Transcript: ORUFI06G06590.4
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- ORUFI06G06590.2 2121 542aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0PUQ5 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - ORUFI06G06590.1 2088 542aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0PUQ5 - - ORUFI06G06590.3 1629 542aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0PUQ5 - - ORUFI06G06590.4 1596 531aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0PUQ6 -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG ACT TCA CTC AAT AAA GTT GTT TCC AAT GGA GAT ACA AGG TCA ATG TTG CCA AAT AAA 60
1 ATGACTTCACTCAATAAAGTTGTTTCCAATGGAGATACAAGGTCAATGTTGCCAAATAAA 60
1 -M--T--S--L--N--K--V--V--S--N--G--D--T--R--S--M--L--P--N--K- 20
61 GTC ACA GCA TTG AAT CCC AAC GCA GCA GAA TTT GTA CCT TCA TGT ATT AGA CCA TCT TTT 120
61 GTCACAGCATTGAATCCCAACGCAGCAGAATTTGTACCTTCATGTATTAGACCATCTTTT 120
21 -V--T--A--L--N--P--N--A--A--E--F--V--P--S--C--I--R--P--S--F- 40
121 GAG AGT AGC GCT GTC TCA GAT GTA AGT AAG GCA GAT CTT AGG GCT TCT GGG AAA ACT ATC 180
121 GAGAGTAGCGCTGTCTCAGATGTAAGTAAGGCAGATCTTAGGGCTTCTGGGAAAACTATC 180
41 -E--S--S--A--V--S--D--V--S--K--A--D--L--R--A--S--G--K--T--I- 60
181 CTA GAT AGG TCC GAG TCA TCA AAG TCA AAT AAC TCG GAT GAT GAG GCA CAC CAG TTT TGG 240
181 CTAGATAGGTCCGAGTCATCAAAGTCAAATAACTCGGATGATGAGGCACACCAGTTTTGG 240
61 -L--D--R--S--E--S--S--K--S--N--N--S--D--D--E--A--H--Q--F--W- 80
241 CGT AAG CAG CTT CCT GAT GAC ATT ATT CCA GAC TTC AGT TTT GAG AAA ATT GAA CAA GAA 300
241 CGTAAGCAGCTTCCTGATGACATTATTCCAGACTTCAGTTTTGAGAAAATTGAACAAGAA 300
81 -R--K--Q--L--P--D--D--I--I--P--D--F--S--F--E--K--I--E--Q--E- 100
301 CCT GAA GAA TTG TCT CTT GCT GGA TTA TCC TTG AAT GCA CCC CCT TTC TAT GGA ACA ACA 360
301 CCTGAAGAATTGTCTCTTGCTGGATTATCCTTGAATGCACCCCCTTTCTATGGAACAACA 360
101 -P--E--E--L--S--L--A--G--L--S--L--N--A--P--P--F--Y--G--T--T- 120
361 GCT AGC CGC TTT TCA AGA GAG CAT GAT TTA TCT TCT CAA GCT AAC AAG AGC CTG GAA CTG 420
361 GCTAGCCGCTTTTCAAGAGAGCATGATTTATCTTCTCAAGCTAACAAGAGCCTGGAACTG 420
121 -A--S--R--F--S--R--E--H--D--L--S--S--Q--A--N--K--S--L--E--L- 140
421 GGG CTT ACC AGT TTA CTT TAT GAA GAT AAT TCA CAA GCA TCG TTT CCA ACT ATG GGT TCA 480
421 GGGCTTACCAGTTTACTTTATGAAGATAATTCACAAGCATCGTTTCCAACTATGGGTTCA 480
141 -G--L--T--S--L--L--Y--E--D--N--S--Q--A--S--F--P--T--M--G--S- 160
481 AGC AAT TGG GAG CAA AAT TTT GTA GGG GAT CTC CAT TTT ACG AAT GGA AAT CAG GGC CTT 540
481 AGCAATTGGGAGCAAAATTTTGTAGGGGATCTCCATTTTACGAATGGAAATCAGGGCCTT 540
161 -S--N--W--E--Q--N--F--V--G--D--L--H--F--T--N--G--N--Q--G--L- 180
541 CAT TAT GAT TCT GAA AGT GCT GCA GGC TTT TCT GAC AGT TTT GCT AGC GAT TAT GCT GCA 600
541 CATTATGATTCTGAAAGTGCTGCAGGCTTTTCTGACAGTTTTGCTAGCGATTATGCTGCA 600
181 -H--Y--D--S--E--S--A--A--G--F--S--D--S--F--A--S--D--Y--A--A- 200
601 GCA ACA GAC GAT GTT CTT GAC CCC CTA GCG TAT TTA GCT TCA CAG TTT CCT GAT TTT TCA 660
601 GCAACAGACGATGTTCTTGACCCCCTAGCGTATTTAGCTTCACAGTTTCCTGATTTTTCA 660
201 -A--T--D--D--V--L--D--P--L--A--Y--L--A--S--Q--F--P--D--F--S- 220
661 TCA GAG AGC CTT GCA GAG CTG TAC TAT GCT AAT GGA TGT GAC TTC AAC CAT ACT ATT GAA 720
661 TCAGAGAGCCTTGCAGAGCTGTACTATGCTAATGGATGTGACTTCAACCATACTATTGAA 720
221 -S--E--S--L--A--E--L--Y--Y--A--N--G--C--D--F--N--H--T--I--E- 240
721 ATC CTC ACC CAG CTA GAG ATG CAA GTT GAT GCT ACC TCC AAT CCA ACT CTG ACC CCC AGG 780
721 ATCCTCACCCAGCTAGAGATGCAAGTTGATGCTACCTCCAATCCAACTCTGACCCCCAGG 780
241 -I--L--T--Q--L--E--M--Q--V--D--A--T--S--N--P--T--L--T--P--R- 260
781 ACA CCA AAC TTT AGC ACA GGG GAC TTC CCC GCA CTG CCA ACA GTT GAA GAC CAA AAT GGT 840
781 ACACCAAACTTTAGCACAGGGGACTTCCCCGCACTGCCAACAGTTGAAGACCAAAATGGT 840
261 -T--P--N--F--S--T--G--D--F--P--A--L--P--T--V--E--D--Q--N--G- 280
841 TTT TCC AAA GGC AAT GCA GAT ATT CTA AGC ATC TTC AAT GGA CGC AGC TCA CCC TCT GTA 900
841 TTTTCCAAAGGCAATGCAGATATTCTAAGCATCTTCAATGGACGCAGCTCACCCTCTGTA 900
281 -F--S--K--G--N--A--D--I--L--S--I--F--N--G--R--S--S--P--S--V- 300
901 TCT ACT GGT ACT GGT GAT TTT GTT TCA GCT GTT CGC AAA CTT GCA TCG CAA AAT TCT GGC 960
901 TCTACTGGTACTGGTGATTTTGTTTCAGCTGTTCGCAAACTTGCATCGCAAAATTCTGGC 960
301 -S--T--G--T--G--D--F--V--S--A--V--R--K--L--A--S--Q--N--S--G- 320
961 CAT TGG AAG TAT AAG AAA GGT CCT GAA TAC GGT AAT GGT GTT TCA ACT GTT TCT GTA CCC 1020
961 CATTGGAAGTATAAGAAAGGTCCTGAATACGGTAATGGTGTTTCAACTGTTTCTGTACCC 1020
321 -H--W--K--Y--K--K--G--P--E--Y--G--N--G--V--S--T--V--S--V--P- 340
1021 AAG CAG TAC AGT TCT ACG ACC AAA ACA TCT TCT GGA AAC AAG TTT CAA AGT GTT AGC AGT 1080
1021 AAGCAGTACAGTTCTACGACCAAAACATCTTCTGGAAACAAGTTTCAAAGTGTTAGCAGT 1080
341 -K--Q--Y--S--S--T--T--K--T--S--S--G--N--K--F--Q--S--V--S--S- 360
1081 GCA AGA GCT GCT CCA TGG CTC GAA ACT GGA GAT GCA GTA G CA AAC ATG TAC TCA GAA TCA 1140
1081 GCAAGAGCTGCTCCATGGCTCGAAACTGGAGATGCAGTAGCAAACATGTACTCAGAATCA 1140
361 -A--R--A--A--P--W--L--E--T--G--D--A--V--A--N--M--Y--S--E--S- 380
1141 AGG GGA GAA GCC CGT GAT TTT GCC CGC ATC CGA AAT GCA TGT TTT GAG CAG G CT AGA CAG 1200
1141 AGGGGAGAAGCCCGTGATTTTGCCCGCATCCGAAATGCATGTTTTGAGCAGGCTAGACAG 1200
381 -R--G--E--A--R--D--F--A--R--I--R--N--A--C--F--E--Q--A--R--Q- 400
1201 GCT TAC CTG ATT GGC AAC AAA GCT CTA GCC AAG GAA TTG AGT ATG AAG GGA CAG ACA TAT 1260
1201 GCTTACCTGATTGGCAACAAAGCTCTAGCCAAGGAATTGAGTATGAAGGGACAGACATAT 1260
401 -A--Y--L--I--G--N--K--A--L--A--K--E--L--S--M--K--G--Q--T--Y- 420
1261 AAC ACA CAA ATG AAA GCA TCT CAT GAG AAA GCA AGA GAA GCT ATT TAT CGA CAG AG G AAC 1320
1261 AACACACAAATGAAAGCATCTCATGAGAAAGCAAGAGAAGCTATTTATCGACAGAGGAAC 1320
421 -N--T--Q--M--K--A--S--H--E--K--A--R--E--A--I--Y--R--Q--R--N- 440
1321 CCA TCT TCG CAA CGA GGG AGC GAC CGT CTG ATC GAT CTA CAT GGT CTC CAT GTG AAC GAA 1380
1321 CCATCTTCGCAACGAGGGAGCGACCGTCTGATCGATCTACATGGTCTCCATGTGAACGAA 1380
441 -P--S--S--Q--R--G--S--D--R--L--I--D--L--H--G--L--H--V--N--E- 460
1381 GCA ATC CAT ATA CTT AAG GTC GAG CTC GGT ACT CTT AAG AGC ACC GCG AGG GCT ACA GGT 1440
1381 GCAATCCATATACTTAAGGTCGAGCTCGGTACTCTTAAGAGCACCGCGAGGGCTACAGGT 1440
461 -A--I--H--I--L--K--V--E--L--G--T--L--K--S--T--A--R--A--T--G- 480
1441 GAG AGG ATG CAA GTC ATG ATA TGT GTC GGG ACA GGT CAT CAC ACC AAG GGT TCT CGC ACC 1500
1441 GAGAGGATGCAAGTCATGATATGTGTCGGGACAGGTCATCACACCAAGGGTTCTCGCACC 1500
481 -E--R--M--Q--V--M--I--C--V--G--T--G--H--H--T--K--G--S--R--T- 500
1501 GCC AGG CTG CCC ATC GCC GTC GAG CAG TTT CTT CTG GAG GAA GGC CTC CAC TAC ACG CAG 1560
1501 GCCAGGCTGCCCATCGCCGTCGAGCAGTTTCTTCTGGAGGAAGGCCTCCACTACACGCAG 1560
501 -A--R--L--P--I--A--V--E--Q--F--L--L--E--E--G--L--H--Y--T--Q- 520
1561 GCA CAA CCT GGT TTG CTC CGT GTT GTG GTG TTC TAA 1596
1561 GCACAACCTGGTTTGCTCCGTGTTGTGGTGTTCTAA 1596
521 -A--Q--P--G--L--L--R--V--V--V--F--*- 531
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