGGACAATGTGTGGAACA 561 168 -I--A--D--F--G--W--S--V--H--T--F--N--R--R--R--T--M--C--G--T- 187 601 TTAGATTACCTGCCCCCTGAAATGGTGGAGAAGACTGAACATGACTACCATGTTGACATT 660 562 TTAGATTACCTGCCCCCTGAAATGGTGGAGAAGACTGAACATGACTACCATGTTGACATT 621 188 -L--D--Y--L--P--P--E--M--V--E--K--T--E--H--D--Y--H--V--D--I- 207 661 TGGAGCTTGGGGATCCTGTGCTATGAGTTCCTTTATGGAGTCCCACCTTTCGAAGCAAAA 720 622 TGGAGCTTGGGGATCCTGTGCTATGAGTTCCTTTATGGAGTCCCACCTTTCGAAGCAAAA 681 208 -W--S--L--G--I--L--C--Y--E--F--L--Y--G--V--P--P--F--E--A--K- 227 721 GAACACTCCGAAACATATCGCAGGATTGTGAAAGTTGACTTGAAGTTCCCACTGAAACCA 780 682 GAACACTCCGAAACATATCGCAGGATTGTGAAAGTTGACTTGAAGTTCCCACTGAAACCA 741 228 -E--H--S--E--T--Y--R--R--I--V--K--V--D--L--K--F--P--L--K--P- 247 781 TTCGTGTCCCCGGCTGCGAAAGACCTAATTTCACAGATGCTCGTGAAGAATTCGGCGCAT 840 742 TTCGTGTCCCCGGCTGCGAAAGACCTAATTTCACAGATGCTCGTGAAGAATTCGGCGCAT 801 248 -F--V--S--P--A--A--K--D--L--I--S--Q--M--L--V--K--N--S--A--H- 267 841 CGTCTGCCCCTCCACAAGCTCCTCGAGCACCCTTGGATAGTTCAAAACGCTGATCCCTCC 900 802 CGTCTGCCCCTCCACAAGCTCCTCGAGCACCCTTGGATAGTTCAAAACGCTGATCCCTCC 861 268 -R--L--P--L--H--K--L--L--E--H--P--W--I--V--Q--N--A--D--P--S- 287 901 GGCGTGTACAGAGGCTAGAACAATCTCTTCCACTCTCCTCAATTCGAGGAGAGACCTGAT 960 862 GGCGTGTACAGAGGCTAG.......................................... 879 288 -G--V--Y--R--G--*-.......................................... 292 961 TCTTTTTCATCACTGTTGTTATGGCAAAACAAGAAAAAAGCAGTAGCCGTACTACTCTAC 1020 ............................................................ ............................................................ 1021 CTGTTGTTTCCGATCCCAGCTGCGCCTGTGTAGTTACGTGACAACGTGTATGCTCAAGCT 1080 ............................................................ ............................................................ 1081 TCAGATTTCCTCGATGAAGATTTGAAGCTGTGTGTGTGGGTTTAACGCGTATGTGTTTTA 1140 ............................................................ ............................................................ 1141 GCGTGTGTTCACAGCATGGGGTTGTGATATGTTTTCTGTGCAACGCCCTGTACTTAATGT 1200 ............................................................ ............................................................ 1201 ACTAATCGTATTTCTTATTGGACATCACTCGATTAGTCT 1239 ....................................... .......................................
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