Oryza punctata (Oryza_punctata_v1.2)
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This transcript has 8 exons, is annotated with 11 domains and features and maps to 6 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OPUNC04G10670.12066492aa
 
Protein coding
A0A0E0KQM2 Ensembl Canonical
-OPUNC04G10670.22361478aa
 
Protein coding
A0A0E0KQM3 -
-OPUNC04G10670.42229442aa
 
Protein coding
A0A0E0KQM5 -
-OPUNC04G10670.31934456aa
 
Protein coding
A0A0E0KQM4 -
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     1 AAAAGCCCGTATCGCCATTTTGCCAACATCTGGCCTTCCTTCTCTCCGCCTCGCGCCGCC     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 TGCGCCGATCTCTCCGTCCCGCGGCCACCGCGTGCCGGCGGCGCCGCGCCCCTGCTGCTT    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 CTGCGGCATCCTCGCCGAGTTCCCCCCTCCGCCGCCGCCTCCCGCGCCGATACCCGTCCC    180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   181 GCGGGCACGGTCCTGCGTCGTCTTGCTGCTTCCGCCGCATCCTCCTCGCCGATGACACCA    240
       ...................................................ATGACACCA      9
       ...................................................-M--T--P-      3

                                                                          
   241 AAATGGAGTGAATGCTCTTCAAATAGTTATAGAGAATTATCTTCAAAGGAAAATGGAGAA    300
    10 AAATGGAGTGAATGCTCTTCAAATAGTTATAGAGAATTATCTTCAAAGGAAAATGGAGAA     69
     4 -K--W--S--E--C--S--S--N--S--Y--R--E--L--S--S--K--E--N--G--E-     23

                                                                          
   301 GGCAAATCATCCATAACAGAGGCAGTTGTTTCATCTACAAGCTATTTTGGTTCACCAGCT    360
    70 GGCAAATCATCCATAACAGAGGCAGTTGTTTCATCTACAAGCTATTTTGGTTCACCAGCT    129
    24 -G--K--S--S--I--T--E--A--V--V--S--S--T--S--Y--F--G--S--P--A-     43

                                                                          
   361 GTCAACAGAATGTGTTCCCTATCTACACAAAAGAAGGATGGGAATGTCTATAAAAGGAGG    420
   130 GTCAACAGAATGTGTTCCCTATCTACACAAAAGAAGGATGGGAATGTCTATAAAAGGAGG    189
    44 -V--N--R--M--C--S--L--S--T--Q--K--K--D--G--N--V--Y--K--R--R-     63

                                                                          
   421 AAGATGGAGAAGGATTCAACTTCCCTTACAGCAAATGAAGAATTTATAGAAATGACAGCT    480
   190 AAGATGGAGAAGGATTCAACTTCCCTTACAGCAAATGAAGAATTTATAGAAATGACAGCT    249
    64 -K--M--E--K--D--S--T--S--L--T--A--N--E--E--F--I--E--M--T--A-     83

                                                                          
   481 CAAAATTGCACAACTTCTGAAGACCACTCTTCATTACTGCTACCTGTTACTTCAGATGCA    540
   250 CAAAATTGCACAACTTCTGAAGACCACTCTTCATTACTGCTACCTGTTACTTCAGATGCA    309
    84 -Q--N--C--T--T--S--E--D--H--S--S--L--L--L--P--V--T--S--D--A-    103

                                                                          
   541 ATGATTTCAAATTCAACGGCACCTATCCTTGAACATGATGAGCCTGCTGGAGTTTCGCTG    600
   310 ATGATTTCAAATTCAACGGCACCTATCCTTGAACATGATGAGCCTGCTGGAGTTTCGCTG    369
   104 -M--I--S--N--S--T--A--P--I--L--E--H--D--E--P--A--G--V--S--L-    123

                                                                          
   601 GTGCCAAATTCTTGTTTGAATGATAGATCTTCAGTATCTAGTATGCTTCCACCATTCATG    660
   370 GTGCCAAATTCTTGTTTGAATGATAGATCTTCAGTATCTAGTATGCTTCCACCATTCATG    429
   124 -V--P--N--S--C--L--N--D--R--S--S--V--S--S--M--L--P--P--F--M-    143

                                                                          
   661 TTGTTTGATAAAAAGGATGCTACTGAATGTTCCTCGTCAAATATTGGTTCTACAGAACCA    720
   430 TTGTTTGATAAAAAGGATGCTACTGAATGTTCCTCGTCAAATATTGGTTCTACAGAACCA    489
   144 -L--F--D--K--K--D--A--T--E--C--S--S--S--N--I--G--S--T--E--P-    163

                                                                          
   721 ATGGCAGGTTTCACATCGGCAAGGGATCTTTGCATTGCCATACTGAGGGAAGATGGACTA    780
   490 ATGGCAGGTTTCACATCGGCAAGGGATCTTTGCATTGCCATACTGAGGGAAGATGGACTA    549
   164 -M--A--G--F--T--S--A--R--D--L--C--I--A--I--L--R--E--D--G--L-    183

                                                                          
   781 ATAACTGAATCGCGAACTAAAATCACGACAGAGGAATTCACTGGTTATGACGCCAACTTA    840
   550 ATAACTGAATCGCGAACTAAAATCACGACAGAGGAATTCACTGGTTATGACGCCAACTTA    609
   184 -I--T--E--S--R--T--K--I--T--T--E--E--F--T--G--Y--D--A--N--L-    203

                                                                          
   841 CTGTTCCCATGCAATACTTGCGGGAAATCAGACCATCCATTAAAGATGCTTATATGTGAT    900
   610 CTGTTCCCATGCAATACTTGCGGGAAATCAGACCATCCATTAAAGATGCTTATATGTGAT    669
   204 -L--F--P--C--N--T--C--G--K--S--D--H--P--L--K--M--L--I--C--D-    223

                                                                          
   901 TCTTGTGAAGCAGCATTCCATCTGTCTTGTTGCATCCCTCGTGTTCATGAGGTACCAACT    960
   670 TCTTGTGAAGCAGCATTCCATCTGTCTTGTTGCATCCCTCGTGTTCATGAGGTACCAACT    729
   224 -S--C--E--A--A--F--H--L--S--C--C--I--P--R--V--H--E--V--P--T-    243

                                                                          
   961 GATGAATGGTATTGTCTGACATGCTTCAGGAAGAAACCAAAGAGTCAGTATGGCAAGCTG   1020
   730 GATGAATGGTATTGTCTGACATGCTTCAGGAAGAAACCAAAGAGTCAGTATGGCAAGCTG    789
   244 -D--E--W--Y--C--L--T--C--F--R--K--K--P--K--S--Q--Y--G--K--L-    263

                                                                          
  1021 TCAGAGGGAAAGGTCAAATCTTCAGGGAATATTAACCAAAAGCCTAATGGCATGAGTCAT   1080
   790 TCAGAGGGAAAGGTCAAATCTTCAGGGAATATTAACCAAAAGCCTAATGGCATGAGTCAT    849
   264 -S--E--G--K--V--K--S--S--G--N--I--N--Q--K--P--N--G--M--S--H-    283

                                                                          
  1081 ATAGAGTACATGTTAAAAGATACCAAACCATATGTTACTGGGGTTCGAATTGGTATGGAC   1140
   850 ATAGAGTACATGTTAAAAGATACCAAACCATATGTTACTGGGGTTCGAATTGGTATGGAC    909
   284 -I--E--Y--M--L--K--D--T--K--P--Y--V--T--G--V--R--I--G--M--D-    303

                                                                          
  1141 TTTCAAGCAGAAGTGCCAGAATGGTCTTGTCCCACTTCCAGTGCTGATGTTTATTGCGAG   1200
   910 TTTCAAGCAGAAGTGCCAGAATGGTCTTGTCCCACTTCCAGTGCTGATGTTTATTGCGAG    969
   304 -F--Q--A--E--V--P--E--W--S--C--P--T--S--S--A--D--V--Y--C--E-    323

                                                                          
  1201 GAACCCTCTGAATTTGATTCTGCTGACCTCACTAAATTGAACTGGTCAAAAACTAATACA   1260
   970 GAACCCTCTGAATTTGATTCTGCTGACCTCACTAAATTGAACTGGTCAAAAACTAATACA   1029
   324 -E--P--S--E--F--D--S--A--D--L--T--K--L--N--W--S--K--T--N--T-    343

                                                                          
  1261 CAATATAGATCTTCAATCGGTAATTGGATACAATGCCGTGAGGTCTTGAGTGAAGGAGAT   1320
  1030 CAATATAGATCTTCAATCGGTAATTGGATACAATGCCGTGAGGTCTTGAGTGAAGGAGAT   1089
   344 -Q--Y--R--S--S--I--G--N--W--I--Q--C--R--E--V--L--S--E--G--D-    363

                                                                          
  1321 TCTGATAAGCCAGTCATCTGTGGCAAATGGAGAAGGGCACCTCTATTTGTTGTTCAGTCA   1380
  1090 TCTGATAAGCCAGTCATCTGTGGCAAATGGAGAAGGGCACCTCTATTTGTTGTTCAGTCA   1149
   364 -S--D--K--P--V--I--C--G--K--W--R--R--A--P--L--F--V--V--Q--S-    383

                                                                          
  1381 GATGATTGGGACTGCTCCTGTTGTCTACCTTGGGATCCGGCTCACGCTGATTGTGCTGTT   1440
  1150 GATGATTGGGACTGCTCCTGTTGTCTACCTTGGGATCCGGCTCACGCTGATTGTGCTGTT   1209
   384 -D--D--W--D--C--S--C--C--L--P--W--D--P--A--H--A--D--C--A--V-    403

                                                                          
  1441 CCGCAGGAATTGGGTACGGATGAAGTTCTAAGGCAGCTGAAGTATGTGAGGATGGTGAAG   1500
  1210 CCGCAGGAATTGGGTACGGATGAAGTTCTAAGGCAGCTGAAGTATGTGAGGATGGTGAAG   1269
   404 -P--Q--E--L--G--T--D--E--V--L--R--Q--L--K--Y--V--R--M--V--K-    423

                                                                          
  1501 AATCGGCTGGTTGATCGAAATCACACGCCTGCTAAAGTTCCAAGGATGATACAACAGGCC   1560
  1270 AATCGGCTGGTTGATCGAAATCACACGCCTGCTAAAGTTCCAAGGATGATACAACAGGCC   1329
   424 -N--R--L--V--D--R--N--H--T--P--A--K--V--P--R--M--I--Q--Q--A-    443

                                                                          
  1561 ATAGGGGGAGGCGTATTTGTAACGGCATTTAGTGTTTTGTGAGCATTTCTTTAGTGCTGC   1620
  1330 ATAGGGGGAGGCGTATTTGTAACGGCATTTAGTGTTTTGTGA..................   1371
   444 -I--G--G--G--V--F--V--T--A--F--S--V--L--*-..................    456

                                                                          
  1621 TGTTGCCGTCTTGGAAAAGAATGCTGCTTGGTGGTATTCCATTTTGTAATGCCTGGTGTG   1680
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1681 TTTGTAGAAGCAGTAGATATTGAGTTATATGCAGCCCAGAAGATATCTTGCATAGGCTGT   1740
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1741 CAGCCTGTCACCATCTTTGTACAAATGAAAAAACATCGGGGACCTAGTGGTAAGGCCATG   1800
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1801 ATCCGCAGGGGAAGGGATATGATATTTTGAAGTGTTTCTATCGTTCTTTACGTATCTTTC   1860
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1861 AGAATATACTGTACTGATAATTTGGCAACAATGACACTGTTGACTTTTGGATATAGGGTT   1920
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1921 TGTCTGGTTTGCTA                                                 1934
       ..............                                                     
       ..............