Oryza punctata (Oryza_punctata_v1.2)
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Zinc finger, RING-type;Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT1G09060) TAIR;Acc:AT1G09060]

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This transcript has 13 exons, is annotated with 20 domains and features and maps to 10 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OPUNC03G16540.23226869aa
 
Protein coding
A0A0E0KDM9 Ensembl Canonical
-OPUNC03G16540.12928869aa
 
Protein coding
A0A0E0KDM9 -
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     1 GGCGATGCAGCGCGCCATCCATGCCCGACAAGACCGTGTGCGAGAAGCACTACGTCCAGG     60
       ....................ATGCCCGACAAGACCGTGTGCGAGAAGCACTACGTCCAGG     40
       ....................-M--P--D--K--T--V--C--E--K--H--Y--V--Q--     13

                                                                          
    61 CCAAGAAGCGCGCCGCCTCCTCCGCGCTCCGGGCCTCCCTCCGCAGGTCCTCCGCCGCCG    120
    41 CCAAGAAGCGCGCCGCCTCCTCCGCGCTCCGGGCCTCCCTCCGCAGGTCCTCCGCCGCCG    100
    14 A--K--K--R--A--A--S--S--A--L--R--A--S--L--R--R--S--S--A--A--     33

                                                                          
   121 GCGCGCCCCCGCCGGCGCGGATGGCGGTCGCGAGGCCCATCTACGGCAGGGTCGCGGGGG    180
   101 GCGCGCCCCCGCCGGCGCGGATGGCGGTCGCGAGGCCCATCTACGGCAGGGTCGCGGGGG    160
    34 G--A--P--P--P--A--R--M--A--V--A--R--P--I--Y--G--R--V--A--G--     53

                                                                          
   181 AGCCGGTCTACGTGGCGGAGCCGGCGGTGCCGCCGCCGCCGCCGCCACGGAGGAGGCAGC    240
   161 AGCCGGTCTACGTGGCGGAGCCGGCGGTGCCGCCGCCGCCGCCGCCACGGAGGAGGCAGC    220
    54 E--P--V--Y--V--A--E--P--A--V--P--P--P--P--P--P--R--R--R--Q--     73

                                                                          
   241 CGGTCCACGGGTTGCCCTTGGGCAATGCTGCCGGCGCGCGCACCGTGGCGGAGCTGGTCG    300
   221 CGGTCCACGGGTTGCCCTTGGGCAATGCTGCCGGCGCGCGCACCGTGGCGGAGCTGGTCG    280
    74 P--V--H--G--L--P--L--G--N--A--A--G--A--R--T--V--A--E--L--V--     93

                                                                          
   301 GGAGAGGCTCAGCGGGGCTGGTTGCCTGCAGCTCGGTGGCGGCGGCGGCAACGGCAACGG    360
   281 GGAGAGGCTCAGCGGGGCTGGTTGCCTGCAGCTCGGTGGCGGCGGCGGCAACGGCAACGG    340
    94 G--R--G--S--A--G--L--V--A--C--S--S--V--A--A--A--A--T--A--T--    113

                                                                          
   361 CCGCCACCTGCCATCAGTGCCGGAGGGGTGCTAATACCATTTGGTGTACAAGCTGCGACA    420
   341 CCGCCACCTGCCATCAGTGCCGGAGGGGTGCTAATACCATTTGGTGTACAAGCTGCGACA    400
   114 A--A--T--C--H--Q--C--R--R--G--A--N--T--I--W--C--T--S--C--D--    133

                                                                          
   421 GGAGGGGATACTGCAGCGACTGCATCTCGAGATGGTACTCTGATATCCCAATTGATGATG    480
   401 GGAGGGGATACTGCAGCGACTGCATCTCGAGATGGTACTCTGATATCCCAATTGATGATG    460
   134 R--R--G--Y--C--S--D--C--I--S--R--W--Y--S--D--I--P--I--D--D--    153

                                                                          
   481 TTCAAAAGGCAAGGGTGCAGGAGATATCTGCTGTAGATAAGTTGGAATATCTTCATAGCA    540
   461 TTCAAAAGGCAAGGGTGCAGGAGATATCTGCTGTAGATAAGTTGGAATATCTTCATAGCA    520
   154 V--Q--K--A--R--V--Q--E--I--S--A--V--D--K--L--E--Y--L--H--S--    173

                                                                          
   541 TTTTGGCATCTGTCCTTCCAGTATTAAAGCAGATTTATTCTGATCAATGCTTCGAGATTG    600
   521 TTTTGGCATCTGTCCTTCCAGTATTAAAGCAGATTTATTCTGATCAATGCTTCGAGATTG    580
   174 I--L--A--S--V--L--P--V--L--K--Q--I--Y--S--D--Q--C--F--E--I--    193

                                                                          
   601 GTGTTGATACGAAAGCTTATGGACTTAGGACAGATATAATCAGGGCGAAGGTCAATCCTG    660
   581 GTGTTGATACGAAAGCTTATGGACTTAGGACAGATATAATCAGGGCGAAGGTCAATCCTG    640
   194 G--V--D--T--K--A--Y--G--L--R--T--D--I--I--R--A--K--V--N--P--    213

                                                                          
   661 ATGAGCAAATTGACTTCTGCAAAGTGCCAGTATTTGATTATCACCGACACTGCCCAAGAT    720
   641 ATGAGCAAATTGACTTCTGCAAAGTGCCAGTATTTGATTATCACCGACACTGCCCAAGAT    700
   214 D--E--Q--I--D--F--C--K--V--P--V--F--D--Y--H--R--H--C--P--R--    233

                                                                          
   721 GTTTGTATGACTTATGTCTTGACTGCTGTCGAGACATAAGGCGATCTAGGACCAATGTTG    780
   701 GTTTGTATGACTTATGTCTTGACTGCTGTCGAGACATAAGGCGATCTAGGACCAATGTTG    760
   234 C--L--Y--D--L--C--L--D--C--C--R--D--I--R--R--S--R--T--N--V--    253

                                                                          
   781 CAAGAGGAGAATGTGCTGAAGGTCGCGTGGTAGATCGAAGTAAAGATACTTTAAGTAAAA    840
   761 CAAGAGGAGAATGTGCTGAAGGTCGCGTGGTAGATCGAAGTAAAGATACTTTAAGTAAAA    820
   254 A--R--G--E--C--A--E--G--R--V--V--D--R--S--K--D--T--L--S--K--    273

                                                                          
   841 GAGCAAGAATGGAACCATCTGCAGAAAGTGCAAATGATAAGTCAGTCCCACAACGAATGG    900
   821 GAGCAAGAATGGAACCATCTGCAGAAAGTGCAAATGATAAGTCAGTCCCACAACGAATGG    880
   274 R--A--R--M--E--P--S--A--E--S--A--N--D--K--S--V--P--Q--R--M--    293

                                                                          
   901 ACATAAAAAATATTGACATAAGATCTTTATTCCCTACATGGAGAGTCAATAATGATGGAA    960
   881 ACATAAAAAATATTGACATAAGATCTTTATTCCCTACATGGAGAGTCAATAATGATGGAA    940
   294 D--I--K--N--I--D--I--R--S--L--F--P--T--W--R--V--N--N--D--G--    313

                                                                          
   961 GCATTACTTGTGGGCCTCATGAGGCTGGTGGTTGTGGCTCCTCAAAGCTAGTGTTAAGGC   1020
   941 GCATTACTTGTGGGCCTCATGAGGCTGGTGGTTGTGGCTCCTCAAAGCTAGTGTTAAGGC   1000
   314 S--I--T--C--G--P--H--E--A--G--G--C--G--S--S--K--L--V--L--R--    333

                                                                          
  1021 GAATATTCAAAATAAACTGGATTAGTAAACTTGTAAAAAATTCTGAGGAAATGGTCAATG   1080
  1001 GAATATTCAAAATAAACTGGATTAGTAAACTTGTAAAAAATTCTGAGGAAATGGTCAATG   1060
   334 R--I--F--K--I--N--W--I--S--K--L--V--K--N--S--E--E--M--V--N--    353

                                                                          
  1081 GTTGCAAAGTACATGATATGGATAATGGATGCTCATCCTGCAATAATGGCAGAACATTAG   1140
  1061 GTTGCAAAGTACATGATATGGATAATGGATGCTCATCCTGCAATAATGGCAGAACATTAG   1120
   354 G--C--K--V--H--D--M--D--N--G--C--S--S--C--N--N--G--R--T--L--    373

                                                                          
  1141 AGTTAACTGGCCATCGTAACTTTGATCTCTCAACATGTTCAAATAATGGTGGTATTGATC   1200
  1121 AGTTAACTGGCCATCGTAACTTTGATCTCTCAACATGTTCAAATAATGGTGGTATTGATC   1180
   374 E--L--T--G--H--R--N--F--D--L--S--T--C--S--N--N--G--G--I--D--    393

                                                                          
  1201 GGTTGTGTGTGTTCTCTCCTGCATTAGAGGAATTGAAATCAGAAGGTATTATTCATTTCC   1260
  1181 GGTTGTGTGTGTTCTCTCCTGCATTAGAGGAATTGAAATCAGAAGGTATTATTCATTTCC   1240
   394 R--L--C--V--F--S--P--A--L--E--E--L--K--S--E--G--I--I--H--F--    413

                                                                          
  1261 GTAAACACTGGATTAAAGGAGAACCTGTAGTTATCAGGAATGCATTTGAGCCTTCTCTGT   1320
  1241 GTAAACACTGGATTAAAGGAGAACCTGTAGTTATCAGGAATGCATTTGAGCCTTCTCTGT   1300
   414 R--K--H--W--I--K--G--E--P--V--V--I--R--N--A--F--E--P--S--L--    433

                                                                          
  1321 CATCAAGCTGGGACCCACTAAATATTTGGCGAGGAATCCAGGAAATCATGGATGAAGAAG   1380
  1301 CATCAAGCTGGGACCCACTAAATATTTGGCGAGGAATCCAGGAAATCATGGATGAAGAAG   1360
   434 S--S--S--W--D--P--L--N--I--W--R--G--I--Q--E--I--M--D--E--E--    453

                                                                          
  1381 TGGATGAAGATGTCATAGTCAAAGCTGTGGATTGCTCAAACCAAGCAGAGGTGGATATTG   1440
  1361 TGGATGAAGATGTCATAGTCAAAGCTGTGGATTGCTCAAACCAAGCAGAGGTGGATATTG   1420
   454 V--D--E--D--V--I--V--K--A--V--D--C--S--N--Q--A--E--V--D--I--    473

                                                                          
  1441 AGCTGAAACAGTTTATCAAAGGTTATTCAGATGGTCACAAGGGGGAAGATGGGGAATTGA   1500
  1421 AGCTGAAACAGTTTATCAAAGGTTATTCAGATGGTCACAAGGGGGAAGATGGGGAATTGA   1480
   474 E--L--K--Q--F--I--K--G--Y--S--D--G--H--K--G--E--D--G--E--L--    493

                                                                          
  1501 TGATGCTGAAATTGAAAGAGTGGCCCACACCCAGTGTATTGGAGGAGTTTCTGCTATGCC   1560
  1481 TGATGCTGAAATTGAAAGAGTGGCCCACACCCAGTGTATTGGAGGAGTTTCTGCTATGCC   1540
   494 M--M--L--K--L--K--E--W--P--T--P--S--V--L--E--E--F--L--L--C--    513

                                                                          
  1561 AAAGACCAGAATTTATTGTCAATTTTCCACTGGTTGATTTTATACATTCTAGGTGGGGAC   1620
  1541 AAAGACCAGAATTTATTGTCAATTTTCCACTGGTTGATTTTATACATTCTAGGTGGGGAC   1600
   514 Q--R--P--E--F--I--V--N--F--P--L--V--D--F--I--H--S--R--W--G--    533

                                                                          
  1621 TCCTAAATCTTTCTGCTAAGTTGCCCCCAGACACCCTACAACCTGAAGTTGGCTTGAAGC   1680
  1601 TCCTAAATCTTTCTGCTAAGTTGCCCCCAGACACCCTACAACCTGAAGTTGGCTTGAAGC   1660
   534 L--L--N--L--S--A--K--L--P--P--D--T--L--Q--P--E--V--G--L--K--    553

                                                                          
  1681 TGTTAATTGCATATGGAAGACATCAAGAAGCTGGTAAAGGTGACTCAGTGACAAATCTAA   1740
  1661 TGTTAATTGCATATGGAAGACATCAAGAAGCTGGTAAAGGTGACTCAGTGACAAATCTAA   1720
   554 L--L--I--A--Y--G--R--H--Q--E--A--G--K--G--D--S--V--T--N--L--    573

                                                                          
  1741 TGATTAACATGTCTGATGTGGTACATATGCTAATGCATACAGCCAAAGTGCATGATGTAT   1800
  1721 TGATTAACATGTCTGATGTGGTACATATGCTAATGCATACAGCCAAAGTGCATGATGTAT   1780
   574 M--I--N--M--S--D--V--V--H--M--L--M--H--T--A--K--V--H--D--V--    593

                                                                          
  1801 GTCCAAAGAGGCTACAACCTGAGCAACATGAAAGGATTGCCAATGGAATGACAATGCATG   1860
  1781 GTCCAAAGAGGCTACAACCTGAGCAACATGAAAGGATTGCCAATGGAATGACAATGCATG   1840
   594 C--P--K--R--L--Q--P--E--Q--H--E--R--I--A--N--G--M--T--M--H--    613

                                                                          
  1861 TAAATGCCAATGCAGCTCTTCAAAATTTGAATGTGGATATGAGGGAACAATCACCTGACC   1920
  1841 TAAATGCCAATGCAGCTCTTCAAAATTTGAATGTGGATATGAGGGAACAATCACCTGACC   1900
   614 V--N--A--N--A--A--L--Q--N--L--N--V--D--M--R--E--Q--S--P--D--    633

                                                                          
  1921 ATATAATCTCAAAGTTTGATGAAAGAGCGCATGCTTCTGCCTTGCGATTACAAGAGAAGT   1980
  1901 ATATAATCTCAAAGTTTGATGAAAGAGCGCATGCTTCTGCCTTGCGATTACAAGAGAAGT   1960
   634 H--I--I--S--K--F--D--E--R--A--H--A--S--A--L--R--L--Q--E--K--    653

                                                                          
  1981 CTTCAGATGCCAAACTTAATAGTGGTCCCGAAGGCTCTTCAACTGAGTTATCTTGCTCAT   2040
  1961 CTTCAGATGCCAAACTTAATAGTGGTCCCGAAGGCTCTTCAACTGAGTTATCTTGCTCAT   2020
   654 S--S--D--A--K--L--N--S--G--P--E--G--S--S--T--E--L--S--C--S--    673

                                                                          
  2041 CACATTCAGAGGAACCAAAAGTTAATGGTTCAGAAAGATCTCAGGCTGGTGCTGTTTGGG   2100
  2021 CACATTCAGAGGAACCAAAAGTTAATGGTTCAGAAAGATCTCAGGCTGGTGCTGTTTGGG   2080
   674 S--H--S--E--E--P--K--V--N--G--S--E--R--S--Q--A--G--A--V--W--    693

                                                                          
  2101 ATGTGTTCCGCAGGCAGGATCTTTCAAAGCTGAATGAATATTTAACTGCTAACTGGGAAG   2160
  2081 ATGTGTTCCGCAGGCAGGATCTTTCAAAGCTGAATGAATATTTAACTGCTAACTGGGAAG   2140
   694 D--V--F--R--R--Q--D--L--S--K--L--N--E--Y--L--T--A--N--W--E--    713

                                                                          
  2161 AACTGACAGCTAGTACTCAGGTTAAGAATCCTATTTATGAACAAGCTGTATATCTCAACA   2220
  2141 AACTGACAGCTAGTACTCAGGTTAAGAATCCTATTTATGAACAAGCTGTATATCTCAACA   2200
   714 E--L--T--A--S--T--Q--V--K--N--P--I--Y--E--Q--A--V--Y--L--N--    733

                                                                          
  2221 GGTATCATAAAAGGATACTGAAAGATCAATATGGAATTGAACCATGGACATTCCAGCAAC   2280
  2201 GGTATCATAAAAGGATACTGAAAGATCAATATGGAATTGAACCATGGACATTCCAGCAAC   2260
   734 R--Y--H--K--R--I--L--K--D--Q--Y--G--I--E--P--W--T--F--Q--Q--    753

                                                                          
  2281 ATATTGGGGAGGCTGTTTTTATTCCAGCTGGCTGCCCTTTCCAAGTGAAAAATATCCAGT   2340
  2261 ATATTGGGGAGGCTGTTTTTATTCCAGCTGGCTGCCCTTTCCAAGTGAAAAATATCCAGT   2320
   754 H--I--G--E--A--V--F--I--P--A--G--C--P--F--Q--V--K--N--I--Q--    773

                                                                          
  2341 CTACGGTTCAATTGGCTCTTGATTTCTTGTCACCGGAAAGTTTGGGGGAGTCGACCCGAA   2400
  2321 CTACGGTTCAATTGGCTCTTGATTTCTTGTCACCGGAAAGTTTGGGGGAGTCGACCCGAA   2380
   774 S--T--V--Q--L--A--L--D--F--L--S--P--E--S--L--G--E--S--T--R--    793

                                                                          
  2401 TGGCCCAAGAGATTCGCTGCCTGCCTAATGATCATGATGCAAAACTGAAGATGCTTGAGA   2460
  2381 TGGCCCAAGAGATTCGCTGCCTGCCTAATGATCATGATGCAAAACTGAAGATGCTTGAGA   2440
   794 M--A--Q--E--I--R--C--L--P--N--D--H--D--A--K--L--K--M--L--E--    813

                                                                          
  2461 TCGGAAAGATATCTTTATACGCAGCTAGTTCTGCTGTCAGAGAAATTCAGAGAATGACCC   2520
  2441 TCGGAAAGATATCTTTATACGCAGCTAGTTCTGCTGTCAGAGAAATTCAGAGAATGACCC   2500
   814 I--G--K--I--S--L--Y--A--A--S--S--A--V--R--E--I--Q--R--M--T--    833

                                                                          
  2521 TCGATCCCAAGTTTAATCTAGACCTTAAATTCAACGATCAGAATCTAACTCAGGCGGTTT   2580
  2501 TCGATCCCAAGTTTAATCTAGACCTTAAATTCAACGATCAGAATCTAACTCAGGCGGTTT   2560
   834 L--D--P--K--F--N--L--D--L--K--F--N--D--Q--N--L--T--Q--A--V--    853

                                                                          
  2581 CTGAGAACTTGGCTAGAGTTACCAAACAACGGAAGATATCATGCGGCTGAGATACGCGGT   2640
  2561 CTGAGAACTTGGCTAGAGTTACCAAACAACGGAAGATATCATGCGGCTGA..........   2610
   854 S--E--N--L--A--R--V--T--K--Q--R--K--I--S--C--G--*-..........    869

                                                                          
  2641 GTTCAAAATTGAAATCCATTTAAATTAGATATAGCAATTGTACATGTATTACATGGTGTC   2700
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2701 ATATGAAAGGAACACAATGACACATTCTAATTGTTATCAGATAGCATAAACCCCTCACCC   2760
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2761 TCACCTGTATATTGGACTAGGACTAACGCTGAGCTCTTGTAAACAGAAGAAACGTGGAGC   2820
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2821 AATTATTTAGCTTTAGATTGTCAGAATCAGAGTTACTGGTATGCTTAGAGACTGTCACTT   2880
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2881 TGATACAAATAATTCTTCTGCCGTTTCTGGGAGAAATTTTACATCTGTTATTAAGGAACT   2940
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2941 TTGCTAACAAGTCGAACTTGTTGCAATGAGCAATCTGGTCTCTAGAGACTGTCTTGTCAT   3000
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3001 GGTGAAGGTACAATTTCTCGAAAACTATATGAACCAGATCTTCCTCCTTTGTAGATAGAT   3060
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3061 TTCATCGTAAGATGATAGATTTCAGCGTTAACATGCACCAGATCGAGATAAATACATGAT   3120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3121 TTGTTGGTCTTGTGTTAATTTCAATTCGGACACAAGTTTGAATTGTAAAATCATGTTTCT   3180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3181 TAAGGATGAACTTCCGTTCTACCACTCCATCCACAGTGGACACAGC                 3226
       ..............................................                     
       ..............................................