Transcript: OPUNC01G44460.1
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FIZZY-related 3 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT5G13840) TAIR;Acc:AT5G13840]
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- OPUNC01G44460.1 1784 463aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0JU87 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 TCGGCGGCGGAGCAGCAGACGAGCAAGAGATCTCTAATCTTTCTCG ATG GCG ACG GAC GC 60
..............................................ATGGCGACGGACGC 14
..............................................-M--A--T--D--A 5
61 G TCC CCC AAG ACG GCG CCG CCG CGC CTC AAC GTG CCG CCG GCG ATG GCG GGG GGA CTC CG 120
15 GTCCCCCAAGACGGCGCCGCCGCGCCTCAACGTGCCGCCGGCGATGGCGGGGGGACTCCG 74
5 --S--P--K--T--A--P--P--R--L--N--V--P--P--A--M--A--G--G--L--R 25
121 C CTC GAT CCC GCC GTC GCC TCC CCG GCC CGC CTC CTC CTC GAC GTC CCC AAG ACG CCC TC 180
75 CCTCGATCCCGCCGTCGCCTCCCCGGCCCGCCTCCTCCTCGACGTCCCCAAGACGCCCTC 134
25 --L--D--P--A--V--A--S--P--A--R--L--L--L--D--V--P--K--T--P--S 45
181 C CCT TCC AAG ACC ACA TAC AGC GAC CGC TTC ATC CCC TGC CGC TCC TCC TCC CGC CTC CA 240
135 CCCTTCCAAGACCACATACAGCGACCGCTTCATCCCCTGCCGCTCCTCCTCCCGCCTCCA 194
45 --P--S--K--T--T--Y--S--D--R--F--I--P--C--R--S--S--S--R--L--H 65
241 C AAC TTC GCC CTC CTC GAC CGC GAC CGC GCC TCC CCC TCC TCC ACC GAC GAC GCC CCA TA 300
195 CAACTTCGCCCTCCTCGACCGCGACCGCGCCTCCCCCTCCTCCACCGACGACGCCCCATA 254
65 --N--F--A--L--L--D--R--D--R--A--S--P--S--S--T--D--D--A--P--Y 85
301 C TCC CGC CTC CTC CGC GCC GAG ATC TTC GGC CCG GAC TCC CCC TCG CCG GCT CCC TCC TC 360
255 CTCCCGCCTCCTCCGCGCCGAGATCTTCGGCCCGGACTCCCCCTCGCCGGCTCCCTCCTC 314
85 --S--R--L--L--R--A--E--I--F--G--P--D--S--P--S--P--A--P--S--S 105
361 C CCC AAC ACC AAT CTC TTC CGC TTC AAG ACC GAC CAC CCC TCG CCC AAA TCG CCC TTC GC 420
315 CCCCAACACCAATCTCTTCCGCTTCAAGACCGACCACCCCTCGCCCAAATCGCCCTTCGC 374
105 --P--N--T--N--L--F--R--F--K--T--D--H--P--S--P--K--S--P--F--A 125
421 C GCC TCC GCC GCC GCC GCC GCC GGC CAC CAC GAC TGC ACC GCC GGC TCC GCC GAG TCC TC 480
375 CGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCCACCACGACTGCACCGCCGGCTCCGCCGAGTCCTC 434
125 --A--S--A--A--A--A--A--G--H--H--D--C--T--A--G--S--A--E--S--S 145
481 C ACG CCG CGC AAG CCG CCC AGG AAG GTC CCC AAG ACT CCG CAC AAG G TC CTG GAC GCG CC 540
435 CACGCCGCGCAAGCCGCCCAGGAAGGTCCCCAAGACTCCGCACAAGGTCCTGGACGCGCC 494
145 --T--P--R--K--P--P--R--K--V--P--K--T--P--H--K--V--L--D--A--P 165
541 G TCG CTG CAG GAC GAC TTC TAC CTC AAT CTT GTC GAC TGG TCG TCG CAG AAC ACG CTC GC 600
495 GTCGCTGCAGGACGACTTCTACCTCAATCTTGTCGACTGGTCGTCGCAGAACACGCTCGC 554
165 --S--L--Q--D--D--F--Y--L--N--L--V--D--W--S--S--Q--N--T--L--A 185
601 C GTC GGC CTC GGG AAT TGC GTC TAC CTC TGG TCG GCT TCC AAT TGC AAG GTC ACC AAG CT 660
555 CGTCGGCCTCGGGAATTGCGTCTACCTCTGGTCGGCTTCCAATTGCAAGGTCACCAAGCT 614
185 --V--G--L--G--N--C--V--Y--L--W--S--A--S--N--C--K--V--T--K--L 205
661 C TGC GAT TTG GGG CCC AGG GAC AGC GTC TGC GCC GTG CAC TGG ACG CGA GAA GGC TCC TA 720
615 CTGCGATTTGGGGCCCAGGGACAGCGTCTGCGCCGTGCACTGGACGCGAGAAGGCTCCTA 674
205 --C--D--L--G--P--R--D--S--V--C--A--V--H--W--T--R--E--G--S--Y 225
721 T CTT GCC ATC GGC ACC AGC CTT GGC GAT GTC CAG A TT TGG GAT AGC TCT CGC TGT AAA CG 780
675 TCTTGCCATCGGCACCAGCCTTGGCGATGTCCAGATTTGGGATAGCTCTCGCTGTAAACG 734
225 --L--A--I--G--T--S--L--G--D--V--Q--I--W--D--S--S--R--C--K--R 245
781 G ATT AGG AAC ATG GGA GGA CAC CAA ACA CGG ACT GGT GTA TTA GCA TGG AGC TCC CGA AT 840
735 GATTAGGAACATGGGAGGACACCAAACACGGACTGGTGTATTAGCATGGAGCTCCCGAAT 794
245 --I--R--N--M--G--G--H--Q--T--R--T--G--V--L--A--W--S--S--R--I 265
841 C TTG TCC TCC GGT AGC AGG GAC AAG AAC ATA CTG CAG CAT GAC ATC CGT GTC CCA AGT GA 900
795 CTTGTCCTCCGGTAGCAGGGACAAGAACATACTGCAGCATGACATCCGTGTCCCAAGTGA 854
265 --L--S--S--G--S--R--D--K--N--I--L--Q--H--D--I--R--V--P--S--D 285
901 C TAT ATC AGC AAG TTC TCA GGG CAC AGA TCA GAG G TC TGT GGA CTG AAA TGG TCG CAC GA 960
855 CTATATCAGCAAGTTCTCAGGGCACAGATCAGAGGTCTGTGGACTGAAATGGTCGCACGA 914
285 --Y--I--S--K--F--S--G--H--R--S--E--V--C--G--L--K--W--S--H--D 305
961 C GAC CGT GAG CTT GCA TCC GGT GGA AAT GAT AAC CAG CTG CTA GTA TGG AAC CAA CGT TC 1020
915 CGACCGTGAGCTTGCATCCGGTGGAAATGATAACCAGCTGCTAGTATGGAACCAACGTTC 974
305 --D--R--E--L--A--S--G--G--N--D--N--Q--L--L--V--W--N--Q--R--S 325
1021 G CAG CAG CCG GTA TTG AGA CTG ACA GAA CAC ACA GCT GCA GTT AAA GCA ATA GCA TGG TC 1080
975 GCAGCAGCCGGTATTGAGACTGACAGAACACACAGCTGCAGTTAAAGCAATAGCATGGTC 1034
325 --Q--Q--P--V--L--R--L--T--E--H--T--A--A--V--K--A--I--A--W--S 345
1081 A CCA CAT CAG CAA GGC CTC CTG GCA TCA GGG GGT GGA ACC GCT GAT AGG TGT ATC AGG TT 1140
1035 ACCACATCAGCAAGGCCTCCTGGCATCAGGGGGTGGAACCGCTGATAGGTGTATCAGGTT 1094
345 --P--H--Q--Q--G--L--L--A--S--G--G--G--T--A--D--R--C--I--R--F 365
1141 C TGG AAC ACG GTT TGT AAT CTT GCC TGG TGT AAA AAT GTA AAT GAG CTT GTG AGC ACT CA 1200
1095 CTGGAACACGGTTTGTAATCTTGCCTGGTGTAAAAATGTAAATGAGCTTGTGAGCACTCA 1154
365 --W--N--T--V--C--N--L--A--W--C--K--N--V--N--E--L--V--S--T--H 385
1201 T GGG TAT TCC CAA AAC CAA ATC ATG GTG TGG AAG TAC CCA TCT ATG TCA AAG G TT GCT AC 1260
1155 TGGGTATTCCCAAAACCAAATCATGGTGTGGAAGTACCCATCTATGTCAAAGGTTGCTAC 1214
385 --G--Y--S--Q--N--Q--I--M--V--W--K--Y--P--S--M--S--K--V--A--T 405
1261 T CTA ACT GGA CAC ACG CTG CGT GTG CTT TAC CTT GCA ATG TCA CCT GAT GGA CAG ACA AT 1320
1215 TCTAACTGGACACACGCTGCGTGTGCTTTACCTTGCAATGTCACCTGATGGACAGACAAT 1274
405 --L--T--G--H--T--L--R--V--L--Y--L--A--M--S--P--D--G--Q--T--I 425
1321 A GTA ACA GGA GCC GGG GAT GAA ACC CTC AGA TTT TGG AAT ATT TTT CCT TCA ATG AAG AC 1380
1275 AGTAACAGGAGCCGGGGATGAAACCCTCAGATTTTGGAATATTTTTCCTTCAATGAAGAC 1334
425 --V--T--G--A--G--D--E--T--L--R--F--W--N--I--F--P--S--M--K--T 445
1381 A CAG G CT CCT GTT CGT GAT ATT GGG CTC TGG TCA TTC TCG AGA AGC CAC ATA CGG TGA CC 1440
1335 ACAGGCTCCTGTTCGTGATATTGGGCTCTGGTCATTCTCGAGAAGCCACATACGGTGA.. 1392
445 --Q--A--P--V--R--D--I--G--L--W--S--F--S--R--S--H--I--R--*-.. 463
1441 ATAATAGGAGGCAAAGAAGATGCATATGTTTGTACGAAACATAATTTTCTGAACTTGTGC 1500
............................................................
............................................................
1501 AGTTCTTCAGCGATTTGTAAATTGTGAGGCCTAATCATTCATTTATTATTTGTGTGCGCG 1560
............................................................
............................................................
1561 TGTGTGTTTGTGAGATGGAGAGGAAGGGAGAAGAACTCATATTAACATAACCAATTCTTT 1620
............................................................
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1621 GTATTAGAAGCTCATAAGTCGGCTAGTTTCTTGTTTGGAATTTCATTGCAGAGAAACAAG 1680
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1681 GGCCTTGTAATTTATCACAAACTTATATGCTTGTATTATTCTCACACACTTTGTGGCCAT 1740
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1741 TTCATGACTTCAAAATGGATCAAACCTCTGGATTATGTTTGTTA 1784
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