Oryza rufipogon (OR_W1943) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 7: 359,725-365,429 forward strand.
This transcript has 12 exons, is annotated with 15 domains and features and maps to 49 oligo probes.
This transcript is a product of gene ORUFI07G00530 Show transcript tableHide transcript table
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1 ATACTAGTACAATCCCTCCCCCTCCTCGTTCACGGCGACAACCCCGCCGCCGCCGCCGCC 60 ............................................................ ............................................................ 61 GCCTTTCGAGAGATTCCCCGGCGAGATGGCGCCTCCTCCCCCAAAAGAGCTTCCTGGCTT 120 .........................ATGGCGCCTCCTCCCCCAAAAGAGCTTCCTGGCTT 35 .........................-M--A--P--P--P--P--K--E--L--P--G--F 12 121 CTACTACGACCCGGACAAGAACCGCTACTTCCCCATCCGAGGTCCCATCCCCGGCGCCGC 180 36 CTACTACGACCCGGACAAGAACCGCTACTTCCCCATCCGAGGTCCCATCCCCGGCGCCGC 95 12 --Y--Y--D--P--D--K--N--R--Y--F--P--I--R--G--P--I--P--G--A--A 32 181 CACCCGCCGCCCTGCACTACCGCCTCCTGCCCAACCCCCGCCGCCCCAGGCTGCAGCAGC 240 96 CACCCGCCGCCCTGCACTACCGCCTCCTGCCCAACCCCCGCCGCCCCAGGCTGCAGCAGC 155 32 --T--R--R--P--A--L--P--P--P--A--Q--P--P--P--P--Q--A--A--A--A 52 241 TGGATGCAGGAAGACGGCGAGGCAGCCCGAGCTGGTCCACGCCAGGGAGATGTACGGCGG 300 156 TGGATGCAGGAAGACGGCGAGGCAGCCCGAGCTGGTCCACGCCAGGGAGATGTACGGCGG 215 52 --G--C--R--K--T--A--R--Q--P--E--L--V--H--A--R--E--M--Y--G--G 72 301 CGGGGTCATCTTCTCCAACAAGAGGAAGTCCACCTTCATGCGCCAGTGCCAGTACGCCCA 360 216 CGGGGTCATCTTCTCCAACAAGAGGAAGTCCACCTTCATGCGCCAGTGCCAGTACGCCCA 275 72 --G--V--I--F--S--N--K--R--K--S--T--F--M--R--Q--C--Q--Y--A--Q 92 361 GGCGTCTCAACCCATGGTTTGGAAGTACAAGGGCACGGCCTTGGTGGCTGACAAAGCACT 420 276 GGCGTCTCAACCCATGGTTTGGAAGTACAAGGGCACGGCCTTGGTGGCTGACAAAGCACT 335 92 --A--S--Q--P--M--V--W--K--Y--K--G--T--A--L--V--A--D--K--A--L 112 421 CGAAGAATTGTATGTGACGATTCAGACACCAATTGGACTGAAAGAATCCAAGGTGCTAGT 480 336 CGAAGAATTGTATGTGACGATTCAGACACCAATTGGACTGAAAGAATCCAAGGTGCTAGT 395 112 --E--E--L--Y--V--T--I--Q--T--P--I--G--L--K--E--S--K--V--L--V 132 481 GACCGGAAGCATGAATGGCATAGTTCGTTTATATGGACTAGGGACTGCTATAGCAAACAT 540 396 GACCGGAAGCATGAATGGCATAGTTCGTTTATATGGACTAGGGACTGCTATAGCAAACAT 455 132 --T--G--S--M--N--G--I--V--R--L--Y--G--L--G--T--A--I--A--N--I 152 541 TGAGGATGAGATGGAGTTTTTACCTGAACCTGCTTGGACTCCCTTGGTAAAGCAGAATGC 600 456 TGAGGATGAGATGGAGTTTTTACCTGAACCTGCTTGGACTCCCTTGGTAAAGCAGAATGC 515 152 --E--D--E--M--E--F--L--P--E--P--A--W--T--P--L--V--K--Q--N--A 172 601 ACCAGTGAATTCTGCACTTGCAAGCATCTGGTCATCTGAAACAGCTTTCTCAAAATTCTT 660 516 ACCAGTGAATTCTGCACTTGCAAGCATCTGGTCATCTGAAACAGCTTTCTCAAAATTCTT 575 172 --P--V--N--S--A--L--A--S--I--W--S--S--E--T--A--F--S--K--F--L 192 661 ATCAAGATCTGGAGAATCTGGTGGTTCTATACATATTATGGATCTGTCTGATACTATTGA 720 576 ATCAAGATCTGGAGAATCTGGTGGTTCTATACATATTATGGATCTGTCTGATACTATTGA 635 192 --S--R--S--G--E--S--G--G--S--I--H--I--M--D--L--S--D--T--I--D 212 721 CGTGGCAATGGGCTCGATGAATGCCTATGGAGGAAATATTATAGGAAATATTATACCGGT 780 636 CGTGGCAATGGGCTCGATGAATGCCTATGGAGGAAATATTATAGGAAATATTATACCGGT 695 212 --V--A--M--G--S--M--N--A--Y--G--G--N--I--I--G--N--I--I--P--V 232 781 TGCTTCATTTAATCGCACAATCTGGACAGCTGATTGTAATTCAGATGGCACACAGGCAGT 840 696 TGCTTCATTTAATCGCACAATCTGGACAGCTGATTGTAATTCAGATGGCACACAGGCAGT 755 232 --A--S--F--N--R--T--I--W--T--A--D--C--N--S--D--G--T--Q--A--V 252 841 CATAGGTACAAACAGTGGTGCTGCTTTTTTTGATTTGGAAAGAAGAGCATTATCATGGAT 900 756 CATAGGTACAAACAGTGGTGCTGCTTTTTTTGATTTGGAAAGAAGAGCATTATCATGGAT 815 252 --I--G--T--N--S--G--A--A--F--F--D--L--E--R--R--A--L--S--W--M 272 901 GTATCACTGCAAGAGTGACATTCTCTCCCAACAATTTATGCAATCGGGAAATGTTGTGCT 960 816 GTATCACTGCAAGAGTGACATTCTCTCCCAACAATTTATGCAATCGGGAAATGTTGTGCT 875 272 --Y--H--C--K--S--D--I--L--S--Q--Q--F--M--Q--S--G--N--V--V--L 292 961 ATGCGGCTTGAGGAATGGGAGCATATTTCCTCTTGATGTACGGCAAAAGCAACATAATCG 1020 876 ATGCGGCTTGAGGAATGGGAGCATATTTCCTCTTGATGTACGGCAAAAGCAACATAATCG 935 292 --C--G--L--R--N--G--S--I--F--P--L--D--V--R--Q--K--Q--H--N--R 312 1021 TCCTACCGAGCTAGCTTCACCTGGTACTGCTAGGAGGACTATTCCCCTGACACCCAGAAG 1080 936 TCCTACCGAGCTAGCTTCACCTGGTACTGCTAGGAGGACTATTCCCCTGACACCCAGAAG 995 312 --P--T--E--L--A--S--P--G--T--A--R--R--T--I--P--L--T--P--R--R 332 1081 GCATAATCGTTGGAGAAATCAGGCTGATAACGCTAAATCTTCAAGAGCTATTTCTATGTC 1140 996 GCATAATCGTTGGAGAAATCAGGCTGATAACGCTAAATCTTCAAGAGCTATTTCTATGTC 1055 332 --H--N--R--W--R--N--Q--A--D--N--A--K--S--S--R--A--I--S--M--S 352 1141 TTCAGCAGTTTGCAGCTTGGTGGTTCTCTCATCAGATGAGCACTACTTCTTAGGGAGCTC 1200 1056 TTCAGCAGTTTGCAGCTTGGTGGTTCTCTCATCAGATGAGCACTACTTCTTAGGGAGCTC 1115 352 --S--A--V--C--S--L--V--V--L--S--S--D--E--H--Y--F--L--G--S--S 372 1201 CATGGATGGATCTATCAAGCTATTCGATCTCCGTCTCATTCAGAAAGGGCCTATACAGTC 1260 1116 CATGGATGGATCTATCAAGCTATTCGATCTCCGTCTCATTCAGAAAGGGCCTATACAGTC 1175 372 --M--D--G--S--I--K--L--F--D--L--R--L--I--Q--K--G--P--I--Q--S 392 1261 TTATGCAGGGCATATAAATTCACATACTCATTTACCACTTGTTGTCGATCCCTCTGAAAC 1320 1176 TTATGCAGGGCATATAAATTCACATACTCATTTACCACTTGTTGTCGATCCCTCTGAAAC 1235 392 --Y--A--G--H--I--N--S--H--T--H--L--P--L--V--V--D--P--S--E--T 412 1321 CCTTCTTATGTCAGGTGGGGAAGACAGAATGGTTCGAATTTGGAGTATAAAAACGGGCGA 1380 1236 CCTTCTTATGTCAGGTGGGGAAGACAGAATGGTTCGAATTTGGAGTATAAAAACGGGCGA 1295 412 --L--L--M--S--G--G--E--D--R--M--V--R--I--W--S--I--K--T--G--E 432 1381 GCAAATATTTGCACAGAGTGTGGCTGGTTCACTATTCACGGCACTTTGCTGGCCAGAAAG 1440 1296 GCAAATATTTGCACAGAGTGTGGCTGGTTCACTATTCACGGCACTTTGCTGGCCAGAAAG 1355 432 --Q--I--F--A--Q--S--V--A--G--S--L--F--T--A--L--C--W--P--E--S 452 1441 CGGCTGCGACTTGCACAATTCTTCGCTGTTCGGTGTAAATCACAGTTGGGGGGCTTGGAT 1500 1356 CGGCTGCGACTTGCACAATTCTTCGCTGTTCGGTGTAAATCACAGTTGGGGGGCTTGGAT 1415 452 --G--C--D--L--H--N--S--S--L--F--G--V--N--H--S--W--G--A--W--M 472 1501 GGGATCGCGTGATGGTCTGTTCTATGTGCATGGTACTTAAGCGACTGATGGTACTGACTC 1560 1416 GGGATCGCGTGATGGTCTGTTCTATGTGCATGGTACTTAA.................... 1455 472 --G--S--R--D--G--L--F--Y--V--H--G--T--*-.................... 484 1561 AAGCCATGATGGCTCTACTGGTGTTATGTACATAAGCATATAAGGAGCGATGGACTGAGT 1620 ............................................................ ............................................................ 1621 TCTTTGCTGCTGGAGAGTTGACGCTAACGTTACTGGAGCTGTGTGCACTGATGAGAAGAG 1680 ............................................................ ............................................................ 1681 TCATCTCAATGTAGCCGATGTTATATAACCATGAGATAGATGTGTGCTCATTTTAACGTT 1740 ............................................................ ............................................................ 1741 TTTTTCTTTTTAATCTTATTATGATGATAGATTCTTAGGTCATGGGTGAGAGGTACTGGG 1800 ............................................................ ............................................................ 1801 AGCTATGTTCAGCATCATGTATGTGTTGAACCGCTTGTATTTTCGGTTATCCTTACAAGC 1860 ............................................................ ............................................................ 1861 TAACTATTCGTTGTAACAACCTGTGCATTTCATTTCATATCTCAGTTACCTCGTGCTAGT 1920 ............................................................ ............................................................ 1921 TGGGTGATGCCTGACTGACTGACTAGTTGGGTGCTGAAGCTAACGCACCAATCTGTTTCA 1980 ............................................................ ............................................................ 1981 ATCATCAAAATGCTGGGTGACTGTTCTTGGTGTCTGTATGTGTGTGCT 2028 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