Oryza punctata (Oryza_punctata_v1.2)
Description

Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT5G14050) TAIR;Acc:AT5G14050]

Location
About this transcript

This transcript has 2 exons, is annotated with 21 domains and features and maps to 12 oligo probes.

Gene
Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OPUNC07G19920.12141557aa
 
Protein coding
A0A0E0LN07 Ensembl Canonical
Variants
  • loading
Markup
  • loaded
                                                                          
     1 CCGCCGCCTCGCCCGTCCTCTCCCCCCTCCCGCCTCCTCTACTCGCCGCCTCGCCGCGCG     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 GCCGCCGGGCGCTGCTTCGTGCCGCCGTCTACCGCCCCCCGGAGCTGCGCCGTGGCCATT    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 TCCTCCGGCAAGATGAGTTTGATATCTCAGAATCCCCTTCAGAAGCGCCGACTGGAGACA    180
       ............ATGAGTTTGATATCTCAGAATCCCCTTCAGAAGCGCCGACTGGAGACA     48
       ............-M--S--L--I--S--Q--N--P--L--Q--K--R--R--L--E--T-     16

                                                                          
   181 ATTGGAGCTGATGATGATAGTGATGAGGGATTAGGCTCTCCCACTGCTGCCGGAGCTGAG    240
    49 ATTGGAGCTGATGATGATAGTGATGAGGGATTAGGCTCTCCCACTGCTGCCGGAGCTGAG    108
    17 -I--G--A--D--D--D--S--D--E--G--L--G--S--P--T--A--A--G--A--E-     36

                                                                          
   241 GATGGGAATGAAACCAAGTCAGAGAAGCGCAAAAAGGAGAAGAAGCGGAAGAAGGCCAAG    300
   109 GATGGGAATGAAACCAAGTCAGAGAAGCGCAAAAAGGAGAAGAAGCGGAAGAAGGCCAAG    168
    37 -D--G--N--E--T--K--S--E--K--R--K--K--E--K--K--R--K--K--A--K-     56

                                                                          
   301 GCGCTTGAGGCACTGGAGGAGAAGGAGAACAAGGAGAGGGAGGAGATGAAGAAGCTGGAG    360
   169 GCGCTTGAGGCACTGGAGGAGAAGGAGAACAAGGAGAGGGAGGAGATGAAGAAGCTGGAG    228
    57 -A--L--E--A--L--E--E--K--E--N--K--E--R--E--E--M--K--K--L--E-     76

                                                                          
   361 AGCTCCCTGTTTGGTGCCCTCTATGCGCCGCCTCAGTTTGGCACTGAGGTTGAGGCTGCG    420
   229 AGCTCCCTGTTTGGTGCCCTCTATGCGCCGCCTCAGTTTGGCACTGAGGTTGAGGCTGCG    288
    77 -S--S--L--F--G--A--L--Y--A--P--P--Q--F--G--T--E--V--E--A--A-     96

                                                                          
   421 GATCCTGACAAGGATGCACCTTCATTCTTCATGGATAGGTCTGGTGGTGATGGCGAGGAT    480
   289 GATCCTGACAAGGATGCACCTTCATTCTTCATGGATAGGTCTGGTGGTGATGGCGAGGAT    348
    97 -D--P--D--K--D--A--P--S--F--F--M--D--R--S--G--G--D--G--E--D-    116

                                                                          
   481 GACTTGCCTGTCTATGAGGAGGGCTTGTCCAGTGAAGATGAGGGGGATGACATGGTTGGC    540
   349 GACTTGCCTGTCTATGAGGAGGGCTTGTCCAGTGAAGATGAGGGGGATGACATGGTTGGC    408
   117 -D--L--P--V--Y--E--E--G--L--S--S--E--D--E--G--D--D--M--V--G-    136

                                                                          
   541 AGGGAGAGGAAGCCTGCATGGGTGGATGAGGAGGAGGTGACTGAGGTGGACATTTCGAAG    600
   409 AGGGAGAGGAAGCCTGCATGGGTGGATGAGGAGGAGGTGACTGAGGTGGACATTTCGAAG    468
   137 -R--E--R--K--P--A--W--V--D--E--E--E--V--T--E--V--D--I--S--K-    156

                                                                          
   601 GTGGCAAGGTTGAGGAAGTTGAGAAAGGAGGCTGATGAACATGTGATCTCAGGCAAAGAG    660
   469 GTGGCAAGGTTGAGGAAGTTGAGAAAGGAGGCTGATGAACATGTGATCTCAGGCAAAGAG    528
   157 -V--A--R--L--R--K--L--R--K--E--A--D--E--H--V--I--S--G--K--E-    176

                                                                          
   661 TATGAGGCTAGGTTGCGTGGTCAACATGCCAAGTTGAACCGCTTCGCTGGTTGGGCTGAC    720
   529 TATGAGGCTAGGTTGCGTGGTCAACATGCCAAGTTGAACCGCTTCGCTGGTTGGGCTGAC    588
   177 -Y--E--A--R--L--R--G--Q--H--A--K--L--N--R--F--A--G--W--A--D-    196

                                                                          
   721 TTGGACCGTAAAGCTCCTCTTCCTGGGTCGTCTGACAGTGAATCTGATGAAGAGGGTGGA    780
   589 TTGGACCGTAAAGCTCCTCTTCCTGGGTCGTCTGACAGTGAATCTGATGAAGAGGGTGGA    648
   197 -L--D--R--K--A--P--L--P--G--S--S--D--S--E--S--D--E--E--G--G-    216

                                                                          
   781 GTTGATGATATTCTTCGAAATAATGATGAGCTTGTTGTCAAGGATAATGCTAAGCTCTTA    840
   649 GTTGATGATATTCTTCGAAATAATGATGAGCTTGTTGTCAAGGATAATGCTAAGCTCTTA    708
   217 -V--D--D--I--L--R--N--N--D--E--L--V--V--K--D--N--A--K--L--L-    236

                                                                          
   841 CCTGACATGCTAGGGTTCTCAAGACTTGTAGATGCAAATGCCCAGGAACCATCTAGCGGC    900
   709 CCTGACATGCTAGGGTTCTCAAGACTTGTAGATGCAAATGCCCAGGAACCATCTAGCGGC    768
   237 -P--D--M--L--G--F--S--R--L--V--D--A--N--A--Q--E--P--S--S--G-    256

                                                                          
   901 CCTATCAATTCAGTGCAGTTTCACAGGAATGGGCAGCTTATGCTTGTTGCTGGTTTGGAC    960
   769 CCTATCAATTCAGTGCAGTTTCACAGGAATGGGCAGCTTATGCTTGTTGCTGGTTTGGAC    828
   257 -P--I--N--S--V--Q--F--H--R--N--G--Q--L--M--L--V--A--G--L--D-    276

                                                                          
   961 AAGCATTTGAGATTTTTCCAGATTGATGGGAAGAGAAATCCCAAGATCCAGAGCATATTT   1020
   829 AAGCATTTGAGATTTTTCCAGATTGATGGGAAGAGAAATCCCAAGATCCAGAGCATATTT    888
   277 -K--H--L--R--F--F--Q--I--D--G--K--R--N--P--K--I--Q--S--I--F-    296

                                                                          
  1021 ATTGAGGACTGCCCTGTTCACAAGGCCGCATTTCTGCCTGATGGTTCTGAGGTTATCCTT   1080
   889 ATTGAGGACTGCCCTGTTCACAAGGCCGCATTTCTGCCTGATGGTTCTGAGGTTATCCTT    948
   297 -I--E--D--C--P--V--H--K--A--A--F--L--P--D--G--S--E--V--I--L-    316

                                                                          
  1081 TCAGGCAGGAGGAAATTCTTCTACTCATTTGATCTGGTGAATGCTGCTGTTAGTAAGATT   1140
   949 TCAGGCAGGAGGAAATTCTTCTACTCATTTGATCTGGTGAATGCTGCTGTTAGTAAGATT   1008
   317 -S--G--R--R--K--F--F--Y--S--F--D--L--V--N--A--A--V--S--K--I-    336

                                                                          
  1141 GGACCCTTAACAGGACGTGAGGAGAAAAGCCTAGAACACTTTGAGATATCACCTGATTCA   1200
  1009 GGACCCTTAACAGGACGTGAGGAGAAAAGCCTAGAACACTTTGAGATATCACCTGATTCA   1068
   337 -G--P--L--T--G--R--E--E--K--S--L--E--H--F--E--I--S--P--D--S-    356

                                                                          
  1201 AAGACCATTGCATTCATTGGTAATGAGGGGTACATTCTTTTGATTTCTTCCAAAACAAAG   1260
  1069 AAGACCATTGCATTCATTGGTAATGAGGGGTACATTCTTTTGATTTCTTCCAAAACAAAG   1128
   357 -K--T--I--A--F--I--G--N--E--G--Y--I--L--L--I--S--S--K--T--K-    376

                                                                          
  1261 CAGCTCATTGGAACCCTCAAGATGAATGGGAATGTGCGTTCATTGGCTTTTTCTGATGGT   1320
  1129 CAGCTCATTGGAACCCTCAAGATGAATGGGAATGTGCGTTCATTGGCTTTTTCTGATGGT   1188
   377 -Q--L--I--G--T--L--K--M--N--G--N--V--R--S--L--A--F--S--D--G-    396

                                                                          
  1321 GGGAATCAGCTACTTAGCAGTGGTGGTGATGGCCATGTGTACCACTGGGATCTCAGGACA   1380
  1189 GGGAATCAGCTACTTAGCAGTGGTGGTGATGGCCATGTGTACCACTGGGATCTCAGGACA   1248
   397 -G--N--Q--L--L--S--S--G--G--D--G--H--V--Y--H--W--D--L--R--T-    416

                                                                          
  1381 AGAAAGTGTATCCACAAGGGTACCGACGAGGGTTCCTTGGCAGGCATTTCACTTTGCACT   1440
  1249 AGAAAGTGTATCCACAAGGGTACCGACGAGGGTTCCTTGGCAGGCATTTCACTTTGCACT   1308
   417 -R--K--C--I--H--K--G--T--D--E--G--S--L--A--G--I--S--L--C--T-    436

                                                                          
  1441 TCACCTGACAGCTCTCTGTTCGCCACAGGCTCCACCAGCGGCATCGTGAATGTGTACAAG   1500
  1309 TCACCTGACAGCTCTCTGTTCGCCACAGGCTCCACCAGCGGCATCGTGAATGTGTACAAG   1368
   437 -S--P--D--S--S--L--F--A--T--G--S--T--S--G--I--V--N--V--Y--K-    456

                                                                          
  1501 AGGGATGATTTTCTGGGCGGGAAGAGGAAGCCACTGAAGACGATCGAGAACCTCACAACC   1560
  1369 AGGGATGATTTTCTGGGCGGGAAGAGGAAGCCACTGAAGACGATCGAGAACCTCACAACC   1428
   457 -R--D--D--F--L--G--G--K--R--K--P--L--K--T--I--E--N--L--T--T-    476

                                                                          
  1561 GAGATCGGTGAAATGAAGTTCAACCATGATGCCCAGGTTCTGGCGATAAGCTCGAGAAAG   1620
  1429 GAGATCGGTGAAATGAAGTTCAACCATGATGCCCAGGTTCTGGCGATAAGCTCGAGAAAG   1488
   477 -E--I--G--E--M--K--F--N--H--D--A--Q--V--L--A--I--S--S--R--K-    496

                                                                          
  1621 GAGAGGAACGGGATGAGGCTCGTGCATGTCCCATCCCTCACCGTGTTCCAGAACTGGCCA   1680
  1489 GAGAGGAACGGGATGAGGCTCGTGCATGTCCCATCCCTCACCGTGTTCCAGAACTGGCCA   1548
   497 -E--R--N--G--M--R--L--V--H--V--P--S--L--T--V--F--Q--N--W--P-    516

                                                                          
  1681 GGGCCTCGGTTCAGCCTCCACTATCCACGGTGCCTGGACTTCAGCCCAGGCAGCGGGTTT   1740
  1549 GGGCCTCGGTTCAGCCTCCACTATCCACGGTGCCTGGACTTCAGCCCAGGCAGCGGGTTT   1608
   517 -G--P--R--F--S--L--H--Y--P--R--C--L--D--F--S--P--G--S--G--F-    536

                                                                          
  1741 TTGTCCATCGGACATGCTGGTGGAAAGGTTTTGCTGTATAAGCTGCACCACTACCAAAAT   1800
  1609 TTGTCCATCGGACATGCTGGTGGAAAGGTTTTGCTGTATAAGCTGCACCACTACCAAAAT   1668
   537 -L--S--I--G--H--A--G--G--K--V--L--L--Y--K--L--H--H--Y--Q--N-    556

                                                                          
  1801 GCCTAAAACATGAATGTTACTCTCCTCCCTATGGGCTGAAATGTGACCTGAAAAAAAATC   1860
  1669 GCCTAA......................................................   1674
   557 -A--*-......................................................    557

                                                                          
  1861 AACTTTCCAACATTGTAATTTCAATTTTGAGAGATATCGATGGTATCTGTAGTCCAGTTC   1920
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1921 TTCTGAATTCTTTTTATTTTCTCTTTCCCTTGGGTGTTGTAATCCCTTACTATGGTGTTT   1980
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1981 AATGCAAAGCTGGCAAATTTACCCATGTTGCATATCTTTTCTCATGCAAATTTATATATC   2040
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2041 TGTACGGGTGATTGTTGTGTCATTCTGTTTGGTGTGCAGACTAGATGAGCTAGTTCTGGA   2100
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2101 ACGCAACCTTCCCAGACCCCTATCGTTTAGCTAAATACGGG                      2141
       .........................................                          
       .........................................