Oryza punctata (Oryza_punctata_v1.2) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 11: 7,607,092-7,610,483 reverse strand.
This transcript has 5 exons, is annotated with 10 domains and features and maps to 17 oligo probes.
This transcript is a product of gene OPUNC11G07440 Show transcript tableHide transcript table
.
1 ATGGCGGTGCGGAGGCGGGCGTCAGCGGTGGCCGTGCACGGCGGCCGGGTGCCGAAGCGG 60 1 ATGGCGGTGCGGAGGCGGGCGTCAGCGGTGGCCGTGCACGGCGGCCGGGTGCCGAAGCGG 60 1 -M--A--V--R--R--R--A--S--A--V--A--V--H--G--G--R--V--P--K--R- 20 61 GCGCGGGTGACGGCGGAGCCGTCGCTGCTCGAGATGCGGGCGTTTCCCGGGCGGAACAAG 120 61 GCGCGGGTGACGGCGGAGCCGTCGCTGCTCGAGATGCGGGCGTTTCCCGGGCGGAACAAG 120 21 -A--R--V--T--A--E--P--S--L--L--E--M--R--A--F--P--G--R--N--K- 40 121 GAGGAGGAGCCGGCGCGCGGAGGCGGGCAGTCGTCGTTCCGAGCCCGGGTGCGGGGGTTC 180 121 GAGGAGGAGCCGGCGCGCGGAGGCGGGCAGTCGTCGTTCCGAGCCCGGGTGCGGGGGTTC 180 41 -E--E--E--P--A--R--G--G--G--Q--S--S--F--R--A--R--V--R--G--F- 60 181 CTGGCGCGGTGCGCGGTGGCGGCGGCGCCGACGGAGATGGATGAATTGTCGCCGGGCATG 240 181 CTGGCGCGGTGCGCGGTGGCGGCGGCGCCGACGGAGATGGATGAATTGTCGCCGGGCATG 240 61 -L--A--R--C--A--V--A--A--A--P--T--E--M--D--E--L--S--P--G--M- 80 241 TCGTCGTGGCATGTGGGATTTACCACCGCCGAGGCGGTGGCGGTGATGGAGGTGGTGGAG 300 241 TCGTCGTGGCATGTGGGATTTACCACCGCCGAGGCGGTGGCGGTGATGGAGGTGGTGGAG 300 81 -S--S--W--H--V--G--F--T--T--A--E--A--V--A--V--M--E--V--V--E- 100 301 GAGGAGGTGGCCAGGTCCAGGCGGGTCTACTGCGAGCACTGCACTGTCGCCGGCTGGAGC 360 301 GAGGAGGTGGCCAGGTCCAGGCGGGTCTACTGCGAGCACTGCACTGTCGCCGGCTGGAGC 360 101 -E--E--V--A--R--S--R--R--V--Y--C--E--H--C--T--V--A--G--W--S- 120 361 AAGCACCCCGTTTGCTCCAAGAGGTACCACTTCATAATTCGCAATGAGAATGAAATCGGC 420 361 AAGCACCCCGTTTGCTCCAAGAGGTACCACTTCATAATTCGCAATGAGAATGAAATCGGC 420 121 -K--H--P--V--C--S--K--R--Y--H--F--I--I--R--N--E--N--E--I--G- 140 421 ACCTCCAAAACCTGCAGGCGTTGCGGGTTCATGGTGGCACTGCAGGAAACAAGATGTCCG 480 421 ACCTCCAAAACCTGCAGGCGTTGCGGGTTCATGGTGGCACTGCAGGAAACAAGATGTCCG 480 141 -T--S--K--T--C--R--R--C--G--F--M--V--A--L--Q--E--T--R--C--P- 160 481 TCCTGCAATCATGTTGGCCTCTCACGTGATGATCCGGAAGATTGGGACTATGTGCAGCTG 540 481 TCCTGCAATCATGTTGGCCTCTCACGTGATGATCCGGAAGATTGGGACTATGTGCAGCTG 540 161 -S--C--N--H--V--G--L--S--R--D--D--P--E--D--W--D--Y--V--Q--L- 180 541 GAGAGTCCACGGCATTTGCTGCATGGCATAGTCCATGAAAACGGGTTTGGCCACCTTGTT 600 541 GAGAGTCCACGGCATTTGCTGCATGGCATAGTCCATGAAAACGGGTTTGGCCACCTTGTT 600 181 -E--S--P--R--H--L--L--H--G--I--V--H--E--N--G--F--G--H--L--V- 200 601 CGGATTAATGGCCGTGAGGGAGGCTCCAGCGTCATGACAGGATCCCAACTGATGAACTTC 660 601 CGGATTAATGGCCGTGAGGGAGGCTCCAGCGTCATGACAGGATCCCAACTGATGAACTTC 660 201 -R--I--N--G--R--E--G--G--S--S--V--M--T--G--S--Q--L--M--N--F- 220 661 TGGGATCAGCTCTGCAGATACCTCAGGGTTAGAAAAGTCTCAGTGATGGATGTTTCGAAG 720 661 TGGGATCAGCTCTGCAGATACCTCAGGGTTAGAAAAGTCTCAGTGATGGATGTTTCGAAG 720 221 -W--D--Q--L--C--R--Y--L--R--V--R--K--V--S--V--M--D--V--S--K- 240 721 AAGTATGGATCTGACTACCGAAGTCTCCATGCTGTTGCCACTGGCTGTTCTTGGTATGGC 780 721 AAGTATGGATCTGACTACCGAAGTCTCCATGCTGTTGCCACTGGCTGTTCTTGGTATGGC 780 241 -K--Y--G--S--D--Y--R--S--L--H--A--V--A--T--G--C--S--W--Y--G- 260 781 CTGTGGGGATTCAAACTTAGCAGCGGAAGCTTTGGAATCACACCTTTAGACTACTCCAAA 840 781 CTGTGGGGATTCAAACTTAGCAGCGGAAGCTTTGGAATCACACCTTTAGACTACTCCAAA 840 261 -L--W--G--F--K--L--S--S--G--S--F--G--I--T--P--L--D--Y--S--K- 280 841 GCTGTAGAAAGCCTATCCTCAGTGCCACTCTCTAATTTTTTCCCTCACTCCCGATCTCCT 900 841 GCTGTAGAAAGCCTATCCTCAGTGCCACTCTCTAATTTTTTCCCTCACTCCCGATCTCCT 900 281 -A--V--E--S--L--S--S--V--P--L--S--N--F--F--P--H--S--R--S--P- 300 901 CGAAACCAGTTACAAAATACCATTGCGTTCTACCAATCTCTCTCAAGGCACCCTCTCACC 960 901 CGAAACCAGTTACAAAATACCATTGCGTTCTACCAATCTCTCTCAAGGCACCCTCTCACC 960 301 -R--N--Q--L--Q--N--T--I--A--F--Y--Q--S--L--S--R--H--P--L--T- 320 961 ACAATCCGTGAACTGTTCGCCTGTATAATAGAGCTTGCCACCGGCAAGAGTGTGCACAAA 1020 961 ACAATCCGTGAACTGTTCGCCTGTATAATAGAGCTTGCCACCGGCAAGAGTGTGCACAAA 1020 321 -T--I--R--E--L--F--A--C--I--I--E--L--A--T--G--K--S--V--H--K- 340 1021 GAGAAAATGGCATATGATGCCCATTATCAGGAGGAATTCCCAGAAGAGGAATTACAGCGA 1080 1021 GAGAAAATGGCATATGATGCCCATTATCAGGAGGAATTCCCAGAAGAGGAATTACAGCGA 1080 341 -E--K--M--A--Y--D--A--H--Y--Q--E--E--F--P--E--E--E--L--Q--R- 360 1081 GCAACAGACATTGCTCTCAAAATTCTCCGTGCTGCAGATAGATGGGTTGCTACACGGACA 1140 1081 GCAACAGACATTGCTCTCAAAATTCTCCGTGCTGCAGATAGATGGGTTGCTACACGGACA 1140 361 -A--T--D--I--A--L--K--I--L--R--A--A--D--R--W--V--A--T--R--T- 380 1141 CTAAAGGCAGTTACGTCCCATCCAATTGGTTCGCCACAGCTGGTCGATTACTGCATCAAG 1200 1141 CTAAAGGCAGTTACGTCCCATCCAATTGGTTCGCCACAGCTGGTCGATTACTGCATCAAG 1200 381 -L--K--A--V--T--S--H--P--I--G--S--P--Q--L--V--D--Y--C--I--K- 400 1201 ACCCTTGGTGGTACAAGAACCGATGATGGGATGGTTGTTGCAGTTCGATGCAACAGTGAG 1260 1201 ACCCTTGGTGGTACAAGAACCGATGATGGGATGGTTGTTGCAGTTCGATGCAACAGTGAG 1260 401 -T--L--G--G--T--R--T--D--D--G--M--V--V--A--V--R--C--N--S--E- 420 1261 ATGAACACTGTAGAGTACAGGCTTACGACTGAAACCCTCTTCCCACCAAACAACGTGTGC 1320 1261 ATGAACACTGTAGAGTACAGGCTTACGACTGAAACCCTCTTCCCACCAAACAACGTGTGC 1320 421 -M--N--T--V--E--Y--R--L--T--T--E--T--L--F--P--P--N--N--V--C- 440 1321 ACCCTAACCCAAGACCACCTATTCCGTGACATTAAGTTCTTGTATGACGCACTTCTCTAC 1380 1321 ACCCTAACCCAAGACCACCTATTCCGTGACATTAAGTTCTTGTATGACGCACTTCTCTAC 1380 441 -T--L--T--Q--D--H--L--F--R--D--I--K--F--L--Y--D--A--L--L--Y- 460 1381 CCATACACAATGCATCCTTATATGCCAGAAGAAAATTATGAGCATGCCAAGAGGTCTGCA 1440 1381 CCATACACAATGCATCCTTATATGCCAGAAGAAAATTATGAGCATGCCAAGAGGTCTGCA 1440 461 -P--Y--T--M--H--P--Y--M--P--E--E--N--Y--E--H--A--K--R--S--A- 480 1441 ATGATCCTTTTGGACTGCAAGCAATTCATCAAGCATTATGATCTGGAAGAAGACTTCTTG 1500 1441 ATGATCCTTTTGGACTGCAAGCAATTCATCAAGCATTATGATCTGGAAGAAGACTTCTTG 1500 481 -M--I--L--L--D--C--K--Q--F--I--K--H--Y--D--L--E--E--D--F--L- 500 1501 CCTCAAAACCCATCCCAGTTGCACATTTGGTGCCAAGTGAAGCTAGCTGACCAGGTTGAT 1560 1501 CCTCAAAACCCATCCCAGTTGCACATTTGGTGCCAAGTGAAGCTAGCTGACCAGGTTGAT 1560 501 -P--Q--N--P--S--Q--L--H--I--W--C--Q--V--K--L--A--D--Q--V--D- 520 1561 GATCCACCTTGTATCCCAGCAGAGCTCATAACACTTCCACAAACAGCAACTATTGCTGAT 1620 1561 GATCCACCTTGTATCCCAGCAGAGCTCATAACACTTCCACAAACAGCAACTATTGCTGAT 1620 521 -D--P--P--C--I--P--A--E--L--I--T--L--P--Q--T--A--T--I--A--D- 540 1621 CTCAAAGGGGAGGCTGCGAGAGCATTTCGAGACATGTACCTAATGTTGCAGAGTTTTATA 1680 1621 CTCAAAGGGGAGGCTGCGAGAGCATTTCGAGACATGTACCTAATGTTGCAGAGTTTTATA 1680 541 -L--K--G--E--A--A--R--A--F--R--D--M--Y--L--M--L--Q--S--F--I- 560 1681 GCTGACCAGCTTCTTGATTGTGCAACTGCAAGCGAGACAACACAAATCAAGCTCTTGTTT 1740 1681 GCTGACCAGCTTCTTGATTGTGCAACTGCAAGCGAGACAACACAAATCAAGCTCTTGTTT 1740 561 -A--D--Q--L--L--D--C--A--T--A--S--E--T--T--Q--I--K--L--L--F- 580 1741 GGAGCAAAGGGGGCTGTCCGCATCAAAGGCAGGTGCATTGGCGGTGAAAGACGGTTTGCA 1800 1741 GGAGCAAAGGGGGCTGTCCGCATCAAAGGCAGGTGCATTGGCGGTGAAAGACGGTTTGCA 1800 581 -G--A--K--G--A--V--R--I--K--G--R--C--I--G--G--E--R--R--F--A- 600 1801 ATTTACCGGATGGAGAGGGGTGTGGACAAATGGACGGTTAAATGCTCCTGTGGAGCAAAG 1860 1801 ATTTACCGGATGGAGAGGGGTGTGGACAAATGGACGGTTAAATGCTCCTGTGGAGCAAAG 1860 601 -I--Y--R--M--E--R--G--V--D--K--W--T--V--K--C--S--C--G--A--K- 620 1861 GACGATGATGGTGAGAGAATGTTATCCTGTGACTCTTGCCATATGTGGATGCACACTAGG 1920 1861 GACGATGATGGTGAGAGAATGTTATCCTGTGACTCTTGCCATATGTGGATGCACACTAGG 1920 621 -D--D--D--G--E--R--M--L--S--C--D--S--C--H--M--W--M--H--T--R- 640 1921 TGTGCTGGAATCAGTGATTTTGATAGGGTTCCAAAGAGATATGTATGTAAATCATGTAAA 1980 1921 TGTGCTGGAATCAGTGATTTTGATAGGGTTCCAAAGAGATATGTATGTAAATCATGTAAA 1980 641 -C--A--G--I--S--D--F--D--R--V--P--K--R--Y--V--C--K--S--C--K- 660 1981 CTAACCCACAAGCCGAAGAGCAGTGGCCCTAGGCTCATGTATAGTAGTGCACCTTACAAA 2040 1981 CTAACCCACAAGCCGAAGAGCAGTGGCCCTAGGCTCATGTATAGTAGTGCACCTTACAAA 2040 661 -L--T--H--K--P--K--S--S--G--P--R--L--M--Y--S--S--A--P--Y--K- 680 2041 AGATGTAAGACTGGCACAGGTTCCTTTAGCAATGCAGCTGAAGGATTACTGCGGCCTCAC 2100 2041 AGATGTAAGACTGGCACAGGTTCCTTTAGCAATGCAGCTGAAGGATTACTGCGGCCTCAC 2100 681 -R--C--K--T--G--T--G--S--F--S--N--A--A--E--G--L--L--R--P--H- 700 2101 ATCAGCTAA 2109 2101 ATCAGCTAA 2109 701 -I--S--*- 702
.
.
Ensembl Plants release 61 - May 2025 © EMBL-EBI EMBL-EBI
.
.
![[RSS logo]](/i/rss_icon_16.png "Ensembl blog"){kind=icon}
![[twitter logo]](/i/twitter.png "Follow us on Twitter!")
