Transcript: OPUNC09G12300.2
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- OPUNC09G12300.2 2219 652aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0M2E8 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - OPUNC09G12300.1 2120 619aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0M2E7 -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 G CCAAGGGAGGAAAAAAAAACAAAAAACGAAGGAAAAAAAGGACAGTCGCATCGCGCCAC 60
............................................................
............................................................
61 CGCGGCGGGAGAGGCGTACGGCGCACCGGCCGGCCGTCGGATCTGCGCCGGCAACGCGTC 120
............................................................
............................................................
121 CCCCCACCGGATCCCCGCTGCCGGAGGTGGACGAGGCGGCGCTCCGGCCATTTCCCCGCC 180
............................................................
............................................................
181 CGCGAGCGCCCAGATCCGTCCCGCCG ACGAGAGGAGGAAGGCAAGAAGCAGATAAACGCA 240
............................................................
............................................................
241 GTTCCTTTCAGCCACTCT ATG TCC AGG GAC TTG GAT TGT CCT GTG CAG ACA CAG ATG GCC 300
..................ATGTCCAGGGACTTGGATTGTCCTGTGCAGACACAGATGGCC 42
..................-M--S--R--D--L--D--C--P--V--Q--T--Q--M--A- 14
301 ATT GCA GTA CTG AAT CGT AGC TTC AGC AGT GAA TAT CCT GCA AGT AGA ACT GAG GGG AGA 360
43 ATTGCAGTACTGAATCGTAGCTTCAGCAGTGAATATCCTGCAAGTAGAACTGAGGGGAGA 102
15 -I--A--V--L--N--R--S--F--S--S--E--Y--P--A--S--R--T--E--G--R- 34
361 TCA TGT AGT TGG AAA AGA TTC TTT GTC CAA ACT GAC AAT GGT TCT GTG CTG CCC ATT GAA 420
103 TCATGTAGTTGGAAAAGATTCTTTGTCCAAACTGACAATGGTTCTGTGCTGCCCATTGAA 162
35 -S--C--S--W--K--R--F--F--V--Q--T--D--N--G--S--V--L--P--I--E- 54
421 CTG GAG AAG GGA GAA AAT GCA CAT ACT GTG AAA AGG AAG CTC CAG GTA GCC CTC AAT GTA 480
163 CTGGAGAAGGGAGAAAATGCACATACTGTGAAAAGGAAGCTCCAGGTAGCCCTCAATGTA 222
55 -L--E--K--G--E--N--A--H--T--V--K--R--K--L--Q--V--A--L--N--V- 74
481 CCC ACA GAG GAG AGC TCA CTG ACC TTT GGT GAT CTG GTT CTG AAT AAT GAT CTC AGC AGT 540
223 CCCACAGAGGAGAGCTCACTGACCTTTGGTGATCTGGTTCTGAATAATGATCTCAGCAGT 282
75 -P--T--E--E--S--S--L--T--F--G--D--L--V--L--N--N--D--L--S--S- 94
541 ATT CGC AAC GAC TCA CCA CTG CTC CTA AGA AAG AAT CAG ATG CAT CGG AGC AGC TCC ACG 600
283 ATTCGCAACGACTCACCACTGCTCCTAAGAAAGAATCAGATGCATCGGAGCAGCTCCACG 342
95 -I--R--N--D--S--P--L--L--L--R--K--N--Q--M--H--R--S--S--S--T- 114
601 CCT TGC CTC TCT CCT ACT GGG CAT GAT GTG CAG CAG CAA GAT CGC AGT GAA CCC ATT GAA 660
343 CCTTGCCTCTCTCCTACTGGGCATGATGTGCAGCAGCAAGATCGCAGTGAACCCATTGAA 402
115 -P--C--L--S--P--T--G--H--D--V--Q--Q--Q--D--R--S--E--P--I--E- 134
661 ATC CTT GGA TGT TTG AGC CCC TCT TCT CAG ATG AAG CAG CTT GCT GAT GAT GTT GTG AAA 720
403 ATCCTTGGATGTTTGAGCCCCTCTTCTCAGATGAAGCAGCTTGCTGATGATGTTGTGAAA 462
135 -I--L--G--C--L--S--P--S--S--Q--M--K--Q--L--A--D--D--V--V--K- 154
721 GCC ATA AGG AAT GGT GTT GAC CCG GTA CCT GTT AAT AGT GGC ATG GGT GGT GCG TAC TAC 780
463 GCCATAAGGAATGGTGTTGACCCGGTACCTGTTAATAGTGGCATGGGTGGTGCGTACTAC 522
155 -A--I--R--N--G--V--D--P--V--P--V--N--S--G--M--G--G--A--Y--Y- 174
781 TTC AAG AAC ATT TAC GGG GAA CGT GTT GCA ATT GTC AAG CCA ACT GAT GAA GAG CCA TTT 840
523 TTCAAGAACATTTACGGGGAACGTGTTGCAATTGTCAAGCCAACTGATGAAGAGCCATTT 582
175 -F--K--N--I--Y--G--E--R--V--A--I--V--K--P--T--D--E--E--P--F- 194
841 GCT CCA AAT AAT CCT AAA GGT TTT GTG GGG AAG ACC CTT GGA CTG CCA GGC CTC AAA AGA 900
583 GCTCCAAATAATCCTAAAGGTTTTGTGGGGAAGACCCTTGGACTGCCAGGCCTCAAAAGA 642
195 -A--P--N--N--P--K--G--F--V--G--K--T--L--G--L--P--G--L--K--R- 214
901 TCT GTA CCC GTC GGT GAG ACT GGG CTC CGA GAG GTT GCT GCT TAC CTT CTT GAC CAT GAT 960
643 TCTGTACCCGTCGGTGAGACTGGGCTCCGAGAGGTTGCTGCTTACCTTCTTGACCATGAT 702
215 -S--V--P--V--G--E--T--G--L--R--E--V--A--A--Y--L--L--D--H--D- 234
961 AAC TTT GCA AAT GTC CCG CCC ACA ATG CTG GTC AAG ATC ACA CAC TCT GTG TTC AAT GTG 1020
703 AACTTTGCAAATGTCCCGCCCACAATGCTGGTCAAGATCACACACTCTGTGTTCAATGTG 762
235 -N--F--A--N--V--P--P--T--M--L--V--K--I--T--H--S--V--F--N--V- 254
1021 AAC GAC ACT GTG GGC TGC AAA AGT AAA GTC TTC CAC AAC AAA CTG CAG GCC GTG AGC AAG 1080
763 AACGACACTGTGGGCTGCAAAAGTAAAGTCTTCCACAACAAACTGCAGGCCGTGAGCAAG 822
255 -N--D--T--V--G--C--K--S--K--V--F--H--N--K--L--Q--A--V--S--K- 274
1081 CTT GCA TCA TTG CAG CAA TTT ATT GCT CAT GAT TAT GAT GCT AGC GAC CAT GGG ACG TCA 1140
823 CTTGCATCATTGCAGCAATTTATTGCTCATGATTATGATGCTAGCGACCATGGGACGTCA 882
275 -L--A--S--L--Q--Q--F--I--A--H--D--Y--D--A--S--D--H--G--T--S- 294
1141 AGC TTC CCT GTA TCT GCA GTG CAC AGG ATT GGC ATA CTT GAC ATC AGA ATA TTC AAC ACG 1200
883 AGCTTCCCTGTATCTGCAGTGCACAGGATTGGCATACTTGACATCAGAATATTCAACACG 942
295 -S--F--P--V--S--A--V--H--R--I--G--I--L--D--I--R--I--F--N--T- 314
1201 GAC AGG CAC GCA GGA AAT CTT CTG GTT AGG AAG CTT GGC CCT GGG CCT GAC AAT TTT GGA 1260
943 GACAGGCACGCAGGAAATCTTCTGGTTAGGAAGCTTGGCCCTGGGCCTGACAATTTTGGA 1002
315 -D--R--H--A--G--N--L--L--V--R--K--L--G--P--G--P--D--N--F--G- 334
1261 GTG CAG ACT GAG CTA ATT CCT ATT GAT CAT GGT CTC TGT CTT CCA GAA TGT CTA GAA GAC 1320
1003 GTGCAGACTGAGCTAATTCCTATTGATCATGGTCTCTGTCTTCCAGAATGTCTAGAAGAC 1062
335 -V--Q--T--E--L--I--P--I--D--H--G--L--C--L--P--E--C--L--E--D- 354
1321 CCT TAC TTT GAA TGG ATC CAC TGG CCA CAG GCA TCC ATT CCT TTC ACT GAG GAG GAA CTC 1380
1063 CCTTACTTTGAATGGATCCACTGGCCACAGGCATCCATTCCTTTCACTGAGGAGGAACTC 1122
355 -P--Y--F--E--W--I--H--W--P--Q--A--S--I--P--F--T--E--E--E--L- 374
1381 GAA TAC ATT GCA AAT CTG GAT CCT GTA AAA GAT GCT GAA ATG CTT CGG ATG GAG CTG CCC 1440
1123 GAATACATTGCAAATCTGGATCCTGTAAAAGATGCTGAAATGCTTCGGATGGAGCTGCCC 1182
375 -E--Y--I--A--N--L--D--P--V--K--D--A--E--M--L--R--M--E--L--P- 394
1441 TTT ATC CGT GGA GCA TGT CTG AGG GTG CTG GTG CTA TCA ACA ATA TTT CTC AAA GAA GCT 1500
1183 TTTATCCGTGGAGCATGTCTGAGGGTGCTGGTGCTATCAACAATATTTCTCAAAGAAGCT 1242
395 -F--I--R--G--A--C--L--R--V--L--V--L--S--T--I--F--L--K--E--A- 414
1501 GCA GCA TTT GGC CTC TGC TTG TCA GAG ATA GGA GAG ATG ATG AGT AGG CAG TTC ACT GGG 1560
1243 GCAGCATTTGGCCTCTGCTTGTCAGAGATAGGAGAGATGATGAGTAGGCAGTTCACTGGG 1302
415 -A--A--F--G--L--C--L--S--E--I--G--E--M--M--S--R--Q--F--T--G- 434
1561 AAA GAA GAG GAG CCA AGT GAG CTT GAG CTT CTT TGC ATG GAG GCA AGG AAG TGG GTC AAG 1620
1303 AAAGAAGAGGAGCCAAGTGAGCTTGAGCTTCTTTGCATGGAGGCAAGGAAGTGGGTCAAG 1362
435 -K--E--E--E--P--S--E--L--E--L--L--C--M--E--A--R--K--W--V--K- 454
1621 AAA AGA GAG CTA TTT CTT CCA GAA GCC GGA GTT GAA GAT GAC AAT GAT GGC TTC ACC CAG 1680
1363 AAAAGAGAGCTATTTCTTCCAGAAGCCGGAGTTGAAGATGACAATGATGGCTTCACCCAG 1422
455 -K--R--E--L--F--L--P--E--A--G--V--E--D--D--N--D--G--F--T--Q- 474
1681 TTC TCT ATC GAC AGC GAA GAT GGT TCT GAT GCA TCT GAA TTA CCA TCT TTC AGC AAG TTC 1740
1423 TTCTCTATCGACAGCGAAGATGGTTCTGATGCATCTGAATTACCATCTTTCAGCAAGTTC 1482
475 -F--S--I--D--S--E--D--G--S--D--A--S--E--L--P--S--F--S--K--F- 494
1741 GGA CTC ATG AAA GCT AGT CAC AGA ATT CCA CTG TCA AAG TTA GAT GAG TGC GAT GAG GAA 1800
1483 GGACTCATGAAAGCTAGTCACAGAATTCCACTGTCAAAGTTAGATGAGTGCGATGAGGAA 1542
495 -G--L--M--K--A--S--H--R--I--P--L--S--K--L--D--E--C--D--E--E- 514
1801 GAT GAT GAA GAG GAT GAT GGT GAT GAT GAT GAG ATG TTC AAA GAT GAT GCT GAA AAC TTG 1860
1543 GATGATGAAGAGGATGATGGTGATGATGATGAGATGTTCAAAGATGATGCTGAAAACTTG 1602
515 -D--D--E--E--D--D--G--D--D--D--E--M--F--K--D--D--A--E--N--L- 534
1861 AAA AAT CCG TTT TCT AAG CAT ATT CCT TCA GTC TCA AAG TTA TCA GCG TCG TTC AAG GGG 1920
1603 AAAAATCCGTTTTCTAAGCATATTCCTTCAGTCTCAAAGTTATCAGCGTCGTTCAAGGGG 1662
535 -K--N--P--F--S--K--H--I--P--S--V--S--K--L--S--A--S--F--K--G- 554
1921 CTC GGT TTC ATT GGG AAA GCT AGA GCC TAC CAC AAA GGT GTT CCC AAG AAC AAG GTG ACT 1980
1663 CTCGGTTTCATTGGGAAAGCTAGAGCCTACCACAAAGGTGTTCCCAAGAACAAGGTGACT 1722
555 -L--G--F--I--G--K--A--R--A--Y--H--K--G--V--P--K--N--K--V--T- 574
1981 GCT AAA ACT AAC TAT AGT GGC AAA GGT AGT GAG CAT CAG TCT GGT AGC AGG AGT GCC AAT 2040
1723 GCTAAAACTAACTATAGTGGCAAAGGTAGTGAGCATCAGTCTGGTAGCAGGAGTGCCAAT 1782
575 -A--K--T--N--Y--S--G--K--G--S--E--H--Q--S--G--S--R--S--A--N- 594
2041 GAG CTT CTC CCT CCC AGC GCC AGT TTT GTG AAG CTG TCC GAC ATG GGC CCT GAC GAG TGG 2100
1783 GAGCTTCTCCCTCCCAGCGCCAGTTTTGTGAAGCTGTCCGACATGGGCCCTGACGAGTGG 1842
595 -E--L--L--P--P--S--A--S--F--V--K--L--S--D--M--G--P--D--E--W- 614
2101 AGC GCA TTC CTC GAC AAG TTC CAG GAG CTG CTC CCG AGC GCC TTC CGA GCC CGG AAG CAC 2160
1843 AGCGCATTCCTCGACAAGTTCCAGGAGCTGCTCCCGAGCGCCTTCCGAGCCCGGAAGCAC 1902
615 -S--A--F--L--D--K--F--Q--E--L--L--P--S--A--F--R--A--R--K--H- 634
2161 GCC GCT GCT GGT GGC CCT CGT CCG TTG CAG AGG CTG GGC ACT TCT TGC CAG TTT TGA AA 2219
1903 GCCGCTGCTGGTGGCCCTCGTCCGTTGCAGAGGCTGGGCACTTCTTGCCAGTTTTGA.. 1959
635 -A--A--A--G--G--P--R--P--L--Q--R--L--G--T--S--C--Q--F--*-.. 652
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