Oryza punctata (Oryza_punctata_v1.2)
Location
About this transcript

This transcript has 1 exon, is annotated with 16 domains and features and maps to 5 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OPUNC05G07640.1636211aa
 
Protein coding
A0A0E0L035 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGTTCTTGTCCGGGTTTTCGCCGGCGGTGCACCATGACCTGCAGCCGGGTGGCCGTCCG     60
     1 ATGTTCTTGTCCGGGTTTTCGCCGGCGGTGCACCATGACCTGCAGCCGGGTGGCCGTCCG     60
     1 -M--F--L--S--G--F--S--P--A--V--H--H--D--L--Q--P--G--G--R--P-     20

                                                                          
    61 TACGACGGCGACGACGGCGACCGCACGCTGGTGGTGCTGCTCACCTTCGGCATCTTCTTC    120
    61 TACGACGGCGACGACGGCGACCGCACGCTGGTGGTGCTGCTCACCTTCGGCATCTTCTTC    120
    21 -Y--D--G--D--D--G--D--R--T--L--V--V--L--L--T--F--G--I--F--F-     40

                                                                          
   121 TCCTTCGTCATCCTCTACCTCGTCGCCGGCCTCATCTGGGCCGTCGTCATCACGGCCTCC    180
   121 TCCTTCGTCATCCTCTACCTCGTCGCCGGCCTCATCTGGGCCGTCGTCATCACGGCCTCC    180
    41 -S--F--V--I--L--Y--L--V--A--G--L--I--W--A--V--V--I--T--A--S-     60

                                                                          
   181 GCCGTCGTGCTGTCCTTCCTCTACCTCAGGGTCCGGCGGCGGCGCGCCGTGGGCACGGCG    240
   181 GCCGTCGTGCTGTCCTTCCTCTACCTCAGGGTCCGGCGGCGGCGCGCCGTGGGCACGGCG    240
    61 -A--V--V--L--S--F--L--Y--L--R--V--R--R--R--R--A--V--G--T--A-     80

                                                                          
   241 ACGGCGAGGCGAGGAGGGGCGGCGCCCAACGACGTCGTCTTCATCGTGGGAGCTCATCAG    300
   241 ACGGCGAGGCGAGGAGGGGCGGCGCCCAACGACGTCGTCTTCATCGTGGGAGCTCATCAG    300
    81 -T--A--R--R--G--G--A--A--P--N--D--V--V--F--I--V--G--A--H--Q-    100

                                                                          
   301 GCAGCTCGGAACACCGGCAGCGGCGGCGGGCTGGTGGGTGGTGGTGCTGATGCCGCCGCC    360
   301 GCAGCTCGGAACACCGGCAGCGGCGGCGGGCTGGTGGGTGGTGGTGCTGATGCCGCCGCC    360
   101 -A--A--R--N--T--G--S--G--G--G--L--V--G--G--G--A--D--A--A--A-    120

                                                                          
   361 GCCGTCGTGTCCATGATCCCGGCGTTCGAGTACAAGAGGATGAACGGCGGCGAGGACGGC    420
   361 GCCGTCGTGTCCATGATCCCGGCGTTCGAGTACAAGAGGATGAACGGCGGCGAGGACGGC    420
   121 -A--V--V--S--M--I--P--A--F--E--Y--K--R--M--N--G--G--E--D--G-    140

                                                                          
   421 GGCGCGGCGGCCGGGTCGGGGTGGGCGCAGTGCGTGATATGCCTCGGGCTGGTGCAGGTG    480
   421 GGCGCGGCGGCCGGGTCGGGGTGGGCGCAGTGCGTGATATGCCTCGGGCTGGTGCAGGTG    480
   141 -G--A--A--A--G--S--G--W--A--Q--C--V--I--C--L--G--L--V--Q--V-    160

                                                                          
   481 GGCGAGGTGGTGCGGCGGCTGCCGGCGTGCAAGCACCTGTTCCACGTGGAGTGCATCGAC    540
   481 GGCGAGGTGGTGCGGCGGCTGCCGGCGTGCAAGCACCTGTTCCACGTGGAGTGCATCGAC    540
   161 -G--E--V--V--R--R--L--P--A--C--K--H--L--F--H--V--E--C--I--D-    180

                                                                          
   541 GCGTGGCTGAGCTCGCATTCGACTTGCCCGATCTGCCGCGCCGACGTCGTCGACGAGCTC    600
   541 GCGTGGCTGAGCTCGCATTCGACTTGCCCGATCTGCCGCGCCGACGTCGTCGACGAGCTC    600
   181 -A--W--L--S--S--H--S--T--C--P--I--C--R--A--D--V--V--D--E--L-    200

                                                                          
   601 GCCGCCGCCTCCGGCCGGTTAGAGCTGCCGGTTTGA                            636
   601 GCCGCCGCCTCCGGCCGGTTAGAGCTGCCGGTTTGA                            636
   201 -A--A--A--S--G--R--L--E--L--P--V--*-                            211