Transcript: ORUFI12G21730.1
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- ORUFI12G21730.1 2844 947aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0RKA6 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG AAC GTG TTC GCG GGG GTG GGC GGG GGC GCG GCG GGG AAG GAG GCG GGG ACG GTG GGC 60
1 ATGAACGTGTTCGCGGGGGTGGGCGGGGGCGCGGCGGGGAAGGAGGCGGGGACGGTGGGC 60
1 -M--N--V--F--A--G--V--G--G--G--A--A--G--K--E--A--G--T--V--G- 20
61 GGC GGG GCG CTG CTG GAG CTG ACG CCG CAC AAG CTG GCG CTG TGC CAC CTC GTG CAG GTG 120
61 GGCGGGGCGCTGCTGGAGCTGACGCCGCACAAGCTGGCGCTGTGCCACCTCGTGCAGGTG 120
21 -G--G--A--L--L--E--L--T--P--H--K--L--A--L--C--H--L--V--Q--V- 40
121 TTC GCG CCG CCG CCG CAG GCC GGG GTC TCG GCC CCC GCG CTG CCC TTC CCC TTC GAG TCC 180
121 TTCGCGCCGCCGCCGCAGGCCGGGGTCTCGGCCCCCGCGCTGCCCTTCCCCTTCGAGTCC 180
41 -F--A--P--P--P--Q--A--G--V--S--A--P--A--L--P--F--P--F--E--S- 60
181 GTC GCC CAC CAC AAC CGC CTC GGC CTC TTC CTC TTC GCC CTC ACC CGC T CG TGC GAG GAT 240
181 GTCGCCCACCACAACCGCCTCGGCCTCTTCCTCTTCGCCCTCACCCGCTCGTGCGAGGAT 240
61 -V--A--H--H--N--R--L--G--L--F--L--F--A--L--T--R--S--C--E--D- 80
241 TTT CGG GAA CCT CCA CTG GAA GAG CTT CTA AGG CAG CTG AAG GCA GTT GAT GCT TTG GTT 300
241 TTTCGGGAACCTCCACTGGAAGAGCTTCTAAGGCAGCTGAAGGCAGTTGATGCTTTGGTT 300
81 -F--R--E--P--P--L--E--E--L--L--R--Q--L--K--A--V--D--A--L--V- 100
301 AAT GGC TGG CTC TGT GAG CAG CTT ACA AGT ACC CTT TCA GCG CTT ACT TCA CCG GAT GAT 360
301 AATGGCTGGCTCTGTGAGCAGCTTACAAGTACCCTTTCAGCGCTTACTTCACCGGATGAT 360
101 -N--G--W--L--C--E--Q--L--T--S--T--L--S--A--L--T--S--P--D--D- 120
361 CTG TTC AAC TTC TTT GAT AAG CTA CGA G G C GTT CTG TCT GCG CCA GAA GGT GCA AAT GTG 420
361 CTGTTCAACTTCTTTGATAAGCTACGAGGCGTTCTGTCTGCGCCAGAAGGTGCAAATGTG 420
121 -L--F--N--F--F--D--K--L--R--G--V--L--S--A--P--E--G--A--N--V- 140
421 GAA GAC GAA TTT CTG GAT CCA AAT AGT CAG CTT GGA GTT TTT CTT CGT TGC TGT ATA CTT 480
421 GAAGACGAATTTCTGGATCCAAATAGTCAGCTTGGAGTTTTTCTTCGTTGCTGTATACTT 480
141 -E--D--E--F--L--D--P--N--S--Q--L--G--V--F--L--R--C--C--I--L- 160
481 TCC TTC AAT ACA ATG ACC TTT GAG G GT GTC TGC CAT CTT TTG GCA AAT CTT GTG GAG TAT 540
481 TCCTTCAATACAATGACCTTTGAGGGTGTCTGCCATCTTTTGGCAAATCTTGTGGAGTAT 540
161 -S--F--N--T--M--T--F--E--G--V--C--H--L--L--A--N--L--V--E--Y- 180
541 TGT AAC TCC GCT GAC ACC TCA TAC GAC TTG GCA GAA GAT GAG GAC TTC AAC AGT GAA ATG 600
541 TGTAACTCCGCTGACACCTCATACGACTTGGCAGAAGATGAGGACTTCAACAGTGAAATG 600
181 -C--N--S--A--D--T--S--Y--D--L--A--E--D--E--D--F--N--S--E--M- 200
601 GAA ATG AGC AAC TTC ATG GAT ACA AAT ATG CAT GTT AGA GAT GGT GTA TTT GAC AAA TAC 660
601 GAAATGAGCAACTTCATGGATACAAATATGCATGTTAGAGATGGTGTATTTGACAAATAC 660
201 -E--M--S--N--F--M--D--T--N--M--H--V--R--D--G--V--F--D--K--Y- 220
661 AAT CAA GGT TAT GCC CCT AGG AGC CAT ATG GTA GAC AGC TCG TCA TCT CTA GTA CAT GCT 720
661 AATCAAGGTTATGCCCCTAGGAGCCATATGGTAGACAGCTCGTCATCTCTAGTACATGCT 720
221 -N--Q--G--Y--A--P--R--S--H--M--V--D--S--S--S--S--L--V--H--A- 240
721 CCA GCC TCA CTC CAT GAT TTT GAG GAA G CT AAT ATG TTC AAG GCA GAT GAT AAC CTG GGT 780
721 CCAGCCTCACTCCATGATTTTGAGGAAGCTAATATGTTCAAGGCAGATGATAACCTGGGT 780
241 -P--A--S--L--H--D--F--E--E--A--N--M--F--K--A--D--D--N--L--G- 260
781 CCA ACT TGT CTG AGG TCA AGA TGG CAA TTA GAG GCA TAT CTT AAC CAA CAA GCT GAT ATT 840
781 CCAACTTGTCTGAGGTCAAGATGGCAATTAGAGGCATATCTTAACCAACAAGCTGATATT 840
261 -P--T--C--L--R--S--R--W--Q--L--E--A--Y--L--N--Q--Q--A--D--I- 280
841 CTT GAG AA G GAT CCT AGT TCG GTG CCT TTG AAT TCA TTT AAT GCT ACT ATG AGT CAA CTT 900
841 CTTGAGAAGGATCCTAGTTCGGTGCCTTTGAATTCATTTAATGCTACTATGAGTCAACTT 900
281 -L--E--K--D--P--S--S--V--P--L--N--S--F--N--A--T--M--S--Q--L- 300
901 CAG AAA TTA GCT CCA GAG CTC CAT CGT AAT TGT GAA GAG TTC CTT GTC ACA ATG GTT TAT 960
901 CAGAAATTAGCTCCAGAGCTCCATCGTAATTGTGAAGAGTTCCTTGTCACAATGGTTTAT 960
301 -Q--K--L--A--P--E--L--H--R--N--C--E--E--F--L--V--T--M--V--Y- 320
961 TTT GAT CTA TAT TCT ACC TGT CAG GTC CAA TTT TTG CAG TAT TTG AAT GCT CTT ACC CAT 1020
961 TTTGATCTATATTCTACCTGTCAGGTCCAATTTTTGCAGTATTTGAATGCTCTTACCCAT 1020
321 -F--D--L--Y--S--T--C--Q--V--Q--F--L--Q--Y--L--N--A--L--T--H- 340
1021 GAT GAC TAC GTT GCT GCA TTA GAT AAT CTT CAC CGC TAT TTT GAT TAC AG T GCA GGG ATG 1080
1021 GATGACTACGTTGCTGCATTAGATAATCTTCACCGCTATTTTGATTACAGTGCAGGGATG 1080
341 -D--D--Y--V--A--A--L--D--N--L--H--R--Y--F--D--Y--S--A--G--M- 360
1081 CAA GGA CTT TTC AGT CGT ACC GCG TCT CCA TTC CAA GAT ATT ATA GTT GGG AAG TAT GAG 1140
1081 CAAGGACTTTTCAGTCGTACCGCGTCTCCATTCCAAGATATTATAGTTGGGAAGTATGAG 1140
361 -Q--G--L--F--S--R--T--A--S--P--F--Q--D--I--I--V--G--K--Y--E- 380
1141 AGT GCT TTG CTC TGC TTA GGT AAC TTG CAC TGT TAT TTT GGA CAT CCG AAG AAA GCC TTA 1200
1141 AGTGCTTTGCTCTGCTTAGGTAACTTGCACTGTTATTTTGGACATCCGAAGAAAGCCTTA 1200
381 -S--A--L--L--C--L--G--N--L--H--C--Y--F--G--H--P--K--K--A--L- 400
1201 GAG G CA TTC ACA GAA GCA GTG CGT GTT TCC CAA ATG AAC AAT GAT GAT TCA TGC CTG GCC 1260
1201 GAGGCATTCACAGAAGCAGTGCGTGTTTCCCAAATGAACAATGATGATTCATGCCTGGCC 1260
401 -E--A--F--T--E--A--V--R--V--S--Q--M--N--N--D--D--S--C--L--A- 420
1261 TAT ATA TTA GGA GCT ATT TCC AAT CTG TTA TCA AAG ATA GGC ATG TCA AGC ACA GTT GGA 1320
1261 TATATATTAGGAGCTATTTCCAATCTGTTATCAAAGATAGGCATGTCAAGCACAGTTGGA 1320
421 -Y--I--L--G--A--I--S--N--L--L--S--K--I--G--M--S--S--T--V--G- 440
1321 ACA ATT GGT TCT CCT TAT TCA CTT GGA AAT AAC ATC GGA TTA GGC ACA CCG CTG TCC ATT 1380
1321 ACAATTGGTTCTCCTTATTCACTTGGAAATAACATCGGATTAGGCACACCGCTGTCCATT 1380
441 -T--I--G--S--P--Y--S--L--G--N--N--I--G--L--G--T--P--L--S--I- 460
1381 CAG CAA CAG CTG CTT GTT CTT TTA AAG AGA TCA CTT AAG CGA GCT GAT ACC TTG AAA CTT 1440
1381 CAGCAACAGCTGCTTGTTCTTTTAAAGAGATCACTTAAGCGAGCTGATACCTTGAAACTT 1440
461 -Q--Q--Q--L--L--V--L--L--K--R--S--L--K--R--A--D--T--L--K--L- 480
1441 ACA AGC TTG CTG TCC TTT GAT CAC CTT TCT CTT GCA AAA TTT GAT CTG AAG CAT GTC CAA 1500
1441 ACAAGCTTGCTGTCCTTTGATCACCTTTCTCTTGCAAAATTTGATCTGAAGCATGTCCAA 1500
481 -T--S--L--L--S--F--D--H--L--S--L--A--K--F--D--L--K--H--V--Q- 500
1501 AGG CCT CTG GTG TCC TTT GGC CCT AAT GCT TCC ACA AAG CTT AGA ACA TGT CCT GCA GAT 1560
1501 AGGCCTCTGGTGTCCTTTGGCCCTAATGCTTCCACAAAGCTTAGAACATGTCCTGCAGAT 1560
501 -R--P--L--V--S--F--G--P--N--A--S--T--K--L--R--T--C--P--A--D- 520
1561 GTC TGC AAG A AT TTG AGA TTA AGT TCA CGT GTG TTG ACT GAC TTT GGC ACA GAT GGC TTA 1620
1561 GTCTGCAAGAATTTGAGATTAAGTTCACGTGTGTTGACTGACTTTGGCACAGATGGCTTA 1620
521 -V--C--K--N--L--R--L--S--S--R--V--L--T--D--F--G--T--D--G--L- 540
1621 TCA GCA TCA AAT GAT AAT GGT AGT TTT AGT ACT TCA TGG CTT AGG AAT CTG TCT GCT GCT 1680
1621 TCAGCATCAAATGATAATGGTAGTTTTAGTACTTCATGGCTTAGGAATCTGTCTGCTGCT 1680
541 -S--A--S--N--D--N--G--S--F--S--T--S--W--L--R--N--L--S--A--A- 560
1681 TCT AAT TCT TGG TGT AGC AGC TCG AAA AAA TCT GGA AAA CTA CTT ACG AAT GAC TTC GAC 1740
1681 TCTAATTCTTGGTGTAGCAGCTCGAAAAAATCTGGAAAACTACTTACGAATGACTTCGAC 1740
561 -S--N--S--W--C--S--S--S--K--K--S--G--K--L--L--T--N--D--F--D- 580
1741 AAT TTC CAT TTT CAT GCA CAA CCA AGT CCT ATA CCT GCA TCA GTA TTG CAA TTA GCT GGC 1800
1741 AATTTCCATTTTCATGCACAACCAAGTCCTATACCTGCATCAGTATTGCAATTAGCTGGC 1800
581 -N--F--H--F--H--A--Q--P--S--P--I--P--A--S--V--L--Q--L--A--G- 600
1801 TCA GCT TAT TTG CTG AGG GCC ACT GCT TGG GAA CAC TAC GGG AG T GCT CCG ATG GTT CGA 1860
1801 TCAGCTTATTTGCTGAGGGCCACTGCTTGGGAACACTACGGGAGTGCTCCGATGGTTCGA 1860
601 -S--A--Y--L--L--R--A--T--A--W--E--H--Y--G--S--A--P--M--V--R- 620
1861 ATG AAT TCG TTG GTC TAT GCA ACC TGC TTT GCT GAT GCT GCA AG T TCA TCA GAG CTG TCG 1920
1861 ATGAATTCGTTGGTCTATGCAACCTGCTTTGCTGATGCTGCAAGTTCATCAGAGCTGTCG 1920
621 -M--N--S--L--V--Y--A--T--C--F--A--D--A--A--S--S--S--E--L--S- 640
1921 CTA GCA TAT GTC AAG CTA ATT CAG CAT TTA GCA ACT TTC AAA GGG TAT TCA G CG GCA TTC 1980
1921 CTAGCATATGTCAAGCTAATTCAGCATTTAGCAACTTTCAAAGGGTATTCAGCGGCATTC 1980
641 -L--A--Y--V--K--L--I--Q--H--L--A--T--F--K--G--Y--S--A--A--F- 660
1981 TCT GCT CTC AAG CTT GCT GAA GAG AAG TTC CCG TTG TCA GCA AAT TCA CAT ATC CAG CTT 2040
1981 TCTGCTCTCAAGCTTGCTGAAGAGAAGTTCCCGTTGTCAGCAAATTCACATATCCAGCTT 2040
661 -S--A--L--K--L--A--E--E--K--F--P--L--S--A--N--S--H--I--Q--L- 680
2041 CTT AAA ATG CAA TTA TTG CAC GAG CGT GCT CTG CAT CG A GGA CAC CTG AAA GTT GCG CAA 2100
2041 CTTAAAATGCAATTATTGCACGAGCGTGCTCTGCATCGAGGACACCTGAAAGTTGCGCAA 2100
681 -L--K--M--Q--L--L--H--E--R--A--L--H--R--G--H--L--K--V--A--Q- 700
2101 CAG ATC TGT GAT GAG TTT GCT GTG TTG TCA TCT TCT GTT AGT GGA GTC GAC ATT GAG CTG 2160
2101 CAGATCTGTGATGAGTTTGCTGTGTTGTCATCTTCTGTTAGTGGAGTCGACATTGAGCTG 2160
701 -Q--I--C--D--E--F--A--V--L--S--S--S--V--S--G--V--D--I--E--L- 720
2161 AAG ACA GAA GCT AGG TTA CGG CAT GCT CGC ACG CTT CTT GCC GCA AAA CAA TTT AGT CAG 2220
2161 AAGACAGAAGCTAGGTTACGGCATGCTCGCACGCTTCTTGCCGCAAAACAATTTAGTCAG 2220
721 -K--T--E--A--R--L--R--H--A--R--T--L--L--A--A--K--Q--F--S--Q- 740
2221 G CA GCA AAT GTG GCA AAT TCT CTT TTC TCT ACT TGC TAC AAG TAC AAC ATG CAG GTG GAG 2280
2221 GCAGCAAATGTGGCAAATTCTCTTTTCTCTACTTGCTACAAGTACAACATGCAGGTGGAG 2280
741 -A--A--N--V--A--N--S--L--F--S--T--C--Y--K--Y--N--M--Q--V--E- 760
2281 AAT GCA AGT GTT CTT TTA TTA CTT GCA GAG ATA CAG AAA A AT TCT GAC AAT GCA GTC CTT 2340
2281 AATGCAAGTGTTCTTTTATTACTTGCAGAGATACAGAAAAATTCTGACAATGCAGTCCTT 2340
761 -N--A--S--V--L--L--L--L--A--E--I--Q--K--N--S--D--N--A--V--L- 780
2341 GGG CTT CCT TAC GCA TTA GCT AGT CAA TCA TTC TGC AAA TCA TTT AAC TTA GAT CTG CTT 2400
2341 GGGCTTCCTTACGCATTAGCTAGTCAATCATTCTGCAAATCATTTAACTTAGATCTGCTT 2400
781 -G--L--P--Y--A--L--A--S--Q--S--F--C--K--S--F--N--L--D--L--L- 800
2401 GAA GCC TCG GCT ACA CTA ACT CTT ACT GAA TTA TGG CTG GCT CTT GGA TCA ACC CAT GCA 2460
2401 GAAGCCTCGGCTACACTAACTCTTACTGAATTATGGCTGGCTCTTGGATCAACCCATGCA 2460
801 -E--A--S--A--T--L--T--L--T--E--L--W--L--A--L--G--S--T--H--A- 820
2461 AAG AGG GCC TTG AGT CTT GTT TGC CAA AGC CTT CCA ATG ATC CTT GGT CAT GGT GGA CTT 2520
2461 AAGAGGGCCTTGAGTCTTGTTTGCCAAAGCCTTCCAATGATCCTTGGTCATGGTGGACTT 2520
821 -K--R--A--L--S--L--V--C--Q--S--L--P--M--I--L--G--H--G--G--L- 840
2521 GAG CTG CGC GCT CGA GCT CAC ATA GTT CTT GCA AAA TGC TAT CTG TCC GAT CCA AAA TTC 2580
2521 GAGCTGCGCGCTCGAGCTCACATAGTTCTTGCAAAATGCTATCTGTCCGATCCAAAATTC 2580
841 -E--L--R--A--R--A--H--I--V--L--A--K--C--Y--L--S--D--P--K--F- 860
2581 TCA G AA AAA CCG GTT CCC CTT TGT CCT TTC ATC ATG GCA GTT TCC GAA GAC CCT TCT GCT 2640
2581 TCAGAAAAACCGGTTCCCCTTTGTCCTTTCATCATGGCAGTTTCCGAAGACCCTTCTGCT 2640
861 -S--E--K--P--V--P--L--C--P--F--I--M--A--V--S--E--D--P--S--A- 880
2641 GTT CTA GAT CCT CTG AAC CAA GCT GCG GAA GAT CTG GAG GTT TTG GAG T AC CAC GAA ATG 2700
2641 GTTCTAGATCCTCTGAACCAAGCTGCGGAAGATCTGGAGGTTTTGGAGTACCACGAAATG 2700
881 -V--L--D--P--L--N--Q--A--A--E--D--L--E--V--L--E--Y--H--E--M- 900
2701 GCG GCA GAA GCA TAC TAC CTA AAG GCA ATG GTC TAC AAC AAT CTA GGA AAA CTG GAT GAG 2760
2701 GCGGCAGAAGCATACTACCTAAAGGCAATGGTCTACAACAATCTAGGAAAACTGGATGAG 2760
901 -A--A--E--A--Y--Y--L--K--A--M--V--Y--N--N--L--G--K--L--D--E- 920
2761 AGG GAG GAA GCT GCA GCT TCT TTC AAG GAG CAC ACA CTC GCC CTT GAA AAC CCA TAT AAC 2820
2761 AGGGAGGAAGCTGCAGCTTCTTTCAAGGAGCACACACTCGCCCTTGAAAACCCATATAAC 2820
921 -R--E--E--A--A--A--S--F--K--E--H--T--L--A--L--E--N--P--Y--N- 940
2821 GAA GAG GAT TCA CTT GCT TGC TGA 2844
2821 GAAGAGGATTCACTTGCTTGCTGA 2844
941 -E--E--D--S--L--A--C--*- 947
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