Oryza rufipogon (OR_W1943) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 8: 1,883,634-1,888,594 forward strand.
This transcript has 15 exons, is annotated with 27 domains and features and maps to 44 oligo probes.
This transcript is a product of gene ORUFI08G02620 Show transcript tableHide transcript table
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1 TCCACCCCGCCCGCCGCCGCTCCCTATTCCTATTTAATCCCATCTCTCTTCCTCATCACC 60 ............................................................ ............................................................ 61 GCTCTCCTCTCTCCAGGCAAGAGGAAGTACGCAACCTCAAGCCGGACAAGACGTGAGCAA 120 ............................................................ ............................................................ 121 AGATGGGCCCCACTAGTAGGAACCATAAATCATCTCAAAAAGATGTGGCACCGAATGAAG 180 ..ATGGGCCCCACTAGTAGGAACCATAAATCATCTCAAAAAGATGTGGCACCGAATGAAG 58 ..-M--G--P--T--S--R--N--H--K--S--S--Q--K--D--V--A--P--N--E-- 19 181 CCAAACCACCCCGATATCCACAGCGCAACCGCTCCATCACTGCCTCTGCCTCTGCCTCTG 240 59 CCAAACCACCCCGATATCCACAGCGCAACCGCTCCATCACTGCCTCTGCCTCTGCCTCTG 118 20 A--K--P--P--R--Y--P--Q--R--N--R--S--I--T--A--S--A--S--A--S-- 39 241 CCTTTGCCTCTCCCGCTGTTGCCAACTCCAGAGTTGCCAAGGAAAGGCCATCTTCATCAA 300 119 CCTTTGCCTCTCCCGCTGTTGCCAACTCCAGAGTTGCCAAGGAAAGGCCATCTTCATCAA 178 40 A--F--A--S--P--A--V--A--N--S--R--V--A--K--E--R--P--S--S--S-- 59 301 CTGCTGGTGAAGGTGAACCACAGGAAACGGTGCTAAAGCTTCCAAGCATCCCAACACTTC 360 179 CTGCTGGTGAAGGTGAACCACAGGAAACGGTGCTAAAGCTTCCAAGCATCCCAACACTTC 238 60 T--A--G--E--G--E--P--Q--E--T--V--L--K--L--P--S--I--P--T--L-- 79 361 CTGCACGGATGGCAAAGTTGGTGCCATTAGAGGGGTTGGGATGCGAGGCAGCGGTGGGAT 420 239 CTGCACGGATGGCAAAGTTGGTGCCATTAGAGGGGTTGGGATGCGAGGCAGCGGTGGGAT 298 80 P--A--R--M--A--K--L--V--P--L--E--G--L--G--C--E--A--A--V--G-- 99 421 CGCTAACACCGAGTCGGGAGCGAGAATACAAGGTGACCAACAAGCACACTGAGGGAAGGC 480 299 CGCTAACACCGAGTCGGGAGCGAGAATACAAGGTGACCAACAAGCACACTGAGGGAAGGC 358 100 S--L--T--P--S--R--E--R--E--Y--K--V--T--N--K--H--T--E--G--R-- 119 481 GCCCTGTCTACGCCATTGTCTTCAATTTCCTCGATGTTCGCTACTACGACATCTTCGCCA 540 359 GCCCTGTCTACGCCATTGTCTTCAATTTCCTCGATGTTCGCTACTACGACATCTTCGCCA 418 120 R--P--V--Y--A--I--V--F--N--F--L--D--V--R--Y--Y--D--I--F--A-- 139 541 CCGCCTGTGGCCCTCGTCTTTCAACCTACCGCTGCCTCATGAATGGCAAATTTGCTCTTC 600 419 CCGCCTGTGGCCCTCGTCTTTCAACCTACCGCTGCCTCATGAATGGCAAATTTGCTCTTC 478 140 T--A--C--G--P--R--L--S--T--Y--R--C--L--M--N--G--K--F--A--L-- 159 601 TGCAAAGCTATCTTGATGACGATATGAATGAGTCATTCTTCACTGTGAGCTGGGCTTGCG 660 479 TGCAAAGCTATCTTGATGACGATATGAATGAGTCATTCTTCACTGTGAGCTGGGCTTGCG 538 160 L--Q--S--Y--L--D--D--D--M--N--E--S--F--F--T--V--S--W--A--C-- 179 661 ACATTGATGGCAATCCATTGTTAGTAGCTGCAGGAAGCACTGGAATCATTCGAGTCATCA 720 539 ACATTGATGGCAATCCATTGTTAGTAGCTGCAGGAAGCACTGGAATCATTCGAGTCATCA 598 180 D--I--D--G--N--P--L--L--V--A--A--G--S--T--G--I--I--R--V--I-- 199 721 ACTGTGCCACTGAGAAGATATATAAGAGTCTTGTTGGCCATGGTGGTTCAGTAAACGAAA 780 599 ACTGTGCCACTGAGAAGATATATAAGAGTCTTGTTGGCCATGGTGGTTCAGTAAACGAAA 658 200 N--C--A--T--E--K--I--Y--K--S--L--V--G--H--G--G--S--V--N--E-- 219 781 TAAAGTCTCAACCATCGAATCCTTCACTCATCATTTCTGCAAGCAAGGATGAATCTATTA 840 659 TAAAGTCTCAACCATCGAATCCTTCACTCATCATTTCTGCAAGCAAGGATGAATCTATTA 718 220 I--K--S--Q--P--S--N--P--S--L--I--I--S--A--S--K--D--E--S--I-- 239 841 AGCTGTGGAATGTGCAGACAGGGATCTTAATTTTGGTTTTTGGTGGAGTAGGAGGTCACC 900 719 AGCTGTGGAATGTGCAGACAGGGATCTTAATTTTGGTTTTTGGTGGAGTAGGAGGTCACC 778 240 K--L--W--N--V--Q--T--G--I--L--I--L--V--F--G--G--V--G--G--H-- 259 901 GACACGAAGTACTTGGTGTTGACTTCCACACATCTGATATCTACCGCTTTTTAAGTTGTG 960 779 GACACGAAGTACTTGGTGTTGACTTCCACACATCTGATATCTACCGCTTTTTAAGTTGTG 838 260 R--H--E--V--L--G--V--D--F--H--T--S--D--I--Y--R--F--L--S--C-- 279 961 GAATGGACAACACTGTGAGAATCTGGTCAATGAAAGAATTCTGGGAATATGTTGAGAAAT 1020 839 GAATGGACAACACTGTGAGAATCTGGTCAATGAAAGAATTCTGGGAATATGTTGAGAAAT 898 280 G--M--D--N--T--V--R--I--W--S--M--K--E--F--W--E--Y--V--E--K-- 299 1021 CCTATTCATGGACTGATGCTACATCAAAATTTCCAACAAAATTTGTCCAATTTCCGGTCC 1080 899 CCTATTCATGGACTGATGCTACATCAAAATTTCCAACAAAATTTGTCCAATTTCCGGTCC 958 300 S--Y--S--W--T--D--A--T--S--K--F--P--T--K--F--V--Q--F--P--V-- 319 1081 TGTGTGCTGAAATACATTCTAACTATGTAGACTGTACTAAATGGCTTGGGGACTTTGTCC 1140 959 TGTGTGCTGAAATACATTCTAACTATGTAGACTGTACTAAATGGCTTGGGGACTTTGTCC 1018 320 L--C--A--E--I--H--S--N--Y--V--D--C--T--K--W--L--G--D--F--V-- 339 1141 TGTCAAAGAGTGTTGAAAATGAAATCTTGCTGTGGGAATCGATCACAAAAGAAGAAAACC 1200 1019 TGTCAAAGAGTGTTGAAAATGAAATCTTGCTGTGGGAATCGATCACAAAAGAAGAAAACC 1078 340 L--S--K--S--V--E--N--E--I--L--L--W--E--S--I--T--K--E--E--N-- 359 1201 CTGGCGAGGGTCACATTGATGTTCTTCAGAAGTACCCTGTGCCAGAATGTAACATCTGGT 1260 1079 CTGGCGAGGGTCACATTGATGTTCTTCAGAAGTACCCTGTGCCAGAATGTAACATCTGGT 1138 360 P--G--E--G--H--I--D--V--L--Q--K--Y--P--V--P--E--C--N--I--W-- 379 1261 TCATGAAATTCTCATGTGATTTTCACCACAATCAGTTGGCAATAGGAAACCGTGATGGTA 1320 1139 TCATGAAATTCTCATGTGATTTTCACCACAATCAGTTGGCAATAGGAAACCGTGATGGTA 1198 380 F--M--K--F--S--C--D--F--H--H--N--Q--L--A--I--G--N--R--D--G-- 399 1321 AAGTCTATGTCTGGAAAGTACAGACCAGCCCTCCTGTTCTAATTGCTCGGCTCAATAATC 1380 1199 AAGTCTATGTCTGGAAAGTACAGACCAGCCCTCCTGTTCTAATTGCTCGGCTCAATAATC 1258 400 K--V--Y--V--W--K--V--Q--T--S--P--P--V--L--I--A--R--L--N--N-- 419 1381 CACAAGTGAAATCAGCCATAAGGCAGACTGCAGTGTCCTTTGATGGAAGCACAATCCTTG 1440 1259 CACAAGTGAAATCAGCCATAAGGCAGACTGCAGTGTCCTTTGATGGAAGCACAATCCTTG 1318 420 P--Q--V--K--S--A--I--R--Q--T--A--V--S--F--D--G--S--T--I--L-- 439 1441 CCTGCACAGAGGATGGCAACATATGGCGTTGGGATGAAGTGGATCACCCAACCGCCCCAG 1500 1319 CCTGCACAGAGGATGGCAACATATGGCGTTGGGATGAAGTGGATCACCCAACCGCCCCAG 1378 440 A--C--T--E--D--G--N--I--W--R--W--D--E--V--D--H--P--T--A--P-- 459 1501 TCCCAAGCAAGAAACAAAAGTGAAGCAAGGATTATATTAATTGAAATTAATAAGGCTGAA 1560 1379 TCCCAAGCAAGAAACAAAAGTGA..................................... 1401 460 V--P--S--K--K--Q--K--*-..................................... 466 1561 TTGGCGATTTGTTCTTGGTATACTTTGTTATACTACTTTGCCTTAGCGTTCATCAAAACT 1620 ............................................................ ............................................................ 1621 GCCATTTGATTTTCCAACATTCAGAAAACTCTATAGCTGGATGTAAGATTTATTATCGCA 1680 ............................................................ ............................................................ 1681 AGATATTCAGGATGTTGGTCGGTGACTTGGTTTTATCAATAATTTGCTGGGAATATAGTA 1740 ............................................................ ............................................................ 1741 CTTAATCT 1748 ........ ........
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Ensembl Plants release 61 - May 2025 © EMBL-EBI EMBL-EBI
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