Transcript: OPUNC03G16540.2
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Description
Zinc finger, RING-type;Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT1G09060) TAIR;Acc:AT1G09060]
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- OPUNC03G16540.2 3226 869aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0KDM9 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - OPUNC03G16540.1 2928 869aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0KDM9 -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 GGCGATGCAGCGCGCCATCC ATG CCC GAC AAG ACC GTG TGC GAG AAG CAC TAC GTC CAG G 60
....................ATGCCCGACAAGACCGTGTGCGAGAAGCACTACGTCCAGG 40
....................-M--P--D--K--T--V--C--E--K--H--Y--V--Q-- 13
61 CC AAG AAG CGC GCC GCC TCC TCC GCG CTC CGG GCC TCC CTC CGC AGG TCC TCC GCC GCC G 120
41 CCAAGAAGCGCGCCGCCTCCTCCGCGCTCCGGGCCTCCCTCCGCAGGTCCTCCGCCGCCG 100
14 A--K--K--R--A--A--S--S--A--L--R--A--S--L--R--R--S--S--A--A-- 33
121 GC GCG CCC CCG CCG GCG CGG ATG GCG GTC GCG AGG CCC ATC TAC GGC AGG GTC GCG GGG G 180
101 GCGCGCCCCCGCCGGCGCGGATGGCGGTCGCGAGGCCCATCTACGGCAGGGTCGCGGGGG 160
34 G--A--P--P--P--A--R--M--A--V--A--R--P--I--Y--G--R--V--A--G-- 53
181 AG CCG GTC TAC GTG GCG GAG CCG GCG GTG CCG CCG CCG CCG CCG CCA CGG AGG AGG CAG C 240
161 AGCCGGTCTACGTGGCGGAGCCGGCGGTGCCGCCGCCGCCGCCGCCACGGAGGAGGCAGC 220
54 E--P--V--Y--V--A--E--P--A--V--P--P--P--P--P--P--R--R--R--Q-- 73
241 CG GTC CAC GGG TTG CCC TTG GGC AAT GCT GCC GGC GCG CGC ACC GTG GCG GAG CTG GTC G 300
221 CGGTCCACGGGTTGCCCTTGGGCAATGCTGCCGGCGCGCGCACCGTGGCGGAGCTGGTCG 280
74 P--V--H--G--L--P--L--G--N--A--A--G--A--R--T--V--A--E--L--V-- 93
301 GG AGA GGC TCA GCG GGG CTG GTT GCC TGC AGC TCG GTG GCG GCG GCG GCA ACG GCA ACG G 360
281 GGAGAGGCTCAGCGGGGCTGGTTGCCTGCAGCTCGGTGGCGGCGGCGGCAACGGCAACGG 340
94 G--R--G--S--A--G--L--V--A--C--S--S--V--A--A--A--A--T--A--T-- 113
361 CC GCC ACC TGC CAT CAG TGC CGG AGG GGT GCT AAT ACC ATT TGG TGT ACA AGC TGC GAC A 420
341 CCGCCACCTGCCATCAGTGCCGGAGGGGTGCTAATACCATTTGGTGTACAAGCTGCGACA 400
114 A--A--T--C--H--Q--C--R--R--G--A--N--T--I--W--C--T--S--C--D-- 133
421 GG AGG GGA TAC TGC AGC GAC TGC ATC TCG AGA TG G TAC TCT GAT ATC CCA ATT GAT GAT G 480
401 GGAGGGGATACTGCAGCGACTGCATCTCGAGATGGTACTCTGATATCCCAATTGATGATG 460
134 R--R--G--Y--C--S--D--C--I--S--R--W--Y--S--D--I--P--I--D--D-- 153
481 TT CAA AAG GCA AGG GTG CAG GAG ATA TCT GCT GTA GAT AAG TTG GAA TAT CTT CAT AGC A 540
461 TTCAAAAGGCAAGGGTGCAGGAGATATCTGCTGTAGATAAGTTGGAATATCTTCATAGCA 520
154 V--Q--K--A--R--V--Q--E--I--S--A--V--D--K--L--E--Y--L--H--S-- 173
541 TT TTG GCA TCT GTC CTT CCA GTA TTA AAG CAG ATT TAT TCT GAT CAA TGC TTC GAG ATT G 600
521 TTTTGGCATCTGTCCTTCCAGTATTAAAGCAGATTTATTCTGATCAATGCTTCGAGATTG 580
174 I--L--A--S--V--L--P--V--L--K--Q--I--Y--S--D--Q--C--F--E--I-- 193
601 GT GTT GAT ACG AAA GCT TAT G G A CTT AGG ACA GAT ATA ATC AGG GCG AAG GTC AAT CCT G 660
581 GTGTTGATACGAAAGCTTATGGACTTAGGACAGATATAATCAGGGCGAAGGTCAATCCTG 640
194 G--V--D--T--K--A--Y--G--L--R--T--D--I--I--R--A--K--V--N--P-- 213
661 AT GAG CAA AT T GAC TTC TGC AAA GTG CCA GTA TTT GAT TAT CAC CGA CAC TGC CCA AGA T 720
641 ATGAGCAAATTGACTTCTGCAAAGTGCCAGTATTTGATTATCACCGACACTGCCCAAGAT 700
214 D--E--Q--I--D--F--C--K--V--P--V--F--D--Y--H--R--H--C--P--R-- 233
721 GT TTG TAT GAC TTA TGT CTT GAC TGC TGT CGA GAC ATA AGG CGA TCT AGG ACC AAT GTT G 780
701 GTTTGTATGACTTATGTCTTGACTGCTGTCGAGACATAAGGCGATCTAGGACCAATGTTG 760
234 C--L--Y--D--L--C--L--D--C--C--R--D--I--R--R--S--R--T--N--V-- 253
781 CA AGA GGA GAA TGT GCT GAA GGT CGC GTG GTA GAT CGA AGT AAA GAT ACT TTA AGT AAA A 840
761 CAAGAGGAGAATGTGCTGAAGGTCGCGTGGTAGATCGAAGTAAAGATACTTTAAGTAAAA 820
254 A--R--G--E--C--A--E--G--R--V--V--D--R--S--K--D--T--L--S--K-- 273
841 GA GCA AGA ATG GAA CCA TCT GCA GAA AGT GCA AAT GAT AAG TCA GTC CCA CAA CGA ATG G 900
821 GAGCAAGAATGGAACCATCTGCAGAAAGTGCAAATGATAAGTCAGTCCCACAACGAATGG 880
274 R--A--R--M--E--P--S--A--E--S--A--N--D--K--S--V--P--Q--R--M-- 293
901 AC ATA AAA AAT ATT GAC ATA AGA TCT TTA TTC CCT ACA TGG AGA GTC AAT AAT GAT GGA A 960
881 ACATAAAAAATATTGACATAAGATCTTTATTCCCTACATGGAGAGTCAATAATGATGGAA 940
294 D--I--K--N--I--D--I--R--S--L--F--P--T--W--R--V--N--N--D--G-- 313
961 GC ATT ACT TGT GGG CCT CAT GAG GCT GGT GGT TGT GGC TCC TCA AAG CTA GTG TTA AGG C 1020
941 GCATTACTTGTGGGCCTCATGAGGCTGGTGGTTGTGGCTCCTCAAAGCTAGTGTTAAGGC 1000
314 S--I--T--C--G--P--H--E--A--G--G--C--G--S--S--K--L--V--L--R-- 333
1021 GA ATA TTC AAA ATA AAC TGG ATT AGT AAA CTT GTA AAA AAT TCT GAG GAA ATG GTC AAT G 1080
1001 GAATATTCAAAATAAACTGGATTAGTAAACTTGTAAAAAATTCTGAGGAAATGGTCAATG 1060
334 R--I--F--K--I--N--W--I--S--K--L--V--K--N--S--E--E--M--V--N-- 353
1081 GT TGC AAA GTA CAT GAT ATG GAT AAT GGA TGC TCA TCC TGC AAT AAT GGC AGA ACA TTA G 1140
1061 GTTGCAAAGTACATGATATGGATAATGGATGCTCATCCTGCAATAATGGCAGAACATTAG 1120
354 G--C--K--V--H--D--M--D--N--G--C--S--S--C--N--N--G--R--T--L-- 373
1141 AG TTA ACT GGC CAT CGT AAC TTT GAT CTC TCA ACA TGT TCA AAT AAT GGT GGT ATT GAT C 1200
1121 AGTTAACTGGCCATCGTAACTTTGATCTCTCAACATGTTCAAATAATGGTGGTATTGATC 1180
374 E--L--T--G--H--R--N--F--D--L--S--T--C--S--N--N--G--G--I--D-- 393
1201 GG TTG TGT GTG TTC TCT CCT GCA TTA GAG GAA TTG AAA TCA GAA GGT ATT ATT CAT TTC C 1260
1181 GGTTGTGTGTGTTCTCTCCTGCATTAGAGGAATTGAAATCAGAAGGTATTATTCATTTCC 1240
394 R--L--C--V--F--S--P--A--L--E--E--L--K--S--E--G--I--I--H--F-- 413
1261 GT AAA CAC TGG ATT AAA GGA GAA CCT GTA GTT ATC AGG AAT GCA TTT GAG CCT TCT CTG T 1320
1241 GTAAACACTGGATTAAAGGAGAACCTGTAGTTATCAGGAATGCATTTGAGCCTTCTCTGT 1300
414 R--K--H--W--I--K--G--E--P--V--V--I--R--N--A--F--E--P--S--L-- 433
1321 CA TCA AGC TGG GAC CCA CTA AAT ATT TGG CGA GGA ATC CAG GAA ATC ATG GAT GAA GAA G 1380
1301 CATCAAGCTGGGACCCACTAAATATTTGGCGAGGAATCCAGGAAATCATGGATGAAGAAG 1360
434 S--S--S--W--D--P--L--N--I--W--R--G--I--Q--E--I--M--D--E--E-- 453
1381 TG GAT GAA GAT GTC ATA GTC AAA GCT GTG GAT TGC TCA AAC CAA GCA GAG GTG GAT ATT G 1440
1361 TGGATGAAGATGTCATAGTCAAAGCTGTGGATTGCTCAAACCAAGCAGAGGTGGATATTG 1420
454 V--D--E--D--V--I--V--K--A--V--D--C--S--N--Q--A--E--V--D--I-- 473
1441 AG CTG AAA CAG TTT ATC AAA GGT TAT TCA GAT GGT CAC AAG GGG GAA GAT GGG GAA TTG A 1500
1421 AGCTGAAACAGTTTATCAAAGGTTATTCAGATGGTCACAAGGGGGAAGATGGGGAATTGA 1480
474 E--L--K--Q--F--I--K--G--Y--S--D--G--H--K--G--E--D--G--E--L-- 493
1501 TG ATG CTG AAA TTG AAA GAG TGG CCC ACA CCC AGT GTA TTG GAG GAG TTT CTG CTA TGC C 1560
1481 TGATGCTGAAATTGAAAGAGTGGCCCACACCCAGTGTATTGGAGGAGTTTCTGCTATGCC 1540
494 M--M--L--K--L--K--E--W--P--T--P--S--V--L--E--E--F--L--L--C-- 513
1561 AA AGA CCA GAA TTT ATT GTC AAT TTT CCA CTG GTT GAT TTT ATA CAT TCT AGG TGG GGA C 1620
1541 AAAGACCAGAATTTATTGTCAATTTTCCACTGGTTGATTTTATACATTCTAGGTGGGGAC 1600
514 Q--R--P--E--F--I--V--N--F--P--L--V--D--F--I--H--S--R--W--G-- 533
1621 TC CTA AAT CTT TCT GCT AAG TTG CCC CCA GAC ACC CTA CAA CCT GAA GTT GGC TTG AAG C 1680
1601 TCCTAAATCTTTCTGCTAAGTTGCCCCCAGACACCCTACAACCTGAAGTTGGCTTGAAGC 1660
534 L--L--N--L--S--A--K--L--P--P--D--T--L--Q--P--E--V--G--L--K-- 553
1681 TG TTA ATT GCA TAT GGA AGA CAT CAA GAA GCT GGT AAA GGT GAC TCA GTG ACA AAT CTA A 1740
1661 TGTTAATTGCATATGGAAGACATCAAGAAGCTGGTAAAGGTGACTCAGTGACAAATCTAA 1720
554 L--L--I--A--Y--G--R--H--Q--E--A--G--K--G--D--S--V--T--N--L-- 573
1741 TG ATT AAC ATG TCT GAT GTG GTA CAT ATG CTA ATG CAT ACA GCC AAA GTG CAT GAT GTA T 1800
1721 TGATTAACATGTCTGATGTGGTACATATGCTAATGCATACAGCCAAAGTGCATGATGTAT 1780
574 M--I--N--M--S--D--V--V--H--M--L--M--H--T--A--K--V--H--D--V-- 593
1801 GT CCA AAG AGG CTA CAA CCT GAG CAA CAT GAA AGG ATT GCC AAT GGA ATG ACA ATG CAT G 1860
1781 GTCCAAAGAGGCTACAACCTGAGCAACATGAAAGGATTGCCAATGGAATGACAATGCATG 1840
594 C--P--K--R--L--Q--P--E--Q--H--E--R--I--A--N--G--M--T--M--H-- 613
1861 TA AAT GCC AAT GCA GCT CTT CAA AAT TTG AAT GTG GAT ATG AGG GAA CAA TCA CCT GAC C 1920
1841 TAAATGCCAATGCAGCTCTTCAAAATTTGAATGTGGATATGAGGGAACAATCACCTGACC 1900
614 V--N--A--N--A--A--L--Q--N--L--N--V--D--M--R--E--Q--S--P--D-- 633
1921 AT ATA ATC TCA AAG TTT GAT GAA AGA GCG CAT GCT TCT GCC TTG CGA TTA CAA GAG AAG T 1980
1901 ATATAATCTCAAAGTTTGATGAAAGAGCGCATGCTTCTGCCTTGCGATTACAAGAGAAGT 1960
634 H--I--I--S--K--F--D--E--R--A--H--A--S--A--L--R--L--Q--E--K-- 653
1981 CT TCA GAT GCC AAA CTT AAT AGT GGT CCC GAA GGC TCT TCA ACT GAG TTA TCT TGC TCA T 2040
1961 CTTCAGATGCCAAACTTAATAGTGGTCCCGAAGGCTCTTCAACTGAGTTATCTTGCTCAT 2020
654 S--S--D--A--K--L--N--S--G--P--E--G--S--S--T--E--L--S--C--S-- 673
2041 CA CAT TCA GAG GAA CCA AAA GTT AAT GGT TCA GAA AGA TCT CAG GCT GGT GCT GTT TGG G 2100
2021 CACATTCAGAGGAACCAAAAGTTAATGGTTCAGAAAGATCTCAGGCTGGTGCTGTTTGGG 2080
674 S--H--S--E--E--P--K--V--N--G--S--E--R--S--Q--A--G--A--V--W-- 693
2101 AT GTG TTC CGC AGG CAG GAT CTT TCA AAG CTG AAT GAA TAT TTA ACT GCT AAC TGG GAA G 2160
2081 ATGTGTTCCGCAGGCAGGATCTTTCAAAGCTGAATGAATATTTAACTGCTAACTGGGAAG 2140
694 D--V--F--R--R--Q--D--L--S--K--L--N--E--Y--L--T--A--N--W--E-- 713
2161 AA CTG ACA GCT AGT ACT CAG G TT AAG AAT CCT ATT TAT GAA CAA GCT GTA TAT CTC AAC A 2220
2141 AACTGACAGCTAGTACTCAGGTTAAGAATCCTATTTATGAACAAGCTGTATATCTCAACA 2200
714 E--L--T--A--S--T--Q--V--K--N--P--I--Y--E--Q--A--V--Y--L--N-- 733
2221 GG TAT CAT AAA AGG ATA CTG AAA GAT CAA TAT G G A ATT GAA CCA TGG ACA TTC CAG CAA C 2280
2201 GGTATCATAAAAGGATACTGAAAGATCAATATGGAATTGAACCATGGACATTCCAGCAAC 2260
734 R--Y--H--K--R--I--L--K--D--Q--Y--G--I--E--P--W--T--F--Q--Q-- 753
2281 AT ATT GGG GAG GCT GTT TTT ATT CCA GCT GGC TGC CCT TTC CAA GTG AAA AAT ATC CAG T 2340
2261 ATATTGGGGAGGCTGTTTTTATTCCAGCTGGCTGCCCTTTCCAAGTGAAAAATATCCAGT 2320
754 H--I--G--E--A--V--F--I--P--A--G--C--P--F--Q--V--K--N--I--Q-- 773
2341 CT ACG GTT CAA TTG GCT CTT GAT TTC TTG TCA CCG GAA AGT TTG GGG GAG TCG ACC CGA A 2400
2321 CTACGGTTCAATTGGCTCTTGATTTCTTGTCACCGGAAAGTTTGGGGGAGTCGACCCGAA 2380
774 S--T--V--Q--L--A--L--D--F--L--S--P--E--S--L--G--E--S--T--R-- 793
2401 TG GCC CAA GAG ATT CGC TGC CTG CCT AAT GAT CAT GAT GCA AAA CTG AAG ATG CTT GAG A 2460
2381 TGGCCCAAGAGATTCGCTGCCTGCCTAATGATCATGATGCAAAACTGAAGATGCTTGAGA 2440
794 M--A--Q--E--I--R--C--L--P--N--D--H--D--A--K--L--K--M--L--E-- 813
2461 TC GGA AAG ATA TCT TTA TAC GCA GCT AGT TCT GCT GTC AGA GAA ATT CAG AGA ATG ACC C 2520
2441 TCGGAAAGATATCTTTATACGCAGCTAGTTCTGCTGTCAGAGAAATTCAGAGAATGACCC 2500
814 I--G--K--I--S--L--Y--A--A--S--S--A--V--R--E--I--Q--R--M--T-- 833
2521 TC GAT CCC AA G TTT AAT CTA GAC CTT AAA TTC AAC GAT CAG AAT CTA ACT CAG GCG GTT T 2580
2501 TCGATCCCAAGTTTAATCTAGACCTTAAATTCAACGATCAGAATCTAACTCAGGCGGTTT 2560
834 L--D--P--K--F--N--L--D--L--K--F--N--D--Q--N--L--T--Q--A--V-- 853
2581 CT GAG AAC TTG GCT AGA GTT ACC AAA CAA CGG AAG ATA TCA TGC GGC TGA GATACGCGGT 2640
2561 CTGAGAACTTGGCTAGAGTTACCAAACAACGGAAGATATCATGCGGCTGA.......... 2610
854 S--E--N--L--A--R--V--T--K--Q--R--K--I--S--C--G--*-.......... 869
2641 GTTCAAAATTGAAATCCATTTAAATTAGATATAGCAATTGTACATGTATTACATGGTGTC 2700
............................................................
............................................................
2701 ATATGAAAGGAACACAATGACACATTCTAATTGTTATCAGATAGCATAAACCCCTCACCC 2760
............................................................
............................................................
2761 TCACCTGTATATTGGACTAGGACTAACGCTGAGCTCTTGTAAACAGAAGAAACGTGGAGC 2820
............................................................
............................................................
2821 AATTATTTAGCTTTAGATTGTCAGAATCAGAGTTACTGGTATGCTTAGAGACTGTCACTT 2880
............................................................
............................................................
2881 TGATACAAATAATTCTTCTGCCGTTTCTGGGAGAAATTTTACATCTGTTATTAAGGAACT 2940
............................................................
............................................................
2941 TTGCTAACAAGTCGAACTTGTTGCAATGAGCAATCTGGTCTCTAGAGACTGTCTTGTCAT 3000
............................................................
............................................................
3001 GGTGAAGGTACAATTTCTCGAAAACTATATGAACCAGATCTTCCTCCTTTGTAGATAGAT 3060
............................................................
............................................................
3061 TTCATCGTAAGATGATAGATTTCAGCGTTAACATGCACCAGATCGAGATAAATACATGAT 3120
............................................................
............................................................
3121 TTGTTGGTCTTGTGTTAATTTCAATTCGGACACAAGTTTGAATTGTAAAATCATGTTTCT 3180
............................................................
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3181 TAAGGATGAACTTCCGTTCTACCACTCCATCCACAGTGGACACAGC 3226
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