Transcript: OPUNC01G42940.1
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Description
Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT5G13480) TAIR;Acc:AT5G13480]
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- OPUNC01G42940.2 2076 691aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0JTN4 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - OPUNC01G42940.1 2031 676aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0JTN3 -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG ATG CAG CAG CAG CAG CAG CCG CCA CCG CCT CCG CCG CAG CAC CCG CCG CCT CAG GCC 60
1 ATGATGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCACCGCCTCCGCCGCAGCACCCGCCGCCTCAGGCC 60
1 -M--M--Q--Q--Q--Q--Q--P--P--P--P--P--P--Q--H--P--P--P--Q--A- 20
61 GGG GGC GGC GGC GGC GGC GGG GAG TTC TAC CGA GGC CCG CCG CAG CCG CCG ATG CGG CAG 120
61 GGGGGCGGCGGCGGCGGCGGGGAGTTCTACCGAGGCCCGCCGCAGCCGCCGATGCGGCAG 120
21 -G--G--G--G--G--G--G--E--F--Y--R--G--P--P--Q--P--P--M--R--Q- 40
121 CTC TCG GCG GCG TCC TCC ACC AAC ATC CCC GGC GAC TAC GCA GCG CAC CAG GGG CAC CCC 180
121 CTCTCGGCGGCGTCCTCCACCAACATCCCCGGCGACTACGCAGCGCACCAGGGGCACCCC 180
41 -L--S--A--A--S--S--T--N--I--P--G--D--Y--A--A--H--Q--G--H--P- 60
181 CCG ACG CAG CAG AAT CAG CCG CCG TAC GAT G CT TAT GGG GAC AAT TTC GGT GCT AAA AGG 240
181 CCGACGCAGCAGAATCAGCCGCCGTACGATGCTTATGGGGACAATTTCGGTGCTAAAAGG 240
61 -P--T--Q--Q--N--Q--P--P--Y--D--A--Y--G--D--N--F--G--A--K--R- 80
241 ATG CGG AAG CCT GTC CAG CGG CGA ACA GTG GAC TAC ACA AGC ACA GTC GTC CGT TAT GTT 300
241 ATGCGGAAGCCTGTCCAGCGGCGAACAGTGGACTACACAAGCACAGTCGTCCGTTATGTT 300
81 -M--R--K--P--V--Q--R--R--T--V--D--Y--T--S--T--V--V--R--Y--V- 100
301 CAA G CT CGC ATG TGG CAG CGG GAT GCT AGG GAC AGA CAC ACG GTG CAG CCG ACT CCA GCT 360
301 CAAGCTCGCATGTGGCAGCGGGATGCTAGGGACAGACACACGGTGCAGCCGACTCCAGCT 360
101 -Q--A--R--M--W--Q--R--D--A--R--D--R--H--T--V--Q--P--T--P--A- 120
361 GCT GTT CTG GAC A TG CTG CCG TCT GTT GCA TAC CCC GAT AAC CCC TCA ACA AGT TTT GCC 420
361 GCTGTTCTGGACATGCTGCCGTCTGTTGCATACCCCGATAACCCCTCAACAAGTTTTGCC 420
121 -A--V--L--D--M--L--P--S--V--A--Y--P--D--N--P--S--T--S--F--A- 140
421 GCA AAA TTT GTA CAT TCA TCA ATA AAC AAG AAC CGA TGC TCT ATT AAT CGG GTC TTG GGC 480
421 GCAAAATTTGTACATTCATCAATAAACAAGAACCGATGCTCTATTAATCGGGTCTTGGGC 480
141 -A--K--F--V--H--S--S--I--N--K--N--R--C--S--I--N--R--V--L--G- 160
481 GCC GGC TTA TTA CGG GAT CAC AGA GTG GTG AAT TCA CCC TAT GGA ATG GCT CAT GAC CAA 540
481 GCCGGCTTATTACGGGATCACAGAGTGGTGAATTCACCCTATGGAATGGCTCATGACCAA 540
161 -A--G--L--L--R--D--H--R--V--V--N--S--P--Y--G--M--A--H--D--Q- 180
541 GCT GTA AGA TCG ATG ATT TGG AGT AAC AAT GAG AAC TGG ATG GTC ACT GGT GAT GAT GGT 600
541 GCTGTAAGATCGATGATTTGGAGTAACAATGAGAACTGGATGGTCACTGGTGATGATGGT 600
181 -A--V--R--S--M--I--W--S--N--N--E--N--W--M--V--T--G--D--D--G- 200
601 GGT GCA ATC AA G TAT TGG CAA AGT AAT ATG AAC AAT GTT AAA GTT AAT AAA ACA GCT CAC 660
601 GGTGCAATCAAGTATTGGCAAAGTAATATGAACAATGTTAAAGTTAATAAAACAGCTCAC 660
201 -G--A--I--K--Y--W--Q--S--N--M--N--N--V--K--V--N--K--T--A--H- 220
661 AGA GAA TCA GTT CGT GAC TTA AG A ACA GAC CTG AAG TTT TGC TCC TGT TCT GAT GAC ACT 720
661 AGAGAATCAGTTCGTGACTTAAGAACAGACCTGAAGTTTTGCTCCTGTTCTGATGACACT 720
221 -R--E--S--V--R--D--L--R--T--D--L--K--F--C--S--C--S--D--D--T- 240
721 ACT GTG AAG GTT TGG GAC TTT GCA AGA TGC CAG GAA GAA AGA TCT TTA ACT G GT GGT AAA 780
721 ACTGTGAAGGTTTGGGACTTTGCAAGATGCCAGGAAGAAAGATCTTTAACTGGTGGTAAA 780
241 -T--V--K--V--W--D--F--A--R--C--Q--E--E--R--S--L--T--G--G--K- 260
781 GAC TAT CTC GTG AAA CTT TGG GAT GCA AAA AGT GGT AGA GAG CTA CGT TCA TT C CAT GGT 840
781 GACTATCTCGTGAAACTTTGGGATGCAAAAAGTGGTAGAGAGCTACGTTCATTCCATGGT 840
261 -D--Y--L--V--K--L--W--D--A--K--S--G--R--E--L--R--S--F--H--G- 280
841 CAT AAA AAC ATT GTA CAA TGT GTA AAG TGG AAT CAG AAT GGG AAC TGG GTG TTG ACT GCC 900
841 CATAAAAACATTGTACAATGTGTAAAGTGGAATCAGAATGGGAACTGGGTGTTGACTGCC 900
281 -H--K--N--I--V--Q--C--V--K--W--N--Q--N--G--N--W--V--L--T--A- 300
901 TCC AAG GAT CAG ATT ATT AAG C TA TAT GAT ATT AGA TCC ATG AAA GAG CTT GAA TCC TTC 960
901 TCCAAGGATCAGATTATTAAGCTATATGATATTAGATCCATGAAAGAGCTTGAATCCTTC 960
301 -S--K--D--Q--I--I--K--L--Y--D--I--R--S--M--K--E--L--E--S--F- 320
961 CGT GGA CAC AAC AAG GAT GTG ACT G C T TTG GCA TGG CAT CCA TTT CAT GAA GAA TAT TTT 1020
961 CGTGGACACAACAAGGATGTGACTGCTTTGGCATGGCATCCATTTCATGAAGAATATTTT 1020
321 -R--G--H--N--K--D--V--T--A--L--A--W--H--P--F--H--E--E--Y--F- 340
1021 GTT AGC GGG AGC TAT GAT GGA GCA ATC TTT CAT TGG TTG GTT GG C CAT GAA ACT CCA CAG 1080
1021 GTTAGCGGGAGCTATGATGGAGCAATCTTTCATTGGTTGGTTGGCCATGAAACTCCACAG 1080
341 -V--S--G--S--Y--D--G--A--I--F--H--W--L--V--G--H--E--T--P--Q- 360
1081 ATA GAG ATA AAT AAC GCA CAT GAC AAT AGT GTG TGG GAC CTT GCC TGG CAT CCT GTT GGT 1140
1081 ATAGAGATAAATAACGCACATGACAATAGTGTGTGGGACCTTGCCTGGCATCCTGTTGGT 1140
361 -I--E--I--N--N--A--H--D--N--S--V--W--D--L--A--W--H--P--V--G- 380
1141 TAT CTA CTT TGC AG T GGG GGC AAT GAT CAT GCT ACG CGA TTT TGG TGT AGA AAT AGG CCT 1200
1141 TATCTACTTTGCAGTGGGGGCAATGATCATGCTACGCGATTTTGGTGTAGAAATAGGCCT 1200
381 -Y--L--L--C--S--G--G--N--D--H--A--T--R--F--W--C--R--N--R--P- 400
1201 GGT GAT CTT ACC CGC GAT AAA TAC AAC AGT GGA CAG ATG CAA G GT TAC GGT GAC CAA CAT 1260
1201 GGTGATCTTACCCGCGATAAATACAACAGTGGACAGATGCAAGGTTACGGTGACCAACAT 1260
401 -G--D--L--T--R--D--K--Y--N--S--G--Q--M--Q--G--Y--G--D--Q--H- 420
1261 CCT GCT TTT GCT GGC CGT GCT ATG GGT GGA TTC CAG ATG CCT GAA CCT TCA ACA ACA CCT 1320
1261 CCTGCTTTTGCTGGCCGTGCTATGGGTGGATTCCAGATGCCTGAACCTTCAACAACACCT 1320
421 -P--A--F--A--G--R--A--M--G--G--F--Q--M--P--E--P--S--T--T--P- 440
1321 GGA CCA TTT AAT ACT GGA TTG TCA CGA AAT GAA GGT ACA ATT CCT GGC ATT GGG GTC GCA 1380
1321 GGACCATTTAATACTGGATTGTCACGAAATGAAGGTACAATTCCTGGCATTGGGGTCGCA 1380
441 -G--P--F--N--T--G--L--S--R--N--E--G--T--I--P--G--I--G--V--A- 460
1381 ATG CCT CTT GAT GGA TCT GAT CAT GGA GAG CAG AGG CCA TCG ATA CCT GGC CTT CCA CCT 1440
1381 ATGCCTCTTGATGGATCTGATCATGGAGAGCAGAGGCCATCGATACCTGGCCTTCCACCT 1440
461 -M--P--L--D--G--S--D--H--G--E--Q--R--P--S--I--P--G--L--P--P- 480
1441 GGG CAA CCT CCC TTG CCT CCA GGT CCC CAT CCA TCT CTT CTT GCG GGT GGG CAG CAA CAA 1500
1441 GGGCAACCTCCCTTGCCTCCAGGTCCCCATCCATCTCTTCTTGCGGGTGGGCAGCAACAA 1500
481 -G--Q--P--P--L--P--P--G--P--H--P--S--L--L--A--G--G--Q--Q--Q- 500
1501 CAA TAT CAA CAG ATG CAG CAG CAG CAT CCT CAA TTT CCT CGA CCA CCA CCT CCA AAT ATG 1560
1501 CAATATCAACAGATGCAGCAGCAGCATCCTCAATTTCCTCGACCACCACCTCCAAATATG 1560
501 -Q--Y--Q--Q--M--Q--Q--Q--H--P--Q--F--P--R--P--P--P--P--N--M- 520
1561 CCT CAA TTG CAG CCC CCA GCA CAC ATG CTT CCA CAT GTG CAA GGA TCT CGA CCA CCA CTT 1620
1561 CCTCAATTGCAGCCCCCAGCACACATGCTTCCACATGTGCAAGGATCTCGACCACCACTT 1620
521 -P--Q--L--Q--P--P--A--H--M--L--P--H--V--Q--G--S--R--P--P--L- 540
1621 CCA CAG CTT CCA TCA ATG CCA GGT CCA TCA CCA GTG AAT CCG CCA CTA CCA CCT ATG CCT 1680
1621 CCACAGCTTCCATCAATGCCAGGTCCATCACCAGTGAATCCGCCACTACCACCTATGCCT 1680
541 -P--Q--L--P--S--M--P--G--P--S--P--V--N--P--P--L--P--P--M--P- 560
1681 CAC CCG ATG GCG ATG CAA GTG CAA GGT TCA TCA AAC CAG ATG ATG CCT CAA ATG CCA CAG 1740
1681 CACCCGATGGCGATGCAAGTGCAAGGTTCATCAAACCAGATGATGCCTCAAATGCCACAG 1740
561 -H--P--M--A--M--Q--V--Q--G--S--S--N--Q--M--M--P--Q--M--P--Q- 580
1741 CAC TTG ATT GGT ATG AAT CAG ACA CAT CAG GGC CCT CCT AGT AAT ATG CCT CCA ATG GGT 1800
1741 CACTTGATTGGTATGAATCAGACACATCAGGGCCCTCCTAGTAATATGCCTCCAATGGGT 1800
581 -H--L--I--G--M--N--Q--T--H--Q--G--P--P--S--N--M--P--P--M--G- 600
1801 GGC TTT CCT AAT GGA ATG GGA AAT ATT CAA GGT GGA TCT AGT GCT TCT GGC ATG CAA AAC 1860
1801 GGCTTTCCTAATGGAATGGGAAATATTCAAGGTGGATCTAGTGCTTCTGGCATGCAAAAC 1860
601 -G--F--P--N--G--M--G--N--I--Q--G--G--S--S--A--S--G--M--Q--N- 620
1861 TTT CCT ATG GGT GGC ATG TAC AAC AGG CCT CAG GGA CAA ATG CCT CCA CAA GCA CAA GCA 1920
1861 TTTCCTATGGGTGGCATGTACAACAGGCCTCAGGGACAAATGCCTCCACAAGCACAAGCA 1920
621 -F--P--M--G--G--M--Y--N--R--P--Q--G--Q--M--P--P--Q--A--Q--A- 640
1921 CAG ATG ACA TCC ATC CCT GGT CTG AGC TCA TAT CAG C CG GGT ATG GGC AAT GTG GGC CTT 1980
1921 CAGATGACATCCATCCCTGGTCTGAGCTCATATCAGCCGGGTATGGGCAATGTGGGCCTT 1980
641 -Q--M--T--S--I--P--G--L--S--S--Y--Q--P--G--M--G--N--V--G--L- 660
1981 CCA CCG CCA CCC CCA CAG CAT CCA CCG CCT CGC GGT TCA GCA CCG CAA TGA 2031
1981 CCACCGCCACCCCCACAGCATCCACCGCCTCGCGGTTCAGCACCGCAATGA 2031
661 -P--P--P--P--P--Q--H--P--P--P--R--G--S--A--P--Q--*- 676
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