Oryza punctata (Oryza_punctata_v1.2)
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This transcript has 8 exons, is annotated with 29 domains and features and maps to 9 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OPUNC04G10280.12103700aa
 
Protein coding
A0A0E0KQH0 Ensembl Canonical
Variants
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     1 ATGGCGAGGAGCGGTGGCCGTGACGGTTGTTGTTCTTCCTGCGCTGCCGCCTTCCGTGGA     60
     1 ATGGCGAGGAGCGGTGGCCGTGACGGTTGTTGTTCTTCCTGCGCTGCCGCCTTCCGTGGA     60
     1 -M--A--R--S--G--G--R--D--G--C--C--S--S--C--A--A--A--F--R--G-     20

                                                                          
    61 GTGAACCACCGACGACGAACAAGGGATGATATCTTCTTTGATGCATTTGATGATATTACA    120
    61 GTGAACCACCGACGACGAACAAGGGATGATATCTTCTTTGATGCATTTGATGATATTACA    120
    21 -V--N--H--R--R--R--T--R--D--D--I--F--F--D--A--F--D--D--I--T-     40

                                                                          
   121 TCAACAAGGGAGCCTTCATTGTCAGATGATTGCAGCACAAGTGATGAAGGATTAGCATCA    180
   121 TCAACAAGGGAGCCTTCATTGTCAGATGATTGCAGCACAAGTGATGAAGGATTAGCATCA    180
    41 -S--T--R--E--P--S--L--S--D--D--C--S--T--S--D--E--G--L--A--S-     60

                                                                          
   181 AGGAGATTTGAGTACGATATTTGGGGGAACGAGCCAATGAGTGTTGAAGAAAGGCGGCAA    240
   181 AGGAGATTTGAGTACGATATTTGGGGGAACGAGCCAATGAGTGTTGAAGAAAGGCGGCAA    240
    61 -R--R--F--E--Y--D--I--W--G--N--E--P--M--S--V--E--E--R--R--Q-     80

                                                                          
   241 AGGTTCCTGAAGGGAATGGGGTTTGATGAATTTGTTGCTACCAGAGTGGATTTTTCTCAA    300
   241 AGGTTCCTGAAGGGAATGGGGTTTGATGAATTTGTTGCTACCAGAGTGGATTTTTCTCAA    300
    81 -R--F--L--K--G--M--G--F--D--E--F--V--A--T--R--V--D--F--S--Q-    100

                                                                          
   301 ACACAGGAAGAAATCACATCTGTTGGCCCTTTCGCTGACTTGGAGTTAGAGGAGGGTACT    360
   301 ACACAGGAAGAAATCACATCTGTTGGCCCTTTCGCTGACTTGGAGTTAGAGGAGGGTACT    360
   101 -T--Q--E--E--I--T--S--V--G--P--F--A--D--L--E--L--E--E--G--T-    120

                                                                          
   361 ACCAGTGACATTTCTTCCGTGAATTCATCTGTTCGTGAGAATGATTCAGTTTCTGATGGC    420
   361 ACCAGTGACATTTCTTCCGTGAATTCATCTGTTCGTGAGAATGATTCAGTTTCTGATGGC    420
   121 -T--S--D--I--S--S--V--N--S--S--V--R--E--N--D--S--V--S--D--G-    140

                                                                          
   421 TCCTGTTGCATAAGAGATATTGACAGTGGCGAGAGATATGCAGCTCAGAATGATGGATAT    480
   421 TCCTGTTGCATAAGAGATATTGACAGTGGCGAGAGATATGCAGCTCAGAATGATGGATAT    480
   141 -S--C--C--I--R--D--I--D--S--G--E--R--Y--A--A--Q--N--D--G--Y-    160

                                                                          
   481 GGTGAATTAACTAGCATGCTTAAGGATGTCGCATCACATAAGGTGATGTCTCTTCTGGAG    540
   481 GGTGAATTAACTAGCATGCTTAAGGATGTCGCATCACATAAGGTGATGTCTCTTCTGGAG    540
   161 -G--E--L--T--S--M--L--K--D--V--A--S--H--K--V--M--S--L--L--E-    180

                                                                          
   541 TTTGATGGCTTACCCGGCCTTTCTCAATCTGTTCAAAAGTTATTGCGAAAGGTGTACAGC    600
   541 TTTGATGGCTTACCCGGCCTTTCTCAATCTGTTCAAAAGTTATTGCGAAAGGTGTACAGC    600
   181 -F--D--G--L--P--G--L--S--Q--S--V--Q--K--L--L--R--K--V--Y--S-    200

                                                                          
   601 AGCTCTTTGGAAGAAAAAAAGAAAGTGCTTAATAAAAAAAAGGGTGTCAAGAGCTTGTGG    660
   601 AGCTCTTTGGAAGAAAAAAAGAAAGTGCTTAATAAAAAAAAGGGTGTCAAGAGCTTGTGG    660
   201 -S--S--L--E--E--K--K--K--V--L--N--K--K--K--G--V--K--S--L--W-    220

                                                                          
   661 AAGAGCTTCATGAAAAACAGGAGTTTTGGTGGAATTTGCAAGTACGACATCAATGTAAAA    720
   661 AAGAGCTTCATGAAAAACAGGAGTTTTGGTGGAATTTGCAAGTACGACATCAATGTAAAA    720
   221 -K--S--F--M--K--N--R--S--F--G--G--I--C--K--Y--D--I--N--V--K-    240

                                                                          
   721 AACTGCACAATGGGCATACCATCCAGAACAAAAGTTCAACATCGAAAGAAAAAAACCGTG    780
   721 AACTGCACAATGGGCATACCATCCAGAACAAAAGTTCAACATCGAAAGAAAAAAACCGTG    780
   241 -N--C--T--M--G--I--P--S--R--T--K--V--Q--H--R--K--K--K--T--V-    260

                                                                          
   781 GAATTTTCCGCTGTCCATATGGGTCAAGAAATCCAAGCTCATAAGGGTTTAATTAAAGTA    840
   781 GAATTTTCCGCTGTCCATATGGGTCAAGAAATCCAAGCTCATAAGGGTTTAATTAAAGTA    840
   261 -E--F--S--A--V--H--M--G--Q--E--I--Q--A--H--K--G--L--I--K--V-    280

                                                                          
   841 ATGAAATTCAGCCCGTCAGGCTGGTATTTAGCAACTGGTGGTGAGGACTGCATTGTACGG    900
   841 ATGAAATTCAGCCCGTCAGGCTGGTATTTAGCAACTGGTGGTGAGGACTGCATTGTACGG    900
   281 -M--K--F--S--P--S--G--W--Y--L--A--T--G--G--E--D--C--I--V--R-    300

                                                                          
   901 ATATGGCAGATTATGGAAGTGGAAACGTCTTCAAAGTTATATGGGGGAGACAACCCTCAG    960
   901 ATATGGCAGATTATGGAAGTGGAAACGTCTTCAAAGTTATATGGGGGAGACAACCCTCAG    960
   301 -I--W--Q--I--M--E--V--E--T--S--S--K--L--Y--G--G--D--N--P--Q-    320

                                                                          
   961 AACTATGATGATAAAATTACAATCATCAAAACGGAACTAGGAAGAGGGAAGAATCATGCC   1020
   961 AACTATGATGATAAAATTACAATCATCAAAACGGAACTAGGAAGAGGGAAGAATCATGCC   1020
   321 -N--Y--D--D--K--I--T--I--I--K--T--E--L--G--R--G--K--N--H--A-    340

                                                                          
  1021 CTTGCGGTAGTGCCCAAGAAAGGTTTCCGTATTTCAGAGGCTCCATTACATGAATTCCAA   1080
  1021 CTTGCGGTAGTGCCCAAGAAAGGTTTCCGTATTTCAGAGGCTCCATTACATGAATTCCAA   1080
   341 -L--A--V--V--P--K--K--G--F--R--I--S--E--A--P--L--H--E--F--Q-    360

                                                                          
  1081 GGCCATACAGATGATATCCTGGATATGGCATGGTCAGAGTCAGATTATCTCTTGACCTCA   1140
  1081 GGCCATACAGATGATATCCTGGATATGGCATGGTCAGAGTCAGATTATCTCTTGACCTCA   1140
   361 -G--H--T--D--D--I--L--D--M--A--W--S--E--S--D--Y--L--L--T--S-    380

                                                                          
  1141 TCAAAGGATAAGACAGTGCGCTTGTGGAAAGTTGGCTGTGATGGTTGTCTTGGATTGTTC   1200
  1141 TCAAAGGATAAGACAGTGCGCTTGTGGAAAGTTGGCTGTGATGGTTGTCTTGGATTGTTC   1200
   381 -S--K--D--K--T--V--R--L--W--K--V--G--C--D--G--C--L--G--L--F-    400

                                                                          
  1201 AAACACAAGGACTACGTTACTTGTGTTCAATTCAATCCTATCGATGAGAGATACTTCATC   1260
  1201 AAACACAAGGACTACGTTACTTGTGTTCAATTCAATCCTATCGATGAGAGATACTTCATC   1260
   401 -K--H--K--D--Y--V--T--C--V--Q--F--N--P--I--D--E--R--Y--F--I-    420

                                                                          
  1261 AGTGGTTCAATAGATGGAAAAGTTCGCGTTTGGGATGCTTTAGACAAGAGAGTAGTTGAC   1320
  1261 AGTGGTTCAATAGATGGAAAAGTTCGCGTTTGGGATGCTTTAGACAAGAGAGTAGTTGAC   1320
   421 -S--G--S--I--D--G--K--V--R--V--W--D--A--L--D--K--R--V--V--D-    440

                                                                          
  1321 TGGGCTGATACACGGAAGATCATAACTGCTCTTAGTTATCAACCAGATGGAAAGGGTTTC   1380
  1321 TGGGCTGATACACGGAAGATCATAACTGCTCTTAGTTATCAACCAGATGGAAAGGGTTTC   1380
   441 -W--A--D--T--R--K--I--I--T--A--L--S--Y--Q--P--D--G--K--G--F-    460

                                                                          
  1381 ATTGTTGGCTCTACTTCTGGAGAATGCCGCTTTTATGATCAATCAGGTGAAAACATCCAA   1440
  1381 ATTGTTGGCTCTACTTCTGGAGAATGCCGCTTTTATGATCAATCAGGTGAAAACATCCAA   1440
   461 -I--V--G--S--T--S--G--E--C--R--F--Y--D--Q--S--G--E--N--I--Q-    480

                                                                          
  1441 CTGGACAAAGAATTGCTTATGCAAGGGAAGAAGTCTGCTGTTCGTCGGGTCAACAGTCTG   1500
  1441 CTGGACAAAGAATTGCTTATGCAAGGGAAGAAGTCTGCTGTTCGTCGGGTCAACAGTCTG   1500
   481 -L--D--K--E--L--L--M--Q--G--K--K--S--A--V--R--R--V--N--S--L-    500

                                                                          
  1501 CAGTTATGTACAAGTGATTCCTCTAGGATTACAATCACATCAACAGGTTCCAAAATTCGA   1560
  1501 CAGTTATGTACAAGTGATTCCTCTAGGATTACAATCACATCAACAGGTTCCAAAATTCGA   1560
   501 -Q--L--C--T--S--D--S--S--R--I--T--I--T--S--T--G--S--K--I--R-    520

                                                                          
  1561 GTTGCTGATGGTGTTGATATTATCCAAAAATTTGAAGGGCCTTGGAATTTGAAGGCTCTT   1620
  1561 GTTGCTGATGGTGTTGATATTATCCAAAAATTTGAAGGGCCTTGGAATTTGAAGGCTCTT   1620
   521 -V--A--D--G--V--D--I--I--Q--K--F--E--G--P--W--N--L--K--A--L-    540

                                                                          
  1621 TCTTCACCATCTTTAACATCAGACGGTAGATATCTCATATCGGCTGGACTGGATTCCAAT   1680
  1621 TCTTCACCATCTTTAACATCAGACGGTAGATATCTCATATCGGCTGGACTGGATTCCAAT   1680
   541 -S--S--P--S--L--T--S--D--G--R--Y--L--I--S--A--G--L--D--S--N-    560

                                                                          
  1681 GTCTACATCTGGAACTTTGATATTCCAACCGTCGCCGATCATAAAGGCGAAACTAAATCG   1740
  1681 GTCTACATCTGGAACTTTGATATTCCAACCGTCGCCGATCATAAAGGCGAAACTAAATCG   1740
   561 -V--Y--I--W--N--F--D--I--P--T--V--A--D--H--K--G--E--T--K--S-    580

                                                                          
  1741 GTTCGCTCCTGTGAGAAATTCTTCTCCAAGGATGTGACAACCGTGGTACCATGGCCCGGG   1800
  1741 GTTCGCTCCTGTGAGAAATTCTTCTCCAAGGATGTGACAACCGTGGTACCATGGCCCGGG   1800
   581 -V--R--S--C--E--K--F--F--S--K--D--V--T--T--V--V--P--W--P--G-    600

                                                                          
  1801 CTGCATCAAGAAAGACAACAGATGAAGACATCTTCCAGCCTGACTGAAGAATCCGTCAGT   1860
  1801 CTGCATCAAGAAAGACAACAGATGAAGACATCTTCCAGCCTGACTGAAGAATCCGTCAGT   1860
   601 -L--H--Q--E--R--Q--Q--M--K--T--S--S--S--L--T--E--E--S--V--S-    620

                                                                          
  1861 TCACCCATTTTGCACCGCCACGGGGAGCACCGTTCCCCCGCAGCGCGGTGTTTCGCTGAC   1920
  1861 TCACCCATTTTGCACCGCCACGGGGAGCACCGTTCCCCCGCAGCGCGGTGTTTCGCTGAC   1920
   621 -S--P--I--L--H--R--H--G--E--H--R--S--P--A--A--R--C--F--A--D-    640

                                                                          
  1921 GGTATGAAGGGTACTCCGACATGGCCGGAGGAGAACCTTCCTCCTGCAAAAACCGCTGAT   1980
  1921 GGTATGAAGGGTACTCCGACATGGCCGGAGGAGAACCTTCCTCCTGCAAAAACCGCTGAT   1980
   641 -G--M--K--G--T--P--T--W--P--E--E--N--L--P--P--A--K--T--A--D-    660

                                                                          
  1981 GCCCCACGACTGTCTGACTGTCTCTCCACGATCTCGCCTGCATGGAACACGGTAATTGTG   2040
  1981 GCCCCACGACTGTCTGACTGTCTCTCCACGATCTCGCCTGCATGGAACACGGTAATTGTG   2040
   661 -A--P--R--L--S--D--C--L--S--T--I--S--P--A--W--N--T--V--I--V-    680

                                                                          
  2041 ACTGCAAGTCGAGACGGGGTGATCAGGTCTTTCCACAACTACGGCTTGCCTGTGAGATTG   2100
  2041 ACTGCAAGTCGAGACGGGGTGATCAGGTCTTTCCACAACTACGGCTTGCCTGTGAGATTG   2100
   681 -T--A--S--R--D--G--V--I--R--S--F--H--N--Y--G--L--P--V--R--L-    700

                                                                          
  2101 TGA                                                            2103
  2101 TGA                                                            2103
       -*-                                                             700