Transcript: ORUFI02G38490.1
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- ORUFI02G38490.1 2337 778aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0NMP4 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GCG CAG AGC AAC TGG GAA GCA GAT AAG AT G CTT GAT GTG TAT ATC TAT GAC TAT CTG 60
1 ATGGCGCAGAGCAACTGGGAAGCAGATAAGATGCTTGATGTGTATATCTATGACTATCTG 60
1 -M--A--Q--S--N--W--E--A--D--K--M--L--D--V--Y--I--Y--D--Y--L- 20
61 CTG AAG AGG AAC TTG CAG TCG ACG GCC AAG GCT TTC ATG GCG GAG GGA AAG GTC GCC GCT 120
61 CTGAAGAGGAACTTGCAGTCGACGGCCAAGGCTTTCATGGCGGAGGGAAAGGTCGCCGCT 120
21 -L--K--R--N--L--Q--S--T--A--K--A--F--M--A--E--G--K--V--A--A- 40
121 GAT CCA GTC G CA ATT GAT GCT CCT GGA GGG TTT CTC TTT GAG TGG TGG TCT GTT TTT TGG 180
121 GATCCAGTCGCAATTGATGCTCCTGGAGGGTTTCTCTTTGAGTGGTGGTCTGTTTTTTGG 180
41 -D--P--V--A--I--D--A--P--G--G--F--L--F--E--W--W--S--V--F--W- 60
181 GAT ATA TTT ATT GCA AGA ACA AAT GAG AAG CAT TCT GAG GTT GCA GCG GCA TAC CTA GAG 240
181 GATATATTTATTGCAAGAACAAATGAGAAGCATTCTGAGGTTGCAGCGGCATACCTAGAG 240
61 -D--I--F--I--A--R--T--N--E--K--H--S--E--V--A--A--A--Y--L--E- 80
241 G CA CAG CAA ATC AAA GCG AGA GAG CAC CAA CAG CAG ATG CAG ATG CAG CAG TTG CAA CTA 300
241 GCACAGCAAATCAAAGCGAGAGAGCACCAACAGCAGATGCAGATGCAGCAGTTGCAACTA 300
81 -A--Q--Q--I--K--A--R--E--H--Q--Q--Q--M--Q--M--Q--Q--L--Q--L- 100
301 ATA CAA CAC AGA CAT GCT CAA CTG CAG CGA ACT AAT GCA AGT CAT CCT TCA CTT AAT GGT 360
301 ATACAACACAGACATGCTCAACTGCAGCGAACTAATGCAAGTCATCCTTCACTTAATGGT 360
101 -I--Q--H--R--H--A--Q--L--Q--R--T--N--A--S--H--P--S--L--N--G- 120
361 CCA ATA AAC ACC CTA AAT TCT GAT GGC ATT CTG GGG CAT TCA ACA GCT AGT GTT TTG GCT 420
361 CCAATAAACACCCTAAATTCTGATGGCATTCTGGGGCATTCAACAGCTAGTGTTTTGGCT 420
121 -P--I--N--T--L--N--S--D--G--I--L--G--H--S--T--A--S--V--L--A- 140
421 GCC AAG ATG TAT GAA GAG CGC TTG AAG CAC CCT CAA TCC TTG GAC TCT GAG GGA TCA CAG 480
421 GCCAAGATGTATGAAGAGCGCTTGAAGCACCCTCAATCCTTGGACTCTGAGGGATCACAG 480
141 -A--K--M--Y--E--E--R--L--K--H--P--Q--S--L--D--S--E--G--S--Q- 160
481 CTT CTT GAT GCT AGT AGG ATG GCT CTT CTC AAG TCA GCT GCA ACA AAT CAT GCA GG G CAA 540
481 CTTCTTGATGCTAGTAGGATGGCTCTTCTCAAGTCAGCTGCAACAAATCATGCAGGGCAA 540
161 -L--L--D--A--S--R--M--A--L--L--K--S--A--A--T--N--H--A--G--Q- 180
541 TTA GTT CCC GGA ACT CCC GGA AAT GTG TCT ACA ACG CTG CAA CAA ATC CAG TCT AGG AAT 600
541 TTAGTTCCCGGAACTCCCGGAAATGTGTCTACAACGCTGCAACAAATCCAGTCTAGGAAT 600
181 -L--V--P--G--T--P--G--N--V--S--T--T--L--Q--Q--I--Q--S--R--N- 200
601 CAA CAA ACT ATG G AT ATA AAA AGT GAA GGT AAT ATG GGT GTT GCC CAA AGA TCT TTG CCC 660
601 CAACAAACTATGGATATAAAAAGTGAAGGTAATATGGGTGTTGCCCAAAGATCTTTGCCC 660
201 -Q--Q--T--M--D--I--K--S--E--G--N--M--G--V--A--Q--R--S--L--P- 220
661 ATG GAC CCA TCA TCC TTA TAT GGA CAG GGT ATT ATT CAG CCA AAA CCT GGA TTG GGC GGT 720
661 ATGGACCCATCATCCTTATATGGACAGGGTATTATTCAGCCAAAACCTGGATTGGGCGGT 720
221 -M--D--P--S--S--L--Y--G--Q--G--I--I--Q--P--K--P--G--L--G--G- 240
721 GCA G G A CTA AAC CAA GGA GTA AGC GGT CTA CCA TTG AAA GGG TGG CCA TTA ACT GGA ATT 780
721 GCAGGACTAAACCAAGGAGTAAGCGGTCTACCATTGAAAGGGTGGCCATTAACTGGAATT 780
241 -A--G--L--N--Q--G--V--S--G--L--P--L--K--G--W--P--L--T--G--I- 260
781 GAC CAA TTG CGA CCA AAT TTA GGT GCT CAA ATG CAG AAG CCA TTT CTT TCA ACA CAG TCA 840
781 GACCAATTGCGACCAAATTTAGGTGCTCAAATGCAGAAGCCATTTCTTTCAACACAGTCA 840
261 -D--Q--L--R--P--N--L--G--A--Q--M--Q--K--P--F--L--S--T--Q--S- 280
841 CAG TTT CAA CTT ATG TCA CCA CAG CAG CAG CAA CAA TTC TTA GCA CAG GCC CAA GCA CAA 900
841 CAGTTTCAACTTATGTCACCACAGCAGCAGCAACAATTCTTAGCACAGGCCCAAGCACAA 900
281 -Q--F--Q--L--M--S--P--Q--Q--Q--Q--Q--F--L--A--Q--A--Q--A--Q- 300
901 GGC AAT CTT AGC AAC TCA AGT AAC TAT GGG GAT TTG GAT CCC CGG AGA TAT ACA GCA CTA 960
901 GGCAATCTTAGCAACTCAAGTAACTATGGGGATTTGGATCCCCGGAGATATACAGCACTA 960
301 -G--N--L--S--N--S--S--N--Y--G--D--L--D--P--R--R--Y--T--A--L- 320
961 ACC AGG GGT GGC TTG AAT GGT AAG GAT GGA CAG CCT GCT GGA ACT GAT GGG TGT ATT AGT 1020
961 ACCAGGGGTGGCTTGAATGGTAAGGATGGACAGCCTGCTGGAACTGATGGGTGTATTAGT 1020
321 -T--R--G--G--L--N--G--K--D--G--Q--P--A--G--T--D--G--C--I--S- 340
1021 TCC CCA ATG CAA TCC AGT TCA CCC AAA GTT AGG TCA GAC CAA GAG TAT CTC ATA AAG GTA 1080
1021 TCCCCAATGCAATCCAGTTCACCCAAAGTTAGGTCAGACCAAGAGTATCTCATAAAGGTA 1080
341 -S--P--M--Q--S--S--S--P--K--V--R--S--D--Q--E--Y--L--I--K--V- 360
1081 CAA CAG ACA TCT TCC CAG CAA CCG CAG GAA CAG CAG CAG CAG CAG AGC CAG CAA CAA CAG 1140
1081 CAACAGACATCTTCCCAGCAACCGCAGGAACAGCAGCAGCAGCAGAGCCAGCAACAACAG 1140
361 -Q--Q--T--S--S--Q--Q--P--Q--E--Q--Q--Q--Q--Q--S--Q--Q--Q--Q- 380
1141 CAG CAG CAA AGC CAG CAA CAG CAA ATG CAA CAG AGC AAT AGA AAA AGA AAG CAA CCT ACA 1200
1141 CAGCAGCAAAGCCAGCAACAGCAAATGCAACAGAGCAATAGAAAAAGAAAGCAACCTACA 1200
381 -Q--Q--Q--S--Q--Q--Q--Q--M--Q--Q--S--N--R--K--R--K--Q--P--T- 400
1201 TCT TCA GGA GCA GCA AAT AGT ACT GGA ACA GGG AAT ACA GTT GGC CCT TCA ACC AAT TCT 1260
1201 TCTTCAGGAGCAGCAAATAGTACTGGAACAGGGAATACAGTTGGCCCTTCAACCAATTCT 1260
401 -S--S--G--A--A--N--S--T--G--T--G--N--T--V--G--P--S--T--N--S- 420
1261 CCA CCA TCT ACT CCA TCC ACG CAT ACC CCA GGA GAT GGA CTT GGG ATG CCT GGC AAT ATG 1320
1261 CCACCATCTACTCCATCCACGCATACCCCAGGAGATGGACTTGGGATGCCTGGCAATATG 1320
421 -P--P--S--T--P--S--T--H--T--P--G--D--G--L--G--M--P--G--N--M- 440
1321 CGC CAC GTC CCG AAA AAT TTA GTG ATG TAT GGT GCT GAC GGA ACA GGA CTA GCA TCC TCT 1380
1321 CGCCACGTCCCGAAAAATTTAGTGATGTATGGTGCTGACGGAACAGGACTAGCATCCTCT 1380
441 -R--H--V--P--K--N--L--V--M--Y--G--A--D--G--T--G--L--A--S--S- 460
1381 TCA AAC CAA ATG GAT GAT CTC GAG CCA TTT GGT GAT GTT GGC TCT TTG GAA GAT AAT GTT 1440
1381 TCAAACCAAATGGATGATCTCGAGCCATTTGGTGATGTTGGCTCTTTGGAAGATAATGTT 1440
461 -S--N--Q--M--D--D--L--E--P--F--G--D--V--G--S--L--E--D--N--V- 480
1441 GAA TCA TTC TTA GCC AAT GAT GAT GGA GAT GCA AGG GAT ATT TTT GCT GCA CTT AAA AGA 1500
1441 GAATCATTCTTAGCCAATGATGATGGAGATGCAAGGGATATTTTTGCTGCACTTAAAAGA 1500
481 -E--S--F--L--A--N--D--D--G--D--A--R--D--I--F--A--A--L--K--R- 500
1501 AGT CCT GCA GAG CCT AAC CCA GCG GCT TCA AAA G AT GGC AAG ATA TTG GCT AGC GCT GGA 1560
1501 AGTCCTGCAGAGCCTAACCCAGCGGCTTCAAAAGATGGCAAGATATTGGCTAGCGCTGGA 1560
501 -S--P--A--E--P--N--P--A--A--S--K--D--G--K--I--L--A--S--A--G- 520
1561 CAT GAA AAG AAG G CT GTA CTT TGG AAC ATG GAC ACC TTC CAG AGC CAG TAT ACA TCA GAA 1620
1561 CATGAAAAGAAGGCTGTACTTTGGAACATGGACACCTTCCAGAGCCAGTATACATCAGAA 1620
521 -H--E--K--K--A--V--L--W--N--M--D--T--F--Q--S--Q--Y--T--S--E- 540
1621 GAA CAC AGC CTC ATA ATT ACT GAT GTC CGT TTC CGG CCT AAT TCT TCC CAG CTG GCA ACA 1680
1621 GAACACAGCCTCATAATTACTGATGTCCGTTTCCGGCCTAATTCTTCCCAGCTGGCAACA 1680
541 -E--H--S--L--I--I--T--D--V--R--F--R--P--N--S--S--Q--L--A--T- 560
1681 TCA TCC TTT GAT AGA ACT ATT AAG CTG TGG AAT GCT GCA GAT C CT GGA TTC TGT TTG CAT 1740
1681 TCATCCTTTGATAGAACTATTAAGCTGTGGAATGCTGCAGATCCTGGATTCTGTTTGCAT 1740
561 -S--S--F--D--R--T--I--K--L--W--N--A--A--D--P--G--F--C--L--H- 580
1741 ACG TTT GTT GGG CAT AAT GTC CAA GTC ACA TCT TTA GAT TTT CAT CCA AAG AAG ACG GAC 1800
1741 ACGTTTGTTGGGCATAATGTCCAAGTCACATCTTTAGATTTTCATCCAAAGAAGACGGAC 1800
581 -T--F--V--G--H--N--V--Q--V--T--S--L--D--F--H--P--K--K--T--D- 600
1801 CTT TTG TGC TCT TGT GAT GGC AAT GGT GAA ATC CGG TAC TGG AAT CTG ACC CAG CTT AGC 1860
1801 CTTTTGTGCTCTTGTGATGGCAATGGTGAAATCCGGTACTGGAATCTGACCCAGCTTAGC 1860
601 -L--L--C--S--C--D--G--N--G--E--I--R--Y--W--N--L--T--Q--L--S- 620
1861 TGC ATG CGT GCC ATG AAG G GA GGT ACT GCC CAA GTT CGA TTC CAA CCT AAC ACT GGA CAG 1920
1861 TGCATGCGTGCCATGAAGGGAGGTACTGCCCAAGTTCGATTCCAACCTAACACTGGACAG 1920
621 -C--M--R--A--M--K--G--G--T--A--Q--V--R--F--Q--P--N--T--G--Q- 640
1921 TTT CTC GCA GCT GCT GCG GAG ACT ATG GTT GCC ATT TTT GAT GTT GAA ACG CAC AGC AAA 1980
1921 TTTCTCGCAGCTGCTGCGGAGACTATGGTTGCCATTTTTGATGTTGAAACGCACAGCAAA 1980
641 -F--L--A--A--A--A--E--T--M--V--A--I--F--D--V--E--T--H--S--K- 660
1981 AAA TAC ACA CTA CAG G GC CAT AAC ACA GAT GTG CAA TCA GTG TGT TGG GAC AGC AGT GGG 2040
1981 AAATACACACTACAGGGCCATAACACAGATGTGCAATCAGTGTGTTGGGACAGCAGTGGG 2040
661 -K--Y--T--L--Q--G--H--N--T--D--V--Q--S--V--C--W--D--S--S--G- 680
2041 GAG TAC CTT GCC TCT GTC AGT CAG GAC TTG GTT AAG GTC TGG TCA ATA TCA TCA GGA GAG 2100
2041 GAGTACCTTGCCTCTGTCAGTCAGGACTTGGTTAAGGTCTGGTCAATATCATCAGGAGAG 2100
681 -E--Y--L--A--S--V--S--Q--D--L--V--K--V--W--S--I--S--S--G--E- 700
2101 TGC ATT CAT GAG GTT AGC TCC AAT GGA AAC AAG TTC CAC TCT TGT GTG TTC CAC CCA AGC 2160
2101 TGCATTCATGAGGTTAGCTCCAATGGAAACAAGTTCCACTCTTGTGTGTTCCACCCAAGC 2160
701 -C--I--H--E--V--S--S--N--G--N--K--F--H--S--C--V--F--H--P--S- 720
2161 TAT GCC AAT CTC CTT GTT ATT GGA GGC TAC CAG T CC CTG GAG CTA TGG AAC ATG GTA AAG 2220
2161 TATGCCAATCTCCTTGTTATTGGAGGCTACCAGTCCCTGGAGCTATGGAACATGGTAAAG 2220
721 -Y--A--N--L--L--V--I--G--G--Y--Q--S--L--E--L--W--N--M--V--K- 740
2221 AAC CAG AGC ATG ACG ATA CAA GCC CAT GAA GGT CTA ATT GCG GCC TTG GCG CAA TCG CCA 2280
2221 AACCAGAGCATGACGATACAAGCCCATGAAGGTCTAATTGCGGCCTTGGCGCAATCGCCA 2280
741 -N--Q--S--M--T--I--Q--A--H--E--G--L--I--A--A--L--A--Q--S--P- 760
2281 GTG AAC GGG ACG GTG GCT TCT GCG AGC CAC GAC AAC TCT GTC AAG TTG TGG AAG TAA 2337
2281 GTGAACGGGACGGTGGCTTCTGCGAGCCACGACAACTCTGTCAAGTTGTGGAAGTAA 2337
761 -V--N--G--T--V--A--S--A--S--H--D--N--S--V--K--L--W--K--*- 778
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