Oryza punctata (Oryza_punctata_v1.2)
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This transcript has 2 exons, is annotated with 6 domains and features and maps to 12 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OPUNC09G12300.22219652aa
 
Protein coding
A0A0E0M2E8 Ensembl Canonical
-OPUNC09G12300.12120619aa
 
Protein coding
A0A0E0M2E7 -
Codons
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  • Alternating codons
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     1 GCCAAGGGAGGAAAAAAAAACAAAAAACGAAGGAAAAAAAGGACAGTCGCATCGCGCCAC     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 CGCGGCGGGAGAGGCGTACGGCGCACCGGCCGGCCGTCGGATCTGCGCCGGCAACGCGTC    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 CCCCCACCGGATCCCCGCTGCCGGAGGTGGACGAGGCGGCGCTCCGGCCATTTCCCCGCC    180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   181 CGCGAGCGCCCAGATCCGTCCCGCCGACGAGAGGAGGAAGGCAAGAAGCAGATAAACGCA    240
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   241 GTTCCTTTCAGCCACTCTATGTCCAGGGACTTGGATTGTCCTGTGCAGACACAGATGGCC    300
       ..................ATGTCCAGGGACTTGGATTGTCCTGTGCAGACACAGATGGCC     42
       ..................-M--S--R--D--L--D--C--P--V--Q--T--Q--M--A-     14

                                                                          
   301 ATTGCAGTACTGAATCGTAGCTTCAGCAGTGAATATCCTGCAAGTAGAACTGAGGGGAGA    360
    43 ATTGCAGTACTGAATCGTAGCTTCAGCAGTGAATATCCTGCAAGTAGAACTGAGGGGAGA    102
    15 -I--A--V--L--N--R--S--F--S--S--E--Y--P--A--S--R--T--E--G--R-     34

                                                                          
   361 TCATGTAGTTGGAAAAGATTCTTTGTCCAAACTGACAATGGTTCTGTGCTGCCCATTGAA    420
   103 TCATGTAGTTGGAAAAGATTCTTTGTCCAAACTGACAATGGTTCTGTGCTGCCCATTGAA    162
    35 -S--C--S--W--K--R--F--F--V--Q--T--D--N--G--S--V--L--P--I--E-     54

                                                                          
   421 CTGGAGAAGGGAGAAAATGCACATACTGTGAAAAGGAAGCTCCAGGTAGCCCTCAATGTA    480
   163 CTGGAGAAGGGAGAAAATGCACATACTGTGAAAAGGAAGCTCCAGGTAGCCCTCAATGTA    222
    55 -L--E--K--G--E--N--A--H--T--V--K--R--K--L--Q--V--A--L--N--V-     74

                                                                          
   481 CCCACAGAGGAGAGCTCACTGACCTTTGGTGATCTGGTTCTGAATAATGATCTCAGCAGT    540
   223 CCCACAGAGGAGAGCTCACTGACCTTTGGTGATCTGGTTCTGAATAATGATCTCAGCAGT    282
    75 -P--T--E--E--S--S--L--T--F--G--D--L--V--L--N--N--D--L--S--S-     94

                                                                          
   541 ATTCGCAACGACTCACCACTGCTCCTAAGAAAGAATCAGATGCATCGGAGCAGCTCCACG    600
   283 ATTCGCAACGACTCACCACTGCTCCTAAGAAAGAATCAGATGCATCGGAGCAGCTCCACG    342
    95 -I--R--N--D--S--P--L--L--L--R--K--N--Q--M--H--R--S--S--S--T-    114

                                                                          
   601 CCTTGCCTCTCTCCTACTGGGCATGATGTGCAGCAGCAAGATCGCAGTGAACCCATTGAA    660
   343 CCTTGCCTCTCTCCTACTGGGCATGATGTGCAGCAGCAAGATCGCAGTGAACCCATTGAA    402
   115 -P--C--L--S--P--T--G--H--D--V--Q--Q--Q--D--R--S--E--P--I--E-    134

                                                                          
   661 ATCCTTGGATGTTTGAGCCCCTCTTCTCAGATGAAGCAGCTTGCTGATGATGTTGTGAAA    720
   403 ATCCTTGGATGTTTGAGCCCCTCTTCTCAGATGAAGCAGCTTGCTGATGATGTTGTGAAA    462
   135 -I--L--G--C--L--S--P--S--S--Q--M--K--Q--L--A--D--D--V--V--K-    154

                                                                          
   721 GCCATAAGGAATGGTGTTGACCCGGTACCTGTTAATAGTGGCATGGGTGGTGCGTACTAC    780
   463 GCCATAAGGAATGGTGTTGACCCGGTACCTGTTAATAGTGGCATGGGTGGTGCGTACTAC    522
   155 -A--I--R--N--G--V--D--P--V--P--V--N--S--G--M--G--G--A--Y--Y-    174

                                                                          
   781 TTCAAGAACATTTACGGGGAACGTGTTGCAATTGTCAAGCCAACTGATGAAGAGCCATTT    840
   523 TTCAAGAACATTTACGGGGAACGTGTTGCAATTGTCAAGCCAACTGATGAAGAGCCATTT    582
   175 -F--K--N--I--Y--G--E--R--V--A--I--V--K--P--T--D--E--E--P--F-    194

                                                                          
   841 GCTCCAAATAATCCTAAAGGTTTTGTGGGGAAGACCCTTGGACTGCCAGGCCTCAAAAGA    900
   583 GCTCCAAATAATCCTAAAGGTTTTGTGGGGAAGACCCTTGGACTGCCAGGCCTCAAAAGA    642
   195 -A--P--N--N--P--K--G--F--V--G--K--T--L--G--L--P--G--L--K--R-    214

                                                                          
   901 TCTGTACCCGTCGGTGAGACTGGGCTCCGAGAGGTTGCTGCTTACCTTCTTGACCATGAT    960
   643 TCTGTACCCGTCGGTGAGACTGGGCTCCGAGAGGTTGCTGCTTACCTTCTTGACCATGAT    702
   215 -S--V--P--V--G--E--T--G--L--R--E--V--A--A--Y--L--L--D--H--D-    234

                                                                          
   961 AACTTTGCAAATGTCCCGCCCACAATGCTGGTCAAGATCACACACTCTGTGTTCAATGTG   1020
   703 AACTTTGCAAATGTCCCGCCCACAATGCTGGTCAAGATCACACACTCTGTGTTCAATGTG    762
   235 -N--F--A--N--V--P--P--T--M--L--V--K--I--T--H--S--V--F--N--V-    254

                                                                          
  1021 AACGACACTGTGGGCTGCAAAAGTAAAGTCTTCCACAACAAACTGCAGGCCGTGAGCAAG   1080
   763 AACGACACTGTGGGCTGCAAAAGTAAAGTCTTCCACAACAAACTGCAGGCCGTGAGCAAG    822
   255 -N--D--T--V--G--C--K--S--K--V--F--H--N--K--L--Q--A--V--S--K-    274

                                                                          
  1081 CTTGCATCATTGCAGCAATTTATTGCTCATGATTATGATGCTAGCGACCATGGGACGTCA   1140
   823 CTTGCATCATTGCAGCAATTTATTGCTCATGATTATGATGCTAGCGACCATGGGACGTCA    882
   275 -L--A--S--L--Q--Q--F--I--A--H--D--Y--D--A--S--D--H--G--T--S-    294

                                                                          
  1141 AGCTTCCCTGTATCTGCAGTGCACAGGATTGGCATACTTGACATCAGAATATTCAACACG   1200
   883 AGCTTCCCTGTATCTGCAGTGCACAGGATTGGCATACTTGACATCAGAATATTCAACACG    942
   295 -S--F--P--V--S--A--V--H--R--I--G--I--L--D--I--R--I--F--N--T-    314

                                                                          
  1201 GACAGGCACGCAGGAAATCTTCTGGTTAGGAAGCTTGGCCCTGGGCCTGACAATTTTGGA   1260
   943 GACAGGCACGCAGGAAATCTTCTGGTTAGGAAGCTTGGCCCTGGGCCTGACAATTTTGGA   1002
   315 -D--R--H--A--G--N--L--L--V--R--K--L--G--P--G--P--D--N--F--G-    334

                                                                          
  1261 GTGCAGACTGAGCTAATTCCTATTGATCATGGTCTCTGTCTTCCAGAATGTCTAGAAGAC   1320
  1003 GTGCAGACTGAGCTAATTCCTATTGATCATGGTCTCTGTCTTCCAGAATGTCTAGAAGAC   1062
   335 -V--Q--T--E--L--I--P--I--D--H--G--L--C--L--P--E--C--L--E--D-    354

                                                                          
  1321 CCTTACTTTGAATGGATCCACTGGCCACAGGCATCCATTCCTTTCACTGAGGAGGAACTC   1380
  1063 CCTTACTTTGAATGGATCCACTGGCCACAGGCATCCATTCCTTTCACTGAGGAGGAACTC   1122
   355 -P--Y--F--E--W--I--H--W--P--Q--A--S--I--P--F--T--E--E--E--L-    374

                                                                          
  1381 GAATACATTGCAAATCTGGATCCTGTAAAAGATGCTGAAATGCTTCGGATGGAGCTGCCC   1440
  1123 GAATACATTGCAAATCTGGATCCTGTAAAAGATGCTGAAATGCTTCGGATGGAGCTGCCC   1182
   375 -E--Y--I--A--N--L--D--P--V--K--D--A--E--M--L--R--M--E--L--P-    394

                                                                          
  1441 TTTATCCGTGGAGCATGTCTGAGGGTGCTGGTGCTATCAACAATATTTCTCAAAGAAGCT   1500
  1183 TTTATCCGTGGAGCATGTCTGAGGGTGCTGGTGCTATCAACAATATTTCTCAAAGAAGCT   1242
   395 -F--I--R--G--A--C--L--R--V--L--V--L--S--T--I--F--L--K--E--A-    414

                                                                          
  1501 GCAGCATTTGGCCTCTGCTTGTCAGAGATAGGAGAGATGATGAGTAGGCAGTTCACTGGG   1560
  1243 GCAGCATTTGGCCTCTGCTTGTCAGAGATAGGAGAGATGATGAGTAGGCAGTTCACTGGG   1302
   415 -A--A--F--G--L--C--L--S--E--I--G--E--M--M--S--R--Q--F--T--G-    434

                                                                          
  1561 AAAGAAGAGGAGCCAAGTGAGCTTGAGCTTCTTTGCATGGAGGCAAGGAAGTGGGTCAAG   1620
  1303 AAAGAAGAGGAGCCAAGTGAGCTTGAGCTTCTTTGCATGGAGGCAAGGAAGTGGGTCAAG   1362
   435 -K--E--E--E--P--S--E--L--E--L--L--C--M--E--A--R--K--W--V--K-    454

                                                                          
  1621 AAAAGAGAGCTATTTCTTCCAGAAGCCGGAGTTGAAGATGACAATGATGGCTTCACCCAG   1680
  1363 AAAAGAGAGCTATTTCTTCCAGAAGCCGGAGTTGAAGATGACAATGATGGCTTCACCCAG   1422
   455 -K--R--E--L--F--L--P--E--A--G--V--E--D--D--N--D--G--F--T--Q-    474

                                                                          
  1681 TTCTCTATCGACAGCGAAGATGGTTCTGATGCATCTGAATTACCATCTTTCAGCAAGTTC   1740
  1423 TTCTCTATCGACAGCGAAGATGGTTCTGATGCATCTGAATTACCATCTTTCAGCAAGTTC   1482
   475 -F--S--I--D--S--E--D--G--S--D--A--S--E--L--P--S--F--S--K--F-    494

                                                                          
  1741 GGACTCATGAAAGCTAGTCACAGAATTCCACTGTCAAAGTTAGATGAGTGCGATGAGGAA   1800
  1483 GGACTCATGAAAGCTAGTCACAGAATTCCACTGTCAAAGTTAGATGAGTGCGATGAGGAA   1542
   495 -G--L--M--K--A--S--H--R--I--P--L--S--K--L--D--E--C--D--E--E-    514

                                                                          
  1801 GATGATGAAGAGGATGATGGTGATGATGATGAGATGTTCAAAGATGATGCTGAAAACTTG   1860
  1543 GATGATGAAGAGGATGATGGTGATGATGATGAGATGTTCAAAGATGATGCTGAAAACTTG   1602
   515 -D--D--E--E--D--D--G--D--D--D--E--M--F--K--D--D--A--E--N--L-    534

                                                                          
  1861 AAAAATCCGTTTTCTAAGCATATTCCTTCAGTCTCAAAGTTATCAGCGTCGTTCAAGGGG   1920
  1603 AAAAATCCGTTTTCTAAGCATATTCCTTCAGTCTCAAAGTTATCAGCGTCGTTCAAGGGG   1662
   535 -K--N--P--F--S--K--H--I--P--S--V--S--K--L--S--A--S--F--K--G-    554

                                                                          
  1921 CTCGGTTTCATTGGGAAAGCTAGAGCCTACCACAAAGGTGTTCCCAAGAACAAGGTGACT   1980
  1663 CTCGGTTTCATTGGGAAAGCTAGAGCCTACCACAAAGGTGTTCCCAAGAACAAGGTGACT   1722
   555 -L--G--F--I--G--K--A--R--A--Y--H--K--G--V--P--K--N--K--V--T-    574

                                                                          
  1981 GCTAAAACTAACTATAGTGGCAAAGGTAGTGAGCATCAGTCTGGTAGCAGGAGTGCCAAT   2040
  1723 GCTAAAACTAACTATAGTGGCAAAGGTAGTGAGCATCAGTCTGGTAGCAGGAGTGCCAAT   1782
   575 -A--K--T--N--Y--S--G--K--G--S--E--H--Q--S--G--S--R--S--A--N-    594

                                                                          
  2041 GAGCTTCTCCCTCCCAGCGCCAGTTTTGTGAAGCTGTCCGACATGGGCCCTGACGAGTGG   2100
  1783 GAGCTTCTCCCTCCCAGCGCCAGTTTTGTGAAGCTGTCCGACATGGGCCCTGACGAGTGG   1842
   595 -E--L--L--P--P--S--A--S--F--V--K--L--S--D--M--G--P--D--E--W-    614

                                                                          
  2101 AGCGCATTCCTCGACAAGTTCCAGGAGCTGCTCCCGAGCGCCTTCCGAGCCCGGAAGCAC   2160
  1843 AGCGCATTCCTCGACAAGTTCCAGGAGCTGCTCCCGAGCGCCTTCCGAGCCCGGAAGCAC   1902
   615 -S--A--F--L--D--K--F--Q--E--L--L--P--S--A--F--R--A--R--K--H-    634

                                                                          
  2161 GCCGCTGCTGGTGGCCCTCGTCCGTTGCAGAGGCTGGGCACTTCTTGCCAGTTTTGAAA    2219
  1903 GCCGCTGCTGGTGGCCCTCGTCCGTTGCAGAGGCTGGGCACTTCTTGCCAGTTTTGA..    1959
   635 -A--A--A--G--G--P--R--P--L--Q--R--L--G--T--S--C--Q--F--*-..     652