Oryza punctata (Oryza_punctata_v1.2) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 7: 5,968,643-5,976,544 forward strand.
This transcript has 17 exons, is annotated with 28 domains and features and maps to 15 oligo probes.
This transcript is a product of gene OPUNC07G06470 Show transcript tableHide transcript table
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1 GTTGGTGTTGCTTTGCTTTCTTCTTCCTCTGACGTTTCCCCCTCCCTCCCTCCCTCGCCA 60 ............................................................ ............................................................ 61 CGGATCCGAGGTCTCTCAAAGCCCTAGCTACACCTCCTCCCCGACCTCTCCGCCCCGGCG 120 ............................................................ ............................................................ 121 GCAATGGAGGACGAGGAGATGGAGAAGAAGGTGCACCAGTACCTGCAGCGGAAGGGCTTC 180 ...ATGGAGGACGAGGAGATGGAGAAGAAGGTGCACCAGTACCTGCAGCGGAAGGGCTTC 57 ...-M--E--D--E--E--M--E--K--K--V--H--Q--Y--L--Q--R--K--G--F- 19 181 CGCATGGCGGAGCTCGCGCTGCTCGAGGACCGCACCCGCCTCTCCACCACCGCCTCCTCC 240 58 CGCATGGCGGAGCTCGCGCTGCTCGAGGACCGCACCCGCCTCTCCACCACCGCCTCCTCC 117 20 -R--M--A--E--L--A--L--L--E--D--R--T--R--L--S--T--T--A--S--S- 39 241 TCCTCCCACTCCCTCTCCGACGCCGCGCTCTCCAGGTCGGAAAACGATCCAGCGAGGTAC 300 118 TCCTCCCACTCCCTCTCCGACGCCGCGCTCTCCAGGTCGGAAAACGATCCAGCGAGGTAC 177 40 -S--S--H--S--L--S--D--A--A--L--S--R--S--E--N--D--P--A--R--Y- 59 301 TATGATGGCTATAGTAAACTAAGAACATGGGCATACAGTTCTCTTGATCACTACAAGCAT 360 178 TATGATGGCTATAGTAAACTAAGAACATGGGCATACAGTTCTCTTGATCACTACAAGCAT 237 60 -Y--D--G--Y--S--K--L--R--T--W--A--Y--S--S--L--D--H--Y--K--H- 79 361 GAATTACTCCGCATTCTTTATCCACTATTTGTCCACTGTTTCATGGATTTAGTGGCAGAG 420 238 GAATTACTCCGCATTCTTTATCCACTATTTGTCCACTGTTTCATGGATTTAGTGGCAGAG 297 80 -E--L--L--R--I--L--Y--P--L--F--V--H--C--F--M--D--L--V--A--E- 99 421 GGACATACACAGGAAGCTTGCTCATTTTTCCACACATTTCGTGAAGACCATGAGCATTCG 480 298 GGACATACACAGGAAGCTTGCTCATTTTTCCACACATTTCGTGAAGACCATGAGCATTCG 357 100 -G--H--T--Q--E--A--C--S--F--F--H--T--F--R--E--D--H--E--H--S- 119 481 AGGGATCTCAAGAAGCTGGAAAGCATCCTTTCTCCTTTACATTTGGAGGAAATGGAAGTG 540 358 AGGGATCTCAAGAAGCTGGAAAGCATCCTTTCTCCTTTACATTTGGAGGAAATGGAAGTG 417 120 -R--D--L--K--K--L--E--S--I--L--S--P--L--H--L--E--E--M--E--V- 139 541 GCTCGATCTTTAAGGCAGAATAAATTCGGAATTAAGCTATGTGAGGTTTATTCATATGAA 600 418 GCTCGATCTTTAAGGCAGAATAAATTCGGAATTAAGCTATGTGAGGTTTATTCATATGAA 477 140 -A--R--S--L--R--Q--N--K--F--G--I--K--L--C--E--V--Y--S--Y--E- 159 601 TTGCTTCTCCAGTATCTCCACAAAACACAAGCTCTTGTGGTGCTTGGAATAATCAATGAA 660 478 TTGCTTCTCCAGTATCTCCACAAAACACAAGCTCTTGTGGTGCTTGGAATAATCAATGAA 537 160 -L--L--L--Q--Y--L--H--K--T--Q--A--L--V--V--L--G--I--I--N--E- 179 661 CGCATAGATTTTGAAGTATCCCCTGGGCGGTCTCCATTAATCGCTGATGACTCGGATGCT 720 538 CGCATAGATTTTGAAGTATCCCCTGGGCGGTCTCCATTAATCGCTGATGACTCGGATGCT 597 180 -R--I--D--F--E--V--S--P--G--R--S--P--L--I--A--D--D--S--D--A- 199 721 GTTGTTCTGATTGGAACTAGCAAGGACTTGACAAAACAGATAAATCAGAAGGAGGTGCAT 780 598 GTTGTTCTGATTGGAACTAGCAAGGACTTGACAAAACAGATAAATCAGAAGGAGGTGCAT 657 200 -V--V--L--I--G--T--S--K--D--L--T--K--Q--I--N--Q--K--E--V--H- 219 781 TGGGGGAAAAGATCCTTAGAAGGTGGAAAGCAGGGTGGTTCACATAAAAAGATCAAAAAG 840 658 TGGGGGAAAAGATCCTTAGAAGGTGGAAAGCAGGGTGGTTCACATAAAAAGATCAAAAAG 717 220 -W--G--K--R--S--L--E--G--G--K--Q--G--G--S--H--K--K--I--K--K- 239 841 GACAAGCTTGTAGGAACCACAGGGAAAAACATGAAATCTGAAACTAGCATGGTTTCTGTA 900 718 GACAAGCTTGTAGGAACCACAGGGAAAAACATGAAATCTGAAACTAGCATGGTTTCTGTA 777 240 -D--K--L--V--G--T--T--G--K--N--M--K--S--E--T--S--M--V--S--V- 259 901 GCACCACGAGTTAAACCAGAGCTAACGCTTCCAATGACGTCTGTTGAAGTTGAGCAGTCA 960 778 GCACCACGAGTTAAACCAGAGCTAACGCTTCCAATGACGTCTGTTGAAGTTGAGCAGTCA 837 260 -A--P--R--V--K--P--E--L--T--L--P--M--T--S--V--E--V--E--Q--S- 279 961 ATTCTTGAGGACTTGCGAAACCGTGCACAGTTGAATAGCTTGGCATTGCCTTCTGTTAGC 1020 838 ATTCTTGAGGACTTGCGAAACCGTGCACAGTTGAATAGCTTGGCATTGCCTTCTGTTAGC 897 280 -I--L--E--D--L--R--N--R--A--Q--L--N--S--L--A--L--P--S--V--S- 299 1021 TTCTATACATTCCTTAATACACATAATGGTTTAATCATTATATGTGGAACTCAGTGTAAA 1080 898 TTCTATACATTCCTTAATACACATAATGGTTTAATCATTATATGTGGAACTCAGTGTAAA 957 300 -F--Y--T--F--L--N--T--H--N--G--L--I--I--I--C--G--T--Q--C--K- 319 1081 ATCTCCTTGGTGTTCACTAGGTTTGGGATATGTCAAAGATTGGACAGCCTTCCAAAGCAT 1140 958 ATCTCCTTGGTGTTCACTAGGTTTGGGATATGTCAAAGATTGGACAGCCTTCCAAAGCAT 1017 320 -I--S--L--V--F--T--R--F--G--I--C--Q--R--L--D--S--L--P--K--H- 339 1141 CCACACAAGGCGAGAATGGACCCTCCCAGGGTGAGCGTGTATCGACATCAGATGAAGCAC 1200 1018 CCACACAAGGCGAGAATGGACCCTCCCAGGGTGAGCGTGTATCGACATCAGATGAAGCAC 1077 340 -P--H--K--A--R--M--D--P--P--R--V--S--V--Y--R--H--Q--M--K--H- 359 1201 GGAAATCCTGTACATTATTCCAAGGTCATTCTGGACCAGTTTATTCTGCCACTCCGTTTA 1260 1078 GGAAATCCTGTACATTATTCCAAGGTCATTCTGGACCAGTTTATTCTGCCACTCCGTTTA 1137 360 -G--N--P--V--H--Y--S--K--V--I--L--D--Q--F--I--L--P--L--R--L- 379 1261 TGGAACACCAAGTTGAATGCGAATCTTGTTTGCTACAAAGGACACAACTACCCTGTTTGG 1320 1138 TGGAACACCAAGTTGAATGCGAATCTTGTTTGCTACAAAGGACACAACTACCCTGTTTGG 1197 380 -W--N--T--K--L--N--A--N--L--V--C--Y--K--G--H--N--Y--P--V--W- 399 1321 GATGTCCAATTTAGTCCAGTTGGTCATTACTTTGCTAGTGCTTCGCATGACAGGACCGCT 1380 1198 GATGTCCAATTTAGTCCAGTTGGTCATTACTTTGCTAGTGCTTCGCATGACAGGACCGCT 1257 400 -D--V--Q--F--S--P--V--G--H--Y--F--A--S--A--S--H--D--R--T--A- 419 1381 AGAATCTGGTCCATGGATAAAATCCAGCCTTTGAGAATAATGGCTGGGCATTTATCTGAT 1440 1258 AGAATCTGGTCCATGGATAAAATCCAGCCTTTGAGAATAATGGCTGGGCATTTATCTGAT 1317 420 -R--I--W--S--M--D--K--I--Q--P--L--R--I--M--A--G--H--L--S--D- 439 1441 GTTGATTGTGTGCAATGGCATGTCAACTGCAACTACATTGCCACCGGCTCTAGTGACAAA 1500 1318 GTTGATTGTGTGCAATGGCATGTCAACTGCAACTACATTGCCACCGGCTCTAGTGACAAA 1377 440 -V--D--C--V--Q--W--H--V--N--C--N--Y--I--A--T--G--S--S--D--K- 459 1501 ACTGTAAGACTATGGGATGTTCAAACCGGTGAATGTATAAGGATGTTTATTGGCCATAGG 1560 1378 ACTGTAAGACTATGGGATGTTCAAACCGGTGAATGTATAAGGATGTTTATTGGCCATAGG 1437 460 -T--V--R--L--W--D--V--Q--T--G--E--C--I--R--M--F--I--G--H--R- 479 1561 AGTATGGTTTTATCATTGGCAATGTCTCCTGATGGGCGATACATGGCCTCTGGAGATGAA 1620 1438 AGTATGGTTTTATCATTGGCAATGTCTCCTGATGGGCGATACATGGCCTCTGGAGATGAA 1497 480 -S--M--V--L--S--L--A--M--S--P--D--G--R--Y--M--A--S--G--D--E- 499 1621 GATGGAACAATCATGATGTGGGATATATCTTCTGGTCGTTGTGTTTCACCACTAGTGGGA 1680 1498 GATGGAACAATCATGATGTGGGATATATCTTCTGGTCGTTGTGTTTCACCACTAGTGGGA 1557 500 -D--G--T--I--M--M--W--D--I--S--S--G--R--C--V--S--P--L--V--G- 519 1681 CACAACTCTTGTGTGTGGTCGCTTGCTTACAGCAAAGGTGGTTCAGCTAACCGACTGAGG 1740 1558 CACAACTCTTGTGTGTGGTCGCTTGCTTACAGCAAAGGTGGTTCAGCTAACCGACTGAGG 1617 520 -H--N--S--C--V--W--S--L--A--Y--S--K--G--G--S--A--N--R--L--R- 539 1741 ATGCTGAAAGCCCTCCCTACAAAATCAACCCCTGTTTACACTCTGCAGTTTTCTCGGAGG 1800 1618 ATGCTGAAAGCCCTCCCTACAAAATCAACCCCTGTTTACACTCTGCAGTTTTCTCGGAGG 1677 540 -M--L--K--A--L--P--T--K--S--T--P--V--Y--T--L--Q--F--S--R--R- 559 1801 AATCTTTTATTTGCGGCTGGTGCTCCCTCGCTTGGCTCCTAAGCTTCTGTATGTTCTATA 1860 1678 AATCTTTTATTTGCGGCTGGTGCTCCCTCGCTTGGCTCCTAA.................. 1719 560 -N--L--L--F--A--A--G--A--P--S--L--G--S--*-.................. 572 1861 GAGTACAAATAGCATTCTTTCAGTTTTGGTTTTAGTAAGGAGTAAAGTTGATGTCTACTG 1920 ............................................................ ............................................................ 1921 GGGTGGCAGGTGTCGTAGCATCTACATTTTCCATTAGTGATCCCAGTGAACCTAGGAGTA 1980 ............................................................ ............................................................ 1981 AATTATAGCACTGGGGCACTGCAATTCGTTGCAATATGTGTAGTGATGTAGCATTAGCCA 2040 ............................................................ ............................................................ 2041 GTTCAAAATATATGCAATTTCCAGTAATGATACATCTAACTTGACTCTACATGTGCCATA 2100 ............................................................ ............................................................ 2101 CTGTTTCAGCCCATCATTCTTTCCTCAGATTTGATCCCACCTCCCATACAAAGGGTATGG 2160 ............................................................ ............................................................ 2161 GTGGGATCAAATCTGAACCGAGGTATAACCGTGTAACCTCATTTTCTGGATGAACCATGC 2220 ............................................................ ............................................................ 2221 CCGCGCGATAACTTCTTCTCACAGAAAATGATTAAAGCAGAGTTACTTATGTTCGGATTT 2280 ............................................................ ............................................................ 2281 CTGG 2284 .... ....
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