Oryza punctata (Oryza_punctata_v1.2)
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This transcript has 8 exons, is annotated with 51 domains and features and maps to 28 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OPUNC04G27280.23900763aa
 
Protein coding
A0A0E0KWV0 Ensembl Canonical
-OPUNC04G27280.12289762aa
 
Protein coding
A0A0E0KWU9 -
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
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Other
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     1 ATGCCGGAGGCGGTGGTGGCGGACCGCATGGATCCGGCTGCGGCTGCGGCGTGCGGCGAC     60
     1 ATGCCGGAGGCGGTGGTGGCGGACCGCATGGATCCGGCTGCGGCTGCGGCGTGCGGCGAC     60
     1 -M--P--E--A--V--V--A--D--R--M--D--P--A--A--A--A--A--C--G--D-     20

                                                                          
    61 GAGGCGGCGGAGCGGCGGGAGGTGGAGCAGGAGGAGGATGAGGAGTTCTACGAGTCGCTG    120
    61 GAGGCGGCGGAGCGGCGGGAGGTGGAGCAGGAGGAGGATGAGGAGTTCTACGAGTCGCTG    120
    21 -E--A--A--E--R--R--E--V--E--Q--E--E--D--E--E--F--Y--E--S--L-     40

                                                                          
   121 GATCGGATCCTGTCGTCGTCGTGCTCGTCCACGTCCGCCTCCGACGACGACGTGGCCTCT    180
   121 GATCGGATCCTGTCGTCGTCGTGCTCGTCCACGTCCGCCTCCGACGACGACGTGGCCTCT    180
    41 -D--R--I--L--S--S--S--C--S--S--T--S--A--S--D--D--D--V--A--S-     60

                                                                          
   181 GACTCGGAGCCCCTGCGGCGGCCGTCCCCACGCCTATCCTCCCCTCGTTCGTCGACCCCT    240
   181 GACTCGGAGCCCCTGCGGCGGCCGTCCCCACGCCTATCCTCCCCTCGTTCGTCGACCCCT    240
    61 -D--S--E--P--L--R--R--P--S--P--R--L--S--S--P--R--S--S--T--P-     80

                                                                          
   241 TCTCCCCCGTCCTCGTCGCCGCCACGGCCGGCGCCTGTGGTGGCCGCGGAGGAGCCCAGA    300
   241 TCTCCCCCGTCCTCGTCGCCGCCACGGCCGGCGCCTGTGGTGGCCGCGGAGGAGCCCAGA    300
    81 -S--P--P--S--S--S--P--P--R--P--A--P--V--V--A--A--E--E--P--R-    100

                                                                          
   301 TCCAGCGGCCACGGGAAGCCGCCGCTTGCGAGGAACCCGAGTGGCGGCGCGGAGCAATGC    360
   301 TCCAGCGGCCACGGGAAGCCGCCGCTTGCGAGGAACCCGAGTGGCGGCGCGGAGCAATGC    360
   101 -S--S--G--H--G--K--P--P--L--A--R--N--P--S--G--G--A--E--Q--C-    120

                                                                          
   361 CGGATCCGGAACCTGGACGACGGTACGGAGTTCGAGGTCGGGGAGGTTCACGATGAGGTG    420
   361 CGGATCCGGAACCTGGACGACGGTACGGAGTTCGAGGTCGGGGAGGTTCACGATGAGGTG    420
   121 -R--I--R--N--L--D--D--G--T--E--F--E--V--G--E--V--H--D--E--V-    140

                                                                          
   421 GTCCGGGAGGTCGGCACTGGCCGGCAGCTCACCTTCGAGGAGTTCGAGCTCTGCATTGGC    480
   421 GTCCGGGAGGTCGGCACTGGCCGGCAGCTCACCTTCGAGGAGTTCGAGCTCTGCATTGGC    480
   141 -V--R--E--V--G--T--G--R--Q--L--T--F--E--E--F--E--L--C--I--G-    160

                                                                          
   481 CGCTCTCCGATCGTCCAAGAGCTCATGCGCCGGACCACGACAGCCGCTTCATCCTCCACC    540
   481 CGCTCTCCGATCGTCCAAGAGCTCATGCGCCGGACCACGACAGCCGCTTCATCCTCCACC    540
   161 -R--S--P--I--V--Q--E--L--M--R--R--T--T--T--A--A--S--S--S--T-    180

                                                                          
   541 TCCGACCACGCCACCCCAGCATCCAAGCCACGAAGGAAGCCTGGAGGCTGGTTGCGTGGC    600
   541 TCCGACCACGCCACCCCAGCATCCAAGCCACGAAGGAAGCCTGGAGGCTGGTTGCGTGGC    600
   181 -S--D--H--A--T--P--A--S--K--P--R--R--K--P--G--G--W--L--R--G-    200

                                                                          
   601 ATCCGGCACCTGGCGGGAAGCGTTGCATACGGGCGCCGTAGCACCGATGAGAGGGATAAG    660
   601 ATCCGGCACCTGGCGGGAAGCGTTGCATACGGGCGCCGTAGCACCGATGAGAGGGATAAG    660
   201 -I--R--H--L--A--G--S--V--A--Y--G--R--R--S--T--D--E--R--D--K-    220

                                                                          
   661 GAGAAGGAGAAGGAGAAGAAGGAGAGGGAAGCGCGGCGCCTGAGCTCCGCCACCGATGAC    720
   661 GAGAAGGAGAAGGAGAAGAAGGAGAGGGAAGCGCGGCGCCTGAGCTCCGCCACCGATGAC    720
   221 -E--K--E--K--E--K--K--E--R--E--A--R--R--L--S--S--A--T--D--D-    240

                                                                          
   721 AGCCTTGATGGCAACGGCTCGCGCAATGCAGGGAGGGTCAGGGTGCGGCAGTATGGGAAG    780
   721 AGCCTTGATGGCAACGGCTCGCGCAATGCAGGGAGGGTCAGGGTGCGGCAGTATGGGAAG    780
   241 -S--L--D--G--N--G--S--R--N--A--G--R--V--R--V--R--Q--Y--G--K-    260

                                                                          
   781 GCCTGCAAGGAGCTCACCGGTCTGTTCATGACACAGGAATTGGCTGCTCATTCGGGCTCA    840
   781 GCCTGCAAGGAGCTCACCGGTCTGTTCATGACACAGGAATTGGCTGCTCATTCGGGCTCA    840
   261 -A--C--K--E--L--T--G--L--F--M--T--Q--E--L--A--A--H--S--G--S-    280

                                                                          
   841 ATCTGGTGTATTAACTTCAGCTTGGATGGACGATACCTTGCAAGCGCCGGCGAGGACCGT    900
   841 ATCTGGTGTATTAACTTCAGCTTGGATGGACGATACCTTGCAAGCGCCGGCGAGGACCGT    900
   281 -I--W--C--I--N--F--S--L--D--G--R--Y--L--A--S--A--G--E--D--R-    300

                                                                          
   901 GTCATCCATGTGTGGGAGGTATCAGAGGGAGAGAGGAAGGGAGAGTTGCTCGGGGAAGGT    960
   901 GTCATCCATGTGTGGGAGGTATCAGAGGGAGAGAGGAAGGGAGAGTTGCTCGGGGAAGGT    960
   301 -V--I--H--V--W--E--V--S--E--G--E--R--K--G--E--L--L--G--E--G-    320

                                                                          
   961 ACAGTGGCAAGGGAGAATGGTGGCGGCTGCAGCCCGTTTCTTGCAGCTGTTGGAAATGGA   1020
   961 ACAGTGGCAAGGGAGAATGGTGGCGGCTGCAGCCCGTTTCTTGCAGCTGTTGGAAATGGA   1020
   321 -T--V--A--R--E--N--G--G--G--C--S--P--F--L--A--A--V--G--N--G-    340

                                                                          
  1021 TCGCCGGAGCTGGCAACATTGTCATTGAGCTGTGCTGACGGGGGTTTTGTGGAGAAGAAG   1080
  1021 TCGCCGGAGCTGGCAACATTGTCATTGAGCTGTGCTGACGGGGGTTTTGTGGAGAAGAAG   1080
   341 -S--P--E--L--A--T--L--S--L--S--C--A--D--G--G--F--V--E--K--K-    360

                                                                          
  1081 AGGAGGCCAAGGATGCAAAGCAGCCGGAAGTCTGTTGGCTCTGATCATCTAGTTGTCCCT   1140
  1081 AGGAGGCCAAGGATGCAAAGCAGCCGGAAGTCTGTTGGCTCTGATCATCTAGTTGTCCCT   1140
   361 -R--R--P--R--M--Q--S--S--R--K--S--V--G--S--D--H--L--V--V--P-    380

                                                                          
  1141 GAATGTGTGTTTGGGTTCAGAGATAAACCAGTATGCTCTCTACTGGGTCACGCCGCCGAT   1200
  1141 GAATGTGTGTTTGGGTTCAGAGATAAACCAGTATGCTCTCTACTGGGTCACGCCGCCGAT   1200
   381 -E--C--V--F--G--F--R--D--K--P--V--C--S--L--L--G--H--A--A--D-    400

                                                                          
  1201 GTTCTTGATCTATCATGGTCCAAATCTCAGTACTTGCTTTCATCCTCAATGGACAAAACT   1260
  1201 GTTCTTGATCTATCATGGTCCAAATCTCAGTACTTGCTTTCATCCTCAATGGACAAAACT   1260
   401 -V--L--D--L--S--W--S--K--S--Q--Y--L--L--S--S--S--M--D--K--T-    420

                                                                          
  1261 GTTAAACTATGGGACATTACTACTAGTACCTGTCTGAAAACATTTTCACACACAGACTAT   1320
  1261 GTTAAACTATGGGACATTACTACTAGTACCTGTCTGAAAACATTTTCACACACAGACTAT   1320
   421 -V--K--L--W--D--I--T--T--S--T--C--L--K--T--F--S--H--T--D--Y-    440

                                                                          
  1321 GTGACTTGCATCCAATTCAATCCCGTGGATGATAACTTCTTCATTAGTGGATCACTGGAT   1380
  1321 GTGACTTGCATCCAATTCAATCCCGTGGATGATAACTTCTTCATTAGTGGATCACTGGAT   1380
   441 -V--T--C--I--Q--F--N--P--V--D--D--N--F--F--I--S--G--S--L--D-    460

                                                                          
  1381 GAAAAAGTACGCATTTGGAATGTACATGATCGTAAGATTGAGGATTGGAATGATCTTCAT   1440
  1381 GAAAAAGTACGCATTTGGAATGTACATGATCGTAAGATTGAGGATTGGAATGATCTTCAT   1440
   461 -E--K--V--R--I--W--N--V--H--D--R--K--I--E--D--W--N--D--L--H-    480

                                                                          
  1441 GAGATGGTCACTGCTGCGTGTTACTCCCCTGATGGACAGGTTGCACTGGTGGGATCACAC   1500
  1441 GAGATGGTCACTGCTGCGTGTTACTCCCCTGATGGACAGGTTGCACTGGTGGGATCACAC   1500
   481 -E--M--V--T--A--A--C--Y--S--P--D--G--Q--V--A--L--V--G--S--H-    500

                                                                          
  1501 AAGGGAAGCTGTCATTTATTTGATACAACTGAAAAGAAGCTTCAGTACAAAAATCAGATA   1560
  1501 AAGGGAAGCTGTCATTTATTTGATACAACTGAAAAGAAGCTTCAGTACAAAAATCAGATA   1560
   501 -K--G--S--C--H--L--F--D--T--T--E--K--K--L--Q--Y--K--N--Q--I-    520

                                                                          
  1561 GAACTAAGAATCAGGAAGAAGAAGTCTGGCCAGAAGAAGATAACTGGCTTCCAGTTTGCT   1620
  1561 GAACTAAGAATCAGGAAGAAGAAGTCTGGCCAGAAGAAGATAACTGGCTTCCAGTTTGCT   1620
   521 -E--L--R--I--R--K--K--K--S--G--Q--K--K--I--T--G--F--Q--F--A-    540

                                                                          
  1621 CCTGGAAGCTCGTCGGAAGTCCTGATTACCTCTGCAGATTCACGAATCCGTGTTGTTAAT   1680
  1621 CCTGGAAGCTCGTCGGAAGTCCTGATTACCTCTGCAGATTCACGAATCCGTGTTGTTAAT   1680
   541 -P--G--S--S--S--E--V--L--I--T--S--A--D--S--R--I--R--V--V--N-    560

                                                                          
  1681 GGTGATGAACTTGTTCACAAATTTAAAGGGTTCCGCAATACAAGTAGCCAAATATCCGCT   1740
  1681 GGTGATGAACTTGTTCACAAATTTAAAGGGTTCCGCAATACAAGTAGCCAAATATCCGCT   1740
   561 -G--D--E--L--V--H--K--F--K--G--F--R--N--T--S--S--Q--I--S--A-    580

                                                                          
  1741 TCTGTAGCTCCAAACGGGAAATATGTGGTCTGTGCCAGTGAGGACTCCCACGTGTATGTC   1800
  1741 TCTGTAGCTCCAAACGGGAAATATGTGGTCTGTGCCAGTGAGGACTCCCACGTGTATGTC   1800
   581 -S--V--A--P--N--G--K--Y--V--V--C--A--S--E--D--S--H--V--Y--V-    600

                                                                          
  1801 TGGAGGCATGACAATACTTCCCATCCGAGCAGAAGCAGGAGTGCAGTTGATGTAACCAAC   1860
  1801 TGGAGGCATGACAATACTTCCCATCCGAGCAGAAGCAGGAGTGCAGTTGATGTAACCAAC   1860
   601 -W--R--H--D--N--T--S--H--P--S--R--S--R--S--A--V--D--V--T--N-    620

                                                                          
  1861 TCATATGAGCATTTCCATTGCCATGATGTCACTGTGGCTATCACATGGCCCGGCGCTGAA   1920
  1861 TCATATGAGCATTTCCATTGCCATGATGTCACTGTGGCTATCACATGGCCCGGCGCTGAA   1920
   621 -S--Y--E--H--F--H--C--H--D--V--T--V--A--I--T--W--P--G--A--E-    640

                                                                          
  1921 TCCCGTGGCTCATTCGGGTCCCGTAGCAGCAGAAACAGTGATTCAGACGATGCAGTGATG   1980
  1921 TCCCGTGGCTCATTCGGGTCCCGTAGCAGCAGAAACAGTGATTCAGACGATGCAGTGATG   1980
   641 -S--R--G--S--F--G--S--R--S--S--R--N--S--D--S--D--D--A--V--M-    660

                                                                          
  1981 AACACGGGTCGGGATGCCCCTGTAGAAAACAGTGAGCACGATCTGAATGGCACTGTCAAT   2040
  1981 AACACGGGTCGGGATGCCCCTGTAGAAAACAGTGAGCACGATCTGAATGGCACTGTCAAT   2040
   661 -N--T--G--R--D--A--P--V--E--N--S--E--H--D--L--N--G--T--V--N-    680

                                                                          
  2041 AGATGCACCAAGCACCCAGTTTGTGAAGGTGTTGCAAGCACAAGCAATCCTCCAGCGGAT   2100
  2041 AGATGCACCAAGCACCCAGTTTGTGAAGGTGTTGCAAGCACAAGCAATCCTCCAGCGGAT   2100
   681 -R--C--T--K--H--P--V--C--E--G--V--A--S--T--S--N--P--P--A--D-    700

                                                                          
  2101 GGAGTATCAACGTCCTGGCCTGACGAGAAACAATCGTCTGCCAAGAGCAGTCCTGGTCAC   2160
  2101 GGAGTATCAACGTCCTGGCCTGACGAGAAACAATCGTCTGCCAAGAGCAGTCCTGGTCAC   2160
   701 -G--V--S--T--S--W--P--D--E--K--Q--S--S--A--K--S--S--P--G--H-    720

                                                                          
  2161 TGCTCATCCGACCTTTGCATTGGAGCTTTGGATGTTCAGCGCCGGTCAGCTTGGGGATTG   2220
  2161 TGCTCATCCGACCTTTGCATTGGAGCTTTGGATGTTCAGCGCCGGTCAGCTTGGGGATTG   2220
   721 -C--S--S--D--L--C--I--G--A--L--D--V--Q--R--R--S--A--W--G--L-    740

                                                                          
  2221 GTGATTGTCACTGCAGGAAGGGGTGGTGAAATTAGGGTGTTCCAGAATTTCGGCTTCCCG   2280
  2221 GTGATTGTCACTGCAGGAAGGGGTGGTGAAATTAGGGTGTTCCAGAATTTCGGCTTCCCG   2280
   741 -V--I--V--T--A--G--R--G--G--E--I--R--V--F--Q--N--F--G--F--P-    760

                                                                          
  2281 GTTCAAGTGTAGAATATTCAGAGATGTTGGGAGCCCCAATAGCTCACTCCAACTTGGTAA   2340
  2281 GTTCAAGTGTAG................................................   2292
   761 -V--Q--V--*-................................................    763

                                                                          
  2341 GCACCACACTATTTTTTTTTCCTCTGTTGATACAAGGCTTTGTGTAATTGTATGGTTAAC   2400
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2401 AACCAATACATCAATTTGTTTGTTCATATATTGTTTCTTGGTTTATACACTGATTGATAT   2460
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2461 ATGAAGATAATTTCTAACTCCATGATAATCCATTGTGCAATCTTCCCTCCCAATATGGCT   2520
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2521 TTATTGATCTACACTGTTCAGCATTCTACAGTTCATTTAATTAGTAGGAGCACATGCTAG   2580
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2581 AATCTTGATGGCAACAAACTTTTATTATTGTCATTAACACTGCACATACGTAAACACATC   2640
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2641 TTCCAGCTACAGATCACGATTCACTGATTCTAATGATAATCACCACATCATTGTGCAAGC   2700
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2701 ATATGAAATTGGCGAGAGAAGAAAACAGCAAACACCACGTTGGAGAATTGAGCTGCTTAC   2760
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2761 ATTCCCAATAATTATATCATATCCCTAGCTCAGCAAAACATACTTGATACCGATCGAAGA   2820
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2821 ACACACTACCTGCATACCGATCGAAGAACACACTACCTGAGGCTGCTTTGCTAAAACCGG   2880
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2881 AGCCTCCATAACACGAGCGACCAGCTGTGTTCGTCAGTTACCCGGCGGCGGCCAGCTGAG   2940
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2941 ATCAAGGCCGGCGATGTCGGTGAAGTTGTCCCACGCCGCGCCGGTGACCGCCGTTCCATC   3000
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3001 GTCCCACGGCGCGAGCCCACAATTGTACAGGTCAGGGATCGCCGACTGCCAAGAGAACGC   3060
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3061 AGCCGGTGCAACGCCGGCGAGACCGAACGACGGCAGGAAGGCGCCGTCACTGAGAAACGG   3120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3121 GAAGCCGGCGGGGAGTTCAGCATACGCGTCCGTGGACGTCGTGGGTGGCGGCGACGCCGA   3180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3181 GGAAGGGTCGGCGTCGGCGGAGACTCTGCGGCGCTTGCCGCCGCCGCGGCGAGAGGCGCC   3240
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3241 GCCGACCGGCACGTCGCGGAGCGTGCCCCCGTGCGTCCAGTAGCGGCGGCAGGCGCGGCA   3300
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3301 GAAGTGGCGCGGCTGCGACGTGCTGTAGTTGTTGTAGTAGCAGAACTTGGTGTTTGTGGA   3360
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3361 TCGGCAGCGCGGGCACTCCAGCTGCTGCTTCTTCTCCTGCTGGCCCGTGCGCGGCGAGAC   3420
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3421 CTCCTGATCTCCCTGCAAATCAAAAACCACATGTCAGTGGCCGATCCCCTTCAACTTCAC   3480
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3481 ATAGCAACACAACTGCAAGTGTAACGAACTGACCTGTGGTGGCGGCGAGGAGTCGGTGAG   3540
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3541 CGGGACAGCGTCGGAATCGGCCGGGCGCTTGTTGGAGGCGGTGGCGGCGGCGGAGAGCAC   3600
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3601 TACTGACGGGGAGGAGGCCACTGCAGGAGCCATTTGGTCGGTTGCAGCAGCAGAAGGGCA   3660
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3661 TGCCGCGGTCAGACTACTGCTCGCCTTAATAACCTCGCGCTATCTACGATCTCTGCTGCT   3720
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3721 TTGCTGTTTCTGTGGGCGCGTGATCTCGTCTCTCTCGGGAGGAGGAAACTAAGGAAGAAG   3780
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3781 AGCTAAGCTAGCAGCAGCCGGCTATTTGTAGCAAGATCCTAGTACGAGACGACGAGGAGG   3840
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3841 CTGGTATATTTAGCTTGGTAGACAGAGACGTAGCAGTCAGTCCGACCTGGACGGCGGCAA   3900
       ............................................................       
       ............................................................