Oryza punctata (Oryza_punctata_v1.2)
Description

Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT5G13480) TAIR;Acc:AT5G13480]

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About this transcript

This transcript has 17 exons, is annotated with 39 domains and features and maps to 33 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OPUNC01G42940.22076691aa
 
Protein coding
A0A0E0JTN4 Ensembl Canonical
-OPUNC01G42940.12031676aa
 
Protein coding
A0A0E0JTN3 -
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
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Other
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     1 ATGATGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCACCGCCTCCGCCGCAGCACCCGCCGCCTCAGGCC     60
     1 ATGATGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCACCGCCTCCGCCGCAGCACCCGCCGCCTCAGGCC     60
     1 -M--M--Q--Q--Q--Q--Q--P--P--P--P--P--P--Q--H--P--P--P--Q--A-     20

                                                                          
    61 GGGGGCGGCGGCGGCGGCGGGGAGTTCTACCGAGGCCCGCCGCAGCCGCCGATGCGGCAG    120
    61 GGGGGCGGCGGCGGCGGCGGGGAGTTCTACCGAGGCCCGCCGCAGCCGCCGATGCGGCAG    120
    21 -G--G--G--G--G--G--G--E--F--Y--R--G--P--P--Q--P--P--M--R--Q-     40

                                                                          
   121 CTCTCGGCGGCGTCCTCCACCAACATCCCCGGCGACTACGCAGCGCACCAGGGGCACCCC    180
   121 CTCTCGGCGGCGTCCTCCACCAACATCCCCGGCGACTACGCAGCGCACCAGGGGCACCCC    180
    41 -L--S--A--A--S--S--T--N--I--P--G--D--Y--A--A--H--Q--G--H--P-     60

                                                                          
   181 CCGACGCAGCAGAATCAGCCGCCGTACGATGCTTATGGGGACAATTTCGGTGCTAAAAGG    240
   181 CCGACGCAGCAGAATCAGCCGCCGTACGATGCTTATGGGGACAATTTCGGTGCTAAAAGG    240
    61 -P--T--Q--Q--N--Q--P--P--Y--D--A--Y--G--D--N--F--G--A--K--R-     80

                                                                          
   241 ATGCGGAAGCCTGTCCAGCGGCGAACAGTGGACTACACAAGCACAGTCGTCCGTTATGTT    300
   241 ATGCGGAAGCCTGTCCAGCGGCGAACAGTGGACTACACAAGCACAGTCGTCCGTTATGTT    300
    81 -M--R--K--P--V--Q--R--R--T--V--D--Y--T--S--T--V--V--R--Y--V-    100

                                                                          
   301 CAAGCTCGCATGTGGCAGCGGGATGCTAGGGACAGACACACGGTGCAGCCGACTCCAGCT    360
   301 CAAGCTCGCATGTGGCAGCGGGATGCTAGGGACAGACACACGGTGCAGCCGACTCCAGCT    360
   101 -Q--A--R--M--W--Q--R--D--A--R--D--R--H--T--V--Q--P--T--P--A-    120

                                                                          
   361 GCTGTTCTGGACATGCTGCCGTCTGTTGCATACCCCGATAACCCCTCAACAAGTTTTGCC    420
   361 GCTGTTCTGGACATGCTGCCGTCTGTTGCATACCCCGATAACCCCTCAACAAGTTTTGCC    420
   121 -A--V--L--D--M--L--P--S--V--A--Y--P--D--N--P--S--T--S--F--A-    140

                                                                          
   421 GCAAAATTTGTACATTCATCAATAAACAAGAACCGATGCTCTATTAATCGGGTCTTGGGC    480
   421 GCAAAATTTGTACATTCATCAATAAACAAGAACCGATGCTCTATTAATCGGGTCTTGGGC    480
   141 -A--K--F--V--H--S--S--I--N--K--N--R--C--S--I--N--R--V--L--G-    160

                                                                          
   481 GCCGGCTTATTACGGGATCACAGAGTGGTGAATTCACCCTATGGAATGGCTCATGACCAA    540
   481 GCCGGCTTATTACGGGATCACAGAGTGGTGAATTCACCCTATGGAATGGCTCATGACCAA    540
   161 -A--G--L--L--R--D--H--R--V--V--N--S--P--Y--G--M--A--H--D--Q-    180

                                                                          
   541 GCTGTAAGATCGATGATTTGGAGTAACAATGAGAACTGGATGGTCACTGGTGATGATGGT    600
   541 GCTGTAAGATCGATGATTTGGAGTAACAATGAGAACTGGATGGTCACTGGTGATGATGGT    600
   181 -A--V--R--S--M--I--W--S--N--N--E--N--W--M--V--T--G--D--D--G-    200

                                                                          
   601 GGTGCAATCAAGTATTGGCAAAGTAATATGAACAATGTTAAAGTTAATAAAACAGCTCAC    660
   601 GGTGCAATCAAGTATTGGCAAAGTAATATGAACAATGTTAAAGTTAATAAAACAGCTCAC    660
   201 -G--A--I--K--Y--W--Q--S--N--M--N--N--V--K--V--N--K--T--A--H-    220

                                                                          
   661 AGAGAATCAGTTCGTGACTTAAGAACAGACCTGAAGTTTTGCTCCTGTTCTGATGACACT    720
   661 AGAGAATCAGTTCGTGACTTAAGAACAGACCTGAAGTTTTGCTCCTGTTCTGATGACACT    720
   221 -R--E--S--V--R--D--L--R--T--D--L--K--F--C--S--C--S--D--D--T-    240

                                                                          
   721 ACTGTGAAGGTTTGGGACTTTGCAAGATGCCAGGAAGAAAGATCTTTAACTGGTGGTAAA    780
   721 ACTGTGAAGGTTTGGGACTTTGCAAGATGCCAGGAAGAAAGATCTTTAACTGGTGGTAAA    780
   241 -T--V--K--V--W--D--F--A--R--C--Q--E--E--R--S--L--T--G--G--K-    260

                                                                          
   781 GACTATCTCGTGAAACTTTGGGATGCAAAAAGTGGTAGAGAGCTACGTTCATTCCATGGT    840
   781 GACTATCTCGTGAAACTTTGGGATGCAAAAAGTGGTAGAGAGCTACGTTCATTCCATGGT    840
   261 -D--Y--L--V--K--L--W--D--A--K--S--G--R--E--L--R--S--F--H--G-    280

                                                                          
   841 CATAAAAACATTGTACAATGTGTAAAGTGGAATCAGAATGGGAACTGGGTGTTGACTGCC    900
   841 CATAAAAACATTGTACAATGTGTAAAGTGGAATCAGAATGGGAACTGGGTGTTGACTGCC    900
   281 -H--K--N--I--V--Q--C--V--K--W--N--Q--N--G--N--W--V--L--T--A-    300

                                                                          
   901 TCCAAGGATCAGATTATTAAGCTATATGATATTAGATCCATGAAAGAGCTTGAATCCTTC    960
   901 TCCAAGGATCAGATTATTAAGCTATATGATATTAGATCCATGAAAGAGCTTGAATCCTTC    960
   301 -S--K--D--Q--I--I--K--L--Y--D--I--R--S--M--K--E--L--E--S--F-    320

                                                                          
   961 CGTGGACACAACAAGGATGTGACTGCTTTGGCATGGCATCCATTTCATGAAGAATATTTT   1020
   961 CGTGGACACAACAAGGATGTGACTGCTTTGGCATGGCATCCATTTCATGAAGAATATTTT   1020
   321 -R--G--H--N--K--D--V--T--A--L--A--W--H--P--F--H--E--E--Y--F-    340

                                                                          
  1021 GTTAGCGGGAGCTATGATGGAGCAATCTTTCATTGGTTGGTTGGCCATGAAACTCCACAG   1080
  1021 GTTAGCGGGAGCTATGATGGAGCAATCTTTCATTGGTTGGTTGGCCATGAAACTCCACAG   1080
   341 -V--S--G--S--Y--D--G--A--I--F--H--W--L--V--G--H--E--T--P--Q-    360

                                                                          
  1081 ATAGAGATAAATAACGCACATGACAATAGTGTGTGGGACCTTGCCTGGCATCCTGTTGGT   1140
  1081 ATAGAGATAAATAACGCACATGACAATAGTGTGTGGGACCTTGCCTGGCATCCTGTTGGT   1140
   361 -I--E--I--N--N--A--H--D--N--S--V--W--D--L--A--W--H--P--V--G-    380

                                                                          
  1141 TATCTACTTTGCAGTGGGGGCAATGATCATGCTACGCGATTTTGGTGTAGAAATAGGCCT   1200
  1141 TATCTACTTTGCAGTGGGGGCAATGATCATGCTACGCGATTTTGGTGTAGAAATAGGCCT   1200
   381 -Y--L--L--C--S--G--G--N--D--H--A--T--R--F--W--C--R--N--R--P-    400

                                                                          
  1201 GGTGATCTTACCCGCGATAAATACAACAGTGGACAGATGCAAGGTTACGGTGACCAACAT   1260
  1201 GGTGATCTTACCCGCGATAAATACAACAGTGGACAGATGCAAGGTTACGGTGACCAACAT   1260
   401 -G--D--L--T--R--D--K--Y--N--S--G--Q--M--Q--G--Y--G--D--Q--H-    420

                                                                          
  1261 CCTGCTTTTGCTGGCCGTGCTATGGGTGGATTCCAGATGCCTGAACCTTCAACAACACCT   1320
  1261 CCTGCTTTTGCTGGCCGTGCTATGGGTGGATTCCAGATGCCTGAACCTTCAACAACACCT   1320
   421 -P--A--F--A--G--R--A--M--G--G--F--Q--M--P--E--P--S--T--T--P-    440

                                                                          
  1321 GGACCATTTAATACTGGATTGTCACGAAATGAAGGTACAATTCCTGGCATTGGGGTCGCA   1380
  1321 GGACCATTTAATACTGGATTGTCACGAAATGAAGGTACAATTCCTGGCATTGGGGTCGCA   1380
   441 -G--P--F--N--T--G--L--S--R--N--E--G--T--I--P--G--I--G--V--A-    460

                                                                          
  1381 ATGCCTCTTGATGGATCTGATCATGGAGAGCAGAGGCCATCGATACCTGGCCTTCCACCT   1440
  1381 ATGCCTCTTGATGGATCTGATCATGGAGAGCAGAGGCCATCGATACCTGGCCTTCCACCT   1440
   461 -M--P--L--D--G--S--D--H--G--E--Q--R--P--S--I--P--G--L--P--P-    480

                                                                          
  1441 GGGCAACCTCCCTTGCCTCCAGGTCCCCATCCATCTCTTCTTGCGGGTGGGCAGCAACAA   1500
  1441 GGGCAACCTCCCTTGCCTCCAGGTCCCCATCCATCTCTTCTTGCGGGTGGGCAGCAACAA   1500
   481 -G--Q--P--P--L--P--P--G--P--H--P--S--L--L--A--G--G--Q--Q--Q-    500

                                                                          
  1501 CAATATCAACAGATGCAGCAGCAGCATCCTCAATTTCCTCGACCACCACCTCCAAATATG   1560
  1501 CAATATCAACAGATGCAGCAGCAGCATCCTCAATTTCCTCGACCACCACCTCCAAATATG   1560
   501 -Q--Y--Q--Q--M--Q--Q--Q--H--P--Q--F--P--R--P--P--P--P--N--M-    520

                                                                          
  1561 CCTCAATTGCAGCCCCCAGCACACATGCTTCCACATGTGCAAGGATCTCGACCACCACTT   1620
  1561 CCTCAATTGCAGCCCCCAGCACACATGCTTCCACATGTGCAAGGATCTCGACCACCACTT   1620
   521 -P--Q--L--Q--P--P--A--H--M--L--P--H--V--Q--G--S--R--P--P--L-    540

                                                                          
  1621 CCACAGCTTCCATCAATGCCAGGTCCATCACCAGTGAATCCGCCACTACCACCTATGCCT   1680
  1621 CCACAGCTTCCATCAATGCCAGGTCCATCACCAGTGAATCCGCCACTACCACCTATGCCT   1680
   541 -P--Q--L--P--S--M--P--G--P--S--P--V--N--P--P--L--P--P--M--P-    560

                                                                          
  1681 CACCCGATGGCGATGCAAGTGCAAGGTTCATCAAACCAGATGATGCCTCAAATGCCACAG   1740
  1681 CACCCGATGGCGATGCAAGTGCAAGGTTCATCAAACCAGATGATGCCTCAAATGCCACAG   1740
   561 -H--P--M--A--M--Q--V--Q--G--S--S--N--Q--M--M--P--Q--M--P--Q-    580

                                                                          
  1741 CACTTGATTGGTATGAATCAGACACATCAGGGCCCTCCTAGTAATATGCCTCCAATGGGT   1800
  1741 CACTTGATTGGTATGAATCAGACACATCAGGGCCCTCCTAGTAATATGCCTCCAATGGGT   1800
   581 -H--L--I--G--M--N--Q--T--H--Q--G--P--P--S--N--M--P--P--M--G-    600

                                                                          
  1801 GGCTTTCCTAATGGAATGGGAAATATTCAAGGTGGATCTAGTGCTTCTGGCATGCAAAAC   1860
  1801 GGCTTTCCTAATGGAATGGGAAATATTCAAGGTGGATCTAGTGCTTCTGGCATGCAAAAC   1860
   601 -G--F--P--N--G--M--G--N--I--Q--G--G--S--S--A--S--G--M--Q--N-    620

                                                                          
  1861 TTTCCTATGGGTGGCATGTACAACAGGCCTCAGGGACAAATGCCTCCACAAGCACAAGCA   1920
  1861 TTTCCTATGGGTGGCATGTACAACAGGCCTCAGGGACAAATGCCTCCACAAGCACAAGCA   1920
   621 -F--P--M--G--G--M--Y--N--R--P--Q--G--Q--M--P--P--Q--A--Q--A-    640

                                                                          
  1921 CAGATGACATCCATCCCTGGTCTGAGCTCATATCAGCCGGGTATGGGCAATGTGGGCCTT   1980
  1921 CAGATGACATCCATCCCTGGTCTGAGCTCATATCAGCCGGGTATGGGCAATGTGGGCCTT   1980
   641 -Q--M--T--S--I--P--G--L--S--S--Y--Q--P--G--M--G--N--V--G--L-    660

                                                                          
  1981 CCACCGCCACCCCCACAGCATCCACCGCCTCGCGGTTCAGCACCGCAATGA            2031
  1981 CCACCGCCACCCCCACAGCATCCACCGCCTCGCGGTTCAGCACCGCAATGA            2031
   661 -P--P--P--P--P--Q--H--P--P--P--R--G--S--A--P--Q--*-             676