Oryza rufipogon (OR_W1943)
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This transcript has 2 exons, is annotated with 15 domains and features and maps to 56 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-ORUFI03G30020.11175272aa
 
Protein coding
A0A0E0NZB2 Ensembl Canonical
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     1 GCAAACCACTCGACTCCGAAGCTCCCACTCCCAGGGTTTTAGCTAGGGTTCTGTGTCCCC     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 CGCATCGCCGCCGCCGCCGCCGCGAGCCATGGCCGACGCCGCCGCCCCCGGAGAGGACGA    120
       ............................ATGGCCGACGCCGCCGCCCCCGGAGAGGACGA     32
       ............................-M--A--D--A--A--A--P--G--E--D--D     11

                                                                          
   121 CGCCGCGTGGGAGCGCGCCATCGCGGCGGCCGTCAAGAACGCCCCCTTCTCCGCCCCCAA    180
    33 CGCCGCGTGGGAGCGCGCCATCGCGGCGGCCGTCAAGAACGCCCCCTTCTCCGCCCCCAA     92
    11 --A--A--W--E--R--A--I--A--A--A--V--K--N--A--P--F--S--A--P--K     31

                                                                          
   181 GACCCTAACCCTCGACGGCGCCGTCAAGTCCACCACCGGCCGCCTCCCCTCGCCGTCGCT    240
    93 GACCCTAACCCTCGACGGCGCCGTCAAGTCCACCACCGGCCGCCTCCCCTCGCCGTCGCT    152
    31 --T--L--T--L--D--G--A--V--K--S--T--T--G--R--L--P--S--P--S--L     51

                                                                          
   241 CCTCGGCCGCTACCCGTCCCTCGAGGAGCTCTCCGTCGCCGGCGCCCGCCTCTCCTCGCT    300
   153 CCTCGGCCGCTACCCGTCCCTCGAGGAGCTCTCCGTCGCCGGCGCCCGCCTCTCCTCGCT    212
    51 --L--G--R--Y--P--S--L--E--E--L--S--V--A--G--A--R--L--S--S--L     71

                                                                          
   301 CGCGGGCCTCCCGCGCCTCCCGGCGCTCCGCCGCCTCTCCCTCCCCGACAACCGCCTCTC    360
   213 CGCGGGCCTCCCGCGCCTCCCGGCGCTCCGCCGCCTCTCCCTCCCCGACAACCGCCTCTC    272
    71 --A--G--L--P--R--L--P--A--L--R--R--L--S--L--P--D--N--R--L--S     91

                                                                          
   361 GGGGGCCGCCTCCCTCGCCGCCGTCGCCGAGTCCTGCGGCGCCACGCTCCGCCACCTCGA    420
   273 GGGGGCCGCCTCCCTCGCCGCCGTCGCCGAGTCCTGCGGCGCCACGCTCCGCCACCTCGA    332
    91 --G--A--A--S--L--A--A--V--A--E--S--C--G--A--T--L--R--H--L--D    111

                                                                          
   421 CCTCGGGAACAACCGCTTCGCCGACGTCGCCGAGCTGGCGCCGCTCGCGCCGCACGGGGT    480
   333 CCTCGGGAACAACCGCTTCGCCGACGTCGCCGAGCTGGCGCCGCTCGCGCCGCACGGGGT    392
   111 --L--G--N--N--R--F--A--D--V--A--E--L--A--P--L--A--P--H--G--V    131

                                                                          
   481 CGAGTCGCTCGACCTGTACCAGTGCCCCGTCACCAAGGCCAAGGGGTACAGGGACAAGGT    540
   393 CGAGTCGCTCGACCTGTACCAGTGCCCCGTCACCAAGGCCAAGGGGTACAGGGACAAGGT    452
   131 --E--S--L--D--L--Y--Q--C--P--V--T--K--A--K--G--Y--R--D--K--V    151

                                                                          
   541 GTTCGCGCTGATCCCCAGCCTCAAGTTCTTGGACGGCATGGACGCCGAGGGCAACGACTG    600
   453 GTTCGCGCTGATCCCCAGCCTCAAGTTCTTGGACGGCATGGACGCCGAGGGCAACGACTG    512
   151 --F--A--L--I--P--S--L--K--F--L--D--G--M--D--A--E--G--N--D--C    171

                                                                          
   601 CTTGGATTCCGACGACGAGGAGGATGAAGAGGAGGATGAGGGAGAGGAGGGTGAAGGGGA    660
   513 CTTGGATTCCGACGACGAGGAGGATGAAGAGGAGGATGAGGGAGAGGAGGGTGAAGGGGA    572
   171 --L--D--S--D--D--E--E--D--E--E--E--D--E--G--E--E--G--E--G--E    191

                                                                          
   661 AGGTGATGAAGAAGAAGAAGAGGAGGGTGGAGAGGAAGGGGAAGGTGATGAGGATGACGA    720
   573 AGGTGATGAAGAAGAAGAAGAGGAGGGTGGAGAGGAAGGGGAAGGTGATGAGGATGACGA    632
   191 --G--D--E--E--E--E--E--E--G--G--E--E--G--E--G--D--E--D--D--E    211

                                                                          
   721 AGAGGAAGGAGATGAAGAAGAGGATGAGGAAGAAGGTGAAGAGGAGGCTGAAGATGAAGA    780
   633 AGAGGAAGGAGATGAAGAAGAGGATGAGGAAGAAGGTGAAGAGGAGGCTGAAGATGAAGA    692
   211 --E--E--G--D--E--E--E--D--E--E--E--G--E--E--E--A--E--D--E--E    231

                                                                          
   781 GGATGAAGCTGGTGCCGATGAAGAAGATGAAAGCAAAGTGGCGAATGGAAGCAAAGGGTC    840
   693 GGATGAAGCTGGTGCCGATGAAGAAGATGAAAGCAAAGTGGCGAATGGAAGCAAAGGGTC    752
   231 --D--E--A--G--A--D--E--E--D--E--S--K--V--A--N--G--S--K--G--S    251

                                                                          
   841 TTCAGGATCAGCTCAGCCAAACAAAAGGAAGAGGGACAGTGAAGATGATGCTAACGGAGA    900
   753 TTCAGGATCAGCTCAGCCAAACAAAAGGAAGAGGGACAGTGAAGATGATGCTAACGGAGA    812
   251 --S--G--S--A--Q--P--N--K--R--K--R--D--S--E--D--D--A--N--G--D    271

                                                                          
   901 CAACTGATCTGGTTGGGTCTGGAAATGGTTGCGGCTGGTCGTTGGAGGCTTTTCCTCCAA    960
   813 CAACTGA.....................................................    819
   271 --N--*-.....................................................    272

                                                                          
   961 TGTTCTTTGGAGGGCTTTGAGCCTTTTGAGGCGTTTCCTTCTGTTGATGTAGAAGATTTA   1020
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1021 GCTGTTCTTTTTAGATGCCAAGTTGCCAAAGGTTTTCTAATTATAATTCAGGACTTGGAC   1080
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1081 ATATCCTGATGTACTACTGCACATTTCTGTGACTTTCCGATGCTGCTAATTGAAATACTG   1140
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1141 GTTCTGGGCCTGGTCATGCGGATGATGAACTAGCA                            1175
       ...................................                                
       ...................................