Transcript: ORUFI04G21020.5
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- ORUFI04G21020.1 2515 747aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0PBV1 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - ORUFI04G21020.2 2476 734aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0PBV2 - - ORUFI04G21020.3 2440 722aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0PBV3 - - ORUFI04G21020.5 2380 702aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0PBV5 - - ORUFI04G21020.4 2320 682aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0PBV4 -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 AGTCGCGCAGACAGGCAGCAGCTGACGCGCGCGCGGGGGCGAGGGCAGGAACCCGTCGCG 60
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............................................................
61 ATTGGGCGGACGACGAACCGGTCGCGCGCGGGCGCGTTCGGGAATCGTGGTGGATCTGAC 120
............................................................
............................................................
121 GCCACCACCGCCGCCGCCGCCGCCGCTCGGTTGCTCCTCTCCTCGCCGCGCCGTCGCGTG 180
............................................................
............................................................
181 CGTCGCCGTCGCCTCCTTGCCCCTAGCGGGCGGCCGGGCAATTCCCCGCGCGCCTGCTCG 240
............................................................
............................................................
241 ATCTGCCTCGGTGGTCAATGCGGGCGAGGAG ATG AGC GGC GCC GAG GAG GAG GAG GAG GA 300
...............................ATGAGCGGCGCCGAGGAGGAGGAGGAGGA 29
...............................-M--S--G--A--E--E--E--E--E--E 10
301 G GAG GAG GTG TTC TAT GAG GCG CGG GAC CGC GTG CTC TCC TCC TCC TCC TGC TCC TCC AC 360
30 GGAGGAGGTGTTCTATGAGGCGCGGGACCGCGTGCTCTCCTCCTCCTCCTGCTCCTCCAC 89
10 --E--E--V--F--Y--E--A--R--D--R--V--L--S--S--S--S--C--S--S--T 30
361 C TCG GCC TCG GAC GAC GAC GAC CAC CCG CCG GCG GCG GCG GCG GCG CTC GAC GTG TGG AC 420
90 CTCGGCCTCGGACGACGACGACCACCCGCCGGCGGCGGCGGCGGCGCTCGACGTGTGGAC 149
30 --S--A--S--D--D--D--D--H--P--P--A--A--A--A--A--L--D--V--W--T 50
421 G TCG GAG CCA GCG CCC GTG CAG GAA CGA CGC CGG AGG CTT CTC CAG ATG ATG GGG CTC TC 480
150 GTCGGAGCCAGCGCCCGTGCAGGAACGACGCCGGAGGCTTCTCCAGATGATGGGGCTCTC 209
50 --S--E--P--A--P--V--Q--E--R--R--R--R--L--L--Q--M--M--G--L--S 70
481 C GGT GAC CCC TCT CTG GCG CGC CTC GAG ATG GGT CGA TCG GCC TCC TAC GAC GGG CCC AT 540
210 CGGTGACCCCTCTCTGGCGCGCCTCGAGATGGGTCGATCGGCCTCCTACGACGGGCCCAT 269
70 --G--D--P--S--L--A--R--L--E--M--G--R--S--A--S--Y--D--G--P--I 90
541 C CGG CCG GAG ACG GTG TCG CCC ATC TCC CGA TCC AGA TCG GAT GGC AGC GTG CCG GCC TC 600
270 CCGGCCGGAGACGGTGTCGCCCATCTCCCGATCCAGATCGGATGGCAGCGTGCCGGCCTC 329
90 --R--P--E--T--V--S--P--I--S--R--S--R--S--D--G--S--V--P--A--S 110
601 C GCC ACC AAG CCC CCG CTC GCG GCC CGG TCG CGC CAA ACA TCG TCC GAC TCC TCC GAG GC 660
330 CGCCACCAAGCCCCCGCTCGCGGCCCGGTCGCGCCAAACATCGTCCGACTCCTCCGAGGC 389
110 --A--T--K--P--P--L--A--A--R--S--R--Q--T--S--S--D--S--S--E--A 130
661 C ACG CCA GGG GGA GAT GAC GCG GAC CCC AGG TGC CTA ATC CGA AAC CTC GAC GAC GGC AG 720
390 CACGCCAGGGGGAGATGACGCGGACCCCAGGTGCCTAATCCGAAACCTCGACGACGGCAG 449
130 --T--P--G--G--D--D--A--D--P--R--C--L--I--R--N--L--D--D--G--S 150
721 C GAG TTC GTG GTG AAG GAG GAG TCC GCG CTC CGC GAG GTG GGC ACG GGG AGG CAG CTC AC 780
450 CGAGTTCGTGGTGAAGGAGGAGTCCGCGCTCCGCGAGGTGGGCACGGGGAGGCAGCTCAC 509
150 --E--F--V--V--K--E--E--S--A--L--R--E--V--G--T--G--R--Q--L--T 170
781 C ATG GAG GAG TTC GAC CTC TGC GTC GGT CGC TCC CCC ATC GTC CAG GAG CTC ATG CGC CG 840
510 CATGGAGGAGTTCGACCTCTGCGTCGGTCGCTCCCCCATCGTCCAGGAGCTCATGCGCCG 569
170 --M--E--E--F--D--L--C--V--G--R--S--P--I--V--Q--E--L--M--R--R 190
841 C CAG AAC GTG GCA AGC TCC GGT TCG AGC AAC GGA GCG TCC GCT CTC ATC CAG AGG TCC AG 900
570 CCAGAACGTGGCAAGCTCCGGTTCGAGCAACGGAGCGTCCGCTCTCATCCAGAGGTCCAG 629
190 --Q--N--V--A--S--S--G--S--S--N--G--A--S--A--L--I--Q--R--S--S 210
901 C TCT GAT TCA AGC AAC GGC GCG ACG CGC CAC AGG CGG CGC GGC AGC TGG CTC CGG AGC AT 960
630 CTCTGATTCAAGCAACGGCGCGACGCGCCACAGGCGGCGCGGCAGCTGGCTCCGGAGCAT 689
210 --S--D--S--S--N--G--A--T--R--H--R--R--R--G--S--W--L--R--S--I 230
961 C CGC AAC GTC GCT GGC TCC ATG GTG GTC GGC TCC CGC GAC CGC CGA AGC AGC GAC GAG AA 1020
690 CCGCAACGTCGCTGGCTCCATGGTGGTCGGCTCCCGCGACCGCCGAAGCAGCGACGAGAA 749
230 --R--N--V--A--G--S--M--V--V--G--S--R--D--R--R--S--S--D--E--K 250
1021 G GAC ACC TCC TCG GAA AAG GGA GGG CGT CGG TCC AGC TCA GCC ACA GAC GAC AGC CAG GA 1080
750 GGACACCTCCTCGGAAAAGGGAGGGCGTCGGTCCAGCTCAGCCACAGACGACAGCCAGGA 809
250 --D--T--S--S--E--K--G--G--R--R--S--S--S--A--T--D--D--S--Q--E 270
1081 A AGT GCC AGC GCC GTG CGC CGT GGC CCG GAG CGT GTC AAG GTA CGG CAG TAC GGG AAG AC 1140
810 AAGTGCCAGCGCCGTGCGCCGTGGCCCGGAGCGTGTCAAGGTACGGCAGTACGGGAAGAC 869
270 --S--A--S--A--V--R--R--G--P--E--R--V--K--V--R--Q--Y--G--K--T 290
1141 A TGC AAG GAG CTC AGT GGG CTG TTC ATG AAC CAG GAT ATA CAG GCG CAC AAC GGG TCC AT 1200
870 ATGCAAGGAGCTCAGTGGGCTGTTCATGAACCAGGATATACAGGCGCACAACGGGTCCAT 929
290 --C--K--E--L--S--G--L--F--M--N--Q--D--I--Q--A--H--N--G--S--I 310
1201 C TGG AGC ATA AAG TTT AGT CAC GAC GGG CGG TAC CTC GCG AGT GCT GGG GAG GAT TGC GT 1260
930 CTGGAGCATAAAGTTTAGTCACGACGGGCGGTACCTCGCGAGTGCTGGGGAGGATTGCGT 989
310 --W--S--I--K--F--S--H--D--G--R--Y--L--A--S--A--G--E--D--C--V 330
1261 G ATC CAT GTC TGG GAG GTG TCG GAG CTT GAG AGG AAA CGG GAG GGA AAT GGG GTG TGC AA 1320
990 GATCCATGTCTGGGAGGTGTCGGAGCTTGAGAGGAAACGGGAGGGAAATGGGGTGTGCAA 1049
330 --I--H--V--W--E--V--S--E--L--E--R--K--R--E--G--N--G--V--C--N 350
1321 T CAA CTT GTT GCC GTC GTG TGC AAT GGT TCG CCG GAG CCG ATA TTG GCA TTG GCA AGT GT 1380
1050 TCAACTTGTTGCCGTCGTGTGCAATGGTTCGCCGGAGCCGATATTGGCATTGGCAAGTGT 1109
350 --Q--L--V--A--V--V--C--N--G--S--P--E--P--I--L--A--L--A--S--V 370
1381 T GAT GGA AGC TGT TGG GAG AAG AAG CAT CGG GCT AGA ATC TTG GAA ACT CGG AAG TCT GC 1440
1110 TGATGGAAGCTGTTGGGAGAAGAAGCATCGGGCTAGAATCTTGGAAACTCGGAAGTCTGC 1169
370 --D--G--S--C--W--E--K--K--H--R--A--R--I--L--E--T--R--K--S--A 390
1441 G AGC TCT GAC CGG TTG ATG TTT CCA GAG CAT GTG TTC GCA CTA TCA GAA AAA CCG GTC AA 1500
1170 GAGCTCTGACCGGTTGATGTTTCCAGAGCATGTGTTCGCACTATCAGAAAAACCGGTCAA 1229
390 --S--S--D--R--L--M--F--P--E--H--V--F--A--L--S--E--K--P--V--K 410
1501 A ACT TTT GAG GGG CAT TCG GAG GAT GTG CTT GAT CTC TGC TGG TCT AAA TCT CAG T AC TT 1560
1230 AACTTTTGAGGGGCATTCGGAGGATGTGCTTGATCTCTGCTGGTCTAAATCTCAGTACTT 1289
410 --T--F--E--G--H--S--E--D--V--L--D--L--C--W--S--K--S--Q--Y--L 430
1561 A CTT TCA TCT TCA ATG GAT AAA ACA GTG AAG TTA TGG CAT ATG TCA AGA ACT TCA TGT TT 1620
1290 ACTTTCATCTTCAATGGATAAAACAGTGAAGTTATGGCATATGTCAAGAACTTCATGTTT 1349
430 --L--S--S--S--M--D--K--T--V--K--L--W--H--M--S--R--T--S--C--L 450
1621 G AAA ACA TTT TCA CAT AGT GAC TAT G T G ACA TGC ATC CAA TTC AAC CCT GTT GAT GAT AG 1680
1350 GAAAACATTTTCACATAGTGACTATGTGACATGCATCCAATTCAACCCTGTTGATGATAG 1409
450 --K--T--F--S--H--S--D--Y--V--T--C--I--Q--F--N--P--V--D--D--R 470
1681 A TAC TTC ATT AGT GGT TCT CTG GAT GAA AAG GTT CGC ATA TGG AGC ATT CCG GGA CGT GA 1740
1410 ATACTTCATTAGTGGTTCTCTGGATGAAAAGGTTCGCATATGGAGCATTCCGGGACGTGA 1469
470 --Y--F--I--S--G--S--L--D--E--K--V--R--I--W--S--I--P--G--R--E 490
1741 A ATT GTT GAT TGG AAT GAT CTG CAT GAA ATG GTC ACT GCT GCT TGC TAT ACA CCT GAT GG 1800
1470 AATTGTTGATTGGAATGATCTGCATGAAATGGTCACTGCTGCTTGCTATACACCTGATGG 1529
490 --I--V--D--W--N--D--L--H--E--M--V--T--A--A--C--Y--T--P--D--G 510
1801 A CAG AGA GCA TTA GTC GGT TCC CAC AAG GGC AGC TGT CAT ATT TAT GAT ACA TCT GGT AT 1860
1530 ACAGAGAGCATTAGTCGGTTCCCACAAGGGCAGCTGTCATATTTATGATACATCTGGTAT 1589
510 --Q--R--A--L--V--G--S--H--K--G--S--C--H--I--Y--D--T--S--G--I 530
1861 A TCT CAC CCT CTC ATG ATC CTC ATA TCT TAT GA G TTT TCG AAA TAC CAA CAG CCA AAT AT 1920
1590 ATCTCACCCTCTCATGATCCTCATATCTTATGAGTTTTCGAAATACCAACAGCCAAATAT 1649
530 --S--H--P--L--M--I--L--I--S--Y--E--F--S--K--Y--Q--Q--P--N--I 550
1921 C AGC TTG CCT GTC TTC GAA CGG GAG GGC AGA AGC AAG GCC GTT GTG TCT GTC ACA AAT TC 1980
1650 CAGCTTGCCTGTCTTCGAACGGGAGGGCAGAAGCAAGGCCGTTGTGTCTGTCACAAATTC 1709
550 --S--L--P--V--F--E--R--E--G--R--S--K--A--V--V--S--V--T--N--S 570
1981 G TAT GAA CAC TTC CAC TGC CAG GAT GTG ACT GTA GCT GTT GCT TTG CCA TCT GCT GGA TC 2040
1710 GTATGAACACTTCCACTGCCAGGATGTGACTGTAGCTGTTGCTTTGCCATCTGCTGGATC 1769
570 --Y--E--H--F--H--C--Q--D--V--T--V--A--V--A--L--P--S--A--G--S 590
2041 A GCA ATG ACG TCC AGA ACA AAT TCC AGG AAG ACC GAG GAG CAG GAT AGC ATA CCG CAG CA 2100
1770 AGCAATGACGTCCAGAACAAATTCCAGGAAGACCGAGGAGCAGGATAGCATACCGCAGCA 1829
590 --A--M--T--S--R--T--N--S--R--K--T--E--E--Q--D--S--I--P--Q--Q 610
2101 G CAC ACT CAA CCT GAC AAA CAG CAA GAT TCC TCT GAT TTC CAA TGC CTA AGC GGC AAC GG 2160
1830 GCACACTCAACCTGACAAACAGCAAGATTCCTCTGATTTCCAATGCCTAAGCGGCAACGG 1889
610 --H--T--Q--P--D--K--Q--Q--D--S--S--D--F--Q--C--L--S--G--N--G 630
2161 C CTA AGC ACT AGT TCA AAC CAC AGT GGT GAC AGA ACA TCT GCA ACT TGG CCT GAA GAG TT 2220
1890 CCTAAGCACTAGTTCAAACCACAGTGGTGACAGAACATCTGCAACTTGGCCTGAAGAGTT 1949
630 --L--S--T--S--S--N--H--S--G--D--R--T--S--A--T--W--P--E--E--L 650
2221 G ATG ACA CCA AGT AAG CAG AGC CCT CCG TCC AGT ACC AGC CTT CCC AAC GGT GCT GGC CA 2280
1950 GATGACACCAAGTAAGCAGAGCCCTCCGTCCAGTACCAGCCTTCCCAACGGTGCTGGCCA 2009
650 --M--T--P--S--K--Q--S--P--P--S--S--T--S--L--P--N--G--A--G--Q 670
2281 A GCA CCA AGC CGG TCG GCC TGG GGT TTA GTG ATC GTC ACG GCA GGC CGT GGA GGC CAG AT 2340
2010 AGCACCAAGCCGGTCGGCCTGGGGTTTAGTGATCGTCACGGCAGGCCGTGGAGGCCAGAT 2069
670 --A--P--S--R--S--A--W--G--L--V--I--V--T--A--G--R--G--G--Q--I 690
2341 C AGA GCA TTT CAG AAT TTT GGG TTT CCT GTT CGA GTA TAG 2380
2070 CAGAGCATTTCAGAATTTTGGGTTTCCTGTTCGAGTATAG 2109
690 --R--A--F--Q--N--F--G--F--P--V--R--V--*- 702
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